Protein–RNA interactions for Protein: Q3UND0

Skap2, Src kinase-associated phosphoprotein 2, mousemouse

Predictions only

Length 358 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Skap2Q3UND0 Abcf3-201ENSMUST00000003319 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Skap2Q3UND0 Slc5a9-201ENSMUST00000102719 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Skap2Q3UND0 Adgrv1-206ENSMUST00000128120 1591 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Skap2Q3UND0 4933409D19Rik-201ENSMUST00000193674 1557 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Skap2Q3UND0 Il1rap-202ENSMUST00000096129 4438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Skap2Q3UND0 Oprm1-204ENSMUST00000063036 1427 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Skap2Q3UND0 Dynlrb1-202ENSMUST00000109682 684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Skap2Q3UND0 Gm6890-201ENSMUST00000114117 776 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Skap2Q3UND0 Gm16066-201ENSMUST00000118575 1086 ntTSL 3 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Skap2Q3UND0 Dixdc1-204ENSMUST00000118707 989 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Skap2Q3UND0 Gm16481-201ENSMUST00000119074 1227 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Skap2Q3UND0 Rtbdn-203ENSMUST00000121880 1223 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Skap2Q3UND0 Gm15891-201ENSMUST00000127307 611 ntTSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Skap2Q3UND0 Gm6963-201ENSMUST00000147879 379 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Skap2Q3UND0 Gm44805-202ENSMUST00000150569 587 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Skap2Q3UND0 Gm20426-201ENSMUST00000173657 440 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Skap2Q3UND0 Nr1h2-ps-201ENSMUST00000183844 478 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Skap2Q3UND0 Gm5244-202ENSMUST00000189517 743 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Skap2Q3UND0 Aprt-ps-201ENSMUST00000212311 505 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Skap2Q3UND0 Gm18730-201ENSMUST00000218038 343 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Skap2Q3UND0 Polr2d-201ENSMUST00000025106 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Skap2Q3UND0 Olfr323-201ENSMUST00000070804 972 ntAPPRIS P1 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Skap2Q3UND0 Olfr605-201ENSMUST00000080660 1011 ntAPPRIS P1 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Skap2Q3UND0 Gm6994-201ENSMUST00000088880 1163 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Skap2Q3UND0 Cox5a-201ENSMUST00000000090 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Skap2Q3UND0 Cfap74-209ENSMUST00000151083 5487 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Skap2Q3UND0 Csnk1g1-202ENSMUST00000117849 5173 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Skap2Q3UND0 Ikzf1-201ENSMUST00000018798 1542 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Skap2Q3UND0 Gm15983-201ENSMUST00000140000 4814 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Skap2Q3UND0 Gm29295-201ENSMUST00000190004 1371 ntTSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Skap2Q3UND0 Gm43375-201ENSMUST00000196705 2480 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Skap2Q3UND0 Kdelr1-205ENSMUST00000211716 1350 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Skap2Q3UND0 Gm8369-201ENSMUST00000079855 1374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Skap2Q3UND0 Cacna1s-201ENSMUST00000112064 6251 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Skap2Q3UND0 Spo11-203ENSMUST00000109126 1625 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Skap2Q3UND0 Cyp2d34-201ENSMUST00000109515 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Skap2Q3UND0 Mybpc3-201ENSMUST00000111430 4154 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Skap2Q3UND0 Myh1-201ENSMUST00000018637 5938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Skap2Q3UND0 Gm15997-201ENSMUST00000202188 1491 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Skap2Q3UND0 1110051M20Rik-202ENSMUST00000094835 1498 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Skap2Q3UND0 Arhgap24-203ENSMUST00000094559 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Skap2Q3UND0 Gm4846-201ENSMUST00000143922 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Skap2Q3UND0 Cd55b-201ENSMUST00000112488 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Skap2Q3UND0 Trhr2-201ENSMUST00000044123 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Skap2Q3UND0 Nedd9-202ENSMUST00000163623 4626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Skap2Q3UND0 Bora-201ENSMUST00000022656 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Skap2Q3UND0 Det1-202ENSMUST00000107431 1439 ntTSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Skap2Q3UND0 Cd72-204ENSMUST00000107925 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Skap2Q3UND0 Stx1b-201ENSMUST00000106267 4536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Skap2Q3UND0 