Protein–RNA interactions for Protein: P50405

Sftpb, Pulmonary surfactant-associated protein B, mousemouse

Predictions only

Length 377 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SftpbP50405 Ncapd3-205ENSMUST00000216677 5149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
SftpbP50405 Smarca2-201ENSMUST00000025862 5921 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
SftpbP50405 Snhg17-203ENSMUST00000141809 1553 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
SftpbP50405 4933409D19Rik-201ENSMUST00000193674 1557 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
SftpbP50405 Tacc2-205ENSMUST00000207282 3464 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
SftpbP50405 Avil-201ENSMUST00000026500 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
SftpbP50405 Gm15808-201ENSMUST00000119046 604 ntBASIC11.3□□□□□ -0.6
SftpbP50405 Timm22-202ENSMUST00000120699 746 ntTSL 3 BASIC11.3□□□□□ -0.6
SftpbP50405 1700001G11Rik-203ENSMUST00000153646 764 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
SftpbP50405 Arid3b-204ENSMUST00000164010 1259 ntTSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
SftpbP50405 Hcfc1r1-203ENSMUST00000180140 693 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC11.3□□□□□ -0.6
SftpbP50405 Gm27341-201ENSMUST00000183570 106 ntBASIC11.3□□□□□ -0.6
SftpbP50405 Gm42588-201ENSMUST00000200538 1297 ntBASIC11.3□□□□□ -0.6
SftpbP50405 Gm6905-201ENSMUST00000205729 511 ntBASIC11.3□□□□□ -0.6
SftpbP50405 Gm18856-203ENSMUST00000222015 483 ntTSL 2 BASIC11.3□□□□□ -0.6
SftpbP50405 Gm40983-201ENSMUST00000222524 502 ntTSL 3 BASIC11.3□□□□□ -0.6
SftpbP50405 Olfr887-201ENSMUST00000074681 930 ntAPPRIS P1 BASIC11.3□□□□□ -0.6
SftpbP50405 Srgap3-202ENSMUST00000088373 8887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
SftpbP50405 Mageb4-201ENSMUST00000096378 2401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
SftpbP50405 Dnajb6-203ENSMUST00000114839 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
SftpbP50405 Srrm4-202ENSMUST00000139425 2798 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
SftpbP50405 Bahcc1-203ENSMUST00000122148 10712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
SftpbP50405 Gm20646-201ENSMUST00000176807 1316 ntTSL 3 BASIC11.3□□□□□ -0.6
SftpbP50405 Zp3-201ENSMUST00000005073 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
SftpbP50405 Hsd3b6-201ENSMUST00000029463 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
SftpbP50405 Xirp1-201ENSMUST00000111635 5839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
SftpbP50405 Sirpa-204ENSMUST00000103203 3674 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
SftpbP50405 Cnppd1-202ENSMUST00000168720 3669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
SftpbP50405 Aktip-203ENSMUST00000120349 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
SftpbP50405 Fam118b-202ENSMUST00000063782 1662 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
SftpbP50405 Arhgap33-204ENSMUST00000207860 4396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
SftpbP50405 Nup50-201ENSMUST00000165443 4741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
SftpbP50405 Anxa7-201ENSMUST00000065504 2851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
SftpbP50405 Orc4-201ENSMUST00000028098 4066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
SftpbP50405 Ikbkg-204ENSMUST00000114128 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.29□□□□□ -0.6
SftpbP50405 Sult1a1-201ENSMUST00000106371 1370 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
SftpbP50405 Sult1a1-202ENSMUST00000106372 1369 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
SftpbP50405 Sorbs3-201ENSMUST00000022682 2914 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
SftpbP50405 AC174678.2-201ENSMUST00000156420 3275 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
SftpbP50405 Gm20671-201ENSMUST00000144673 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
SftpbP50405 Nipbl-201ENSMUST00000052965 8815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
SftpbP50405 Atad5-202ENSMUST00000108239 7266 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
SftpbP50405 Skp2-201ENSMUST00000096482 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
SftpbP50405 Thsd4-206ENSMUST00000171654 8522 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
SftpbP50405 Mypn-201ENSMUST00000095580 5246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
SftpbP50405 Csrnp3-208ENSMUST00000176109 2958 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
SftpbP50405 Gm19040-201ENSMUST00000203280 4726 ntBASIC11.29□□□□□ -0.6
SftpbP50405 Ccin-201ENSMUST00000095107 1941 ntAPPRIS P1 BASIC11.29□□□□□ -0.6
