Protein–RNA interactions for Protein: Q04886

Sox8, Transcription factor SOX-8, mousemouse

Predictions only

Length 464 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sox8Q04886 Gm13022-201ENSMUST00000121181 285 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
Sox8Q04886 Gm14165-201ENSMUST00000121456 952 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
Sox8Q04886 Gm27191-201ENSMUST00000145973 448 ntTSL 3 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Sox8Q04886 Ubl5-211ENSMUST00000162303 505 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Sox8Q04886 Gm20441-201ENSMUST00000173512 756 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Sox8Q04886 2610027F03Rik-202ENSMUST00000186982 603 ntTSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Sox8Q04886 AC154572.1-201ENSMUST00000226098 1204 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
Sox8Q04886 Gm26670-202ENSMUST00000226862 340 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
Sox8Q04886 AC134793.1-202ENSMUST00000227444 803 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
Sox8Q04886 Nnmt-201ENSMUST00000034808 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Sox8Q04886 AF529169-201ENSMUST00000044491 7202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Sox8Q04886 Lxn-201ENSMUST00000058981 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Sox8Q04886 Myl9-201ENSMUST00000088552 1128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Sox8Q04886 Magee2-201ENSMUST00000033575 2316 ntAPPRIS P1 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Sox8Q04886 Fam222b-203ENSMUST00000155571 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Sox8Q04886 2610028H24Rik-202ENSMUST00000105415 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Sox8Q04886 Platr19-201ENSMUST00000171380 1466 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Sox8Q04886 E330023G01Rik-201ENSMUST00000186387 1483 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Sox8Q04886 BC052040-201ENSMUST00000110918 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Sox8Q04886 4930517G19Rik-201ENSMUST00000206152 1676 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
Sox8Q04886 Ypel4-201ENSMUST00000090729 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Sox8Q04886 Fam109b-203ENSMUST00000161178 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Sox8Q04886 Nacc2-202ENSMUST00000114159 6675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Sox8Q04886 Lin54-210ENSMUST00000154921 3734 ntTSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Sox8Q04886 Gm8020-201ENSMUST00000170174 1406 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Sox8Q04886 Cops3-201ENSMUST00000019517 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Sox8Q04886 Gem-202ENSMUST00000108304 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Sox8Q04886 Sec22b-201ENSMUST00000029476 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Sox8Q04886 Dis3l-201ENSMUST00000068367 3605 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Sox8Q04886 Mrvi1-202ENSMUST00000125758 5953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Sox8Q04886 Dcaf8-202ENSMUST00000191689 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Sox8Q04886 Kdelc1-201ENSMUST00000027213 1765 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Sox8Q04886 Ebf3-202ENSMUST00000106118 3736 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Sox8Q04886 Flrt1-201ENSMUST00000113383 5859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Sox8Q04886 Ptprr-206ENSMUST00000148731 2511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Sox8Q04886 S100pbp-203ENSMUST00000106059 4084 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Sox8Q04886 Tceanc-202ENSMUST00000112188 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Sox8Q04886 AC122273.1-201ENSMUST00000213634 2327 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
Sox8Q04886 Rgs6-222ENSMUST00000202210 3069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Sox8Q04886 Serpine1-202ENSMUST00000077523 2697 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Sox8Q04886 Tctn1-201ENSMUST00000111738 5717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Sox8Q04886 1700019D03Rik-201ENSMUST00000050567 3641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Sox8Q04886 AC160411.1-201ENSMUST00000218544 4560 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Sox8Q04886 Aldoa-202ENSMUST00000087566 1549 ntTSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Sox8Q04886 Phf24-202ENSMUST00000107975 6494 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Sox8Q04886 Lrrc36-201ENSMUST00000067305 2082 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Sox8Q04886 Rnf17-201ENSMUST00000095793 5264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Sox8Q04886 Pyurf-201ENSMUST00000053386 3573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Sox8Q04886 Als2cl-201ENSMUST00000084926 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Sox8Q04886 Ing1-206ENSMUST00000210740 1866 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Sox8Q04886 Fntb-201ENSMUST00000041008 2613 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Sox8Q04886 Etfrf1-201ENSMUST00000039729 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Sox8Q04886 Ces2d-ps-201ENSMUST00000043209 1656 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
