Protein–RNA interactions for Protein: P09055

Itgb1, Integrin beta-1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 798 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Itgb1P09055 Gm9008-201ENSMUST00000097218 2353 ntAPPRIS P1 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Itgb1P09055 Zbtb42-201ENSMUST00000169593 3478 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Itgb1P09055 Gm15519-201ENSMUST00000120088 1566 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Itgb1P09055 Gm2721-201ENSMUST00000222380 1571 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Itgb1P09055 Igfn1-203ENSMUST00000166193 8989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Itgb1P09055 Mmel1-203ENSMUST00000105634 2669 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Itgb1P09055 Fbxl22-201ENSMUST00000056890 3935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Itgb1P09055 Tmem129-201ENSMUST00000019439 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Itgb1P09055 Camta2-204ENSMUST00000108545 4377 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Itgb1P09055 Camta2-206ENSMUST00000120261 4398 ntTSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Itgb1P09055 Prr12-201ENSMUST00000057293 7023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Itgb1P09055 Frmd8-201ENSMUST00000025728 4504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Itgb1P09055 Rps6kb1-202ENSMUST00000058286 3250 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Itgb1P09055 Zfp37-206ENSMUST00000222050 2017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Itgb1P09055 Dcaf12-201ENSMUST00000030145 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Itgb1P09055 R3hdm2-210ENSMUST00000164831 2937 ntTSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Itgb1P09055 Zfp263-201ENSMUST00000023176 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Itgb1P09055 Gng7-203ENSMUST00000117805 3382 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Itgb1P09055 Hsd3b3-204ENSMUST00000107019 1533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.55
Itgb1P09055 Gipr-201ENSMUST00000094790 2856 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.55
Itgb1P09055 Akap3-201ENSMUST00000095440 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
Itgb1P09055 Fndc3b-201ENSMUST00000046157 6875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Itgb1P09055 Zfp426-202ENSMUST00000115562 3557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Itgb1P09055 Drd1-202ENSMUST00000221470 3576 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Itgb1P09055 Hnrnpk-202ENSMUST00000116403 2970 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Itgb1P09055 Serpina1b-202ENSMUST00000164454 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Itgb1P09055 Lgr5-201ENSMUST00000020350 4714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Itgb1P09055 Snx27-208ENSMUST00000200642 1308 ntTSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Itgb1P09055 Syne3-202ENSMUST00000095439 3357 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Itgb1P09055 Med1-202ENSMUST00000092735 2627 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Itgb1P09055 Ttc7-202ENSMUST00000125875 3917 ntTSL 2 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Itgb1P09055 Clec10a-209ENSMUST00000178945 2332 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Itgb1P09055 A330093E20Rik-202ENSMUST00000184994 2327 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Itgb1P09055 Ceacam1-205ENSMUST00000206171 1722 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Itgb1P09055 Clspn-201ENSMUST00000048391 5027 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Itgb1P09055 Gm8050-201ENSMUST00000171987 1595 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Itgb1P09055 Gpr143-201ENSMUST00000026383 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Itgb1P09055 Kctd10-202ENSMUST00000102581 3103 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Itgb1P09055 Krt40-202ENSMUST00000107443 1080 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Itgb1P09055 B230307C23Rik-202ENSMUST00000122450 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Itgb1P09055 Vmn2r-ps54-203ENSMUST00000150856 1142 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Itgb1P09055 Anp32e-206ENSMUST00000169426 915 ntTSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Itgb1P09055 Rpl41-201ENSMUST00000176010 582 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Itgb1P09055 Rpl41-204ENSMUST00000176906 509 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Itgb1P09055 Mir99ahg-209ENSMUST00000182820 835 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Itgb1P09055 Gm27211-201ENSMUST00000183507 631 ntTSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Itgb1P09055 Mir6973a-201ENSMUST00000183646 78 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Itgb1P09055 Gm28819-201ENSMUST00000186691 572 ntTSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Itgb1P09055 Gm29521-201ENSMUST00000187061 745 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Itgb1P09055 