Protein–RNA interactions for Protein: Q3V4B5

Commd6, COMM domain-containing protein 6, mousemouse

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Length 87 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Commd6Q3V4B5 AC093022.1-201ENSMUST00000226949 1072 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
Commd6Q3V4B5 Gm9826-201ENSMUST00000029124 1299 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
Commd6Q3V4B5 1700013F07Rik-201ENSMUST00000029485 661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Commd6Q3V4B5 Dnajc17-201ENSMUST00000038439 1008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Commd6Q3V4B5 Hist1h1b-201ENSMUST00000080511 743 ntAPPRIS P1 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Commd6Q3V4B5 Krtap19-1-201ENSMUST00000081334 493 ntAPPRIS P1 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Commd6Q3V4B5 Olfr584-201ENSMUST00000098210 964 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
Commd6Q3V4B5 Zfp932-201ENSMUST00000099484 451 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Commd6Q3V4B5 Pigc-205ENSMUST00000193784 4207 ntAPPRIS P1 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Commd6Q3V4B5 Spert-204ENSMUST00000169658 1474 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Commd6Q3V4B5 Nipbl-201ENSMUST00000052965 8815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Commd6Q3V4B5 Acsl6-208ENSMUST00000108899 1662 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Commd6Q3V4B5 Ikbkg-204ENSMUST00000114128 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Commd6Q3V4B5 Hars2-206ENSMUST00000152954 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Commd6Q3V4B5 Gria4-202ENSMUST00000063508 5352 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Commd6Q3V4B5 Dcun1d2-204ENSMUST00000110840 2853 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Commd6Q3V4B5 Tjp1-201ENSMUST00000032729 6102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Commd6Q3V4B5 AW549877-201ENSMUST00000046633 5076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Commd6Q3V4B5 Dpf2-202ENSMUST00000118623 2406 ntTSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Commd6Q3V4B5 Rpgrip1-202ENSMUST00000111603 5380 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Commd6Q3V4B5 4933409D19Rik-201ENSMUST00000193674 1557 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Commd6Q3V4B5 Ak8-201ENSMUST00000074156 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Commd6Q3V4B5 Polq-202ENSMUST00000071452 7290 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Commd6Q3V4B5 Fli1-201ENSMUST00000016231 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Commd6Q3V4B5 Top3a-204ENSMUST00000120417 2318 ntTSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Commd6Q3V4B5 Txlng-201ENSMUST00000041370 3862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Commd6Q3V4B5 Ccin-201ENSMUST00000095107 1941 ntAPPRIS P1 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Commd6Q3V4B5 Zfp68-201ENSMUST00000063262 2254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Commd6Q3V4B5 Zmynd8-205ENSMUST00000109266 5072 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Commd6Q3V4B5 Xirp1-201ENSMUST00000111635 5839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Commd6Q3V4B5 Fbxl18-202ENSMUST00000110766 7857 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Commd6Q3V4B5 Pear1-201ENSMUST00000029714 4260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Commd6Q3V4B5 Ppargc1b-201ENSMUST00000063307 3330 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Commd6Q3V4B5 Col20a1-202ENSMUST00000149179 3867 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Commd6Q3V4B5 Gpr149-201ENSMUST00000058535 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Commd6Q3V4B5 Flicr-201ENSMUST00000144719 3455 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Commd6Q3V4B5 Mkl1-204ENSMUST00000134469 4392 ntTSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Commd6Q3V4B5 Ppil6-201ENSMUST00000105507 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Commd6Q3V4B5 Gm22711-201ENSMUST00000116890 133 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
Commd6Q3V4B5 Arf4os-201ENSMUST00000166902 566 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Commd6Q3V4B5 Gng13-202ENSMUST00000172002 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Commd6Q3V4B5 Eloc-207ENSMUST00000187910 620 ntTSL 2 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Commd6Q3V4B5 Gm44136-201ENSMUST00000203819 1106 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
Commd6Q3V4B5 Gm19208-201ENSMUST00000213861 912 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
