Protein–RNA interactions for Protein: P20293

T, Brachyury protein, mousemouse

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Length 436 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TP20293 Gm21986-201ENSMUST00000113671 5560 ntTSL 2 BASIC10.46□□□□□ -0.73
TP20293 Tifa-205ENSMUST00000171621 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
TP20293 Mdm1-201ENSMUST00000020437 3074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
TP20293 Ccdc136-208ENSMUST00000180829 3169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
TP20293 Invs-201ENSMUST00000030029 5633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
TP20293 Nrp1-201ENSMUST00000026917 3597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
TP20293 Gm14740-201ENSMUST00000118538 1150 ntBASIC10.46□□□□□ -0.73
TP20293 Srrm3os-201ENSMUST00000131896 1271 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
TP20293 Gm12348-201ENSMUST00000138915 313 ntTSL 3 BASIC10.46□□□□□ -0.73
TP20293 Tmem116-209ENSMUST00000156080 1184 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
TP20293 Prss36-208ENSMUST00000156152 1132 ntTSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.73
TP20293 Gm22846-201ENSMUST00000157706 270 ntBASIC10.46□□□□□ -0.73
TP20293 Hmgn3-201ENSMUST00000161796 862 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
TP20293 Olfml3-204ENSMUST00000169286 874 ntBASIC10.46□□□□□ -0.73
TP20293 Anapc16-202ENSMUST00000182116 581 ntTSL 3 BASIC10.46□□□□□ -0.73
TP20293 1600010M07Rik-202ENSMUST00000188662 654 ntTSL 2 BASIC10.46□□□□□ -0.73
TP20293 Gm43584-201ENSMUST00000199762 605 ntTSL 3 BASIC10.46□□□□□ -0.73
TP20293 Gm42867-201ENSMUST00000202995 469 ntBASIC10.46□□□□□ -0.73
TP20293 1700012D14Rik-202ENSMUST00000209959 629 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
TP20293 Gm45398-201ENSMUST00000210561 165 ntBASIC10.46□□□□□ -0.73
TP20293 Folr2-203ENSMUST00000210598 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
TP20293 AC129219.2-201ENSMUST00000224324 701 ntBASIC10.46□□□□□ -0.73
TP20293 Ccdc28b-201ENSMUST00000030586 879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
TP20293 Actg-ps1-201ENSMUST00000099636 1124 ntBASIC10.46□□□□□ -0.73
TP20293 Zbtb45-205ENSMUST00000210282 3908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
TP20293 Tsc22d4-202ENSMUST00000100539 3983 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
TP20293 Pstpip2-201ENSMUST00000114741 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
TP20293 Gm5171-201ENSMUST00000214944 1415 ntBASIC10.46□□□□□ -0.74
TP20293 Sh3tc2-201ENSMUST00000051720 4536 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.46□□□□□ -0.74
TP20293 Vwa5b2-202ENSMUST00000096197 4527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.74
TP20293 4933407I05Rik-204ENSMUST00000217562 1561 ntBASIC10.46□□□□□ -0.74
TP20293 Ltbp1-202ENSMUST00000112514 4870 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.74
TP20293 Sept4-203ENSMUST00000107960 1653 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
TP20293 Steap3-203ENSMUST00000112641 5158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
TP20293 AC158355.1-201ENSMUST00000215895 1705 ntBASIC10.46□□□□□ -0.74
TP20293 1700010I14Rik-201ENSMUST00000024650 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
TP20293 Ing1-206ENSMUST00000210740 1866 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
TP20293 Hist1h2be-201ENSMUST00000051091 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
TP20293 Spata33-207ENSMUST00000212760 4074 ntBASIC10.46□□□□□ -0.74
TP20293 Tyro3-202ENSMUST00000110783 4460 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
TP20293 Fbln2-202ENSMUST00000113498 4644 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
TP20293 Ank3-205ENSMUST00000092433 5072 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
TP20293 Zfp217-202ENSMUST00000109155 5670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
TP20293 Iqce-201ENSMUST00000041783 6037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
TP20293 Hhip-201ENSMUST00000079038 9074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
TP20293 Jade1-201ENSMUST00000026865 5481 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
TP20293 Samd4b-201ENSMUST00000040531 4349 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
TP20293 Gm33366-201ENSMUST00000195583 3827 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
TP20293 Cit-201ENSMUST00000051704 9514 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
TP20293 Pde4b-203ENSMUST00000097950 2756 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
TP20293 Brd4-202ENSMUST00000114475 2731 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
TP20293 Lgals12-201ENSMUST00000079902 2590 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
TP20293 Gm44369-201ENSMUST00000204543 2175 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
TP20293 Med19-201ENSMUST00000102645 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
TP20293 Slc6a9-210ENSMUST00000169885 1876 ntTSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
TP20293 Gm5441-201ENSMUST00000186454 5181 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
TP20293 Slc25a51-202ENSMUST00000116341 4438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
TP20293 Zdbf2-202ENSMUST00000114132 12629 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
TP20293 Nf1-202ENSMUST00000108251 9217 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
TP20293 Rwdd3-205ENSMUST00000106467 1158 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
TP20293 Skap1-206ENSMUST00000107663 742 ntTSL 3 BASIC10.45□□□□□ -0.74
TP20293 Gm14942-201ENSMUST00000119642 336 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
TP20293 Gm14395-201ENSMUST00000120494 563 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
TP20293 Rdh9-203ENSMUST00000136223 1276 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
TP20293 Gm13587-201ENSMUST00000152645 366 ntTSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
TP20293 Gm13449-201ENSMUST00000153559 1231 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
TP20293 Tspo2-205ENSMUST00000162481 473 ntTSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
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TP20293 Gm3551-201ENSMUST00000190750 664 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
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TP20293 Gm44315-201ENSMUST00000203041 219 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
TP20293 Klk1b19-ps-201ENSMUST00000205322 696 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
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TP20293 CT485606.1-201ENSMUST00000213187 878 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
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TP20293 AC160929.1-201ENSMUST00000221247 415 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
TP20293 CT010486.3-201ENSMUST00000224555 811 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
TP20293 AC171241.1-201ENSMUST00000228144 1166 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
TP20293 Odf3-201ENSMUST00000026555 1128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
TP20293 Rdh16f2-201ENSMUST00000092058 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
TP20293 Lman1-201ENSMUST00000048260 3563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
TP20293 Abcf1-201ENSMUST00000043757 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
TP20293 Dcun1d2-203ENSMUST00000110839 2937 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
TP20293 Kalrn-202ENSMUST00000089655 6506 ntTSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
TP20293 Gm28693-201ENSMUST00000189622 2638 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
TP20293 Trpm7-202ENSMUST00000103224 7107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
TP20293 Pcgf2-206ENSMUST00000169807 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
TP20293 Igsf3-202ENSMUST00000195164 3876 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
TP20293 Mfap3l-204ENSMUST00000161702 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
TP20293 Gm15774-201ENSMUST00000141810 2176 ntTSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
TP20293 E230029C05Rik-203ENSMUST00000208028 2066 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
TP20293 Slc6a2-201ENSMUST00000072939 6187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
TP20293 Ctsb-201ENSMUST00000006235 4743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
TP20293 Rbms3-201ENSMUST00000044901 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
TP20293 Ackr3-201ENSMUST00000065587 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
TP20293 Ss18-202ENSMUST00000040964 4153 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
TP20293 Olfr1413-202ENSMUST00000214239 1724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
TP20293 Ccdc15-206ENSMUST00000217238 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
TP20293 Ppat-202ENSMUST00000140076 3981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
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