Protein–RNA interactions for Protein: P81066

Irx2, Iroquois-class homeodomain protein IRX-2, mousemouse

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Length 474 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Irx2P81066 Gm24245-201ENSMUST00000157318 57 ntBASIC11.18□□□□□ -0.62
Irx2P81066 Gng2-205ENSMUST00000161247 419 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.18□□□□□ -0.62
Irx2P81066 Bhmt-ps1-201ENSMUST00000178743 1224 ntBASIC11.18□□□□□ -0.62
Irx2P81066 Gm10535-201ENSMUST00000182275 915 ntTSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Irx2P81066 Gm5745-201ENSMUST00000183748 313 ntBASIC11.18□□□□□ -0.62
Irx2P81066 Gm29152-201ENSMUST00000189284 325 ntTSL 5 BASIC11.18□□□□□ -0.62
Irx2P81066 H2-Bl-209ENSMUST00000194244 862 ntTSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Irx2P81066 AC158516.1-201ENSMUST00000213921 205 ntTSL 5 BASIC11.18□□□□□ -0.62
Irx2P81066 Chchd1-203ENSMUST00000224633 557 ntBASIC11.18□□□□□ -0.62
Irx2P81066 AC238811.3-201ENSMUST00000225422 709 ntBASIC11.18□□□□□ -0.62
Irx2P81066 Nmur1-201ENSMUST00000027440 1218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Irx2P81066 Tatdn3-201ENSMUST00000027945 1196 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.18□□□□□ -0.62
Irx2P81066 Tm2d3-201ENSMUST00000032726 908 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Irx2P81066 Upk2-201ENSMUST00000047740 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Irx2P81066 Tmem107-201ENSMUST00000075980 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Irx2P81066 Olfr91-201ENSMUST00000087144 939 ntAPPRIS P1 BASIC11.18□□□□□ -0.62
Irx2P81066 Ccdc58-201ENSMUST00000099937 747 ntTSL 3 BASIC11.18□□□□□ -0.62
Irx2P81066 Rabgef1-201ENSMUST00000026390 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Irx2P81066 Nifk-201ENSMUST00000027626 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Irx2P81066 Clec12b-201ENSMUST00000032261 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Irx2P81066 Stxbp5-202ENSMUST00000125200 3300 ntTSL 5 BASIC11.18□□□□□ -0.62
Irx2P81066 Gm44510-201ENSMUST00000206288 4532 ntBASIC11.18□□□□□ -0.62
Irx2P81066 Sfi1-201ENSMUST00000066391 3898 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.18□□□□□ -0.62
Irx2P81066 Wfdc8-202ENSMUST00000109338 1794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Irx2P81066 5730403I07Rik-201ENSMUST00000183878 2033 ntTSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Irx2P81066 Clec4g-201ENSMUST00000058040 1441 ntTSL 5 BASIC11.18□□□□□ -0.62
Irx2P81066 Cd74-202ENSMUST00000097563 1410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Irx2P81066 A730018C14Rik-201ENSMUST00000050754 2253 ntTSL 2 BASIC11.18□□□□□ -0.62
Irx2P81066 Agrn-203ENSMUST00000105575 7262 ntTSL 5 BASIC11.17□□□□□ -0.62
Irx2P81066 Ctc1-201ENSMUST00000021278 4164 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Irx2P81066 Prkd3-204ENSMUST00000119284 4743 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Irx2P81066 Gm5114-201ENSMUST00000108017 3047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Irx2P81066 Pcdhga7-202ENSMUST00000193476 3044 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.17□□□□□ -0.62
Irx2P81066 Klhl18-205ENSMUST00000198400 4638 ntTSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Irx2P81066 Ilf3-203ENSMUST00000213518 3513 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Irx2P81066 Tox4-201ENSMUST00000022766 5350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.17□□□□□ -0.62
Irx2P81066 Arid2-201ENSMUST00000096250 8507 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.17□□□□□ -0.62
Irx2P81066 Actg2-201ENSMUST00000075161 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Irx2P81066 Osmr-201ENSMUST00000022746 5491 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Irx2P81066 Mybph-201ENSMUST00000038445 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Irx2P81066 B430010I23Rik-201ENSMUST00000123703 2349 ntTSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Irx2P81066 Usp28-203ENSMUST00000213874 4109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Irx2P81066 Hcrt-202ENSMUST00000107360 509 ntTSL 5 BASIC11.17□□□□□ -0.62
Irx2P81066 Eif5a-205ENSMUST00000108608 775 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.17□□□□□ -0.62
Irx2P81066 Haghl-211ENSMUST00000150324 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Irx2P81066 Gm13832-202ENSMUST00000151159 370 ntTSL 3 BASIC11.17□□□□□ -0.62
Irx2P81066 Gm20495-201ENSMUST00000173902 235 ntBASIC11.17□□□□□ -0.62
Irx2P81066 Gm3764-203ENSMUST00000180635 1191 ntTSL 5 BASIC11.17□□□□□ -0.62
Irx2P81066 Ndufaf8-202ENSMUST00000185558 427 ntTSL 5 BASIC11.17□□□□□ -0.62
