Protein–RNA interactions for Protein: Q0HA38

Ttc21b, Tetratricopeptide repeat protein 21B, mousemouse

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Length 1,315 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ttc21bQ0HA38 Rep15-201ENSMUST00000036194 1662 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ttc21bQ0HA38 Vangl1-208ENSMUST00000168312 1740 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ttc21bQ0HA38 Ppid-201ENSMUST00000029382 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ttc21bQ0HA38 Osbpl7-201ENSMUST00000090020 3771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ttc21bQ0HA38 Ccdc42-202ENSMUST00000102612 785 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ttc21bQ0HA38 Snora68-201ENSMUST00000104375 131 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Ttc21bQ0HA38 Gm14231-201ENSMUST00000120090 592 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Ttc21bQ0HA38 Gm829-201ENSMUST00000123741 465 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ttc21bQ0HA38 Gm16322-202ENSMUST00000141275 700 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ttc21bQ0HA38 Gm13267-202ENSMUST00000150099 281 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ttc21bQ0HA38 Gast-201ENSMUST00000017309 460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ttc21bQ0HA38 Gm37944-201ENSMUST00000194233 414 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Ttc21bQ0HA38 Gm38233-201ENSMUST00000194259 807 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Ttc21bQ0HA38 Gm5311-201ENSMUST00000203518 709 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Ttc21bQ0HA38 Map7-203ENSMUST00000213312 795 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ttc21bQ0HA38 Rps2-ps12-201ENSMUST00000214262 785 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Ttc21bQ0HA38 AC164087.2-201ENSMUST00000216206 1072 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Ttc21bQ0HA38 Ascl3-201ENSMUST00000035372 700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ttc21bQ0HA38 Gm9701-201ENSMUST00000077976 427 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Ttc21bQ0HA38 Armcx1-203ENSMUST00000113197 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ttc21bQ0HA38 Wbp1l-204ENSMUST00000138302 3900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ttc21bQ0HA38 A930006I01Rik-201ENSMUST00000139065 2229 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ttc21bQ0HA38 Gabpb1-206ENSMUST00000110425 4153 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ttc21bQ0HA38 Prkch-201ENSMUST00000021527 3545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ttc21bQ0HA38 Prss57-201ENSMUST00000020573 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ttc21bQ0HA38 Hdac5-203ENSMUST00000107151 4852 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ttc21bQ0HA38 Cdca8-202ENSMUST00000084296 1626 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ttc21bQ0HA38 Gm38111-201ENSMUST00000194817 2741 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Ttc21bQ0HA38 Myadm-202ENSMUST00000164553 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ttc21bQ0HA38 Sik2-205ENSMUST00000176663 4107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ttc21bQ0HA38 Sidt1-205ENSMUST00000136381 4404 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ttc21bQ0HA38 Gm2115-201ENSMUST00000180387 7055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ttc21bQ0HA38 Ugt1a7c-201ENSMUST00000058237 3231 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ttc21bQ0HA38 Vcp-201ENSMUST00000030164 3316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ttc21bQ0HA38 Apold1-201ENSMUST00000167323 3567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ttc21bQ0HA38 Dhx57-202ENSMUST00000086555 5077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ttc21bQ0HA38 Gm45206-201ENSMUST00000206885 2285 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Ttc21bQ0HA38 Ank2-221ENSMUST00000182994 2715 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ttc21bQ0HA38 Tfe3-204ENSMUST00000115677 2943 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ttc21bQ0HA38 Fam78b-202ENSMUST00000126198 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ttc21bQ0HA38 Bcl11a-201ENSMUST00000000881 3061 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ttc21bQ0HA38 Trak1-213ENSMUST00000211439 3533 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ttc21bQ0HA38 Gm5148-203ENSMUST00000108105 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ttc21bQ0HA38 Gm13281-201ENSMUST00000120871 567 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Ttc21bQ0HA38 Olfr1372-ps1-201ENSMUST00000121007 934 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Ttc21bQ0HA38 6430531B16Rik-202ENSMUST00000121412 1176 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ttc21bQ0HA38 Gm6425-201ENSMUST00000136332 790 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Ttc21bQ0HA38 Gm16227-201ENSMUST00000160088 563 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ttc21bQ0HA38 Gm4775-201ENSMUST00000169588 402 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Ttc21bQ0HA38 Gm27826-201ENSMUST00000175282 255 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Ttc21bQ0HA38 4930444A19Rik-202ENSMUST00000190007 633 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ttc21bQ0HA38 Pcdh7-207ENSMUST00000199310 659 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ttc21bQ0HA38 Gm17936-201ENSMUST00000199413 988 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Ttc21bQ0HA38 Gm43106-201ENSMUST00000199485 637 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Ttc21bQ0HA38 AC132384.2-201ENSMUST00000218018 526 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Ttc21bQ0HA38 Gm3791-201ENSMUST00000220790 768 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