Commd6Q3V4B5 Gm10318-202ENSMUST00000217996 639 ntTSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Commd6Q3V4B5 Gm33979-201ENSMUST00000219486 691 ntTSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Commd6Q3V4B5 Fpr-rs3-201ENSMUST00000071189 1032 ntAPPRIS P1 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Commd6Q3V4B5 Klhl29-202ENSMUST00000218384 2716 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Commd6Q3V4B5 Myo9a-203ENSMUST00000128341 11985 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Commd6Q3V4B5 Rad51c-201ENSMUST00000007790 1632 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Commd6Q3V4B5 Cacna1c-226ENSMUST00000219833 7591 ntTSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Commd6Q3V4B5 Man2c1-201ENSMUST00000034836 3215 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Commd6Q3V4B5 Ttll7-205ENSMUST00000170055 6075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Commd6Q3V4B5 Mta1-202ENSMUST00000069690 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Commd6Q3V4B5 Cyp26b1-205ENSMUST00000205228 4288 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Commd6Q3V4B5 Nup50-201ENSMUST00000165443 4741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Commd6Q3V4B5 Gm10548-201ENSMUST00000097631 2629 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
Commd6Q3V4B5 Gpc6-202ENSMUST00000088483 3488 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Commd6Q3V4B5 Dgkh-201ENSMUST00000074729 3967 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Commd6Q3V4B5 Gm45532-201ENSMUST00000210342 3620 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
Commd6Q3V4B5 5830437K03Rik-201ENSMUST00000199219 1379 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
Commd6Q3V4B5 Nanog-201ENSMUST00000012540 2211 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Commd6Q3V4B5 Gmps-201ENSMUST00000029405 8105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Commd6Q3V4B5 Ntm-201ENSMUST00000075069 3022 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Commd6Q3V4B5 Zfp629-203ENSMUST00000122066 5850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Commd6Q3V4B5 Ass1-201ENSMUST00000102840 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Commd6Q3V4B5 AC154171.2-201ENSMUST00000225219 2652 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
Commd6Q3V4B5 Jmjd4-201ENSMUST00000045279 4315 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Commd6Q3V4B5 Lrrc8a-201ENSMUST00000095078 4301 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Commd6Q3V4B5 Med17-201ENSMUST00000034411 3964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Commd6Q3V4B5 Car12-202ENSMUST00000085420 3639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Commd6Q3V4B5 Prf1-201ENSMUST00000035419 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Commd6Q3V4B5 Sez6l-201ENSMUST00000075387 6055 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Commd6Q3V4B5 Zbtb21-203ENSMUST00000113734 6010 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Commd6Q3V4B5 Kcne2-202ENSMUST00000113971 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Commd6Q3V4B5 Inpp4a-208ENSMUST00000137266 2934 ntTSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Commd6Q3V4B5 Gm43152-201ENSMUST00000202495 1638 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
Commd6Q3V4B5 Dyrk4-202ENSMUST00000078521 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Commd6Q3V4B5 Unc79-202ENSMUST00000101099 8874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Commd6Q3V4B5 Gm21103-202ENSMUST00000170923 1761 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Commd6Q3V4B5 Nono-201ENSMUST00000033673 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Commd6Q3V4B5 Eif3d-201ENSMUST00000100484 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Commd6Q3V4B5 Slitrk4-202ENSMUST00000114679 3513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Commd6Q3V4B5 Rpl22-204ENSMUST00000139685 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Commd6Q3V4B5 Eif3i-201ENSMUST00000102593 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Commd6Q3V4B5 1810043G02Rik-202ENSMUST00000105398 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Commd6Q3V4B5 Mapkapk5-203ENSMUST00000111782 969 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Commd6Q3V4B5 Gm6506-201ENSMUST00000119775 1136 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
Commd6Q3V4B5 Spx-202ENSMUST00000126521 357 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Commd6Q3V4B5 Gm1667-201ENSMUST00000151651 558 ntTSL 3 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Commd6Q3V4B5 Gm16312-201ENSMUST00000156285 362 ntTSL 3 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Commd6Q3V4B5 Gm24074-201ENSMUST00000158178 260 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
Commd6Q3V4B5 Malat1-205ENSMUST00000174808 656 ntTSL 2 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Commd6Q3V4B5 Fkbp2-202ENSMUST00000177752 627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Commd6Q3V4B5 Mir7051-201ENSMUST00000184167 73 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
Commd6Q3V4B5 Mir6927-201ENSMUST00000184494 71 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
Commd6Q3V4B5 Mir6420-201ENSMUST00000185032 102 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
Commd6Q3V4B5 Gm29067-201ENSMUST00000190821 470 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
Commd6Q3V4B5 Gm37835-201ENSMUST00000193305 361 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
Commd6Q3V4B5 Gm37284-201ENSMUST00000193607 539 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.1 ms