Protein–RNA interactions for Protein: P62274

Rps29, 40S ribosomal protein S29, mousemouse

Predictions only

Length 56 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rps29P62274 Nme6-206ENSMUST00000197627 905 ntTSL 3 BASIC6.23□□□□□ -1.41
Rps29P62274 Gm42657-201ENSMUST00000201746 211 ntBASIC6.23□□□□□ -1.41
Rps29P62274 Gm3017-201ENSMUST00000203603 1126 ntBASIC6.23□□□□□ -1.41
Rps29P62274 Gm44126-201ENSMUST00000204831 514 ntBASIC6.23□□□□□ -1.41
Rps29P62274 Pet100-203ENSMUST00000207389 363 ntTSL 2 BASIC6.23□□□□□ -1.41
Rps29P62274 Gm44545-201ENSMUST00000208262 746 ntBASIC6.23□□□□□ -1.41
Rps29P62274 Gm45592-201ENSMUST00000209605 1043 ntBASIC6.23□□□□□ -1.41
Rps29P62274 Gm45670-201ENSMUST00000211382 711 ntTSL 1 (best) BASIC6.23□□□□□ -1.41
Rps29P62274 Ly86-201ENSMUST00000021860 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.23□□□□□ -1.41
Rps29P62274 Gm8255-201ENSMUST00000218693 305 ntBASIC6.23□□□□□ -1.41
Rps29P62274 AC123694.1-201ENSMUST00000219525 644 ntTSL 5 BASIC6.23□□□□□ -1.41
Rps29P62274 2310039L15Rik-203ENSMUST00000220058 727 ntTSL 5 BASIC6.23□□□□□ -1.41
Rps29P62274 AC102847.1-202ENSMUST00000226313 1245 ntBASIC6.23□□□□□ -1.41
Rps29P62274 Ntan1-201ENSMUST00000023362 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.23□□□□□ -1.41
Rps29P62274 Tctex1d1-201ENSMUST00000030248 977 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.23□□□□□ -1.41
Rps29P62274 Smco2-201ENSMUST00000032433 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.23□□□□□ -1.41
Rps29P62274 Rbbp5-202ENSMUST00000187505 1977 ntTSL 5 BASIC6.23□□□□□ -1.41
Rps29P62274 Hnrnph2-205ENSMUST00000113203 2315 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.23□□□□□ -1.41
Rps29P62274 1700061G19Rik-201ENSMUST00000025048 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.23□□□□□ -1.41
Rps29P62274 Uimc1-201ENSMUST00000026997 2931 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.23□□□□□ -1.41
Rps29P62274 Rnf13-210ENSMUST00000200497 2573 ntTSL 1 (best) BASIC6.23□□□□□ -1.41
Rps29P62274 Col6a4-201ENSMUST00000121963 7371 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.23□□□□□ -1.41
Rps29P62274 Tfdp2-204ENSMUST00000179065 2213 ntTSL 1 (best) BASIC6.23□□□□□ -1.41
Rps29P62274 Gm6768-201ENSMUST00000022467 1878 ntBASIC6.23□□□□□ -1.41
Rps29P62274 Pappa-201ENSMUST00000084501 11027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.23□□□□□ -1.41
Rps29P62274 Aldoa-202ENSMUST00000087566 1549 ntTSL 5 BASIC6.23□□□□□ -1.41
Rps29P62274 Ablim2-206ENSMUST00000114206 3528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.23□□□□□ -1.41
Rps29P62274 Limd1-201ENSMUST00000026269 4848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.23□□□□□ -1.41
Rps29P62274 Clic4-201ENSMUST00000037099 4119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.23□□□□□ -1.41
Rps29P62274 Dzip1l-202ENSMUST00000112884 3791 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.23□□□□□ -1.41
Rps29P62274 Fyn-207ENSMUST00000146287 2135 ntTSL 1 (best) BASIC6.23□□□□□ -1.41
Rps29P62274 Ttpa-201ENSMUST00000098244 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.23□□□□□ -1.41