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Ttc21bQ0HA38 Cblb-203ENSMUST00000226593 3864 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ttc21bQ0HA38 Sall3-201ENSMUST00000057950 6886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ttc21bQ0HA38 Sp3-202ENSMUST00000102689 4181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ttc21bQ0HA38 Dab2ip-205ENSMUST00000112986 5580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ttc21bQ0HA38 Mylip-202ENSMUST00000222178 1954 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ttc21bQ0HA38 Agxt2-204ENSMUST00000110542 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ttc21bQ0HA38 Gm43931-201ENSMUST00000204817 2870 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Ttc21bQ0HA38 Eif4enif1-204ENSMUST00000120721 2952 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ttc21bQ0HA38 Nnt-203ENSMUST00000109204 3198 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ttc21bQ0HA38 Psd3-213ENSMUST00000212505 3253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ttc21bQ0HA38 Rspo2-201ENSMUST00000063492 3338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ttc21bQ0HA38 Ppp1r3b-204ENSMUST00000211648 4386 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ttc21bQ0HA38 Cacnb2-203ENSMUST00000114723 3945 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Ttc21bQ0HA38 Rbm10-205ENSMUST00000115375 3698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Ttc21bQ0HA38 Hgs-203ENSMUST00000106205 2898 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
Ttc21bQ0HA38 Dab2-203ENSMUST00000110663 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Ttc21bQ0HA38 Got2-201ENSMUST00000034097 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Ttc21bQ0HA38 Best1-201ENSMUST00000117346 2080 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
Ttc21bQ0HA38 Atf3-203ENSMUST00000195117 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Ttc21bQ0HA38 Slc17a8-202ENSMUST00000105295 1863 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Ttc21bQ0HA38 Dhtkd1-202ENSMUST00000095147 5480 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
Ttc21bQ0HA38 Gab3-202ENSMUST00000114104 1705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
Ttc21bQ0HA38 Exosc9-201ENSMUST00000029269 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Ttc21bQ0HA38 Sntb2-203ENSMUST00000212524 9945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ttc21bQ0HA38 Fhl1-202ENSMUST00000114768 1337 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ttc21bQ0HA38 Pxdn-202ENSMUST00000122328 6614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ttc21bQ0HA38 Pxmp4-202ENSMUST00000109703 560 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ttc21bQ0HA38 Il15ra-203ENSMUST00000114831 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ttc21bQ0HA38 Lypla1-202ENSMUST00000115529 930 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ttc21bQ0HA38 Gm13326-201ENSMUST00000118730 1011 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Ttc21bQ0HA38 Gm14639-201ENSMUST00000120850 866 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Ttc21bQ0HA38 Sgcg-202ENSMUST00000121148 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ttc21bQ0HA38 Bola3-203ENSMUST00000122216 554 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ttc21bQ0HA38 Gm12853-201ENSMUST00000134971 442 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ttc21bQ0HA38 Gm15341-201ENSMUST00000137315 592 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ttc21bQ0HA38 Gm17207-201ENSMUST00000168686 645 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ttc21bQ0HA38 1700026J14Rik-201ENSMUST00000180937 794 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ttc21bQ0HA38 Gm29304-201ENSMUST00000186555 695 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Ttc21bQ0HA38 Trav18-202ENSMUST00000186573 325 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ttc21bQ0HA38 Psmb6-ps2-201ENSMUST00000187074 705 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Ttc21bQ0HA38 Gm29223-201ENSMUST00000188867 695 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Ttc21bQ0HA38 Gm37921-201ENSMUST00000194333 695 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Ttc21bQ0HA38 Gm29808-201ENSMUST00000194419 468 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 62.7 ms