Myl2-203ENSMUST00000111751 889 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Skap2Q3UND0 Ppil2-202ENSMUST00000115719 838 ntTSL 2 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Skap2Q3UND0 Gm13611-201ENSMUST00000118269 318 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Skap2Q3UND0 Dusp13-204ENSMUST00000120984 976 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Skap2Q3UND0 Olfr647-ps1-201ENSMUST00000121599 960 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Skap2Q3UND0 Gm10714-201ENSMUST00000131346 874 ntTSL 2 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Skap2Q3UND0 4930483J18Rik-202ENSMUST00000138715 1093 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Skap2Q3UND0 Gm13587-201ENSMUST00000152645 366 ntTSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Skap2Q3UND0 Gm22334-201ENSMUST00000158070 133 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Skap2Q3UND0 Fbxw4-203ENSMUST00000160003 387 ntTSL 3 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Skap2Q3UND0 Gm4310-201ENSMUST00000177847 889 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Skap2Q3UND0 Eloc-207ENSMUST00000187910 620 ntTSL 2 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Skap2Q3UND0 Gm37986-201ENSMUST00000193285 383 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Skap2Q3UND0 Gm43584-201ENSMUST00000199762 605 ntTSL 3 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Skap2Q3UND0 Gm8959-201ENSMUST00000213150 571 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Skap2Q3UND0 Ntan1-201ENSMUST00000023362 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Skap2Q3UND0 2410015M20Rik-201ENSMUST00000052832 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Skap2Q3UND0 Cldn17-201ENSMUST00000069549 1172 ntAPPRIS P1 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Skap2Q3UND0 Lyz1-201ENSMUST00000092162 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Skap2Q3UND0 Prph2-201ENSMUST00000024773 2665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Skap2Q3UND0 Col6a4-201ENSMUST00000121963 7371 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Skap2Q3UND0 Elmo3-201ENSMUST00000109375 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Skap2Q3UND0 Tcp10a-203ENSMUST00000129709 1778 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Skap2Q3UND0 Carmil2-203ENSMUST00000213019 4194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Skap2Q3UND0 Sparcl1-201ENSMUST00000031249 2759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Skap2Q3UND0 Exoc7-203ENSMUST00000106413 3298 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Skap2Q3UND0 Anxa9-202ENSMUST00000107183 1872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Skap2Q3UND0 Ankub1-202ENSMUST00000197088 1854 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Skap2Q3UND0 Cbl-211ENSMUST00000206720 11372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Skap2Q3UND0 Dnm2-202ENSMUST00000091087 3450 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Skap2Q3UND0 Fbxo39-201ENSMUST00000108504 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Skap2Q3UND0 A530053M12Rik-201ENSMUST00000187918 1467 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Skap2Q3UND0 Scn5a-202ENSMUST00000117911 8453 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Skap2Q3UND0 Sgk3-204ENSMUST00000171265 3680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Skap2Q3UND0 Fam90a1b-201ENSMUST00000044989 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Skap2Q3UND0 Gbp3-201ENSMUST00000029935 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Skap2Q3UND0 Kalrn-205ENSMUST00000114953 4722 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Skap2Q3UND0 Fam184b-201ENSMUST00000016023 4236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Skap2Q3UND0 Pklr-201ENSMUST00000047111 2787 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Skap2Q3UND0 5930430L01Rik-201ENSMUST00000145042 3994 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Skap2Q3UND0 Gm31816-202ENSMUST00000209591 1332 ntTSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Skap2Q3UND0 Spatc1l-201ENSMUST00000009259 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Skap2Q3UND0 Arhgap4-202ENSMUST00000114404 2895 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Skap2Q3UND0 Gm9962-202ENSMUST00000186595 1417 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Skap2Q3UND0 Myh1-202ENSMUST00000075734 6012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Skap2Q3UND0 S1pr2-201ENSMUST00000054197 6394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Skap2Q3UND0 Cux1-207ENSMUST00000176216 2821 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Skap2Q3UND0 Slc25a25-202ENSMUST00000052119 3529 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Skap2Q3UND0 St6galnac4-201ENSMUST00000102818 3626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Skap2Q3UND0 Lig3-212ENSMUST00000173727 3636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Skap2Q3UND0 Gripap1-203ENSMUST00000115675 3015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 53.2 ms