Protein–RNA interactions for Protein: P82976

Gbx1, Homeobox protein GBX-1, mousemouse

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Length 418 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gbx1P82976 Oas1d-201ENSMUST00000044224 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Gbx1P82976 Gm13398-201ENSMUST00000149378 2837 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Gbx1P82976 Uhrf1-202ENSMUST00000113035 3402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Gbx1P82976 Sel1l-201ENSMUST00000021347 6300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Gbx1P82976 Reps1-210ENSMUST00000164556 2537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Gbx1P82976 Togaram1-207ENSMUST00000223166 6386 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Gbx1P82976 C130060K24Rik-203ENSMUST00000170608 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Gbx1P82976 2410002F23Rik-204ENSMUST00000107948 2908 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Gbx1P82976 Ece1-201ENSMUST00000102518 4816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Gbx1P82976 Pcsk9-201ENSMUST00000049507 3521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Gbx1P82976 Ntrk2-207ENSMUST00000225488 4706 ntAPPRIS P1 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Gbx1P82976 Ccdc24-206ENSMUST00000164853 3990 ntTSL 2 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Gbx1P82976 Slc1a2-201ENSMUST00000005220 2127 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Gbx1P82976 Zfp652-201ENSMUST00000091565 2663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Gbx1P82976 Anks1b-218ENSMUST00000182595 3715 ntTSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Gbx1P82976 1700018A04Rik-204ENSMUST00000221561 2569 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Gbx1P82976 Immt-206ENSMUST00000166975 2469 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Gbx1P82976 4833422M21Rik-203ENSMUST00000181747 1365 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Gbx1P82976 Cfap54-201ENSMUST00000020200 2473 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Gbx1P82976 Ttc23-201ENSMUST00000032774 2492 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Gbx1P82976 Lgals4-201ENSMUST00000066723 1384 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Gbx1P82976 Rpe65-202ENSMUST00000196999 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Gbx1P82976 Aak1-201ENSMUST00000003710 7203 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Gbx1P82976 Gpc6-202ENSMUST00000088483 3488 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Gbx1P82976 Slc9a8-201ENSMUST00000047815 4521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Gbx1P82976 Myom3-201ENSMUST00000105854 5575 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Gbx1P82976 Khnyn-201ENSMUST00000022831 3898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Gbx1P82976 Gm15074-201ENSMUST00000117603 936 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
Gbx1P82976 Gm13183-201ENSMUST00000118615 789 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
Gbx1P82976 Gm11836-201ENSMUST00000121022 441 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
Gbx1P82976 Gm13166-201ENSMUST00000123828 940 ntTSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Gbx1P82976 Gm7666-201ENSMUST00000146631 819 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
Gbx1P82976 Cideb-201ENSMUST00000001497 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Gbx1P82976 Gm13236-201ENSMUST00000153010 940 ntTSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Gbx1P82976 Gm28516-201ENSMUST00000190257 663 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Gbx1P82976 Pdcd5-ps-201ENSMUST00000191699 381 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
Gbx1P82976 Gm43186-201ENSMUST00000198130 824 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
Gbx1P82976 Tnfsf13b-201ENSMUST00000033892 1239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Gbx1P82976 Crabp2-201ENSMUST00000005019 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Gbx1P82976 Eef1d-203ENSMUST00000089680 973 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Gbx1P82976 Scml2-206ENSMUST00000112345 4847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Gbx1P82976 Arhgap24-204ENSMUST00000112852 2783 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Gbx1P82976 AC174678.2-201ENSMUST00000156420 3275 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Gbx1P82976 Dkk2-201ENSMUST00000029665 3705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Gbx1P82976 Bace2-201ENSMUST00000047275 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Gbx1P82976 Gm21358-201ENSMUST00000191645 1659 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
