Protein–RNA interactions for Protein: A0A0N4SWI3

D6Ertd527e, DNA segment, Chr 6, ERATO Doi 527,-expressed, mousemouse

Predictions only

Length 464 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm13171-201ENSMUST00000117233 391 ntBASIC6.51□□□□□ -1.37
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm15707-201ENSMUST00000118804 996 ntBASIC6.51□□□□□ -1.37
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm12986-201ENSMUST00000119037 967 ntBASIC6.51□□□□□ -1.37
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm12461-201ENSMUST00000120231 1239 ntBASIC6.51□□□□□ -1.37
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm5395-201ENSMUST00000121650 915 ntBASIC6.51□□□□□ -1.37
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm22344-201ENSMUST00000122642 278 ntBASIC6.51□□□□□ -1.37
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm15498-201ENSMUST00000126693 723 ntTSL 1 (best) BASIC6.51□□□□□ -1.37
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm12606-202ENSMUST00000129527 1184 ntTSL 1 (best) BASIC6.51□□□□□ -1.37
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm16069-201ENSMUST00000131146 545 ntTSL 3 BASIC6.51□□□□□ -1.37
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm17226-201ENSMUST00000166637 780 ntTSL 3 BASIC6.51□□□□□ -1.37
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Snord55-201ENSMUST00000174939 79 ntBASIC6.51□□□□□ -1.37
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm23647-201ENSMUST00000175042 109 ntBASIC6.51□□□□□ -1.37
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Rn5s-201ENSMUST00000177555 119 ntBASIC6.51□□□□□ -1.37
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 n-R5s108-201ENSMUST00000177575 119 ntBASIC6.51□□□□□ -1.37
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 n-R5s121-201ENSMUST00000177589 119 ntBASIC6.51□□□□□ -1.37
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm25872-201ENSMUST00000177784 100 ntBASIC6.51□□□□□ -1.37
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 n-R5s146-201ENSMUST00000177889 119 ntBASIC6.51□□□□□ -1.37
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm22109-201ENSMUST00000177995 119 ntBASIC6.51□□□□□ -1.37
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm22291-201ENSMUST00000178027 119 ntBASIC6.51□□□□□ -1.37
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 n-R5s141-201ENSMUST00000178066 119 ntBASIC6.51□□□□□ -1.37
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm23284-201ENSMUST00000178069 119 ntBASIC6.51□□□□□ -1.37
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 n-R5s100-201ENSMUST00000178106 119 ntBASIC6.51□□□□□ -1.37
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 n-R5s111-201ENSMUST00000178203 119 ntBASIC6.51□□□□□ -1.37
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 n-R5s105-201ENSMUST00000178499 119 ntBASIC6.51□□□□□ -1.37
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 n-R5s149-201ENSMUST00000178520 119 ntBASIC6.51□□□□□ -1.37
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 n-R5s103-201ENSMUST00000178755 119 ntBASIC6.51□□□□□ -1.37
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 n-R5s123-201ENSMUST00000178804 119 ntBASIC6.51□□□□□ -1.37
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 n-R5s142-201ENSMUST00000178820 119 ntBASIC6.51□□□□□ -1.37
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 n-R5s144-201ENSMUST00000178859 119 ntBASIC6.51□□□□□ -1.37
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 n-R5s139-201ENSMUST00000178975 119 ntBASIC6.51□□□□□ -1.37
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 n-R5s134-201ENSMUST00000178983 119 ntBASIC6.51□□□□□ -1.37
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 n-R5s136-201ENSMUST00000179080 119 ntBASIC6.51□□□□□ -1.37
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm25018-201ENSMUST00000179081 119 ntBASIC6.51□□□□□ -1.37
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 n-R5s104-201ENSMUST00000179107 119 ntBASIC6.51□□□□□ -1.37
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 n-R5s113-201ENSMUST00000179143 119 ntBASIC6.51□□□□□ -1.37
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 n-R5s133-201ENSMUST00000179275 119 ntBASIC6.51□□□□□ -1.37
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 n-R5s117-201ENSMUST00000179431 119 ntBASIC6.51□□□□□ -1.37
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm25212-201ENSMUST00000179432 119 ntBASIC6.51□□□□□ -1.37
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 n-R5s138-201ENSMUST00000179476 119 ntBASIC6.51□□□□□ -1.37
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 n-R5s122-201ENSMUST00000179500 119 ntBASIC6.51□□□□□ -1.37
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 n-R5s143-201ENSMUST00000179542 119 ntBASIC6.51□□□□□ -1.37
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 n-R5s107-201ENSMUST00000179704 119 ntBASIC6.51□□□□□ -1.37
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm26391-201ENSMUST00000179843 119 ntBASIC6.51□□□□□ -1.37
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 n-R5s110-201ENSMUST00000179995 119 ntBASIC6.51□□□□□ -1.37
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 n-R5s128-201ENSMUST00000180096 119 ntBASIC6.51□□□□□ -1.37
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 n-R5s124-201ENSMUST00000180334 119 ntBASIC6.51□□□□□ -1.37
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm29164-201ENSMUST00000185454 1024 ntBASIC6.51□□□□□ -1.37
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Ighv5-8-202ENSMUST00000191967 337 ntBASIC6.51□□□□□ -1.37
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 P4htm-204ENSMUST00000193621 1297 ntTSL 1 (best) BASIC6.51□□□□□ -1.37
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm8615-202ENSMUST00000201946 737 ntTSL 3 BASIC6.51□□□□□ -1.37
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm43172-201ENSMUST00000202139 2137 ntBASIC6.51□□□□□ -1.37
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Olfr1358-201ENSMUST00000204477 1064 ntAPPRIS P1 BASIC6.51□□□□□ -1.37
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm7238-201ENSMUST00000206467 973 ntBASIC6.51□□□□□ -1.37
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Calca-207ENSMUST00000206853 720 ntTSL 2 BASIC6.51□□□□□ -1.37
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm6518-201ENSMUST00000208450 342 ntBASIC6.51□□□□□ -1.37
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 AC154435.1-201ENSMUST00000223938 959 ntBASIC6.51□□□□□ -1.37
