Protein–RNA interactions for Protein: P12658

Calb1, Calbindin, mousemouse

Predictions only

Length 261 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Calb1P12658 Gm8752-201ENSMUST00000173427 1694 ntBASIC11.96□□□□□ -0.5
Calb1P12658 4930594M22Rik-202ENSMUST00000161599 3595 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
Calb1P12658 Gm44415-201ENSMUST00000204151 2112 ntBASIC11.96□□□□□ -0.5
Calb1P12658 Slit2-216ENSMUST00000174313 7734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
Calb1P12658 Vwa7-202ENSMUST00000172499 3970 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
Calb1P12658 Pml-207ENSMUST00000135310 4413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
Calb1P12658 Gm45165-201ENSMUST00000207763 1631 ntBASIC11.96□□□□□ -0.5
Calb1P12658 Tmbim1-202ENSMUST00000113796 11011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
Calb1P12658 Pde5a-201ENSMUST00000066728 6939 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
Calb1P12658 Lima1-201ENSMUST00000073691 4215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
Calb1P12658 Rin1-208ENSMUST00000225427 4503 ntAPPRIS P2 BASIC11.96□□□□□ -0.5
Calb1P12658 Gm5833-202ENSMUST00000190707 1932 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
Calb1P12658 Enpp7-202ENSMUST00000106273 1408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Calb1P12658 Gm20755-201ENSMUST00000196893 1827 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Calb1P12658 Rbm8a-202ENSMUST00000196456 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Calb1P12658 Syncrip-208ENSMUST00000174282 3404 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Calb1P12658 Kat6b-204ENSMUST00000182405 6977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Calb1P12658 Camk1d-201ENSMUST00000044009 6962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Calb1P12658 Gtf3c1-201ENSMUST00000055506 6961 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Calb1P12658 Gm3372-201ENSMUST00000198806 1792 ntBASIC11.95□□□□□ -0.5
Calb1P12658 Dennd1c-201ENSMUST00000011623 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Calb1P12658 Kcnh5-201ENSMUST00000042299 4058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Calb1P12658 Sgca-202ENSMUST00000103162 1724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Calb1P12658 Gm18798-201ENSMUST00000187264 1700 ntBASIC11.95□□□□□ -0.5
Calb1P12658 Uba1y-ps1-201ENSMUST00000188314 1708 ntBASIC11.95□□□□□ -0.5
Calb1P12658 Dpt-201ENSMUST00000027861 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Calb1P12658 Npl-201ENSMUST00000041874 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Calb1P12658 Ccnb1-201ENSMUST00000072119 2489 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Calb1P12658 Gfra1-209ENSMUST00000169850 3224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Calb1P12658 Slc38a3-202ENSMUST00000167868 3151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Calb1P12658 3830432H09Rik-202ENSMUST00000188909 2414 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Calb1P12658 Cblb-203ENSMUST00000226593 3864 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Calb1P12658 Ppp1r18-201ENSMUST00000113814 3131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Calb1P12658 Pip5k1b-202ENSMUST00000112673 2387 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Calb1P12658 Gm26783-201ENSMUST00000181197 2377 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Calb1P12658 Gstm4-202ENSMUST00000106670 777 ntTSL 3 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Calb1P12658 Gm10631-201ENSMUST00000153288 494 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Calb1P12658 1110036E04Rik-201ENSMUST00000181151 777 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Calb1P12658 Dusp13-211ENSMUST00000183943 779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Calb1P12658 Ak6-205ENSMUST00000190729 1184 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Calb1P12658 Platr10-202ENSMUST00000191479 818 ntBASIC11.95□□□□□ -0.5
Calb1P12658 Gm35025-203ENSMUST00000193519 634 ntTSL 3 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Calb1P12658 Gm43947-201ENSMUST00000203019 959 ntBASIC11.95□□□□□ -0.5
Calb1P12658 Gm2875-201ENSMUST00000211333 360 ntBASIC11.95□□□□□ -0.5
Calb1P12658 AC114645.1-201ENSMUST00000215831 187 ntBASIC11.95□□□□□ -0.5
Calb1P12658 Olfr354-201ENSMUST00000068475 1084 ntAPPRIS P1 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Calb1P12658 Snora73b-201ENSMUST00000083419 205 ntBASIC11.95□□□□□ -0.5
