Protein–RNA interactions for Protein: Q3UP44

Nhlrc4, NHL-repeat-containing protein 4, mousemouse

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Length 136 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nhlrc4Q3UP44 Src-204ENSMUST00000109531 3586 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Nhlrc4Q3UP44 Oprm1-222ENSMUST00000135502 1363 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Nhlrc4Q3UP44 Trim46-203ENSMUST00000107464 3252 ntTSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Nhlrc4Q3UP44 Zfp606-202ENSMUST00000123589 3509 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Nhlrc4Q3UP44 Olfr5-202ENSMUST00000209866 2980 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Nhlrc4Q3UP44 BC034090-201ENSMUST00000035914 3797 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Nhlrc4Q3UP44 Clip1-202ENSMUST00000063905 4589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Nhlrc4Q3UP44 Lpo-201ENSMUST00000103177 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Nhlrc4Q3UP44 Ccpg1-201ENSMUST00000037977 3151 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Nhlrc4Q3UP44 Pip5k1a-205ENSMUST00000107233 3663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Nhlrc4Q3UP44 Nckap5-212ENSMUST00000162877 2630 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Nhlrc4Q3UP44 Ckap2-201ENSMUST00000046916 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Nhlrc4Q3UP44 Zfp46-201ENSMUST00000069195 4639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Nhlrc4Q3UP44 Oprl1-204ENSMUST00000108767 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Nhlrc4Q3UP44 Tbata-203ENSMUST00000121297 1000 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Nhlrc4Q3UP44 Gm10169-201ENSMUST00000121822 348 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
Nhlrc4Q3UP44 Gm4879-201ENSMUST00000122190 1272 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
Nhlrc4Q3UP44 Rbm18-202ENSMUST00000122456 781 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Nhlrc4Q3UP44 4930571N24Rik-202ENSMUST00000142914 598 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Nhlrc4Q3UP44 Snhg17-205ENSMUST00000151331 529 ntTSL 2 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Nhlrc4Q3UP44 Gm16553-201ENSMUST00000160490 716 ntTSL 3 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Nhlrc4Q3UP44 Gm15996-201ENSMUST00000161925 762 ntTSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Nhlrc4Q3UP44 Gm28746-201ENSMUST00000187453 380 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
Nhlrc4Q3UP44 Gm29410-201ENSMUST00000188383 694 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
Nhlrc4Q3UP44 Gm34023-201ENSMUST00000195539 217 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
Nhlrc4Q3UP44 Polr1d-204ENSMUST00000200993 1167 ntTSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Nhlrc4Q3UP44 Gm44814-201ENSMUST00000207018 434 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
Nhlrc4Q3UP44 Omt2b-201ENSMUST00000043734 735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Nhlrc4Q3UP44 Ipo4-201ENSMUST00000047131 3846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Nhlrc4Q3UP44 Krtap4-13-201ENSMUST00000050106 815 ntAPPRIS P1 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Nhlrc4Q3UP44 Commd4-201ENSMUST00000065358 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Nhlrc4Q3UP44 Tmem220-202ENSMUST00000079077 1147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Nhlrc4Q3UP44 Gm25125-201ENSMUST00000083340 136 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
Nhlrc4Q3UP44 Wfdc6a-201ENSMUST00000099096 805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Nhlrc4Q3UP44 Gfm1-201ENSMUST00000077271 4078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Nhlrc4Q3UP44 Aldoa-202ENSMUST00000087566 1549 ntTSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Nhlrc4Q3UP44 Ackr2-202ENSMUST00000214340 3015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Nhlrc4Q3UP44 Pcnt-202ENSMUST00000217838 9341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Nhlrc4Q3UP44 Eya2-201ENSMUST00000063433 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Nhlrc4Q3UP44 E2f8-201ENSMUST00000058745 3691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Nhlrc4Q3UP44 Slc9a3-203ENSMUST00000221703 5118 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Nhlrc4Q3UP44 Gm16677-201ENSMUST00000181229 2174 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
Nhlrc4Q3UP44 Gm27174-201ENSMUST00000184493 2174 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
Nhlrc4Q3UP44 Sept9-202ENSMUST00000093907 3616 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
Nhlrc4Q3UP44 Ypel4-201ENSMUST00000090729 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
Nhlrc4Q3UP44 Ambra1-203ENSMUST00000099712 5021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
Nhlrc4Q3UP44 Mfsd4b5-203ENSMUST00000164566 2372 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
Nhlrc4Q3UP44 Ano10-203ENSMUST00000214409 2384 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
Nhlrc4Q3UP44 Usp13-201ENSMUST00000072312 7580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
