Protein–RNA interactions for Protein: E9Q2C0

Cfap46, Cilia and flagella-associated protein 46, mousemouse

Predictions only

Length 2,641 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cfap46E9Q2C0 Tbc1d16-201ENSMUST00000036113 6986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Cfap46E9Q2C0 Gfap-201ENSMUST00000067444 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Cfap46E9Q2C0 A530053M12Rik-201ENSMUST00000187918 1467 ntTSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Cfap46E9Q2C0 Phka1-206ENSMUST00000122022 6115 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.35□□□□□ -0.75
Cfap46E9Q2C0 Phka1-202ENSMUST00000052012 6115 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Cfap46E9Q2C0 1700019D03Rik-201ENSMUST00000050567 3641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Cfap46E9Q2C0 Ino80-201ENSMUST00000049920 6354 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.35□□□□□ -0.75
Cfap46E9Q2C0 Bpgm-201ENSMUST00000045372 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Cfap46E9Q2C0 Grik4-201ENSMUST00000034515 3413 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.35□□□□□ -0.75
Cfap46E9Q2C0 Gm44190-201ENSMUST00000205083 1401 ntBASIC10.35□□□□□ -0.75
Cfap46E9Q2C0 Camta1-201ENSMUST00000049790 8423 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.35□□□□□ -0.75
Cfap46E9Q2C0 Nrg1-211ENSMUST00000208497 2096 ntTSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Cfap46E9Q2C0 Tnk2-204ENSMUST00000115123 4225 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.35□□□□□ -0.75
Cfap46E9Q2C0 Lgr5-201ENSMUST00000020350 4714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Cfap46E9Q2C0 Fam220-ps-201ENSMUST00000116535 783 ntBASIC10.35□□□□□ -0.75
Cfap46E9Q2C0 Gm13580-201ENSMUST00000131457 566 ntTSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Cfap46E9Q2C0 Gm16552-201ENSMUST00000162348 685 ntTSL 3 BASIC10.35□□□□□ -0.75
Cfap46E9Q2C0 Gm4858-201ENSMUST00000179064 735 ntTSL 5 BASIC10.35□□□□□ -0.75
Cfap46E9Q2C0 AU022754-201ENSMUST00000180441 2976 ntTSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Cfap46E9Q2C0 Ints5-203ENSMUST00000191089 568 ntTSL 5 BASIC10.35□□□□□ -0.75
Cfap46E9Q2C0 Fxyd1-201ENSMUST00000039909 620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.35□□□□□ -0.75
Cfap46E9Q2C0 Elfn1-201ENSMUST00000050519 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Cfap46E9Q2C0 Gm8186-201ENSMUST00000053575 386 ntAPPRIS P1 BASIC10.35□□□□□ -0.75
Cfap46E9Q2C0 Bahcc1-201ENSMUST00000044985 10726 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.35□□□□□ -0.75
Cfap46E9Q2C0 Hsd17b6-203ENSMUST00000219447 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Cfap46E9Q2C0 Pou2af1-201ENSMUST00000034554 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Cfap46E9Q2C0 Tbc1d4-209ENSMUST00000161991 6483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.34□□□□□ -0.75
Cfap46E9Q2C0 Satb2-202ENSMUST00000114415 5805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Cfap46E9Q2C0 Lnx2-201ENSMUST00000016664 4557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Cfap46E9Q2C0 H3f3b-201ENSMUST00000016703 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Cfap46E9Q2C0 Ccdc62-201ENSMUST00000094320 3924 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.34□□□□□ -0.75
Cfap46E9Q2C0 Acnat2-202ENSMUST00000107698 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Cfap46E9Q2C0 Olfr582-203ENSMUST00000211036 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.34□□□□□ -0.75
Cfap46E9Q2C0 Tcf4-243ENSMUST00000202057 1941 ntTSL 5 BASIC10.34□□□□□ -0.75
Cfap46E9Q2C0 Drc3-202ENSMUST00000094140 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Cfap46E9Q2C0 Gm36995-201ENSMUST00000126170 5727 ntTSL 2 BASIC10.34□□□□□ -0.75
Cfap46E9Q2C0 Zfp341-201ENSMUST00000081926 3299 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Cfap46E9Q2C0 6820426E19Rik-201ENSMUST00000204274 1970 ntTSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Cfap46E9Q2C0 Bckdk-202ENSMUST00000124533 1792 ntTSL 3 BASIC10.34□□□□□ -0.75
Cfap46E9Q2C0 Zfand4-210ENSMUST00000223495 1751 ntTSL 5 BASIC10.34□□□□□ -0.75
Cfap46E9Q2C0 Pigc-205ENSMUST00000193784 4207 ntAPPRIS P1 BASIC10.34□□□□□ -0.75
Cfap46E9Q2C0 Rsad1-201ENSMUST00000040487 4143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Cfap46E9Q2C0 Gm12028-201ENSMUST00000118065 436 ntBASIC10.34□□□□□ -0.75
Cfap46E9Q2C0 Aamdc-206ENSMUST00000136757 789 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.34□□□□□ -0.75
Cfap46E9Q2C0 1110028F11Rik-201ENSMUST00000137077 837 ntTSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Cfap46E9Q2C0 4930507D10Rik-201ENSMUST00000137411 1152 ntTSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Cfap46E9Q2C0 Gm26725-201ENSMUST00000180652 1113 ntTSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Cfap46E9Q2C0 Rpl15-ps2-201ENSMUST00000184247 613 ntBASIC10.34□□□□□ -0.75