Gbx1P82976 Slc4a8-204ENSMUST00000162049 3532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Gbx1P82976 Mgl2-205ENSMUST00000165951 1635 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Gbx1P82976 Anxa4-202ENSMUST00000113675 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Gbx1P82976 1810053B23Rik-205ENSMUST00000188056 1592 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Gbx1P82976 Scaf1-201ENSMUST00000085383 4293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Gbx1P82976 Bcl11a-204ENSMUST00000118955 1505 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Gbx1P82976 Hspa5-201ENSMUST00000028222 3672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Gbx1P82976 Kir3dl2-202ENSMUST00000113108 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Gbx1P82976 Ddr1-212ENSMUST00000166980 3627 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Gbx1P82976 Nfya-201ENSMUST00000046719 3645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Gbx1P82976 Gm37651-201ENSMUST00000194679 1494 ntBASIC10.42□□□□□ -0.74
Gbx1P82976 Scyl2-204ENSMUST00000174252 4817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Gbx1P82976 Usp17le-202ENSMUST00000211384 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Gbx1P82976 Gm36445-201ENSMUST00000209344 1432 ntTSL 5 BASIC10.42□□□□□ -0.74
Gbx1P82976 Olfr582-203ENSMUST00000211036 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.42□□□□□ -0.74
Gbx1P82976 Zc3hc1-201ENSMUST00000080812 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Gbx1P82976 Idua-203ENSMUST00000119212 3022 ntTSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Gbx1P82976 Gm12799-201ENSMUST00000118151 2560 ntBASIC10.42□□□□□ -0.74
Gbx1P82976 Vmn1r193-202ENSMUST00000227457 6429 ntAPPRIS P1 BASIC10.42□□□□□ -0.74
Gbx1P82976 Timeless-201ENSMUST00000055539 4457 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Gbx1P82976 Wbp1l-204ENSMUST00000138302 3900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Gbx1P82976 Ass1-201ENSMUST00000102840 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Gbx1P82976 Ido1-202ENSMUST00000110667 1656 ntTSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Gbx1P82976 Kcne2-201ENSMUST00000047383 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Gbx1P82976 Srrm4-202ENSMUST00000139425 2798 ntTSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Gbx1P82976 Gm26642-201ENSMUST00000180981 2782 ntTSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Gbx1P82976 Gm14592-201ENSMUST00000117201 560 ntBASIC10.42□□□□□ -0.74
Gbx1P82976 Gm15352-201ENSMUST00000118696 270 ntBASIC10.42□□□□□ -0.74
Gbx1P82976 4933403O08Rik-201ENSMUST00000132037 999 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Gbx1P82976 Cfap100-204ENSMUST00000134224 849 ntTSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Gbx1P82976 Bcas3os2-201ENSMUST00000134305 661 ntTSL 5 BASIC10.42□□□□□ -0.74
Gbx1P82976 Smim5-203ENSMUST00000152171 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Gbx1P82976 Gm24992-201ENSMUST00000157412 130 ntBASIC10.42□□□□□ -0.74
Gbx1P82976 Gm24074-201ENSMUST00000158178 260 ntBASIC10.42□□□□□ -0.74
Gbx1P82976 Gm28982-201ENSMUST00000186895 512 ntTSL 3 BASIC10.42□□□□□ -0.74
Gbx1P82976 Gm28745-201ENSMUST00000190069 305 ntBASIC10.42□□□□□ -0.74
Gbx1P82976 Rpl7a-ps10-201ENSMUST00000190579 798 ntBASIC10.42□□□□□ -0.74
Gbx1P82976 Gm37981-201ENSMUST00000194280 535 ntBASIC10.42□□□□□ -0.74
Gbx1P82976 Atraid-205ENSMUST00000201136 894 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC10.42□□□□□ -0.74
Gbx1P82976 Gm18056-201ENSMUST00000207670 568 ntBASIC10.42□□□□□ -0.74
Gbx1P82976 Gm18061-201ENSMUST00000208350 562 ntBASIC10.42□□□□□ -0.74
Gbx1P82976 Gm18063-201ENSMUST00000208529 568 ntBASIC10.42□□□□□ -0.74
Gbx1P82976 Gm18052-201ENSMUST00000208750 559 ntBASIC10.42□□□□□ -0.74
Gbx1P82976 Tm2d2-202ENSMUST00000210536 727 ntTSL 3 BASIC10.42□□□□□ -0.74
Gbx1P82976 Ccdc28b-201ENSMUST00000030586 879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Gbx1P82976 Fpr-rs3-201ENSMUST00000071189 1032 ntAPPRIS P1 BASIC10.42□□□□□ -0.74
Gbx1P82976 Rpl34-202ENSMUST00000079085 480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Gbx1P82976 Rpl7a-ps3-201ENSMUST00000090170 796 ntBASIC10.42□□□□□ -0.74
Gbx1P82976 Prl6a1-201ENSMUST00000091679 1093 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.42□□□□□ -0.74
Gbx1P82976 Prl6a1-202ENSMUST00000091680 868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Gbx1P82976 Rpl7a-ps5-201ENSMUST00000095218 807 ntAPPRIS P1 BASIC10.42□□□□□ -0.74
Gbx1P82976 Apbb1-217ENSMUST00000191011 2712 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Gbx1P82976 Kcnma1-205ENSMUST00000145596 12094 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.42□□□□□ -0.74
Gbx1P82976 Top3a-204ENSMUST00000120417 2318 ntTSL 5 BASIC10.42□□□□□ -0.74
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.1 ms