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Tex30-201ENSMUST00000027215 1272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.51□□□□□ -1.37
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Cypt12-201ENSMUST00000029080 550 ntAPPRIS P1 BASIC6.51□□□□□ -1.37
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm24089-201ENSMUST00000093696 109 ntBASIC6.51□□□□□ -1.37
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Kifap3-201ENSMUST00000027877 3946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.51□□□□□ -1.37
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Oprm1-211ENSMUST00000105602 1366 ntTSL 1 (best) BASIC6.51□□□□□ -1.37
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Tmem30c-202ENSMUST00000119407 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.51□□□□□ -1.37
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 4833422M21Rik-203ENSMUST00000181747 1365 ntTSL 1 (best) BASIC6.51□□□□□ -1.37
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Atad2-201ENSMUST00000038194 5684 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC6.51□□□□□ -1.37
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 H2-M2-201ENSMUST00000016427 1550 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.51□□□□□ -1.37
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Pcdhga3-201ENSMUST00000073447 4720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.51□□□□□ -1.37
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Mrvi1-202ENSMUST00000125758 5953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.51□□□□□ -1.37
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Fcrla-201ENSMUST00000046322 1679 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC6.51□□□□□ -1.37
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Spata16-202ENSMUST00000108305 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.51□□□□□ -1.37
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Grm1-202ENSMUST00000105560 4265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.51□□□□□ -1.37
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Zfand2a-202ENSMUST00000110851 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.51□□□□□ -1.37
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Trpv4-201ENSMUST00000071968 3228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.51□□□□□ -1.37
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Srpk3-201ENSMUST00000002081 1981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.51□□□□□ -1.37
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm43773-201ENSMUST00000198548 2162 ntBASIC6.51□□□□□ -1.37
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Arrb1-201ENSMUST00000032995 3715 ntTSL 1 (best) BASIC6.51□□□□□ -1.37
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Pram1-201ENSMUST00000052079 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.51□□□□□ -1.37
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Mfsd4b5-203ENSMUST00000164566 2372 ntTSL 1 (best) BASIC6.51□□□□□ -1.37
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Dusp6-204ENSMUST00000220291 2359 ntTSL 5 BASIC6.51□□□□□ -1.37
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Tbc1d14-210ENSMUST00000140607 4649 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC6.51□□□□□ -1.37
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm38187-201ENSMUST00000195609 4709 ntBASIC6.51□□□□□ -1.37
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Slurp1-202ENSMUST00000190433 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.51□□□□□ -1.37
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Cntnap4-201ENSMUST00000034225 4848 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.51□□□□□ -1.37
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Cttnbp2nl-201ENSMUST00000077548 4946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.51□□□□□ -1.37
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Rtn4ip1-201ENSMUST00000054418 2981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.51□□□□□ -1.37
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Sertm1-201ENSMUST00000070342 3083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.51□□□□□ -1.37
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Smim1-208ENSMUST00000143047 3373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.51□□□□□ -1.37
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Dbx2-201ENSMUST00000054244 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.51□□□□□ -1.37
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Nudt15-201ENSMUST00000043813 3579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.51□□□□□ -1.37
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Cops3-201ENSMUST00000019517 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.5□□□□□ -1.37
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Il34-201ENSMUST00000076846 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.5□□□□□ -1.37
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 A230009B12Rik-202ENSMUST00000159602 1810 ntTSL 1 (best) BASIC6.5□□□□□ -1.37
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm36975-201ENSMUST00000194105 1828 ntTSL 1 (best) BASIC6.5□□□□□ -1.37
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gypa-201ENSMUST00000063359 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.5□□□□□ -1.37
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Grk3-204ENSMUST00000197888 1938 ntTSL 1 (best) BASIC6.5□□□□□ -1.37
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Uqcc1-203ENSMUST00000109632 2313 ntTSL 5 BASIC6.5□□□□□ -1.37
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Prkag3-201ENSMUST00000081636 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.5□□□□□ -1.37
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Tmprss3-201ENSMUST00000024833 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.5□□□□□ -1.37
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Tut1-201ENSMUST00000096239 2747 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.5□□□□□ -1.37
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Phykpl-206ENSMUST00000167797 3116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.5□□□□□ -1.37
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Fbxl22-201ENSMUST00000056890 3935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.5□□□□□ -1.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.1 ms