Protein–RNA interactions for Protein: Q01231

Gja5, Gap junction alpha-5 protein, mousemouse

Predictions only

Length 358 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gja5Q01231 Gm12224-201ENSMUST00000124047 567 ntTSL 2 BASIC13.18□□□□□ -0.3
Gja5Q01231 Gm12254-201ENSMUST00000134617 471 ntBASIC13.18□□□□□ -0.3
Gja5Q01231 4930571N24Rik-202ENSMUST00000142914 598 ntTSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Gja5Q01231 Rrm2b-207ENSMUST00000146821 420 ntTSL 5 BASIC13.18□□□□□ -0.3
Gja5Q01231 Gm16894-201ENSMUST00000181756 842 ntTSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Gja5Q01231 Mir7088-201ENSMUST00000184227 86 ntBASIC13.18□□□□□ -0.3
Gja5Q01231 2310034O05Rik-201ENSMUST00000185221 1107 ntTSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Gja5Q01231 Gm31678-201ENSMUST00000198262 454 ntTSL 3 BASIC13.18□□□□□ -0.3
Gja5Q01231 Gm43667-201ENSMUST00000198616 1095 ntBASIC13.18□□□□□ -0.3
Gja5Q01231 Pcdh7-207ENSMUST00000199310 659 ntTSL 2 BASIC13.18□□□□□ -0.3
Gja5Q01231 Gm36355-201ENSMUST00000203752 639 ntTSL 3 BASIC13.18□□□□□ -0.3
Gja5Q01231 Saa-ps-201ENSMUST00000211148 320 ntBASIC13.18□□□□□ -0.3
Gja5Q01231 Tnfrsf14-205ENSMUST00000219534 1173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Gja5Q01231 CU025215.1-201ENSMUST00000222986 603 ntBASIC13.18□□□□□ -0.3
Gja5Q01231 AC165260.2-201ENSMUST00000225371 395 ntBASIC13.18□□□□□ -0.3
Gja5Q01231 CT009713.2-201ENSMUST00000225532 1149 ntBASIC13.18□□□□□ -0.3
Gja5Q01231 Mrps18b-201ENSMUST00000025305 1079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Gja5Q01231 Prg2-201ENSMUST00000028467 838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Gja5Q01231 Atf7-201ENSMUST00000096143 390 ntBASIC13.18□□□□□ -0.3
Gja5Q01231 Mcu-201ENSMUST00000009791 1079 ntTSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Gja5Q01231 Tmem200a-201ENSMUST00000066049 4115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Gja5Q01231 Rgs12-202ENSMUST00000087684 4713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.18□□□□□ -0.3
Gja5Q01231 Chml-201ENSMUST00000104984 6905 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.18□□□□□ -0.3
Gja5Q01231 Chml-202ENSMUST00000209720 6905 ntTSL 5 BASIC13.18□□□□□ -0.3
Gja5Q01231 Dnm1-202ENSMUST00000091089 3764 ntTSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Gja5Q01231 Pex2-201ENSMUST00000059021 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Gja5Q01231 Cdc37l1-208ENSMUST00000225310 4079 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.18□□□□□ -0.3
Gja5Q01231 Wwp2-201ENSMUST00000166615 4314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Gja5Q01231 Ccnk-202ENSMUST00000221167 2789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Gja5Q01231 Ppnr-201ENSMUST00000190974 3525 ntTSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Gja5Q01231 Rab11fip2-202ENSMUST00000170819 1539 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.18□□□□□ -0.3
Gja5Q01231 Ddx56-201ENSMUST00000004507 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Gja5Q01231 Fastkd3-201ENSMUST00000051784 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Gja5Q01231 BC052040-201ENSMUST00000110918 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Gja5Q01231 Brd4-201ENSMUST00000003726 5955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Gja5Q01231 Gm11525-201ENSMUST00000134436 2804 ntTSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Gja5Q01231 AC122228.1-201ENSMUST00000223113 2057 ntTSL 5 BASIC13.17□□□□□ -0.3
Gja5Q01231 Acsm2-202ENSMUST00000098084 2099 ntTSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Gja5Q01231 2610001J05Rik-203ENSMUST00000185219 1606 ntAPPRIS P1 BASIC13.17□□□□□ -0.3
Gja5Q01231 1110051M20Rik-202ENSMUST00000094835 1498 ntTSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Gja5Q01231 Gfra2-203ENSMUST00000227697 1323 ntBASIC13.17□□□□□ -0.3
Gja5Q01231 Tfe3-204ENSMUST00000115677 2943 ntTSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Gja5Q01231 Flywch1-201ENSMUST00000045517 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Gja5Q01231 Asap1-203ENSMUST00000110115 4535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.17□□□□□ -0.3
Gja5Q01231 Fam214a-205ENSMUST00000215370 4205 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.17□□□□□ -0.3
Gja5Q01231 Sgk1-203ENSMUST00000100036 2476 ntTSL 5 BASIC13.17□□□□□ -0.3
Gja5Q01231 Sgk1-201ENSMUST00000020145 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Gja5Q01231 Sltm-206ENSMUST00000216816 3755 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.17□□□□□ -0.3
Gja5Q01231 Ppip5k1-202ENSMUST00000110625 5226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.17□□□□□ -0.3