Sox8Q04886 Arhgap33-201ENSMUST00000044338 4280 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Sox8Q04886 Stom-201ENSMUST00000028241 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Sox8Q04886 Gm15784-201ENSMUST00000120260 1462 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
Sox8Q04886 Fam234b-202ENSMUST00000111916 2927 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Sox8Q04886 Jmjd4-202ENSMUST00000108777 4351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Sox8Q04886 Scp2-202ENSMUST00000106701 772 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Sox8Q04886 Gm16876-201ENSMUST00000151945 760 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Sox8Q04886 Gm37590-201ENSMUST00000193294 603 ntTSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Sox8Q04886 Gm43249-201ENSMUST00000200464 458 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
Sox8Q04886 Psenen-203ENSMUST00000207747 669 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Sox8Q04886 Gm45609-204ENSMUST00000209837 1207 ntTSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Sox8Q04886 Prss51-204ENSMUST00000224112 1042 ntAPPRIS P1 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Sox8Q04886 1700012P22Rik-201ENSMUST00000030323 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Sox8Q04886 Eif4ebp3-201ENSMUST00000036765 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Sox8Q04886 Adck1-201ENSMUST00000101165 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Sox8Q04886 Cdc20b-203ENSMUST00000181117 1608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Sox8Q04886 Evl-204ENSMUST00000172409 1955 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Sox8Q04886 Fam110b-201ENSMUST00000054857 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Sox8Q04886 Fkbp15-204ENSMUST00000107461 2337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Sox8Q04886 Fastkd5-201ENSMUST00000110262 3015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Sox8Q04886 Dmbt1-201ENSMUST00000084509 6243 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Sox8Q04886 Gm26510-201ENSMUST00000180468 1796 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Sox8Q04886 Kng2-203ENSMUST00000115349 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Sox8Q04886 Vstm2a-202ENSMUST00000109647 1745 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Sox8Q04886 Spata5-202ENSMUST00000108112 3295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Sox8Q04886 Ubtf-202ENSMUST00000079589 3286 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Sox8Q04886 Igf1-207ENSMUST00000122386 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Sox8Q04886 Gm2128-201ENSMUST00000108009 2560 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
Sox8Q04886 Hbs1l-209ENSMUST00000219915 2733 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Sox8Q04886 Kat7-203ENSMUST00000103159 3248 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Sox8Q04886 Cacna1c-205ENSMUST00000112825 7577 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Sox8Q04886 Pgghg-204ENSMUST00000164580 3001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Sox8Q04886 Sgk2-201ENSMUST00000018012 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Sox8Q04886 Dlec1-206ENSMUST00000140326 5815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Sox8Q04886 Tfr2-204ENSMUST00000196471 2839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Sox8Q04886 Wdr43-201ENSMUST00000047086 3450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Sox8Q04886 Ppp2r2cos-201ENSMUST00000152862 1491 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Sox8Q04886 Gtf2ird1-207ENSMUST00000111245 3299 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Sox8Q04886 Tbl1xr1-211ENSMUST00000202747 4209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Sox8Q04886 Sept9-205ENSMUST00000106354 3869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Sox8Q04886 Tpra1-219ENSMUST00000203345 3359 ntTSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Sox8Q04886 Ptpn14-202ENSMUST00000097442 10746 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Sox8Q04886 Gm25880-201ENSMUST00000104331 132 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Sox8Q04886 Fmr1nb-203ENSMUST00000114647 679 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Sox8Q04886 Gm11619-201ENSMUST00000117474 237 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Sox8Q04886 Selenot-ps-201ENSMUST00000119098 593 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Sox8Q04886 Gm14213-201ENSMUST00000119778 768 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 55.2 ms