Protein–RNA interactions for Protein: B2RUQ2

Usf3, Gene model 608, (NCBI), mousemouse

Predictions only

Length 2,221 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usf3B2RUQ2 Gm37793-201ENSMUST00000195548 695 ntBASIC9.29□□□□□ -0.92
Usf3B2RUQ2 Gm6855-201ENSMUST00000206307 790 ntBASIC9.29□□□□□ -0.92
Usf3B2RUQ2 AC156568.1-201ENSMUST00000223018 712 ntTSL 1 (best) BASIC9.29□□□□□ -0.92
Usf3B2RUQ2 Sapcd1-201ENSMUST00000040151 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.29□□□□□ -0.92
Usf3B2RUQ2 Pigb-206ENSMUST00000184035 3221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.29□□□□□ -0.92
Usf3B2RUQ2 Nod1-201ENSMUST00000060655 4315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.29□□□□□ -0.92
Usf3B2RUQ2 Ccdc90b-202ENSMUST00000085017 1494 ntTSL 1 (best) BASIC9.29□□□□□ -0.92
Usf3B2RUQ2 Cinp-201ENSMUST00000043716 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.29□□□□□ -0.92
Usf3B2RUQ2 Zfp384-205ENSMUST00000112424 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.29□□□□□ -0.92
Usf3B2RUQ2 Ccl22-201ENSMUST00000034231 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.29□□□□□ -0.92
Usf3B2RUQ2 Lamb3-209ENSMUST00000194677 4867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.29□□□□□ -0.92
Usf3B2RUQ2 Tfrc-201ENSMUST00000023486 4890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.29□□□□□ -0.92
Usf3B2RUQ2 Cage1-201ENSMUST00000074969 2856 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.29□□□□□ -0.92
Usf3B2RUQ2 Gm6655-201ENSMUST00000201932 1309 ntBASIC9.29□□□□□ -0.92
Usf3B2RUQ2 Sel1l-210ENSMUST00000178462 6150 ntTSL 5 BASIC9.29□□□□□ -0.92
Usf3B2RUQ2 Nectin4-201ENSMUST00000006578 3636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.29□□□□□ -0.92
Usf3B2RUQ2 Bicra-201ENSMUST00000094821 5360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.29□□□□□ -0.92
Usf3B2RUQ2 Jarid2-201ENSMUST00000044608 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.29□□□□□ -0.92
Usf3B2RUQ2 Cdh15-201ENSMUST00000034443 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.28□□□□□ -0.92
Usf3B2RUQ2 Adprhl1-205ENSMUST00000204916 5228 ntTSL 5 BASIC9.28□□□□□ -0.92
Usf3B2RUQ2 Vwa5b2-207ENSMUST00000159780 4042 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.28□□□□□ -0.92
Usf3B2RUQ2 Bbip1-201ENSMUST00000135402 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.28□□□□□ -0.92
Usf3B2RUQ2 Ccnb1-201ENSMUST00000072119 2489 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.28□□□□□ -0.92
Usf3B2RUQ2 Rasal1-201ENSMUST00000031606 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.28□□□□□ -0.92
Usf3B2RUQ2 Papln-202ENSMUST00000121733 4373 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.28□□□□□ -0.92
Usf3B2RUQ2 Rpl23-201ENSMUST00000103146 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.28□□□□□ -0.92
Usf3B2RUQ2 Igkv3-12-201ENSMUST00000103396 359 ntAPPRIS P1 BASIC9.28□□□□□ -0.92
Usf3B2RUQ2 Gm15374-201ENSMUST00000119313 844 ntBASIC9.28□□□□□ -0.92
Usf3B2RUQ2 Gm14055-201ENSMUST00000130262 668 ntTSL 5 BASIC9.28□□□□□ -0.92
Usf3B2RUQ2 Cideb-201ENSMUST00000001497 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.28□□□□□ -0.92
Usf3B2RUQ2 Sorcs1-203ENSMUST00000164039 7241 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC9.28□□□□□ -0.92