Cfap46E9Q2C0 Gm45808-201ENSMUST00000210701 789 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.34□□□□□ -0.75
Cfap46E9Q2C0 Gm39147-202ENSMUST00000211730 882 ntTSL 5 BASIC10.34□□□□□ -0.75
Cfap46E9Q2C0 Gm31763-201ENSMUST00000217788 673 ntTSL 3 BASIC10.34□□□□□ -0.75
Cfap46E9Q2C0 Zc3h7a-201ENSMUST00000037633 3825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Cfap46E9Q2C0 Upk3b-201ENSMUST00000062606 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Cfap46E9Q2C0 Fam173b-203ENSMUST00000161061 2364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Cfap46E9Q2C0 Tecpr1-201ENSMUST00000085701 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Cfap46E9Q2C0 Rin1-201ENSMUST00000025818 4184 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Cfap46E9Q2C0 Gli2-201ENSMUST00000062483 6637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Cfap46E9Q2C0 Col20a1-201ENSMUST00000108856 4489 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.34□□□□□ -0.75
Cfap46E9Q2C0 AC132833.1-202ENSMUST00000228875 1690 ntBASIC10.34□□□□□ -0.75
Cfap46E9Q2C0 Prkd2-201ENSMUST00000086104 3628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Cfap46E9Q2C0 Gipr-201ENSMUST00000094790 2856 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.34□□□□□ -0.75
Cfap46E9Q2C0 Gm11413-201ENSMUST00000155822 1461 ntTSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Cfap46E9Q2C0 Ighv1-49-201ENSMUST00000103519 294 ntAPPRIS P1 BASIC10.34□□□□□ -0.75
Cfap46E9Q2C0 Cryzl1-202ENSMUST00000114023 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Cfap46E9Q2C0 Gm14639-201ENSMUST00000120850 866 ntBASIC10.34□□□□□ -0.75
Cfap46E9Q2C0 Cryzl1-206ENSMUST00000124282 1187 ntTSL 5 BASIC10.34□□□□□ -0.75
Cfap46E9Q2C0 Gm15929-201ENSMUST00000138926 1161 ntTSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Cfap46E9Q2C0 Gm11521-201ENSMUST00000143302 329 ntTSL 3 BASIC10.34□□□□□ -0.75
Cfap46E9Q2C0 Rpl17-ps11-201ENSMUST00000161946 729 ntBASIC10.34□□□□□ -0.75
Cfap46E9Q2C0 1700021P04Rik-201ENSMUST00000178667 659 ntTSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Cfap46E9Q2C0 Gm37723-201ENSMUST00000194480 565 ntBASIC10.34□□□□□ -0.75
Cfap46E9Q2C0 Gm42908-201ENSMUST00000197508 870 ntBASIC10.34□□□□□ -0.75
Cfap46E9Q2C0 Olfr1358-201ENSMUST00000204477 1064 ntAPPRIS P1 BASIC10.34□□□□□ -0.75
Cfap46E9Q2C0 Il18-203ENSMUST00000213916 885 ntTSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Cfap46E9Q2C0 AC156633.1-201ENSMUST00000215971 614 ntTSL 2 BASIC10.34□□□□□ -0.75
Cfap46E9Q2C0 Mkks-202ENSMUST00000110089 3178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Cfap46E9Q2C0 Magel2-201ENSMUST00000080403 4631 ntAPPRIS P1 BASIC10.34□□□□□ -0.75
Cfap46E9Q2C0 Orc4-201ENSMUST00000028098 4066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Cfap46E9Q2C0 Itgal-204ENSMUST00000120857 4533 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Cfap46E9Q2C0 C77080-203ENSMUST00000106051 5049 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Cfap46E9Q2C0 Gm44806-201ENSMUST00000205574 2303 ntBASIC10.33□□□□□ -0.76
Cfap46E9Q2C0 Gm37582-201ENSMUST00000192953 1409 ntBASIC10.33□□□□□ -0.76
Cfap46E9Q2C0 Rgs12-207ENSMUST00000114285 2924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.33□□□□□ -0.76
Cfap46E9Q2C0 Rxrg-201ENSMUST00000015987 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Cfap46E9Q2C0 Gm8725-201ENSMUST00000221829 1333 ntBASIC10.33□□□□□ -0.76
Cfap46E9Q2C0 Ap1s2-203ENSMUST00000112294 3199 ntTSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Cfap46E9Q2C0 Ly6e-210ENSMUST00000188866 2068 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.33□□□□□ -0.76
Cfap46E9Q2C0 Gnat2-201ENSMUST00000058669 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Cfap46E9Q2C0 Ccdc85a-206ENSMUST00000146385 3798 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.33□□□□□ -0.76
Cfap46E9Q2C0 Pkib-203ENSMUST00000095668 3311 ntTSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Cfap46E9Q2C0 Brd4-202ENSMUST00000114475 2731 ntTSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Cfap46E9Q2C0 Cst10-202ENSMUST00000109938 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.33□□□□□ -0.76
Cfap46E9Q2C0 Gm24140-201ENSMUST00000122773 326 ntBASIC10.33□□□□□ -0.76
Cfap46E9Q2C0 Xbp1-204ENSMUST00000149623 897 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.33□□□□□ -0.76
Cfap46E9Q2C0 Gm14715-201ENSMUST00000156823 643 ntTSL 3 BASIC10.33□□□□□ -0.76
Cfap46E9Q2C0 Lrrc27-201ENSMUST00000016124 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Cfap46E9Q2C0 Gstt3-203ENSMUST00000173537 687 ntTSL 3 BASIC10.33□□□□□ -0.76
Cfap46E9Q2C0 1700019D03Rik-207ENSMUST00000191441 638 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.33□□□□□ -0.76
Cfap46E9Q2C0 Pdcd5-ps-201ENSMUST00000191699 381 ntBASIC10.33□□□□□ -0.76
Cfap46E9Q2C0 Gm44323-201ENSMUST00000198689 129 ntBASIC10.33□□□□□ -0.76
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.3 ms