Gm28840-208ENSMUST00000191514 738 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Itgb1P09055 9530062K07Rik-201ENSMUST00000203332 787 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Itgb1P09055 Gm7238-201ENSMUST00000206467 973 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Itgb1P09055 AC099934.4-201ENSMUST00000220745 523 ntTSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Itgb1P09055 Timm9-210ENSMUST00000221892 734 ntTSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Itgb1P09055 Gm40910-202ENSMUST00000223077 569 ntTSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Itgb1P09055 AC164099.1-201ENSMUST00000227780 333 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Itgb1P09055 Tprg-201ENSMUST00000056087 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Itgb1P09055 Dcaf8-201ENSMUST00000074144 4656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Itgb1P09055 Prok2-201ENSMUST00000008273 594 ntTSL 3 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Itgb1P09055 Prkar1a-201ENSMUST00000049527 3359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Itgb1P09055 Rgs3-205ENSMUST00000107424 4084 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Itgb1P09055 Hmgcs2-202ENSMUST00000120541 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Itgb1P09055 Kif1a-210ENSMUST00000190723 6141 ntTSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Itgb1P09055 Impdh2-ps-201ENSMUST00000120826 1545 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Itgb1P09055 Rragd-202ENSMUST00000084747 4295 ntTSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Itgb1P09055 Gm18806-201ENSMUST00000207607 1775 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Itgb1P09055 Chtop-201ENSMUST00000001043 3257 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Itgb1P09055 Plod3-201ENSMUST00000004968 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Itgb1P09055 Trmt61b-202ENSMUST00000137830 2572 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Itgb1P09055 Pcnt-202ENSMUST00000217838 9341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Itgb1P09055 Shank2-202ENSMUST00000105900 8169 ntTSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Itgb1P09055 Egfem1-202ENSMUST00000119598 2687 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Itgb1P09055 Rspo2-201ENSMUST00000063492 3338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Itgb1P09055 Mtap-201ENSMUST00000058030 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Itgb1P09055 Grik3-201ENSMUST00000030676 8973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Itgb1P09055 Tubd1-203ENSMUST00000108030 1964 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Itgb1P09055 Srpk3-201ENSMUST00000002081 1981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Itgb1P09055 AC160410.1-201ENSMUST00000219298 1972 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Itgb1P09055 Haus6-201ENSMUST00000070607 6158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Itgb1P09055 Etfbkmt-209ENSMUST00000179873 1576 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Itgb1P09055 Rnf180-205ENSMUST00000226044 3279 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Itgb1P09055 St14-201ENSMUST00000034478 3259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Itgb1P09055 Gdpd2-201ENSMUST00000019503 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Itgb1P09055 Ecd-201ENSMUST00000022344 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Itgb1P09055 Tmem151a-201ENSMUST00000077066 4006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Itgb1P09055 Gm8020-201ENSMUST00000170174 1406 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Itgb1P09055 Tex10-206ENSMUST00000164866 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Itgb1P09055 Vdr-201ENSMUST00000023119 4370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Itgb1P09055 Pbx1-208ENSMUST00000188912 3970 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Itgb1P09055 Cers6-201ENSMUST00000028426 7038 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Itgb1P09055 Mzf1-201ENSMUST00000069289 3597 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Itgb1P09055 Gm23769-201ENSMUST00000104441 121 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Itgb1P09055 Camk2a-205ENSMUST00000115297 499 ntTSL 2 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Itgb1P09055 Rpsa-ps5-201ENSMUST00000121462 885 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Itgb1P09055 Gm14232-201ENSMUST00000137176 446 ntTSL 3 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Itgb1P09055 Gm13869-201ENSMUST00000146978 1054 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Itgb1P09055 Tex29-204ENSMUST00000166638 561 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Itgb1P09055 Gm20443-201ENSMUST00000173840 735 ntTSL 3 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Itgb1P09055 Mir133a-1hg-201ENSMUST00000179771 395 ntTSL 3 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Itgb1P09055 Gm7627-201ENSMUST00000183205 999 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 62.4 ms