Nhlrc4Q3UP44 Gfm2-202ENSMUST00000042084 3074 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
Nhlrc4Q3UP44 Gm6768-201ENSMUST00000022467 1878 ntBASIC10.15□□□□□ -0.79
Nhlrc4Q3UP44 Prkd2-202ENSMUST00000168093 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
Nhlrc4Q3UP44 Dusp22-202ENSMUST00000095914 3015 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
Nhlrc4Q3UP44 Cyp2j13-202ENSMUST00000097973 1648 ntTSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.79
Nhlrc4Q3UP44 Zcchc8-204ENSMUST00000196282 4350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Nhlrc4Q3UP44 Gm19027-201ENSMUST00000187291 1355 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
Nhlrc4Q3UP44 A1cf-202ENSMUST00000224304 2968 ntAPPRIS ALT1 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Nhlrc4Q3UP44 Crot-201ENSMUST00000003720 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Nhlrc4Q3UP44 Med12l-201ENSMUST00000029393 2295 ntTSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Nhlrc4Q3UP44 Ncstn-201ENSMUST00000003550 2901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Nhlrc4Q3UP44 Lamc2-203ENSMUST00000185356 4916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Nhlrc4Q3UP44 Mrgprd-201ENSMUST00000062163 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Nhlrc4Q3UP44 Adarb1-204ENSMUST00000105406 6662 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Nhlrc4Q3UP44 Mphosph10-201ENSMUST00000032735 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Nhlrc4Q3UP44 Chek1-202ENSMUST00000172702 3797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Nhlrc4Q3UP44 Ces4a-201ENSMUST00000161289 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Nhlrc4Q3UP44 Gm1110-201ENSMUST00000115261 1996 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Nhlrc4Q3UP44 Tax1bp1-201ENSMUST00000080723 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Nhlrc4Q3UP44 Pip5k1b-202ENSMUST00000112673 2387 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Nhlrc4Q3UP44 Tex2-201ENSMUST00000042780 4934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Nhlrc4Q3UP44 Tbc1d14-202ENSMUST00000124036 2765 ntTSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Nhlrc4Q3UP44 Cpne9-201ENSMUST00000041203 2777 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Nhlrc4Q3UP44 Mrpl55-205ENSMUST00000108787 718 ntTSL 2 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Nhlrc4Q3UP44 Gm12274-201ENSMUST00000120062 385 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
Nhlrc4Q3UP44 Gm12030-201ENSMUST00000121917 223 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
Nhlrc4Q3UP44 Gm12208-201ENSMUST00000122004 163 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
Nhlrc4Q3UP44 Gm38389-201ENSMUST00000147871 653 ntTSL 3 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Nhlrc4Q3UP44 B230119M05Rik-201ENSMUST00000154072 979 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Nhlrc4Q3UP44 AU015836-205ENSMUST00000163458 911 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Nhlrc4Q3UP44 Gm26918-201ENSMUST00000182496 728 ntTSL 2 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Nhlrc4Q3UP44 Gm7255-201ENSMUST00000187371 908 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
Nhlrc4Q3UP44 1700008A23Rik-201ENSMUST00000191694 691 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
Nhlrc4Q3UP44 Gm6677-201ENSMUST00000195100 441 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
Nhlrc4Q3UP44 Gm44545-201ENSMUST00000208262 746 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
Nhlrc4Q3UP44 Gm7972-202ENSMUST00000208453 505 ntTSL 3 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Nhlrc4Q3UP44 Gm45410-201ENSMUST00000211331 1093 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
Nhlrc4Q3UP44 Gm29787-201ENSMUST00000222129 849 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
Nhlrc4Q3UP44 Tff2-201ENSMUST00000024826 584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Nhlrc4Q3UP44 1810009A15Rik-201ENSMUST00000096251 806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Nhlrc4Q3UP44 Ctxn2-201ENSMUST00000099452 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Nhlrc4Q3UP44 Slc25a42-202ENSMUST00000110127 3196 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Nhlrc4Q3UP44 Pcdh12-203ENSMUST00000194012 2702 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Nhlrc4Q3UP44 Gm45041-201ENSMUST00000207366 3108 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
Nhlrc4Q3UP44 Wbp1l-201ENSMUST00000099376 3911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Nhlrc4Q3UP44 Ino80c-204ENSMUST00000153360 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Nhlrc4Q3UP44 Ldb3-202ENSMUST00000022328 2468 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Nhlrc4Q3UP44 Gm26672-201ENSMUST00000180922 2685 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Nhlrc4Q3UP44 Vstm2a-201ENSMUST00000109645 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Nhlrc4Q3UP44 Sema4c-202ENSMUST00000191642 3892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Nhlrc4Q3UP44 Gm8020-201ENSMUST00000170174 1406 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
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