Rps29P62274 Rbm4b-201ENSMUST00000036744 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.23□□□□□ -1.41
Rps29P62274 Elovl7-201ENSMUST00000022207 4013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.23□□□□□ -1.41
Rps29P62274 6030443J06Rik-201ENSMUST00000181209 2380 ntTSL 1 (best) BASIC6.23□□□□□ -1.41
Rps29P62274 Axl-201ENSMUST00000002677 4265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.23□□□□□ -1.41
Rps29P62274 Srek1-201ENSMUST00000074616 3934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.23□□□□□ -1.41
Rps29P62274 Tiam1-214ENSMUST00000164263 3569 ntTSL 1 (best) BASIC6.23□□□□□ -1.41
Rps29P62274 AC113282.5-201ENSMUST00000224330 1679 ntAPPRIS P1 BASIC6.23□□□□□ -1.41
Rps29P62274 Iqsec1-201ENSMUST00000101151 6490 ntTSL 5 BASIC6.23□□□□□ -1.41
Rps29P62274 Cep128-210ENSMUST00000141429 4807 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.23□□□□□ -1.41
Rps29P62274 A230009B12Rik-202ENSMUST00000159602 1810 ntTSL 1 (best) BASIC6.22□□□□□ -1.41
Rps29P62274 Nox4-201ENSMUST00000032781 3753 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.22□□□□□ -1.41
Rps29P62274 A930016O22Rik-202ENSMUST00000208685 2349 ntTSL 1 (best) BASIC6.22□□□□□ -1.41
Rps29P62274 Herc6-201ENSMUST00000031817 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.22□□□□□ -1.41
Rps29P62274 Rin1-201ENSMUST00000025818 4184 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.22□□□□□ -1.41
Rps29P62274 A530032D15Rik-201ENSMUST00000160792 1492 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.22□□□□□ -1.41
Rps29P62274 Ecsit-203ENSMUST00000179422 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.22□□□□□ -1.41
Rps29P62274 Zfat-205ENSMUST00000162173 3561 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.22□□□□□ -1.41
Rps29P62274 Mgat1-203ENSMUST00000109194 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.22□□□□□ -1.41
Rps29P62274 Ank2-221ENSMUST00000182994 2715 ntTSL 1 (best) BASIC6.22□□□□□ -1.41
Rps29P62274 Sel1l-201ENSMUST00000021347 6300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.22□□□□□ -1.41
Rps29P62274 Gm26584-201ENSMUST00000180551 3216 ntTSL 5 BASIC6.22□□□□□ -1.41
Rps29P62274 Bach2-201ENSMUST00000037416 3462 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.22□□□□□ -1.41
Rps29P62274 Zc3hc1-202ENSMUST00000102992 1865 ntTSL 1 (best) BASIC6.22□□□□□ -1.41
Rps29P62274 Gm38271-201ENSMUST00000192296 1603 ntBASIC6.22□□□□□ -1.41
Rps29P62274 D430013B06Rik-201ENSMUST00000192922 1872 ntBASIC6.22□□□□□ -1.41
Rps29P62274 Gm37058-201ENSMUST00000193393 1644 ntBASIC6.22□□□□□ -1.41
Rps29P62274 H2-T3-201ENSMUST00000025312 2114 ntTSL 1 (best) BASIC6.22□□□□□ -1.41
Rps29P62274 Scn10a-201ENSMUST00000084787 6416 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC6.22□□□□□ -1.41
Rps29P62274 Rnasel-204ENSMUST00000182538 2761 ntTSL 1 (best) BASIC6.22□□□□□ -1.41
Rps29P62274 Mcam-202ENSMUST00000098852 2772 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.22□□□□□ -1.41
Rps29P62274 Gm15651-201ENSMUST00000159953 2507 ntTSL 1 (best) BASIC6.22□□□□□ -1.41
Rps29P62274 Gtf2a1-202ENSMUST00000063314 2265 ntTSL 1 (best) BASIC6.22□□□□□ -1.41
Rps29P62274 Mybpc3-203ENSMUST00000169776 4163 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC6.22□□□□□ -1.41