Usf3B2RUQ2 Elof1-202ENSMUST00000166335 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.28□□□□□ -0.92
Usf3B2RUQ2 Uba52-ps-201ENSMUST00000183770 379 ntBASIC9.28□□□□□ -0.92
Usf3B2RUQ2 Gm18801-201ENSMUST00000186616 536 ntBASIC9.28□□□□□ -0.92
Usf3B2RUQ2 Gm19587-201ENSMUST00000191395 545 ntBASIC9.28□□□□□ -0.92
Usf3B2RUQ2 AC164087.2-201ENSMUST00000216206 1072 ntBASIC9.28□□□□□ -0.92
Usf3B2RUQ2 Gm4811-201ENSMUST00000220879 1220 ntBASIC9.28□□□□□ -0.92
Usf3B2RUQ2 AC165154.1-201ENSMUST00000226661 340 ntBASIC9.28□□□□□ -0.92
Usf3B2RUQ2 Cxcl1-201ENSMUST00000031327 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.28□□□□□ -0.92
Usf3B2RUQ2 Hspb11-201ENSMUST00000046558 608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.28□□□□□ -0.92
Usf3B2RUQ2 Gm4978-201ENSMUST00000071565 801 ntBASIC9.28□□□□□ -0.92
Usf3B2RUQ2 Mkks-202ENSMUST00000110089 3178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.28□□□□□ -0.92
Usf3B2RUQ2 Hnrnph2-205ENSMUST00000113203 2315 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.28□□□□□ -0.92
Usf3B2RUQ2 Pigc-205ENSMUST00000193784 4207 ntAPPRIS P1 BASIC9.28□□□□□ -0.92
Usf3B2RUQ2 Pcnx3-202ENSMUST00000113615 7264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.28□□□□□ -0.92
Usf3B2RUQ2 Tbc1d14-210ENSMUST00000140607 4649 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC9.28□□□□□ -0.92
Usf3B2RUQ2 Zfp862-ps-204ENSMUST00000204484 6065 ntTSL 1 (best) BASIC9.28□□□□□ -0.92
Usf3B2RUQ2 Tex13c1-201ENSMUST00000105113 2074 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.28□□□□□ -0.92
Usf3B2RUQ2 Nfx1-202ENSMUST00000091614 3617 ntTSL 1 (best) BASIC9.28□□□□□ -0.92
Usf3B2RUQ2 Pik3cd-202ENSMUST00000105688 4335 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.28□□□□□ -0.92
Usf3B2RUQ2 Rpap1-202ENSMUST00000099529 4813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.28□□□□□ -0.92
Usf3B2RUQ2 Olfr5-202ENSMUST00000209866 2980 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.28□□□□□ -0.92
Usf3B2RUQ2 Enox1-203ENSMUST00000227662 3064 ntAPPRIS ALT2 BASIC9.28□□□□□ -0.92
Usf3B2RUQ2 C3-201ENSMUST00000024988 5136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.28□□□□□ -0.92
Usf3B2RUQ2 Ccdc24-206ENSMUST00000164853 3990 ntTSL 2 BASIC9.28□□□□□ -0.92
Usf3B2RUQ2 Enpp7-202ENSMUST00000106273 1408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.28□□□□□ -0.92
Usf3B2RUQ2 Dpep1-201ENSMUST00000019422 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.28□□□□□ -0.92
Usf3B2RUQ2 Wdr78-203ENSMUST00000106868 4045 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.28□□□□□ -0.92
Usf3B2RUQ2 Ddx11-201ENSMUST00000163605 4149 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.28□□□□□ -0.92
Usf3B2RUQ2 Krt7-201ENSMUST00000068904 4094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.28□□□□□ -0.92
Usf3B2RUQ2 Palb2-204ENSMUST00000106469 2559 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.28□□□□□ -0.92
Usf3B2RUQ2 Slc9a3-204ENSMUST00000225423 2589 ntAPPRIS ALT2 BASIC9.28□□□□□ -0.92
Usf3B2RUQ2 Mettl14-204ENSMUST00000174323 4202 ntTSL 1 (best) BASIC9.28□□□□□ -0.92
Usf3B2RUQ2 Igf1-207ENSMUST00000122386 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.28□□□□□ -0.92
Usf3B2RUQ2 Nudt6-203ENSMUST00000108117 879 ntTSL 5 BASIC9.28□□□□□ -0.92