SftpbP50405 Slitrk4-202ENSMUST00000114679 3513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
SftpbP50405 Aldh3b2-201ENSMUST00000143380 2141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
SftpbP50405 Plxna3-201ENSMUST00000004326 6943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
SftpbP50405 Top3a-204ENSMUST00000120417 2318 ntTSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
SftpbP50405 Zfp593-201ENSMUST00000030644 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
SftpbP50405 Hist2h4-201ENSMUST00000171473 1630 ntAPPRIS P1 BASIC11.29□□□□□ -0.6
SftpbP50405 Myo9a-203ENSMUST00000128341 11985 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
SftpbP50405 Gm5795-201ENSMUST00000100920 984 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
SftpbP50405 4930522L14Rik-201ENSMUST00000100937 599 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
SftpbP50405 Gm23200-201ENSMUST00000104379 132 ntBASIC11.29□□□□□ -0.6
SftpbP50405 Gm14193-201ENSMUST00000105067 153 ntBASIC11.29□□□□□ -0.6
SftpbP50405 Gm4294-201ENSMUST00000105169 614 ntBASIC11.29□□□□□ -0.6
SftpbP50405 Nipsnap3b-202ENSMUST00000107665 848 ntTSL 2 BASIC11.29□□□□□ -0.6
SftpbP50405 Gm12216-202ENSMUST00000120776 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.29□□□□□ -0.6
SftpbP50405 Gm11244-201ENSMUST00000121243 237 ntBASIC11.29□□□□□ -0.6
SftpbP50405 Mrpl20-202ENSMUST00000130188 442 ntTSL 3 BASIC11.29□□□□□ -0.6
SftpbP50405 Gm12744-201ENSMUST00000146976 519 ntTSL 3 BASIC11.29□□□□□ -0.6
SftpbP50405 Cideb-201ENSMUST00000001497 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
SftpbP50405 Gm3685-201ENSMUST00000169215 984 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
SftpbP50405 Chtf8-203ENSMUST00000176090 615 ntTSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
SftpbP50405 Gm18367-201ENSMUST00000176139 600 ntBASIC11.29□□□□□ -0.6
SftpbP50405 Gm23694-201ENSMUST00000179335 110 ntBASIC11.29□□□□□ -0.6
SftpbP50405 Gm2383-201ENSMUST00000181461 807 ntBASIC11.29□□□□□ -0.6
SftpbP50405 Gm17087-201ENSMUST00000184183 471 ntAPPRIS P1 BASIC11.29□□□□□ -0.6
SftpbP50405 Gm27184-201ENSMUST00000185095 607 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
SftpbP50405 1700088E04Rik-206ENSMUST00000187550 1168 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
SftpbP50405 Gm42902-201ENSMUST00000199508 662 ntTSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
SftpbP50405 AC154171.1-201ENSMUST00000224610 643 ntBASIC11.29□□□□□ -0.6
SftpbP50405 Immp1l-201ENSMUST00000037499 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
SftpbP50405 Tas2r125-201ENSMUST00000076119 937 ntAPPRIS P1 BASIC11.29□□□□□ -0.6
SftpbP50405 Rpl15-201ENSMUST00000079419 883 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.29□□□□□ -0.6
SftpbP50405 Rnf183-201ENSMUST00000079420 573 ntAPPRIS P1 BASIC11.29□□□□□ -0.6
SftpbP50405 Gm10338-201ENSMUST00000096148 984 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.29□□□□□ -0.6
SftpbP50405 Fbp1-201ENSMUST00000092888 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
SftpbP50405 Nudt7-203ENSMUST00000109109 2795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
SftpbP50405 Gm44617-202ENSMUST00000209122 2763 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
SftpbP50405 Eif4g2-206ENSMUST00000161051 3548 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
SftpbP50405 5033403F01Rik-201ENSMUST00000181376 1678 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
SftpbP50405 Ufd1-202ENSMUST00000115578 2078 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
SftpbP50405 Gm37368-201ENSMUST00000193173 3212 ntBASIC11.29□□□□□ -0.6
SftpbP50405 Mkl1-204ENSMUST00000134469 4392 ntTSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
SftpbP50405 Gm37660-201ENSMUST00000192754 1732 ntBASIC11.29□□□□□ -0.6
SftpbP50405 Shank2-201ENSMUST00000097929 4418 ntTSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
SftpbP50405 Dld-201ENSMUST00000110857 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
SftpbP50405 Zfp629-203ENSMUST00000122066 5850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
SftpbP50405 Dkk2-201ENSMUST00000029665 3705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
SftpbP50405 Slc25a21-205ENSMUST00000217690 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
SftpbP50405 Gm9915-201ENSMUST00000066196 1383 ntBASIC11.28□□□□□ -0.6
SftpbP50405 Cyp2s1-202ENSMUST00000108395 3161 ntTSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
SftpbP50405 Slitrk3-202ENSMUST00000192477 4592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
SftpbP50405 Phtf1os-201ENSMUST00000160110 4046 ntBASIC11.28□□□□□ -0.6
SftpbP50405 Elmo2-201ENSMUST00000071699 3247 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.4 ms