Protein–RNA interactions for Protein: P55088

Aqp4, Aquaporin-4, mousemouse

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Length 323 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Aqp4P55088 Gpm6b-207ENSMUST00000112229 3203 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Aqp4P55088 Allc-202ENSMUST00000110917 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Aqp4P55088 Fam47e-203ENSMUST00000146417 1357 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Aqp4P55088 Tubgcp5-205ENSMUST00000205796 3448 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Aqp4P55088 Rnpc3-201ENSMUST00000092154 3888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Aqp4P55088 Ptprt-204ENSMUST00000109445 12082 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Aqp4P55088 Adar-204ENSMUST00000118341 2399 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Aqp4P55088 Tsix-202ENSMUST00000211291 3263 ntTSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Aqp4P55088 Oprm1-230ENSMUST00000154906 2039 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Aqp4P55088 Slc22a14-204ENSMUST00000170400 2110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Aqp4P55088 Abl2-202ENSMUST00000166172 10151 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Aqp4P55088 Dhcr7-211ENSMUST00000207143 1652 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Aqp4P55088 2810454H06Rik-201ENSMUST00000189942 3148 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
Aqp4P55088 Gm34785-201ENSMUST00000222571 4582 ntTSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Aqp4P55088 Ehd2-201ENSMUST00000098799 5119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Aqp4P55088 Trim17-201ENSMUST00000047697 3664 ntTSL 2 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Aqp4P55088 Arhgap17-202ENSMUST00000106442 3336 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Aqp4P55088 Clip3-201ENSMUST00000014065 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Aqp4P55088 Ccdc15-202ENSMUST00000213633 3331 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Aqp4P55088 Echdc1-201ENSMUST00000020034 3856 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Aqp4P55088 Plekhm1-201ENSMUST00000041272 5968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Aqp4P55088 Zscan12-203ENSMUST00000225545 4405 ntAPPRIS P1 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Aqp4P55088 Card14-201ENSMUST00000053245 3958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Aqp4P55088 Nrap-204ENSMUST00000166203 5079 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Aqp4P55088 C1rb-201ENSMUST00000184647 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Aqp4P55088 Klhl18-205ENSMUST00000198400 4638 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Aqp4P55088 4933439C10Rik-203ENSMUST00000132226 3184 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Aqp4P55088 Vamp5-203ENSMUST00000206154 2619 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Aqp4P55088 Ube2l3-201ENSMUST00000090192 2609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Aqp4P55088 Rpap2-201ENSMUST00000065422 2268 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Aqp4P55088 Ntm-201ENSMUST00000075069 3022 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Aqp4P55088 1700036A12Rik-202ENSMUST00000190053 1828 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Aqp4P55088 Eif3d-201ENSMUST00000100484 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Aqp4P55088 Scn10a-204ENSMUST00000214408 5877 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Aqp4P55088 Vwce-201ENSMUST00000055115 3540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Aqp4P55088 Tatdn3-203ENSMUST00000110891 1214 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Aqp4P55088 Tatdn3-204ENSMUST00000110893 1242 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Aqp4P55088 Pom121l12-201ENSMUST00000117584 1039 ntAPPRIS P1 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Aqp4P55088 Gm8111-201ENSMUST00000117659 987 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
Aqp4P55088 Gm15711-201ENSMUST00000118889 535 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
Aqp4P55088 Got2-ps1-201ENSMUST00000121655 1293 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
Aqp4P55088 Gm12050-201ENSMUST00000127483 615 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Aqp4P55088 Gm13822-201ENSMUST00000127563 346 ntTSL 3 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Aqp4P55088 Gm12690-201ENSMUST00000132108 354 ntTSL 3 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Aqp4P55088 Gm15201-201ENSMUST00000136472 1210 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Aqp4P55088 5730437C11Rik-201ENSMUST00000155540 242 ntTSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Aqp4P55088 Pyy-204ENSMUST00000177304 551 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Aqp4P55088 Gm29585-203ENSMUST00000188089 835 ntTSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Aqp4P55088 Gm28071-201ENSMUST00000190355 478 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
