Protein–RNA interactions for Protein: F6VKC7

Zfp988, Zinc finger protein 988, mousemouse

Predictions only

Length 633 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zfp988F6VKC7 Slc2a10-201ENSMUST00000029196 3544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Zfp988F6VKC7 AC155245.1-201ENSMUST00000222266 1804 ntBASIC10□□□□□ -0.81
Zfp988F6VKC7 Ppp1r18-201ENSMUST00000113814 3131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Zfp988F6VKC7 Slc25a51-201ENSMUST00000107796 4433 ntTSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Zfp988F6VKC7 Vipr2-201ENSMUST00000011315 3383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Zfp988F6VKC7 Topors-201ENSMUST00000042575 3856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Zfp988F6VKC7 Daw1-201ENSMUST00000065403 1651 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10□□□□□ -0.81
Zfp988F6VKC7 Oc90-202ENSMUST00000079776 1670 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Zfp988F6VKC7 Usp2-203ENSMUST00000114830 2122 ntTSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Zfp988F6VKC7 Ptbp1-202ENSMUST00000095457 2598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Zfp988F6VKC7 Tacc2-205ENSMUST00000207282 3464 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Zfp988F6VKC7 Tyk2-201ENSMUST00000001036 4619 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10□□□□□ -0.81
Zfp988F6VKC7 Satb1-207ENSMUST00000140979 3748 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10□□□□□ -0.81
Zfp988F6VKC7 Cct3-208ENSMUST00000168062 1943 ntTSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Zfp988F6VKC7 Tbc1d17-201ENSMUST00000047085 8750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Zfp988F6VKC7 Brat1-201ENSMUST00000041588 3333 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Zfp988F6VKC7 Tspear-201ENSMUST00000092366 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Zfp988F6VKC7 Snord17-201ENSMUST00000104526 238 ntBASIC10□□□□□ -0.81
Zfp988F6VKC7 Skap1-206ENSMUST00000107663 742 ntTSL 3 BASIC10□□□□□ -0.81
Zfp988F6VKC7 Gm12218-201ENSMUST00000117666 399 ntBASIC10□□□□□ -0.81
Zfp988F6VKC7 Cspp1-204ENSMUST00000119714 1268 ntTSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Zfp988F6VKC7 Gm14395-201ENSMUST00000120494 563 ntBASIC10□□□□□ -0.81
Zfp988F6VKC7 Dmrtc1a-204ENSMUST00000121197 1067 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Zfp988F6VKC7 Gm13605-201ENSMUST00000124489 658 ntTSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Zfp988F6VKC7 Nr5a1os-201ENSMUST00000146954 926 ntTSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Zfp988F6VKC7 Gm8546-201ENSMUST00000178288 1264 ntBASIC10□□□□□ -0.81
Zfp988F6VKC7 Csmd2os-202ENSMUST00000179945 643 ntTSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Zfp988F6VKC7 Smim22-207ENSMUST00000184439 382 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC10□□□□□ -0.81
Zfp988F6VKC7 Mrip-ps-201ENSMUST00000184613 940 ntBASIC10□□□□□ -0.81
Zfp988F6VKC7 Ly6e-203ENSMUST00000185861 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10□□□□□ -0.81
Zfp988F6VKC7 Stpg4-202ENSMUST00000186211 591 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10□□□□□ -0.81
Zfp988F6VKC7 Gm29067-201ENSMUST00000190821 470 ntBASIC10□□□□□ -0.81
Zfp988F6VKC7 Gm18753-201ENSMUST00000201000 566 ntBASIC10□□□□□ -0.81
Zfp988F6VKC7 Gm8615-202ENSMUST00000201946 737 ntTSL 3 BASIC10□□□□□ -0.81
Zfp988F6VKC7 AC154257.1-202ENSMUST00000224729 843 ntBASIC10□□□□□ -0.81
Zfp988F6VKC7 1700061G19Rik-201ENSMUST00000025048 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Zfp988F6VKC7 D830039M14Rik-202ENSMUST00000217740 3362 ntBASIC10□□□□□ -0.81
Zfp988F6VKC7 Sept9-202ENSMUST00000093907 3616 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Zfp988F6VKC7 Arfgap3-202ENSMUST00000226124 2461 ntAPPRIS ALT2 BASIC10□□□□□ -0.81
Zfp988F6VKC7 Eef1a1-201ENSMUST00000042235 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Zfp988F6VKC7 Rnf144b-201ENSMUST00000068891 4640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Zfp988F6VKC7 Smg6-201ENSMUST00000045281 5848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Zfp988F6VKC7 Cacna1c-224ENSMUST00000219018 7516 ntTSL 5 BASIC10□□□□□ -0.81
Zfp988F6VKC7 Myh8-201ENSMUST00000019625 6149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Zfp988F6VKC7 Gm5441-201ENSMUST00000186454 5181 ntTSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Zfp988F6VKC7 Capn5-201ENSMUST00000040971 4498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Zfp988F6VKC7 Gm44153-201ENSMUST00000204162 1580 ntBASIC10□□□□□ -0.81
Zfp988F6VKC7 Ntrk2-207ENSMUST00000225488 4706 ntAPPRIS P1 BASIC10□□□□□ -0.81
