Protein–RNA interactions for Protein: P17208

Pou4f1, POU domain, class 4, transcription factor 1, mousemouse

Predictions only

Length 421 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pou4f1P17208 Fxyd1-202ENSMUST00000071697 522 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.88□□□□□ -0.67
Pou4f1P17208 Lrmda-201ENSMUST00000075639 908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Pou4f1P17208 Gm3402-202ENSMUST00000077133 924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.88□□□□□ -0.67
Pou4f1P17208 Klk1b7-ps-201ENSMUST00000078897 448 ntTSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Pou4f1P17208 Tmem184b-202ENSMUST00000178522 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Pou4f1P17208 Dyrk4-202ENSMUST00000078521 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Pou4f1P17208 H2-T3-201ENSMUST00000025312 2114 ntTSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Pou4f1P17208 Prom2-202ENSMUST00000103214 4190 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Pou4f1P17208 Srpk3-201ENSMUST00000002081 1981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Pou4f1P17208 Ngfr-201ENSMUST00000000122 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Pou4f1P17208 Hpgd-201ENSMUST00000034026 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Pou4f1P17208 Impa1-202ENSMUST00000118410 2988 ntTSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Pou4f1P17208 Sult1a1-201ENSMUST00000106371 1370 ntTSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Pou4f1P17208 Sult1a1-202ENSMUST00000106372 1369 ntTSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Pou4f1P17208 5330439B14Rik-201ENSMUST00000194811 1392 ntTSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Pou4f1P17208 Dusp11-201ENSMUST00000032071 6435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Pou4f1P17208 C130021I20Rik-201ENSMUST00000147294 3693 ntTSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Pou4f1P17208 Phf8-211ENSMUST00000168501 6359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.88□□□□□ -0.67
Pou4f1P17208 Fntb-201ENSMUST00000041008 2613 ntTSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Pou4f1P17208 Chmp1b-202ENSMUST00000210564 2490 ntAPPRIS P1 BASIC10.87□□□□□ -0.67
Pou4f1P17208 Apc-203ENSMUST00000115781 12346 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.87□□□□□ -0.67
Pou4f1P17208 Pex13-201ENSMUST00000020523 4146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Pou4f1P17208 Gm45576-201ENSMUST00000210981 1322 ntTSL 5 BASIC10.87□□□□□ -0.67
Pou4f1P17208 CT009489.1-201ENSMUST00000227740 1893 ntBASIC10.87□□□□□ -0.67
Pou4f1P17208 Gm10686-201ENSMUST00000215389 3247 ntBASIC10.87□□□□□ -0.67
Pou4f1P17208 Zfp384-206ENSMUST00000112425 2691 ntTSL 5 BASIC10.87□□□□□ -0.67
Pou4f1P17208 Arih1-202ENSMUST00000165322 1431 ntTSL 5 BASIC10.87□□□□□ -0.67
Pou4f1P17208 Rbm8a-203ENSMUST00000198027 2757 ntTSL 3 BASIC10.87□□□□□ -0.67
Pou4f1P17208 Gm31938-201ENSMUST00000218081 1818 ntTSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Pou4f1P17208 Trp53inp2-201ENSMUST00000043237 3979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Pou4f1P17208 Nckap5-212ENSMUST00000162877 2630 ntTSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Pou4f1P17208 Bcl9-201ENSMUST00000046521 6102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Pou4f1P17208 Gpr37-202ENSMUST00000200812 3035 ntTSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Pou4f1P17208 Spesp1-201ENSMUST00000056949 3042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Pou4f1P17208 Mir877-201ENSMUST00000104738 85 ntBASIC10.87□□□□□ -0.67
Pou4f1P17208 Gm7851-201ENSMUST00000117574 323 ntBASIC10.87□□□□□ -0.67
Pou4f1P17208 Gm13809-201ENSMUST00000117921 597 ntBASIC10.87□□□□□ -0.67
Pou4f1P17208 Gm15595-201ENSMUST00000120840 961 ntBASIC10.87□□□□□ -0.67
Pou4f1P17208 Gm14277-201ENSMUST00000121195 360 ntBASIC10.87□□□□□ -0.67
Pou4f1P17208 Gm14017-201ENSMUST00000121934 386 ntBASIC10.87□□□□□ -0.67
Pou4f1P17208 Mcfd2-205ENSMUST00000145895 751 ntTSL 2 BASIC10.87□□□□□ -0.67
Pou4f1P17208 S100a14-202ENSMUST00000167598 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Pou4f1P17208 Gm2260-201ENSMUST00000184965 657 ntBASIC10.87□□□□□ -0.67
Pou4f1P17208 Gm43371-201ENSMUST00000202838 1031 ntBASIC10.87□□□□□ -0.67
Pou4f1P17208 Gm6905-201ENSMUST00000205729 511 ntBASIC10.87□□□□□ -0.67
Pou4f1P17208 Gm45441-202ENSMUST00000209301 1235 ntTSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Pou4f1P17208 5330413P13Rik-205ENSMUST00000210961 913 ntTSL 5 BASIC10.87□□□□□ -0.67
Pou4f1P17208 Cdc34-208ENSMUST00000219791 799 ntTSL 3 BASIC10.87□□□□□ -0.67
Pou4f1P17208 CT025694.1-201ENSMUST00000226188 934 ntBASIC10.87□□□□□ -0.67
