Protein–RNA interactions for Protein: P04202

Tgfb1, Transforming growth factor beta-1, mousemouse

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Length 390 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tgfb1P04202 Zfp398-201ENSMUST00000079881 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Tgfb1P04202 Mrrf-201ENSMUST00000028250 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Tgfb1P04202 Scamp2-201ENSMUST00000045791 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Tgfb1P04202 Habp2-201ENSMUST00000078284 2314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Tgfb1P04202 Sorbs1-203ENSMUST00000165212 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Tgfb1P04202 Ces5a-203ENSMUST00000212009 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Tgfb1P04202 Sh3d21-201ENSMUST00000094760 1859 ntTSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Tgfb1P04202 AC158355.1-201ENSMUST00000215895 1705 ntBASIC10.28□□□□□ -0.76
Tgfb1P04202 Cyp4f16-208ENSMUST00000169591 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Tgfb1P04202 Gm5797-201ENSMUST00000100886 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Tgfb1P04202 Arpc3-202ENSMUST00000102525 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Tgfb1P04202 Gm3149-201ENSMUST00000112779 997 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Tgfb1P04202 Gm8737-201ENSMUST00000122208 642 ntBASIC10.28□□□□□ -0.76
Tgfb1P04202 Gm8362-202ENSMUST00000170673 997 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Tgfb1P04202 Gm8705-201ENSMUST00000180823 812 ntTSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Tgfb1P04202 1700029E06Rik-201ENSMUST00000189036 757 ntTSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Tgfb1P04202 Gm29088-201ENSMUST00000189363 581 ntTSL 3 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Tgfb1P04202 Gm37293-201ENSMUST00000191658 295 ntBASIC10.28□□□□□ -0.76
Tgfb1P04202 Gm21057-202ENSMUST00000206111 512 ntTSL 2 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Tgfb1P04202 Gm45572-201ENSMUST00000211774 750 ntTSL 5 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Tgfb1P04202 Nutf2-202ENSMUST00000212042 645 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Tgfb1P04202 AC129219.2-201ENSMUST00000224324 701 ntBASIC10.28□□□□□ -0.76
Tgfb1P04202 AC154589.2-201ENSMUST00000228847 251 ntBASIC10.28□□□□□ -0.76
Tgfb1P04202 5930422O12Rik-201ENSMUST00000059351 840 ntAPPRIS P1 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Tgfb1P04202 Apc-201ENSMUST00000066133 1185 ntTSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Tgfb1P04202 Olfr311-201ENSMUST00000071625 927 ntAPPRIS P1 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Tgfb1P04202 Cenpu-202ENSMUST00000093518 783 ntTSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Tgfb1P04202 Olfr1163-201ENSMUST00000099835 1043 ntAPPRIS P1 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Tgfb1P04202 Cfi-201ENSMUST00000077918 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Tgfb1P04202 Gm30228-201ENSMUST00000218501 1949 ntTSL 3 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Tgfb1P04202 Kbtbd12-206ENSMUST00000184878 3351 ntTSL 5 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Tgfb1P04202 Cyp2a22-201ENSMUST00000170227 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Tgfb1P04202 Fntb-201ENSMUST00000041008 2613 ntTSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Tgfb1P04202 Abcc10-202ENSMUST00000095261 5266 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Tgfb1P04202 A230077H06Rik-202ENSMUST00000189574 2477 ntTSL 2 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Tgfb1P04202 Gm11033-203ENSMUST00000156185 2321 ntTSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Tgfb1P04202 Nap1l3-201ENSMUST00000079490 2837 ntAPPRIS P1 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Tgfb1P04202 Pafah1b2-201ENSMUST00000172450 6873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Tgfb1P04202 Tifa-205ENSMUST00000171621 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Tgfb1P04202 Tmprss5-202ENSMUST00000165088 2895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Tgfb1P04202 Gm3716-202ENSMUST00000198582 2879 ntTSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Tgfb1P04202 Mkx-201ENSMUST00000079788 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Tgfb1P04202 Kalrn-207ENSMUST00000114960 6452 ntTSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.76
Tgfb1P04202 Riox2-202ENSMUST00000120667 2200 ntTSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.76
Tgfb1P04202 Clcn4-201ENSMUST00000000619 4607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.76
Tgfb1P04202 Socs6-201ENSMUST00000070116 6036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.76
Tgfb1P04202 Ascc2-202ENSMUST00000109930 4844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.76
