Protein–RNA interactions for Protein: P28705

Rxrg, Retinoic acid receptor RXR-gamma, mousemouse

Predictions only

Length 463 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RxrgP28705 Zcchc8-204ENSMUST00000196282 4350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
RxrgP28705 D030045P18Rik-204ENSMUST00000215085 2186 ntTSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
RxrgP28705 Cyb5b-201ENSMUST00000034400 4316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
RxrgP28705 Arl6ip5-201ENSMUST00000044681 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
RxrgP28705 Fbxo25-204ENSMUST00000209913 2035 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
RxrgP28705 Sptan1-204ENSMUST00000113717 7958 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
RxrgP28705 Rnf13-210ENSMUST00000200497 2573 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
RxrgP28705 Rpl15-204ENSMUST00000112598 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
RxrgP28705 Gm12446-201ENSMUST00000123933 798 ntTSL 3 BASIC11.2□□□□□ -0.62
RxrgP28705 Gm12395-201ENSMUST00000144765 536 ntTSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
RxrgP28705 Cideb-201ENSMUST00000001497 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
RxrgP28705 1700007P06Rik-201ENSMUST00000160380 823 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
RxrgP28705 Taar8c-201ENSMUST00000170267 1035 ntAPPRIS P1 BASIC11.2□□□□□ -0.62
RxrgP28705 Gm20400-201ENSMUST00000173695 665 ntTSL 3 BASIC11.2□□□□□ -0.62
RxrgP28705 Pdcd5-ps-201ENSMUST00000191699 381 ntBASIC11.2□□□□□ -0.62
RxrgP28705 A930036K24Rik-201ENSMUST00000194146 1200 ntBASIC11.2□□□□□ -0.62
RxrgP28705 Gm43552-201ENSMUST00000196121 365 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.2□□□□□ -0.62
RxrgP28705 Crcp-204ENSMUST00000202163 931 ntTSL 2 BASIC11.2□□□□□ -0.62
RxrgP28705 Gm2762-206ENSMUST00000202502 335 ntTSL 3 BASIC11.2□□□□□ -0.62
RxrgP28705 Gm2762-208ENSMUST00000202976 568 ntTSL 3 BASIC11.2□□□□□ -0.62
RxrgP28705 Gm18856-203ENSMUST00000222015 483 ntTSL 2 BASIC11.2□□□□□ -0.62
RxrgP28705 CT009527.1-201ENSMUST00000224205 339 ntBASIC11.2□□□□□ -0.62
RxrgP28705 CT030653.1-201ENSMUST00000224382 1279 ntBASIC11.2□□□□□ -0.62
RxrgP28705 AC129308.3-201ENSMUST00000225652 524 ntBASIC11.2□□□□□ -0.62
RxrgP28705 Taar8a-201ENSMUST00000051133 1035 ntAPPRIS P1 BASIC11.2□□□□□ -0.62
RxrgP28705 Olfr1163-201ENSMUST00000099835 1043 ntAPPRIS P1 BASIC11.2□□□□□ -0.62
RxrgP28705 Maged2-202ENSMUST00000112697 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
RxrgP28705 Tia1-206ENSMUST00000113713 3108 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
RxrgP28705 Gm12200-201ENSMUST00000144876 1858 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
RxrgP28705 Ccar2-201ENSMUST00000035612 3725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
RxrgP28705 Pisd-203ENSMUST00000120591 2491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
RxrgP28705 Gm40617-201ENSMUST00000218840 2420 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
RxrgP28705 Dusp22-202ENSMUST00000095914 3015 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
RxrgP28705 Cd2bp2-207ENSMUST00000206026 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
RxrgP28705 Slc45a4-201ENSMUST00000054266 4664 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
RxrgP28705 Tirap-203ENSMUST00000176531 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
RxrgP28705 Ankrd53-201ENSMUST00000014891 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
RxrgP28705 Pck2-201ENSMUST00000048781 3400 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
RxrgP28705 March7-202ENSMUST00000102747 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
RxrgP28705 Ecsit-204ENSMUST00000180180 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
RxrgP28705 Scn10a-202ENSMUST00000213392 6692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
RxrgP28705 Adam12-201ENSMUST00000067680 7675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
RxrgP28705 Jmjd4-202ENSMUST00000108777 4351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
RxrgP28705 Triobp-204ENSMUST00000109690 7023 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
RxrgP28705 Slc5a8-201ENSMUST00000020255 5331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
RxrgP28705 Nicn1-201ENSMUST00000035227 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
RxrgP28705 Sel1l-201ENSMUST00000021347 6300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
RxrgP28705 Ckap2-201ENSMUST00000046916 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
