Protein–RNA interactions for Protein: Q4QQM4

Trp53i11, Tumor protein p53-inducible protein 11, mousemouse

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Length 189 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trp53i11Q4QQM4 Dclk2-209ENSMUST00000195561 3486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Trp53i11Q4QQM4 Nudt7-203ENSMUST00000109109 2795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Trp53i11Q4QQM4 Snx13-202ENSMUST00000163677 3681 ntTSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Trp53i11Q4QQM4 D930020B18Rik-201ENSMUST00000120642 3335 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.53□□□□□ -0.72
Trp53i11Q4QQM4 Stxbp5l-201ENSMUST00000023526 3344 ntTSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Trp53i11Q4QQM4 Tnk2-204ENSMUST00000115123 4225 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.53□□□□□ -0.72
Trp53i11Q4QQM4 AC169511.2-201ENSMUST00000226674 2063 ntBASIC10.53□□□□□ -0.72
Trp53i11Q4QQM4 Fam186a-202ENSMUST00000100209 9334 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.53□□□□□ -0.72
Trp53i11Q4QQM4 AC113282.1-201ENSMUST00000225278 1707 ntAPPRIS P1 BASIC10.53□□□□□ -0.72
Trp53i11Q4QQM4 Il34-201ENSMUST00000076846 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Trp53i11Q4QQM4 Cpsf4l-202ENSMUST00000100248 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.52□□□□□ -0.72
Trp53i11Q4QQM4 Dnajc12-201ENSMUST00000043317 3025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.72
Trp53i11Q4QQM4 Aldh3a2-201ENSMUST00000066277 2892 ntTSL 2 BASIC10.52□□□□□ -0.72
Trp53i11Q4QQM4 Epha7-204ENSMUST00000108194 2323 ntTSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.72
Trp53i11Q4QQM4 Cyp2a22-201ENSMUST00000170227 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.72
Trp53i11Q4QQM4 Adamts13-201ENSMUST00000014996 3474 ntTSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.72
Trp53i11Q4QQM4 Cblb-203ENSMUST00000226593 3864 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.52□□□□□ -0.72
Trp53i11Q4QQM4 Prdm9-205ENSMUST00000147532 1447 ntTSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Trp53i11Q4QQM4 Gpm6b-209ENSMUST00000112235 4480 ntTSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Trp53i11Q4QQM4 Myh11-201ENSMUST00000090287 6632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Trp53i11Q4QQM4 Rad18-204ENSMUST00000113182 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.52□□□□□ -0.73
Trp53i11Q4QQM4 Cep350-204ENSMUST00000138762 13307 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.52□□□□□ -0.73
Trp53i11Q4QQM4 Pla2g6-206ENSMUST00000173163 3018 ntTSL 5 BASIC10.52□□□□□ -0.73
Trp53i11Q4QQM4 Ltc4s-201ENSMUST00000101265 480 ntTSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Trp53i11Q4QQM4 Gm13284-201ENSMUST00000121020 547 ntBASIC10.52□□□□□ -0.73
Trp53i11Q4QQM4 Gm14965-201ENSMUST00000124118 565 ntTSL 2 BASIC10.52□□□□□ -0.73
Trp53i11Q4QQM4 Snord55-201ENSMUST00000174939 79 ntBASIC10.52□□□□□ -0.73
Trp53i11Q4QQM4 Ly6l-201ENSMUST00000177479 430 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.52□□□□□ -0.73
Trp53i11Q4QQM4 Gm42816-201ENSMUST00000198433 325 ntBASIC10.52□□□□□ -0.73
Trp53i11Q4QQM4 Gm42657-201ENSMUST00000201746 211 ntBASIC10.52□□□□□ -0.73
Trp53i11Q4QQM4 Gm5302-201ENSMUST00000202130 796 ntBASIC10.52□□□□□ -0.73
Trp53i11Q4QQM4 Gm44759-201ENSMUST00000206057 430 ntTSL 3 BASIC10.52□□□□□ -0.73
Trp53i11Q4QQM4 Cox6b1-204ENSMUST00000208838 354 ntTSL 3 BASIC10.52□□□□□ -0.73
Trp53i11Q4QQM4 Gm31166-202ENSMUST00000210638 1268 ntTSL 3 BASIC10.52□□□□□ -0.73
Trp53i11Q4QQM4 Sdf2-201ENSMUST00000002133 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Trp53i11Q4QQM4 Ccdc153-202ENSMUST00000213891 792 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC10.52□□□□□ -0.73
Trp53i11Q4QQM4 CT009718.3-201ENSMUST00000221116 367 ntBASIC10.52□□□□□ -0.73
Trp53i11Q4QQM4 AC136376.2-201ENSMUST00000228819 490 ntBASIC10.52□□□□□ -0.73
Trp53i11Q4QQM4 Ntan1-201ENSMUST00000023362 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Trp53i11Q4QQM4 Chmp3-202ENSMUST00000065364 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Trp53i11Q4QQM4 Fopnl-201ENSMUST00000023357 1465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Trp53i11Q4QQM4 Ikbkg-204ENSMUST00000114128 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.52□□□□□ -0.73
Trp53i11Q4QQM4 Ptgfr-201ENSMUST00000029670 6624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Trp53i11Q4QQM4 Elf2-206ENSMUST00000163748 2656 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Trp53i11Q4QQM4 9330182L06Rik-204ENSMUST00000134991 4115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Trp53i11Q4QQM4 Dph6-203ENSMUST00000102542 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Trp53i11Q4QQM4 Reps1-210ENSMUST00000164556 2537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Trp53i11Q4QQM4 Arhgef9-201ENSMUST00000113873 2117 ntTSL 5 BASIC10.52□□□□□ -0.73
Trp53i11Q4QQM4 Dido1-204ENSMUST00000103055 4613 ntTSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Trp53i11Q4QQM4 Celf3-213ENSMUST00000199775 2351 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.52□□□□□ -0.73