Calb1P12658 Krtap5-1-201ENSMUST00000084413 588 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Calb1P12658 Itgal-204ENSMUST00000120857 4533 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Calb1P12658 Spop-201ENSMUST00000107722 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Calb1P12658 Gm34425-201ENSMUST00000216269 3079 ntTSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Calb1P12658 Gm31108-201ENSMUST00000204101 1633 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Calb1P12658 Fam180a-201ENSMUST00000051176 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Calb1P12658 Gm44086-201ENSMUST00000203251 2349 ntBASIC11.95□□□□□ -0.5
Calb1P12658 Ormdl2-201ENSMUST00000026409 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Calb1P12658 Mpl-202ENSMUST00000102671 2934 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Calb1P12658 Nanog-201ENSMUST00000012540 2211 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Calb1P12658 Tenm2-201ENSMUST00000057207 8298 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Calb1P12658 Saxo2-201ENSMUST00000056728 2783 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Calb1P12658 Myh1-202ENSMUST00000075734 6012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Calb1P12658 Lnx1-203ENSMUST00000113531 3098 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Calb1P12658 Nxpe5-204ENSMUST00000161047 2379 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Calb1P12658 Smco1-201ENSMUST00000093183 1408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Calb1P12658 Tnk2os-201ENSMUST00000141256 1392 ntTSL 2 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Calb1P12658 AC158636.1-201ENSMUST00000220118 1393 ntBASIC11.94□□□□□ -0.5
Calb1P12658 Gm5766-201ENSMUST00000160520 1977 ntBASIC11.94□□□□□ -0.5
Calb1P12658 Gm45449-201ENSMUST00000211485 1960 ntTSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Calb1P12658 Gm26686-201ENSMUST00000181951 3467 ntTSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Calb1P12658 Smg6-201ENSMUST00000045281 5848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Calb1P12658 Abca3-202ENSMUST00000079594 6380 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Calb1P12658 Ccin-201ENSMUST00000095107 1941 ntAPPRIS P1 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Calb1P12658 Gm38271-201ENSMUST00000192296 1603 ntBASIC11.94□□□□□ -0.5
Calb1P12658 Gm20646-201ENSMUST00000176807 1316 ntTSL 3 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Calb1P12658 Abi1-206ENSMUST00000126112 3360 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Calb1P12658 Myh10-203ENSMUST00000102611 7791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Calb1P12658 Wwp2-204ENSMUST00000212205 2758 ntTSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Calb1P12658 1500002C15Rik-201ENSMUST00000178987 2183 ntBASIC11.94□□□□□ -0.5
Calb1P12658 Olfr601-203ENSMUST00000214110 2196 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Calb1P12658 Olfr601-204ENSMUST00000217416 2195 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Calb1P12658 Trim46-203ENSMUST00000107464 3252 ntTSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Calb1P12658 Gm25766-201ENSMUST00000104101 131 ntBASIC11.94□□□□□ -0.5
Calb1P12658 Fam129a-203ENSMUST00000111875 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Calb1P12658 Slc45a2-201ENSMUST00000117100 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Calb1P12658 Hint1-202ENSMUST00000117710 580 ntTSL 2 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Calb1P12658 1700122E12Rik-202ENSMUST00000147538 479 ntTSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Calb1P12658 Vmn2r-ps54-203ENSMUST00000150856 1142 ntTSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Calb1P12658 Mrgpra2a-201ENSMUST00000159004 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Calb1P12658 Gm3233-201ENSMUST00000168997 693 ntAPPRIS P1 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Calb1P12658 Gm29040-201ENSMUST00000189899 1188 ntTSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Calb1P12658 Chn2-210ENSMUST00000203091 755 ntTSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Calb1P12658 Gm45550-201ENSMUST00000209380 946 ntBASIC11.94□□□□□ -0.5
Calb1P12658 Gm4065-202ENSMUST00000218911 986 ntTSL 3 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Calb1P12658 Fth1-201ENSMUST00000025563 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Calb1P12658 Zfp652-201ENSMUST00000091565 2663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Calb1P12658 Katnal2-208ENSMUST00000137498 1824 ntTSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Calb1P12658 Samhd1-203ENSMUST00000109549 3245 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Calb1P12658 Chek1-202ENSMUST00000172702 3797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Calb1P12658 Nox4-201ENSMUST00000032781 3753 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Calb1P12658 Arhgap11a-202ENSMUST00000110947 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Calb1P12658 Fubp1-209ENSMUST00000198227 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.1 ms