RxrgP28705 Pck2-207ENSMUST00000226519 4625 ntAPPRIS P1 BASIC11.2□□□□□ -0.62
RxrgP28705 Gm45501-201ENSMUST00000211468 2526 ntBASIC11.19□□□□□ -0.62
RxrgP28705 Rbl2-210ENSMUST00000211136 4504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
RxrgP28705 Irf9-202ENSMUST00000130697 2459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
RxrgP28705 Ppp1r16b-203ENSMUST00000103116 6370 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
RxrgP28705 Snap29-201ENSMUST00000023449 3429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
RxrgP28705 Gm18642-201ENSMUST00000206642 1400 ntBASIC11.19□□□□□ -0.62
RxrgP28705 C730027H18Rik-201ENSMUST00000218381 2300 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
RxrgP28705 Gm17213-201ENSMUST00000165161 1360 ntBASIC11.19□□□□□ -0.62
RxrgP28705 Tbx10-201ENSMUST00000041871 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
RxrgP28705 Gm43334-201ENSMUST00000197740 1318 ntBASIC11.19□□□□□ -0.62
RxrgP28705 Foxh1-201ENSMUST00000037824 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
RxrgP28705 4632427E13Rik-202ENSMUST00000147198 6559 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
RxrgP28705 Tmcc2-201ENSMUST00000045473 3410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
RxrgP28705 Tcl1-202ENSMUST00000101071 1299 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
RxrgP28705 Gm14807-201ENSMUST00000116640 983 ntBASIC11.19□□□□□ -0.62
RxrgP28705 Gm11801-201ENSMUST00000117807 746 ntBASIC11.19□□□□□ -0.62
RxrgP28705 Gm11980-201ENSMUST00000121445 986 ntBASIC11.19□□□□□ -0.62
RxrgP28705 Lyzl4os-202ENSMUST00000156364 726 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
RxrgP28705 Tcl1-204ENSMUST00000176579 760 ntTSL 2 BASIC11.19□□□□□ -0.62
RxrgP28705 Gm37013-201ENSMUST00000194544 313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
RxrgP28705 D5Ertd615e-203ENSMUST00000198493 1032 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
RxrgP28705 Gm18561-201ENSMUST00000206027 804 ntBASIC11.19□□□□□ -0.62
RxrgP28705 Gm18059-201ENSMUST00000208073 580 ntBASIC11.19□□□□□ -0.62
RxrgP28705 Gm35713-201ENSMUST00000210516 199 ntBASIC11.19□□□□□ -0.62
RxrgP28705 Nutf2-202ENSMUST00000212042 645 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.19□□□□□ -0.62
RxrgP28705 Myl6-211ENSMUST00000219236 692 ntTSL 2 BASIC11.19□□□□□ -0.62
RxrgP28705 Gm9508-201ENSMUST00000220084 693 ntAPPRIS P1 BASIC11.19□□□□□ -0.62
RxrgP28705 CT010506.1-201ENSMUST00000223673 349 ntBASIC11.19□□□□□ -0.62
RxrgP28705 Mitd1-201ENSMUST00000027257 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
RxrgP28705 Nmi-201ENSMUST00000028314 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
RxrgP28705 Krtap19-5-201ENSMUST00000053460 483 ntAPPRIS P1 BASIC11.19□□□□□ -0.62
RxrgP28705 Rims1-204ENSMUST00000097810 6362 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
RxrgP28705 Gm6509-201ENSMUST00000098286 1218 ntTSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
RxrgP28705 CT010498.2-201ENSMUST00000225690 1659 ntAPPRIS P1 BASIC11.19□□□□□ -0.62
RxrgP28705 Atg14-202ENSMUST00000226299 3729 ntAPPRIS P1 BASIC11.19□□□□□ -0.62
RxrgP28705 Grin2b-205ENSMUST00000152012 2461 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
RxrgP28705 Ttc23-201ENSMUST00000032774 2492 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
RxrgP28705 Eef2k-201ENSMUST00000047875 6580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
RxrgP28705 St14-201ENSMUST00000034478 3259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
RxrgP28705 Wdr92-201ENSMUST00000046955 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
RxrgP28705 Gm42602-201ENSMUST00000200288 3224 ntBASIC11.19□□□□□ -0.62
RxrgP28705 Wdr78-203ENSMUST00000106868 4045 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
RxrgP28705 Plxna4os1-201ENSMUST00000150314 1977 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
RxrgP28705 Jade1-201ENSMUST00000026865 5481 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
RxrgP28705 Bmp3-203ENSMUST00000200388 6609 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
RxrgP28705 Bzw1-201ENSMUST00000050552 3876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
RxrgP28705 Gm45161-201ENSMUST00000207316 2263 ntBASIC11.19□□□□□ -0.62
RxrgP28705 Myo15-203ENSMUST00000094135 11715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
RxrgP28705 Gdap2-201ENSMUST00000029459 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
RxrgP28705 Cep250-202ENSMUST00000094421 7919 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
RxrgP28705 Tenm2-201ENSMUST00000057207 8298 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 61.5 ms