Protein–RNA interactions for Protein: Q9JM13

Rabgef1, Rab5 GDP/GTP exchange factor, mousemouse

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Length 491 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rabgef1Q9JM13 Gmip-202ENSMUST00000123453 3443 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Rabgef1Q9JM13 Fut10-202ENSMUST00000110527 2327 ntTSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Rabgef1Q9JM13 BC049352-203ENSMUST00000171799 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Rabgef1Q9JM13 Ighv1-61-201ENSMUST00000103531 351 ntAPPRIS P1 BASIC11.53□□□□□ -0.56
Rabgef1Q9JM13 Cd300ld2-202ENSMUST00000106578 918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.53□□□□□ -0.56
Rabgef1Q9JM13 Sec11a-204ENSMUST00000120285 875 ntTSL 3 BASIC11.53□□□□□ -0.56
Rabgef1Q9JM13 4930595D18Rik-201ENSMUST00000121608 818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Rabgef1Q9JM13 Gm15906-201ENSMUST00000124746 323 ntTSL 5 BASIC11.53□□□□□ -0.56
Rabgef1Q9JM13 Mpv17l-202ENSMUST00000124947 768 ntTSL 3 BASIC11.53□□□□□ -0.56
Rabgef1Q9JM13 Gm23085-201ENSMUST00000157849 293 ntBASIC11.53□□□□□ -0.56
Rabgef1Q9JM13 Omt2a-203ENSMUST00000166056 1167 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Rabgef1Q9JM13 Fam166b-206ENSMUST00000171134 1198 ntTSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Rabgef1Q9JM13 A630035G10Rik-202ENSMUST00000194468 1065 ntTSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Rabgef1Q9JM13 Gm42629-201ENSMUST00000199063 1102 ntBASIC11.53□□□□□ -0.56
Rabgef1Q9JM13 Gm43050-202ENSMUST00000201152 651 ntTSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Rabgef1Q9JM13 Gm8956-201ENSMUST00000203939 825 ntBASIC11.53□□□□□ -0.56
Rabgef1Q9JM13 Gm45219-201ENSMUST00000205602 465 ntBASIC11.53□□□□□ -0.56
Rabgef1Q9JM13 Gm6905-201ENSMUST00000205729 511 ntBASIC11.53□□□□□ -0.56
Rabgef1Q9JM13 Gm4607-201ENSMUST00000206649 577 ntBASIC11.53□□□□□ -0.56
Rabgef1Q9JM13 Gm13522-202ENSMUST00000209682 997 ntTSL 5 BASIC11.53□□□□□ -0.56
Rabgef1Q9JM13 8030455M16Rik-201ENSMUST00000213014 902 ntTSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Rabgef1Q9JM13 AC154765.1-201ENSMUST00000217732 439 ntTSL 3 BASIC11.53□□□□□ -0.56
Rabgef1Q9JM13 Plp2-201ENSMUST00000033486 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Rabgef1Q9JM13 Cnga4-202ENSMUST00000210344 1977 ntTSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Rabgef1Q9JM13 Mccc1os-202ENSMUST00000137198 2686 ntTSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Rabgef1Q9JM13 Fibcd1-201ENSMUST00000028188 4751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Rabgef1Q9JM13 Ccdc129-201ENSMUST00000044729 3431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Rabgef1Q9JM13 Serpina1b-203ENSMUST00000186166 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.53□□□□□ -0.56
Rabgef1Q9JM13 Gm26631-201ENSMUST00000181462 2505 ntTSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Rabgef1Q9JM13 Adh4-201ENSMUST00000013458 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Rabgef1Q9JM13 Nr1i2-201ENSMUST00000023504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Rabgef1Q9JM13 Themis2-201ENSMUST00000045154 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Rabgef1Q9JM13 Myocd-203ENSMUST00000108695 5114 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Rabgef1Q9JM13 Qars-203ENSMUST00000134939 2374 ntTSL 5 BASIC11.53□□□□□ -0.56
Rabgef1Q9JM13 Gm12200-201ENSMUST00000144876 1858 ntTSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Rabgef1Q9JM13 Ankub1-202ENSMUST00000197088 1854 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.53□□□□□ -0.56