Irx2P81066 Mturn-202ENSMUST00000187701 503 ntTSL 5 BASIC11.17□□□□□ -0.62
Irx2P81066 Panct2-202ENSMUST00000188631 625 ntTSL 3 BASIC11.17□□□□□ -0.62
Irx2P81066 2810405F17Rik-201ENSMUST00000189334 1117 ntBASIC11.17□□□□□ -0.62
Irx2P81066 Ighv1-15-201ENSMUST00000192077 351 ntAPPRIS P1 BASIC11.17□□□□□ -0.62
Irx2P81066 Dnd1-ps-201ENSMUST00000196992 964 ntBASIC11.17□□□□□ -0.62
Irx2P81066 Gm43349-201ENSMUST00000200047 503 ntTSL 2 BASIC11.17□□□□□ -0.62
Irx2P81066 Gm8463-201ENSMUST00000208573 613 ntBASIC11.17□□□□□ -0.62
Irx2P81066 Txndc17-201ENSMUST00000021158 981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Irx2P81066 AC158605.1-202ENSMUST00000217860 540 ntTSL 2 BASIC11.17□□□□□ -0.62
Irx2P81066 AC124732.2-201ENSMUST00000221977 316 ntBASIC11.17□□□□□ -0.62
Irx2P81066 4930578I06Rik-201ENSMUST00000022532 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Irx2P81066 Tnfrsf17-201ENSMUST00000023140 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Irx2P81066 Rdh5-201ENSMUST00000026406 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Irx2P81066 Pcdhb19-201ENSMUST00000059571 7138 ntAPPRIS P1 BASIC11.17□□□□□ -0.62
Irx2P81066 Col6a3-201ENSMUST00000056925 10106 ntTSL 5 BASIC11.17□□□□□ -0.62
Irx2P81066 Ccdc148-201ENSMUST00000077687 3977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Irx2P81066 Rfx6-202ENSMUST00000122922 3464 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.17□□□□□ -0.62
Irx2P81066 Cd300lg-203ENSMUST00000107164 2737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Irx2P81066 Gabpa-202ENSMUST00000114184 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Irx2P81066 Tubd1-203ENSMUST00000108030 1964 ntTSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Irx2P81066 Hacl1-214ENSMUST00000167175 1739 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.17□□□□□ -0.62
Irx2P81066 Gm15784-201ENSMUST00000120260 1462 ntBASIC11.17□□□□□ -0.62
Irx2P81066 Zscan30-202ENSMUST00000224144 1458 ntBASIC11.17□□□□□ -0.62
Irx2P81066 Gm12758-201ENSMUST00000127010 4175 ntTSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Irx2P81066 Gpr85-202ENSMUST00000115491 2165 ntAPPRIS P1 BASIC11.17□□□□□ -0.62
Irx2P81066 Shroom2-202ENSMUST00000101141 7494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Irx2P81066 Ccdc15-204ENSMUST00000216042 1669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Irx2P81066 Slc25a17-201ENSMUST00000023040 1667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Irx2P81066 Gm3765-201ENSMUST00000130985 1447 ntBASIC11.17□□□□□ -0.62
Irx2P81066 Srgap3-202ENSMUST00000088373 8887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Irx2P81066 Gm9979-201ENSMUST00000069457 3005 ntTSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Irx2P81066 Gpatch4-201ENSMUST00000029707 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Irx2P81066 Nell1-202ENSMUST00000107603 2756 ntTSL 5 BASIC11.16□□□□□ -0.62
Irx2P81066 Rnft2-201ENSMUST00000117177 4381 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Irx2P81066 Klk13-201ENSMUST00000066834 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Irx2P81066 Gm43764-201ENSMUST00000202553 3172 ntBASIC11.16□□□□□ -0.62
Irx2P81066 Rpa1-201ENSMUST00000000767 2942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Irx2P81066 Atp5g1-201ENSMUST00000090541 4715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Irx2P81066 Zeb1-201ENSMUST00000025081 5805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Irx2P81066 Arid3b-201ENSMUST00000004780 3785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Irx2P81066 Ldhb-201ENSMUST00000032373 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Irx2P81066 Sun1-203ENSMUST00000100517 1522 ntTSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Irx2P81066 Pfkm-202ENSMUST00000163507 2816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.16□□□□□ -0.62
Irx2P81066 Tnfaip8-212ENSMUST00000179937 2385 ntTSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Irx2P81066 Ccdc116-202ENSMUST00000115709 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Irx2P81066 Mafg-203ENSMUST00000106181 840 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.16□□□□□ -0.62
Irx2P81066 Rhox2b-201ENSMUST00000115191 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Irx2P81066 Mrps17-205ENSMUST00000119985 859 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.16□□□□□ -0.62
Irx2P81066 Rab10os-207ENSMUST00000179924 823 ntTSL 5 BASIC11.16□□□□□ -0.62
Irx2P81066 Gm24694-201ENSMUST00000180054 110 ntBASIC11.16□□□□□ -0.62
Irx2P81066 Gm27663-201ENSMUST00000184839 110 ntBASIC11.16□□□□□ -0.62
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39 ms