Rps29P62274 5330417C22Rik-202ENSMUST00000106625 5836 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.22□□□□□ -1.41
Rps29P62274 Fosb-205ENSMUST00000208326 3654 ntTSL 5 BASIC6.22□□□□□ -1.41
Rps29P62274 Gm15984-202ENSMUST00000156466 1534 ntTSL 1 (best) BASIC6.22□□□□□ -1.41
Rps29P62274 Zfp157-203ENSMUST00000110912 886 ntTSL 3 BASIC6.22□□□□□ -1.41
Rps29P62274 1700071K01Rik-201ENSMUST00000117522 819 ntBASIC6.22□□□□□ -1.41
Rps29P62274 C1qtnf7-202ENSMUST00000121872 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.22□□□□□ -1.41
Rps29P62274 Gm14665-201ENSMUST00000122294 557 ntBASIC6.22□□□□□ -1.41
Rps29P62274 Gm28037-201ENSMUST00000122365 611 ntTSL 3 BASIC6.22□□□□□ -1.41
Rps29P62274 Hmgn2-208ENSMUST00000136327 772 ntTSL 2 BASIC6.22□□□□□ -1.41
Rps29P62274 B230119M05Rik-201ENSMUST00000154072 979 ntTSL 1 (best) BASIC6.22□□□□□ -1.41
Rps29P62274 Gm4982-201ENSMUST00000160440 1098 ntBASIC6.22□□□□□ -1.41
Rps29P62274 Gm20536-201ENSMUST00000172588 406 ntTSL 3 BASIC6.22□□□□□ -1.41
Rps29P62274 Gm26555-201ENSMUST00000180452 1037 ntTSL 1 (best) BASIC6.22□□□□□ -1.41
Rps29P62274 Gm26982-201ENSMUST00000182250 1151 ntBASIC6.22□□□□□ -1.41
Rps29P62274 Mir6998-201ENSMUST00000183343 64 ntBASIC6.22□□□□□ -1.41
Rps29P62274 Gm5100-201ENSMUST00000195631 589 ntBASIC6.22□□□□□ -1.41
Rps29P62274 Olfr1358-201ENSMUST00000204477 1064 ntAPPRIS P1 BASIC6.22□□□□□ -1.41
Rps29P62274 Gm31520-203ENSMUST00000204874 647 ntTSL 3 BASIC6.22□□□□□ -1.41
Rps29P62274 BX649293.1-201ENSMUST00000227437 631 ntBASIC6.22□□□□□ -1.41
Rps29P62274 Prrxl1-205ENSMUST00000228878 723 ntBASIC6.22□□□□□ -1.41
Rps29P62274 Fam3b-201ENSMUST00000049721 853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.22□□□□□ -1.41
Rps29P62274 Rnf181-202ENSMUST00000069595 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.22□□□□□ -1.41
Rps29P62274 Naca-201ENSMUST00000073868 885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.22□□□□□ -1.41
Rps29P62274 Tdpoz3-201ENSMUST00000081780 1098 ntAPPRIS P1 BASIC6.22□□□□□ -1.41
Rps29P62274 Vmn1r212-201ENSMUST00000095960 1164 ntAPPRIS P1 BASIC6.22□□□□□ -1.41
Rps29P62274 Wfdc6a-201ENSMUST00000099096 805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.22□□□□□ -1.41
Rps29P62274 Ctxn2-201ENSMUST00000099452 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.22□□□□□ -1.41
Rps29P62274 Olfr1047-201ENSMUST00000099901 960 ntAPPRIS P1 BASIC6.22□□□□□ -1.41
Rps29P62274 Gm20758-201ENSMUST00000220339 2171 ntTSL 1 (best) BASIC6.22□□□□□ -1.41
Rps29P62274 Lbh-201ENSMUST00000024857 3064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.22□□□□□ -1.41
Rps29P62274 Cd93-201ENSMUST00000099269 6677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.22□□□□□ -1.41
Rps29P62274 Dido1-204ENSMUST00000103055 4613 ntTSL 1 (best) BASIC6.22□□□□□ -1.41
Rps29P62274 Copz1-201ENSMUST00000100162 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.22□□□□□ -1.41
Rps29P62274 Pom121l2-201ENSMUST00000017126 2960 ntAPPRIS P4 BASIC6.22□□□□□ -1.41
Rps29P62274 Tmem181b-ps-201ENSMUST00000167717 1413 ntBASIC6.22□□□□□ -1.41
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 54.3 ms