Usf3B2RUQ2 Prr33-202ENSMUST00000151580 399 ntTSL 5 BASIC9.28□□□□□ -0.92
Usf3B2RUQ2 Lyzl4os-202ENSMUST00000156364 726 ntTSL 1 (best) BASIC9.28□□□□□ -0.92
Usf3B2RUQ2 3110031N09Rik-201ENSMUST00000201115 326 ntBASIC9.28□□□□□ -0.92
Usf3B2RUQ2 Gm43969-201ENSMUST00000204833 535 ntBASIC9.28□□□□□ -0.92
Usf3B2RUQ2 Gm29763-201ENSMUST00000205306 616 ntBASIC9.28□□□□□ -0.92
Usf3B2RUQ2 AC160028.1-201ENSMUST00000219645 1095 ntTSL 1 (best) BASIC9.28□□□□□ -0.92
Usf3B2RUQ2 5830428M24Rik-201ENSMUST00000221805 825 ntTSL 2 BASIC9.28□□□□□ -0.92
Usf3B2RUQ2 AC159002.1-201ENSMUST00000226714 924 ntBASIC9.28□□□□□ -0.92
Usf3B2RUQ2 Nmi-201ENSMUST00000028314 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.28□□□□□ -0.92
Usf3B2RUQ2 Mnd1-201ENSMUST00000047368 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.28□□□□□ -0.92
Usf3B2RUQ2 Gm16380-201ENSMUST00000077997 478 ntBASIC9.28□□□□□ -0.92
Usf3B2RUQ2 n-R5s185-201ENSMUST00000083953 119 ntBASIC9.28□□□□□ -0.92
Usf3B2RUQ2 Olfr1339-201ENSMUST00000094832 948 ntAPPRIS P1 BASIC9.28□□□□□ -0.92
Usf3B2RUQ2 Ebf3-202ENSMUST00000106118 3736 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC9.28□□□□□ -0.92
Usf3B2RUQ2 D930048N14Rik-202ENSMUST00000117859 3410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.28□□□□□ -0.92
Usf3B2RUQ2 Mamdc2-201ENSMUST00000036069 3338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.28□□□□□ -0.92
Usf3B2RUQ2 Gm37031-201ENSMUST00000195487 2530 ntBASIC9.28□□□□□ -0.92
Usf3B2RUQ2 Slc22a14-201ENSMUST00000093775 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.28□□□□□ -0.92
Usf3B2RUQ2 Hyal3-201ENSMUST00000040059 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.28□□□□□ -0.92
Usf3B2RUQ2 Sec16a-201ENSMUST00000091252 8737 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.28□□□□□ -0.92
Usf3B2RUQ2 Gm3716-202ENSMUST00000198582 2879 ntTSL 1 (best) BASIC9.28□□□□□ -0.92
Usf3B2RUQ2 Trim23-203ENSMUST00000069187 3546 ntTSL 1 (best) BASIC9.28□□□□□ -0.92
Usf3B2RUQ2 Anxa6-201ENSMUST00000102727 2471 ntTSL 1 (best) BASIC9.28□□□□□ -0.92
Usf3B2RUQ2 Txndc16-203ENSMUST00000123879 4069 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.27□□□□□ -0.92
Usf3B2RUQ2 Rab11fip4os1-201ENSMUST00000145652 2187 ntTSL 1 (best) BASIC9.27□□□□□ -0.92
Usf3B2RUQ2 Pigq-219ENSMUST00000208071 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.27□□□□□ -0.92
Usf3B2RUQ2 Esco1-201ENSMUST00000025142 4433 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.27□□□□□ -0.92
Usf3B2RUQ2 Ndrg4-203ENSMUST00000080666 2738 ntTSL 1 (best) BASIC9.27□□□□□ -0.92
Usf3B2RUQ2 Gm8110-202ENSMUST00000211297 1782 ntTSL 5 BASIC9.27□□□□□ -0.92
Usf3B2RUQ2 Gpcpd1-205ENSMUST00000110142 3703 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.27□□□□□ -0.92
Usf3B2RUQ2 Gm21358-201ENSMUST00000191645 1659 ntBASIC9.27□□□□□ -0.92
Usf3B2RUQ2 Son-203ENSMUST00000117633 8731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.27□□□□□ -0.92
Usf3B2RUQ2 Fdft1-201ENSMUST00000054963 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.27□□□□□ -0.92
Usf3B2RUQ2 4933407I05Rik-204ENSMUST00000217562 1561 ntBASIC9.27□□□□□ -0.92
Usf3B2RUQ2 Rnasel-204ENSMUST00000182538 2761 ntTSL 1 (best) BASIC9.27□□□□□ -0.92
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51.4 ms