Pou4f1P17208 Tas2r125-201ENSMUST00000076119 937 ntAPPRIS P1 BASIC10.87□□□□□ -0.67
Pou4f1P17208 5033403F01Rik-201ENSMUST00000181376 1678 ntTSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Pou4f1P17208 Ufd1-202ENSMUST00000115578 2078 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.87□□□□□ -0.67
Pou4f1P17208 Cfap54-201ENSMUST00000020200 2473 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.87□□□□□ -0.67
Pou4f1P17208 Spata2-201ENSMUST00000057627 4012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Pou4f1P17208 Col11a1-201ENSMUST00000092155 7667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Pou4f1P17208 Gm9915-201ENSMUST00000066196 1383 ntBASIC10.87□□□□□ -0.67
Pou4f1P17208 Myo18a-223ENSMUST00000169105 6475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Pou4f1P17208 Gm43622-201ENSMUST00000200140 2019 ntBASIC10.87□□□□□ -0.67
Pou4f1P17208 Gm10681-202ENSMUST00000178221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.87□□□□□ -0.67
Pou4f1P17208 Peg10-201ENSMUST00000166678 6662 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.87□□□□□ -0.67
Pou4f1P17208 Plekhn1-204ENSMUST00000218699 3196 ntTSL 2 BASIC10.87□□□□□ -0.67
Pou4f1P17208 Gm19040-201ENSMUST00000203280 4726 ntBASIC10.87□□□□□ -0.67
Pou4f1P17208 Sh3d21-201ENSMUST00000094760 1859 ntTSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Pou4f1P17208 AW549877-201ENSMUST00000046633 5076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Pou4f1P17208 Abhd18-201ENSMUST00000108077 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Pou4f1P17208 Nf2-202ENSMUST00000056290 2394 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Pou4f1P17208 Duxf3-201ENSMUST00000174056 1486 ntTSL 5 BASIC10.87□□□□□ -0.67
Pou4f1P17208 Gm37651-201ENSMUST00000194679 1494 ntBASIC10.87□□□□□ -0.67
Pou4f1P17208 Adcy7-202ENSMUST00000168545 5937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Pou4f1P17208 St5-201ENSMUST00000077909 4612 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Pou4f1P17208 Cops7a-202ENSMUST00000112439 1328 ntTSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Pou4f1P17208 Camk2b-207ENSMUST00000101586 1590 ntTSL 5 BASIC10.86□□□□□ -0.67
Pou4f1P17208 Mybph-201ENSMUST00000038445 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Pou4f1P17208 Top3a-204ENSMUST00000120417 2318 ntTSL 5 BASIC10.86□□□□□ -0.67
Pou4f1P17208 Habp2-201ENSMUST00000078284 2314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.86□□□□□ -0.67
Pou4f1P17208 Gm33366-201ENSMUST00000195583 3827 ntBASIC10.86□□□□□ -0.67
Pou4f1P17208 Immt-205ENSMUST00000166938 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Pou4f1P17208 Ccin-201ENSMUST00000095107 1941 ntAPPRIS P1 BASIC10.86□□□□□ -0.67
Pou4f1P17208 Nphs1-203ENSMUST00000126297 3877 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Pou4f1P17208 Gm3372-201ENSMUST00000198806 1792 ntBASIC10.86□□□□□ -0.67
Pou4f1P17208 Klhl22-208ENSMUST00000165790 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Pou4f1P17208 Pdlim2-201ENSMUST00000022681 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Pou4f1P17208 Apol9a-202ENSMUST00000089452 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Pou4f1P17208 Txndc16-203ENSMUST00000123879 4069 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Pou4f1P17208 Tm2d3-203ENSMUST00000107495 1003 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC10.86□□□□□ -0.67
Pou4f1P17208 Gm16066-201ENSMUST00000118575 1086 ntTSL 3 BASIC10.86□□□□□ -0.67
Pou4f1P17208 Gm15374-201ENSMUST00000119313 844 ntBASIC10.86□□□□□ -0.67
Pou4f1P17208 Mrpl20-202ENSMUST00000130188 442 ntTSL 3 BASIC10.86□□□□□ -0.67
Pou4f1P17208 C230038L03Rik-202ENSMUST00000136294 1197 ntTSL 2 BASIC10.86□□□□□ -0.67
Pou4f1P17208 C030017D09Rik-201ENSMUST00000163690 923 ntTSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Pou4f1P17208 H2al1i-201ENSMUST00000164729 318 ntAPPRIS P1 BASIC10.86□□□□□ -0.67
Pou4f1P17208 H2al1h-201ENSMUST00000177926 318 ntAPPRIS P1 BASIC10.86□□□□□ -0.67
Pou4f1P17208 H2al1d-201ENSMUST00000178595 318 ntAPPRIS P1 BASIC10.86□□□□□ -0.67
Pou4f1P17208 H2al1c-201ENSMUST00000178806 318 ntAPPRIS P1 BASIC10.86□□□□□ -0.67
Pou4f1P17208 H2al1f-201ENSMUST00000179004 318 ntAPPRIS P1 BASIC10.86□□□□□ -0.67
Pou4f1P17208 Gm27552-201ENSMUST00000183351 62 ntBASIC10.86□□□□□ -0.67
Pou4f1P17208 Gm27844-201ENSMUST00000183613 62 ntBASIC10.86□□□□□ -0.67
Pou4f1P17208 Gm28694-201ENSMUST00000190681 722 ntTSL 3 BASIC10.86□□□□□ -0.67
Pou4f1P17208 Gm29707-202ENSMUST00000198744 659 ntTSL 3 BASIC10.86□□□□□ -0.67
Pou4f1P17208 1700013M08Rik-202ENSMUST00000200080 798 ntBASIC10.86□□□□□ -0.67
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.8 ms