Trp53i11Q4QQM4 Pip5k1a-206ENSMUST00000107236 3618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Trp53i11Q4QQM4 Eng-201ENSMUST00000009705 3422 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Trp53i11Q4QQM4 Cpeb1-209ENSMUST00000178892 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Trp53i11Q4QQM4 Tmem62-202ENSMUST00000110686 2417 ntTSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Trp53i11Q4QQM4 5031434O11Rik-201ENSMUST00000180404 3731 ntTSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Trp53i11Q4QQM4 Slc45a3-201ENSMUST00000027695 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Trp53i11Q4QQM4 Ccdc191-201ENSMUST00000122014 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Trp53i11Q4QQM4 Pex26-202ENSMUST00000118234 3778 ntTSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Trp53i11Q4QQM4 Hif1an-201ENSMUST00000040455 6194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Trp53i11Q4QQM4 Pyurf-201ENSMUST00000053386 3573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Trp53i11Q4QQM4 Slc37a4-201ENSMUST00000165839 2086 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Trp53i11Q4QQM4 Tlr12-201ENSMUST00000074829 3177 ntAPPRIS P1 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Trp53i11Q4QQM4 Nsd3-210ENSMUST00000153597 1865 ntTSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Trp53i11Q4QQM4 Slc7a1-201ENSMUST00000048116 7179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Trp53i11Q4QQM4 Ccdc129-201ENSMUST00000044729 3431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Trp53i11Q4QQM4 Tmem41b-202ENSMUST00000118429 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Trp53i11Q4QQM4 Capn15-204ENSMUST00000212149 4555 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Trp53i11Q4QQM4 Hipk2-204ENSMUST00000160360 3907 ntTSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Trp53i11Q4QQM4 Hjurp-201ENSMUST00000054674 4878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Trp53i11Q4QQM4 A530053M12Rik-201ENSMUST00000187918 1467 ntTSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Trp53i11Q4QQM4 Kdm4a-204ENSMUST00000106406 4663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Trp53i11Q4QQM4 Mgmt-201ENSMUST00000081510 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Trp53i11Q4QQM4 Pttg1-203ENSMUST00000101340 700 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Trp53i11Q4QQM4 Ctrc-202ENSMUST00000105781 784 ntTSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Trp53i11Q4QQM4 Zfp157-203ENSMUST00000110912 886 ntTSL 3 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Trp53i11Q4QQM4 Ppil2-202ENSMUST00000115719 838 ntTSL 2 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Trp53i11Q4QQM4 Pttg1-205ENSMUST00000118368 696 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Trp53i11Q4QQM4 Rbm18-202ENSMUST00000122456 781 ntTSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Trp53i11Q4QQM4 Elof1-202ENSMUST00000166335 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Trp53i11Q4QQM4 Gm17597-201ENSMUST00000181220 1115 ntTSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Trp53i11Q4QQM4 Gm27003-201ENSMUST00000182590 497 ntTSL 5 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Trp53i11Q4QQM4 9530020I12Rik-203ENSMUST00000219371 819 ntTSL 3 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Trp53i11Q4QQM4 Gm18556-201ENSMUST00000219748 1031 ntBASIC10.51□□□□□ -0.73
Trp53i11Q4QQM4 Olfr335-ps-201ENSMUST00000223545 939 ntAPPRIS P1 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Trp53i11Q4QQM4 AC129975.1-201ENSMUST00000224816 592 ntBASIC10.51□□□□□ -0.73
Trp53i11Q4QQM4 Sorcs1-202ENSMUST00000111756 3617 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Trp53i11Q4QQM4 Astn1-211ENSMUST00000195311 3642 ntTSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Trp53i11Q4QQM4 Sorcs1-207ENSMUST00000211008 3617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Trp53i11Q4QQM4 Tulp2-202ENSMUST00000085331 1525 ntTSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Trp53i11Q4QQM4 Fam198b-202ENSMUST00000118853 6729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Trp53i11Q4QQM4 Astn1-205ENSMUST00000193042 7248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Trp53i11Q4QQM4 Tnxb-201ENSMUST00000087399 12209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Trp53i11Q4QQM4 Ddx55-201ENSMUST00000071057 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Trp53i11Q4QQM4 Gm6024-201ENSMUST00000117850 1558 ntBASIC10.51□□□□□ -0.73
Trp53i11Q4QQM4 Gm31938-201ENSMUST00000218081 1818 ntTSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Trp53i11Q4QQM4 Hsh2d-201ENSMUST00000072097 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Trp53i11Q4QQM4 Inf2-201ENSMUST00000101029 4001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Trp53i11Q4QQM4 Slc43a1-204ENSMUST00000121114 3089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Trp53i11Q4QQM4 Nlrp6-201ENSMUST00000106045 3823 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Trp53i11Q4QQM4 Rad1-202ENSMUST00000100775 4085 ntTSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
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