Protein–RNA interactions for Protein: O89093

Ccl20, C-C motif chemokine 20, mousemouse

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Length 97 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccl20O89093 Add2-203ENSMUST00000203279 1454 ntTSL 2 BASIC9.65□□□□□ -0.87
Ccl20O89093 Galm-201ENSMUST00000039205 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.87
Ccl20O89093 Slc10a3-204ENSMUST00000114147 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.65□□□□□ -0.87
Ccl20O89093 Dkk2-201ENSMUST00000029665 3705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.87
Ccl20O89093 Cln8-201ENSMUST00000027554 6857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.87
Ccl20O89093 Gimap8-202ENSMUST00000203083 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.87
Ccl20O89093 Odf2l-202ENSMUST00000098538 2564 ntTSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.87
Ccl20O89093 Sh2d3c-202ENSMUST00000113242 3107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.87
Ccl20O89093 Gm43064-201ENSMUST00000199710 3144 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.65□□□□□ -0.87
Ccl20O89093 Psd-201ENSMUST00000041391 3900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
Ccl20O89093 Psd-202ENSMUST00000096029 3903 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.64□□□□□ -0.87
Ccl20O89093 4921507G05Rik-201ENSMUST00000181348 1653 ntTSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
Ccl20O89093 Scn5a-203ENSMUST00000120420 7536 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC9.64□□□□□ -0.87
Ccl20O89093 Eif3d-201ENSMUST00000100484 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
Ccl20O89093 Ctnnd1-204ENSMUST00000099941 5783 ntTSL 5 BASIC9.64□□□□□ -0.87
Ccl20O89093 Pcdh10-202ENSMUST00000170695 8234 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
Ccl20O89093 Slc25a25-202ENSMUST00000052119 3529 ntTSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
Ccl20O89093 Gm43152-201ENSMUST00000202495 1638 ntBASIC9.64□□□□□ -0.87
Ccl20O89093 Gphb5-201ENSMUST00000051079 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
Ccl20O89093 Zfp872-202ENSMUST00000178901 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
Ccl20O89093 Armc9-201ENSMUST00000027434 5127 ntTSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
Ccl20O89093 Clip1-202ENSMUST00000063905 4589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.64□□□□□ -0.87
Ccl20O89093 Sertad3-201ENSMUST00000068641 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
Ccl20O89093 Abca3-203ENSMUST00000117337 5202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
Ccl20O89093 Zer1-201ENSMUST00000044751 4100 ntTSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
Ccl20O89093 Tiam2-201ENSMUST00000072156 6127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
Ccl20O89093 Gm5795-201ENSMUST00000100920 984 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.64□□□□□ -0.87
Ccl20O89093 Ypel3-202ENSMUST00000106356 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.64□□□□□ -0.87
Ccl20O89093 Gm22711-201ENSMUST00000116890 133 ntBASIC9.64□□□□□ -0.87
Ccl20O89093 Zfp36l1-ps-201ENSMUST00000118349 899 ntBASIC9.64□□□□□ -0.87
Ccl20O89093 Gm8302-201ENSMUST00000119217 852 ntBASIC9.64□□□□□ -0.87
Ccl20O89093 Gm11941-201ENSMUST00000119904 610 ntBASIC9.64□□□□□ -0.87
Ccl20O89093 Gm16219-201ENSMUST00000120096 274 ntBASIC9.64□□□□□ -0.87
Ccl20O89093 Csf1-204ENSMUST00000120654 821 ntTSL 3 BASIC9.64□□□□□ -0.87
Ccl20O89093 Gm14396-201ENSMUST00000126966 548 ntTSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
Ccl20O89093 Gm10714-201ENSMUST00000131346 874 ntTSL 2 BASIC9.64□□□□□ -0.87
Ccl20O89093 Gm15738-202ENSMUST00000140892 427 ntTSL 2 BASIC9.64□□□□□ -0.87
Ccl20O89093 Hnf4aos-203ENSMUST00000141329 839 ntTSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
Ccl20O89093 Gm3948-201ENSMUST00000147795 421 ntTSL 3 BASIC9.64□□□□□ -0.87
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Ccl20O89093 H2-M2-202ENSMUST00000171139 1298 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
Ccl20O89093 Gstt3-203ENSMUST00000173537 687 ntTSL 3 BASIC9.64□□□□□ -0.87
Ccl20O89093 Gm23694-201ENSMUST00000179335 110 ntBASIC9.64□□□□□ -0.87
Ccl20O89093 Dynlt1b-201ENSMUST00000179569 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
Ccl20O89093 Mir99ahg-209ENSMUST00000182820 835 ntTSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
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Ccl20O89093 Eloc-207ENSMUST00000187910 620 ntTSL 2 BASIC9.64□□□□□ -0.87
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Ccl20O89093 Hsd17b3-201ENSMUST00000039832 1131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
Ccl20O89093 9430041J12Rik-201ENSMUST00000050989 534 ntBASIC9.64□□□□□ -0.87
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Ccl20O89093 Acsbg1-201ENSMUST00000034822 2880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
Ccl20O89093 Anxa7-201ENSMUST00000065504 2851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
Ccl20O89093 Ass1-201ENSMUST00000102840 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
Ccl20O89093 Slc25a17-201ENSMUST00000023040 1667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
Ccl20O89093 Grik1-201ENSMUST00000023652 3554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
Ccl20O89093 Lman1-201ENSMUST00000048260 3563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
Ccl20O89093 Zdbf2-202ENSMUST00000114132 12629 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.64□□□□□ -0.87
Ccl20O89093 Gm11571-201ENSMUST00000136820 2396 ntTSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
Ccl20O89093 Atcayos-203ENSMUST00000150782 3057 ntTSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
Ccl20O89093 Ogfod1-202ENSMUST00000093301 5141 ntTSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
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Ccl20O89093 Armcx2-202ENSMUST00000113193 3666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
Ccl20O89093 Gm6580-201ENSMUST00000117504 1357 ntBASIC9.63□□□□□ -0.87
Ccl20O89093 4833422M21Rik-203ENSMUST00000181747 1365 ntTSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
Ccl20O89093 5330439B14Rik-201ENSMUST00000194811 1392 ntTSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
Ccl20O89093 Cacna1c-219ENSMUST00000189389 6603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.63□□□□□ -0.87
Ccl20O89093 Kcnj9-201ENSMUST00000062387 3857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
Ccl20O89093 Gm45161-201ENSMUST00000207316 2263 ntBASIC9.63□□□□□ -0.87
Ccl20O89093 Abi1-206ENSMUST00000126112 3360 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
Ccl20O89093 AC108416.1-201ENSMUST00000228755 1558 ntBASIC9.63□□□□□ -0.87
Ccl20O89093 Arhgap24-205ENSMUST00000112853 2853 ntTSL 5 BASIC9.63□□□□□ -0.87
Ccl20O89093 Cops7a-202ENSMUST00000112439 1328 ntTSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
Ccl20O89093 Med17-201ENSMUST00000034411 3964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
Ccl20O89093 8430408G22Rik-201ENSMUST00000067354 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
Ccl20O89093 Aldh3a1-202ENSMUST00000108716 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
Ccl20O89093 Syncrip-208ENSMUST00000174282 3404 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
Ccl20O89093 Gdf2-201ENSMUST00000100720 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
Ccl20O89093 Gm22920-201ENSMUST00000102175 109 ntBASIC9.63□□□□□ -0.87
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