Tgfb1P04202 Rin1-201ENSMUST00000025818 4184 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.76
Tgfb1P04202 Cacna1s-204ENSMUST00000160641 6104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.27□□□□□ -0.76
Tgfb1P04202 Azin1-203ENSMUST00000110329 4217 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.27□□□□□ -0.76
Tgfb1P04202 Plekhn1-204ENSMUST00000218699 3196 ntTSL 2 BASIC10.27□□□□□ -0.77
Tgfb1P04202 Ahnak2-201ENSMUST00000101010 2821 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.27□□□□□ -0.77
Tgfb1P04202 Acot9-201ENSMUST00000026324 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Tgfb1P04202 Gm3765-201ENSMUST00000130985 1447 ntBASIC10.27□□□□□ -0.77
Tgfb1P04202 Gm19299-202ENSMUST00000215724 1435 ntTSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Tgfb1P04202 Tra2b-204ENSMUST00000161286 3403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Tgfb1P04202 Gpr173-201ENSMUST00000070316 4855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Tgfb1P04202 Gm44369-201ENSMUST00000204543 2175 ntBASIC10.27□□□□□ -0.77
Tgfb1P04202 Rmdn1-202ENSMUST00000108253 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Tgfb1P04202 Styxl1-205ENSMUST00000111164 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Tgfb1P04202 Gm15074-201ENSMUST00000117603 936 ntBASIC10.27□□□□□ -0.77
Tgfb1P04202 Gm8302-201ENSMUST00000119217 852 ntBASIC10.27□□□□□ -0.77
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Tgfb1P04202 Gm14199-201ENSMUST00000130021 495 ntTSL 2 BASIC10.27□□□□□ -0.77
Tgfb1P04202 B9d1os-201ENSMUST00000137010 674 ntBASIC10.27□□□□□ -0.77
Tgfb1P04202 Gm24074-201ENSMUST00000158178 260 ntBASIC10.27□□□□□ -0.77
Tgfb1P04202 Zdhhc4-208ENSMUST00000161915 1216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.27□□□□□ -0.77
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Tgfb1P04202 Wdr53-204ENSMUST00000178573 1153 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.27□□□□□ -0.77
Tgfb1P04202 Mir99ahg-209ENSMUST00000182820 835 ntTSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Tgfb1P04202 Ly6e-203ENSMUST00000185861 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.27□□□□□ -0.77
Tgfb1P04202 1700066B17Rik-203ENSMUST00000191299 536 ntTSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Tgfb1P04202 5730585A16Rik-201ENSMUST00000193457 1027 ntBASIC10.27□□□□□ -0.77
Tgfb1P04202 Gm37826-201ENSMUST00000195329 322 ntBASIC10.27□□□□□ -0.77
Tgfb1P04202 Ccdc12-201ENSMUST00000019803 834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Tgfb1P04202 Gm43401-201ENSMUST00000198829 394 ntTSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Tgfb1P04202 Gm33474-201ENSMUST00000199486 1231 ntTSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Tgfb1P04202 Colec11-203ENSMUST00000220836 887 ntTSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Tgfb1P04202 CT009754.4-201ENSMUST00000221430 565 ntBASIC10.27□□□□□ -0.77
Tgfb1P04202 AC154276.3-201ENSMUST00000227643 998 ntBASIC10.27□□□□□ -0.77
Tgfb1P04202 Gm11938-201ENSMUST00000072306 663 ntAPPRIS P1 BASIC10.27□□□□□ -0.77
Tgfb1P04202 Cfap74-209ENSMUST00000151083 5487 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.27□□□□□ -0.77
Tgfb1P04202 Gm26811-201ENSMUST00000181258 5485 ntTSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Tgfb1P04202 Rtn4ip1-201ENSMUST00000054418 2981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Tgfb1P04202 Tmem140-201ENSMUST00000074949 2614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Tgfb1P04202 Flnc-201ENSMUST00000065090 9038 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Tgfb1P04202 Gm26794-201ENSMUST00000180810 4312 ntTSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Tgfb1P04202 Sh3gl2-201ENSMUST00000030212 2822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Tgfb1P04202 Sox8-201ENSMUST00000025003 3000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Tgfb1P04202 Foxh1-201ENSMUST00000037824 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Tgfb1P04202 Ss18-202ENSMUST00000040964 4153 ntTSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Tgfb1P04202 4930555B11Rik-201ENSMUST00000123210 1533 ntTSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Tgfb1P04202 Elfn1-201ENSMUST00000050519 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Tgfb1P04202 E330034L11Rik-201ENSMUST00000200640 1742 ntBASIC10.27□□□□□ -0.77
Tgfb1P04202 Stk38-201ENSMUST00000009138 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Tgfb1P04202 Pced1a-201ENSMUST00000089581 3496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Tgfb1P04202 Gtf3c1-204ENSMUST00000205659 6570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.27□□□□□ -0.77
Tgfb1P04202 Snx13-202ENSMUST00000163677 3681 ntTSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
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