Aqp4P55088 Gpx1-204ENSMUST00000193987 653 ntTSL 3 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Aqp4P55088 Gm6108-201ENSMUST00000208365 367 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
Aqp4P55088 Gm13097-201ENSMUST00000210722 397 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
Aqp4P55088 Gm45338-206ENSMUST00000211460 1155 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Aqp4P55088 Hspb2-202ENSMUST00000217159 552 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Aqp4P55088 Nppc-201ENSMUST00000027449 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Aqp4P55088 3300002I08Rik-201ENSMUST00000051153 650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Aqp4P55088 Asb18-202ENSMUST00000097656 788 ntTSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Aqp4P55088 Slc16a7-202ENSMUST00000105257 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Aqp4P55088 Asb8-204ENSMUST00000143400 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Aqp4P55088 Akr1b8-201ENSMUST00000038406 1358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Aqp4P55088 Dnm2-202ENSMUST00000091087 3450 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Aqp4P55088 Gatsl2-201ENSMUST00000016088 7367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Aqp4P55088 Slit2-202ENSMUST00000170109 7758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Aqp4P55088 Slit2-217ENSMUST00000174421 7785 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Aqp4P55088 Smpd4-218ENSMUST00000170273 2166 ntTSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Aqp4P55088 AC144938.1-201ENSMUST00000223994 2167 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
Aqp4P55088 Arih2-201ENSMUST00000013338 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Aqp4P55088 Zfp775-203ENSMUST00000204095 4143 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Aqp4P55088 Dnajc14-202ENSMUST00000217745 4133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Aqp4P55088 Tex11-202ENSMUST00000113716 2591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Aqp4P55088 Ccdc136-202ENSMUST00000115275 3279 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Aqp4P55088 Adh4-201ENSMUST00000013458 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.71
Aqp4P55088 Rnft2-201ENSMUST00000117177 4381 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Aqp4P55088 Gm43152-201ENSMUST00000202495 1638 ntBASIC10.58□□□□□ -0.72
Aqp4P55088 Gm13561-201ENSMUST00000136879 1826 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Aqp4P55088 Nrros-204ENSMUST00000126869 2540 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Aqp4P55088 Wipf1-203ENSMUST00000102680 4032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Aqp4P55088 Nampt-201ENSMUST00000020886 4527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Aqp4P55088 Spata31d1a-203ENSMUST00000224982 5325 ntAPPRIS P1 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Aqp4P55088 Mical2-202ENSMUST00000050149 6669 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Aqp4P55088 Prss57-201ENSMUST00000020573 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Aqp4P55088 Krt33b-201ENSMUST00000073890 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Aqp4P55088 Brsk1-204ENSMUST00000205666 1398 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Aqp4P55088 Gm12218-201ENSMUST00000117666 399 ntBASIC10.58□□□□□ -0.72
Aqp4P55088 Mrpl40-202ENSMUST00000119273 778 ntTSL 3 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Aqp4P55088 Gm13665-201ENSMUST00000120830 528 ntBASIC10.58□□□□□ -0.72
Aqp4P55088 Gm13388-201ENSMUST00000126659 425 ntTSL 3 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Aqp4P55088 Agtpbp1-213ENSMUST00000167096 508 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Aqp4P55088 Ssty2-201ENSMUST00000179136 684 ntAPPRIS P1 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Aqp4P55088 Mir8109-201ENSMUST00000184375 117 ntBASIC10.58□□□□□ -0.72
Aqp4P55088 Gm29539-201ENSMUST00000188031 758 ntTSL 3 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Aqp4P55088 Ssty2-202ENSMUST00000190565 1216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Aqp4P55088 Gm44967-201ENSMUST00000207047 631 ntBASIC10.58□□□□□ -0.72
Aqp4P55088 Scoc-203ENSMUST00000212031 409 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Aqp4P55088 Mt2-202ENSMUST00000212806 388 ntTSL 2 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Aqp4P55088 Tex35-201ENSMUST00000027884 909 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Aqp4P55088 Naa10-201ENSMUST00000033763 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Aqp4P55088 Rnase2b-201ENSMUST00000075648 759 ntAPPRIS P1 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Aqp4P55088 Chrm1-202ENSMUST00000163785 6271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Aqp4P55088 Ing3-202ENSMUST00000115389 2546 ntTSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.7 ms