Gja5Q01231 Dcaf12l1-202ENSMUST00000115056 3495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Gja5Q01231 Samd14-201ENSMUST00000055947 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Gja5Q01231 Fcgr2b-204ENSMUST00000159969 1578 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Gja5Q01231 Gm29245-201ENSMUST00000187332 1416 ntBASIC13.17□□□□□ -0.3
Gja5Q01231 Rpl17-ps1-201ENSMUST00000119156 552 ntBASIC13.17□□□□□ -0.3
Gja5Q01231 Gm12972-201ENSMUST00000152986 1006 ntTSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Gja5Q01231 C130080G10Rik-204ENSMUST00000155185 954 ntTSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Gja5Q01231 Gm36980-201ENSMUST00000195643 622 ntBASIC13.17□□□□□ -0.3
Gja5Q01231 Gm42375-201ENSMUST00000206226 745 ntTSL 5 BASIC13.17□□□□□ -0.3
Gja5Q01231 Gm19605-205ENSMUST00000221712 677 ntTSL 3 BASIC13.17□□□□□ -0.3
Gja5Q01231 AC127583.1-201ENSMUST00000224351 540 ntBASIC13.17□□□□□ -0.3
Gja5Q01231 Srp14-201ENSMUST00000009693 798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Gja5Q01231 Pprc1-201ENSMUST00000062322 5205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Gja5Q01231 Slc6a12-209ENSMUST00000171008 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.17□□□□□ -0.3
Gja5Q01231 Gm30504-201ENSMUST00000209316 1688 ntTSL 5 BASIC13.17□□□□□ -0.3
Gja5Q01231 Lgi4-201ENSMUST00000039775 4037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Gja5Q01231 Wdfy1-204ENSMUST00000113512 4551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Gja5Q01231 Wdfy1-205ENSMUST00000113513 4551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.17□□□□□ -0.3
Gja5Q01231 Wdfy1-206ENSMUST00000113514 4551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Gja5Q01231 Wdfy1-207ENSMUST00000113515 4551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Gja5Q01231 Map3k11-201ENSMUST00000004156 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Gja5Q01231 Trak1-213ENSMUST00000211439 3533 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Gja5Q01231 Wt1os-203ENSMUST00000172701 2960 ntTSL 2 BASIC13.17□□□□□ -0.3
Gja5Q01231 Ikzf2-202ENSMUST00000187184 2013 ntTSL 5 BASIC13.17□□□□□ -0.3
Gja5Q01231 Pacsin1-201ENSMUST00000045896 4190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Gja5Q01231 Rwdd3-204ENSMUST00000106466 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Gja5Q01231 Rspo3-201ENSMUST00000092623 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Gja5Q01231 Cyb561d1-203ENSMUST00000106655 4275 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Gja5Q01231 Dcaf8-201ENSMUST00000074144 4656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Gja5Q01231 Foxd2os-201ENSMUST00000123272 2908 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Gja5Q01231 Gm27194-201ENSMUST00000175753 2936 ntBASIC13.16□□□□□ -0.3
Gja5Q01231 Traf3ip3-201ENSMUST00000043550 2122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Gja5Q01231 AC154537.1-201ENSMUST00000226101 1304 ntBASIC13.16□□□□□ -0.3
Gja5Q01231 Fbxo18-201ENSMUST00000071564 3567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Gja5Q01231 Vrtn-201ENSMUST00000095551 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Gja5Q01231 Tunar-201ENSMUST00000180458 3282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Gja5Q01231 Nanog-201ENSMUST00000012540 2211 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Gja5Q01231 Cars-202ENSMUST00000105909 2462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Gja5Q01231 Suox-201ENSMUST00000054764 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Gja5Q01231 Tulp2-210ENSMUST00000210868 1664 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Gja5Q01231 Gm9-201ENSMUST00000101636 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Gja5Q01231 Rps6-201ENSMUST00000102814 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Gja5Q01231 Snora68-201ENSMUST00000104375 131 ntBASIC13.16□□□□□ -0.3
Gja5Q01231 4930412O13Rik-202ENSMUST00000114919 558 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Gja5Q01231 Gm16480-201ENSMUST00000120439 832 ntBASIC13.16□□□□□ -0.3
Gja5Q01231 Gm13869-201ENSMUST00000146978 1054 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Gja5Q01231 Gm16283-201ENSMUST00000149935 522 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Gja5Q01231 Gm11655-201ENSMUST00000153899 765 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Gja5Q01231 Gm28826-201ENSMUST00000190006 488 ntTSL 2 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Gja5Q01231 Gm38103-201ENSMUST00000191707 864 ntBASIC13.16□□□□□ -0.3
Gja5Q01231 1700113A16Rik-203ENSMUST00000200006 563 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.6 ms