Zfp988F6VKC7 Slc43a1-204ENSMUST00000121114 3089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Zfp988F6VKC7 Kcnh3-201ENSMUST00000041415 3583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Zfp988F6VKC7 Trim25-201ENSMUST00000000284 5566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Zfp988F6VKC7 Ncor2-202ENSMUST00000086083 8575 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10□□□□□ -0.81
Zfp988F6VKC7 Baiap3-206ENSMUST00000182825 3862 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10□□□□□ -0.81
Zfp988F6VKC7 Htr1d-203ENSMUST00000121571 2426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Zfp988F6VKC7 Gm15674-201ENSMUST00000143266 2438 ntTSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Zfp988F6VKC7 D130019J16Rik-201ENSMUST00000193261 2158 ntBASIC9.99□□□□□ -0.81
Zfp988F6VKC7 Acox3-203ENSMUST00000114237 2956 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Zfp988F6VKC7 Tnc-203ENSMUST00000107372 7106 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.99□□□□□ -0.81
Zfp988F6VKC7 Pax5-203ENSMUST00000107825 1445 ntTSL 5 BASIC9.99□□□□□ -0.81
Zfp988F6VKC7 Sap18-204ENSMUST00000128764 5125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Zfp988F6VKC7 Zfp420-202ENSMUST00000074876 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Zfp988F6VKC7 Pcdha6-201ENSMUST00000193389 4653 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Zfp988F6VKC7 Gm13684-201ENSMUST00000152569 2264 ntTSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Zfp988F6VKC7 Atp1a3-205ENSMUST00000196684 3642 ntTSL 5 BASIC9.99□□□□□ -0.81
Zfp988F6VKC7 Lingo1-206ENSMUST00000210032 3627 ntTSL 5 BASIC9.99□□□□□ -0.81
Zfp988F6VKC7 Prss57-203ENSMUST00000169684 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Zfp988F6VKC7 G630064G18Rik-201ENSMUST00000209814 1795 ntTSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Zfp988F6VKC7 CK137956-201ENSMUST00000030614 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Zfp988F6VKC7 Efcab14-203ENSMUST00000106524 1544 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.99□□□□□ -0.81
Zfp988F6VKC7 Rab11fip2-202ENSMUST00000170819 1539 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.99□□□□□ -0.81
Zfp988F6VKC7 Gtf3c2-201ENSMUST00000088010 4552 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Zfp988F6VKC7 Col6a4-201ENSMUST00000121963 7371 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.99□□□□□ -0.81
Zfp988F6VKC7 Tex10-206ENSMUST00000164866 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Zfp988F6VKC7 Gm10848-201ENSMUST00000192361 1811 ntTSL 2 BASIC9.99□□□□□ -0.81
Zfp988F6VKC7 Mybph-201ENSMUST00000038445 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Zfp988F6VKC7 Ndufa11-201ENSMUST00000002452 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Zfp988F6VKC7 Gm25076-201ENSMUST00000104098 132 ntBASIC9.99□□□□□ -0.81
Zfp988F6VKC7 Ttc4-202ENSMUST00000106772 935 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.99□□□□□ -0.81
Zfp988F6VKC7 Gm15528-201ENSMUST00000117821 864 ntBASIC9.99□□□□□ -0.81
Zfp988F6VKC7 Gng7-205ENSMUST00000118465 875 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Zfp988F6VKC7 Cfap100-204ENSMUST00000134224 849 ntTSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Zfp988F6VKC7 Gm11815-201ENSMUST00000139423 708 ntTSL 5 BASIC9.99□□□□□ -0.81
Zfp988F6VKC7 Nudt6-207ENSMUST00000141438 899 ntTSL 2 BASIC9.99□□□□□ -0.81
Zfp988F6VKC7 Gm24992-201ENSMUST00000157412 130 ntBASIC9.99□□□□□ -0.81
Zfp988F6VKC7 H2-M2-202ENSMUST00000171139 1298 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Zfp988F6VKC7 Gstt3-203ENSMUST00000173537 687 ntTSL 3 BASIC9.99□□□□□ -0.81
Zfp988F6VKC7 Gm19246-201ENSMUST00000173599 255 ntBASIC9.99□□□□□ -0.81
Zfp988F6VKC7 Apoe-210ENSMUST00000174710 514 ntTSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Zfp988F6VKC7 5730585A16Rik-201ENSMUST00000193457 1027 ntBASIC9.99□□□□□ -0.81
Zfp988F6VKC7 Gm9645-201ENSMUST00000197131 792 ntBASIC9.99□□□□□ -0.81
Zfp988F6VKC7 Gm38804-201ENSMUST00000203998 767 ntTSL 3 BASIC9.99□□□□□ -0.81
Zfp988F6VKC7 Nt5dc1-206ENSMUST00000213269 802 ntTSL 5 BASIC9.99□□□□□ -0.81
Zfp988F6VKC7 Gm7183-201ENSMUST00000213870 1005 ntBASIC9.99□□□□□ -0.81
Zfp988F6VKC7 1600002K03Rik-201ENSMUST00000041882 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Zfp988F6VKC7 Mlf1-201ENSMUST00000061322 1113 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Zfp988F6VKC7 Actg-ps1-201ENSMUST00000099636 1124 ntBASIC9.99□□□□□ -0.81
Zfp988F6VKC7 Dpysl4-201ENSMUST00000026551 3552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Zfp988F6VKC7 Lyplal1-201ENSMUST00000045388 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Zfp988F6VKC7 Rasgrp4-210ENSMUST00000203070 3008 ntTSL 5 BASIC9.99□□□□□ -0.81
Zfp988F6VKC7 Wbp1l-204ENSMUST00000138302 3900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48 ms