Rabgef1Q9JM13 Ehd2-201ENSMUST00000098799 5119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Rabgef1Q9JM13 Tmc5-203ENSMUST00000121715 3906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Rabgef1Q9JM13 Vcan-202ENSMUST00000109544 5702 ntTSL 5 BASIC11.53□□□□□ -0.56
Rabgef1Q9JM13 Fam53c-201ENSMUST00000049281 4475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.56
Rabgef1Q9JM13 Calu-201ENSMUST00000031779 3229 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.56
Rabgef1Q9JM13 Zfp646-201ENSMUST00000050383 6310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.56
Rabgef1Q9JM13 Tmem231-201ENSMUST00000034429 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.56
Rabgef1Q9JM13 Gm43154-214ENSMUST00000211225 1420 ntTSL 5 BASIC11.52□□□□□ -0.56
Rabgef1Q9JM13 Mindy4-201ENSMUST00000053094 4270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.56
Rabgef1Q9JM13 Mobp-202ENSMUST00000093773 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.56
Rabgef1Q9JM13 Anks1b-216ENSMUST00000182430 3305 ntTSL 5 BASIC11.52□□□□□ -0.56
Rabgef1Q9JM13 5330413P13Rik-204ENSMUST00000210606 1464 ntTSL 5 BASIC11.52□□□□□ -0.56
Rabgef1Q9JM13 S1pr2-201ENSMUST00000054197 6394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.56
Rabgef1Q9JM13 Gm37348-201ENSMUST00000193104 1789 ntBASIC11.52□□□□□ -0.57
Rabgef1Q9JM13 Hmgcll1-201ENSMUST00000008052 3737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Rabgef1Q9JM13 Myh13-203ENSMUST00000180845 5991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.52□□□□□ -0.57
Rabgef1Q9JM13 Dclk1-213ENSMUST00000199702 2922 ntTSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Rabgef1Q9JM13 Aco2-201ENSMUST00000023116 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Rabgef1Q9JM13 Mest-210ENSMUST00000157040 2383 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Rabgef1Q9JM13 Myh1-202ENSMUST00000075734 6012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Rabgef1Q9JM13 Dock6-207ENSMUST00000217336 6880 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.52□□□□□ -0.57
Rabgef1Q9JM13 Prss57-201ENSMUST00000020573 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Rabgef1Q9JM13 Mir680-2-201ENSMUST00000102163 110 ntBASIC11.52□□□□□ -0.57
Rabgef1Q9JM13 Gm23251-201ENSMUST00000103773 110 ntBASIC11.52□□□□□ -0.57
Rabgef1Q9JM13 Rps9-204ENSMUST00000108625 914 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.52□□□□□ -0.57
Rabgef1Q9JM13 Gm5419-201ENSMUST00000119301 527 ntBASIC11.52□□□□□ -0.57
Rabgef1Q9JM13 Gm14965-201ENSMUST00000124118 565 ntTSL 2 BASIC11.52□□□□□ -0.57
Rabgef1Q9JM13 Srrm3os-201ENSMUST00000131896 1271 ntTSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Rabgef1Q9JM13 Gm15346-201ENSMUST00000143638 475 ntTSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Rabgef1Q9JM13 Gm12907-201ENSMUST00000148027 507 ntTSL 2 BASIC11.52□□□□□ -0.57
Rabgef1Q9JM13 9330159M07Rik-202ENSMUST00000180783 1044 ntTSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Rabgef1Q9JM13 Gm3332-201ENSMUST00000189337 928 ntBASIC11.52□□□□□ -0.57
Rabgef1Q9JM13 Gm43058-201ENSMUST00000197645 625 ntBASIC11.52□□□□□ -0.57
Rabgef1Q9JM13 Gm43692-201ENSMUST00000198236 1062 ntBASIC11.52□□□□□ -0.57
Rabgef1Q9JM13 CT572999.1-201ENSMUST00000220315 1260 ntBASIC11.52□□□□□ -0.57
Rabgef1Q9JM13 Cmtm2b-201ENSMUST00000041973 880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Rabgef1Q9JM13 Rpp38-201ENSMUST00000062672 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Rabgef1Q9JM13 Cthrc1-201ENSMUST00000067072 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Rabgef1Q9JM13 Gm10699-201ENSMUST00000098916 2130 ntBASIC11.52□□□□□ -0.57
Rabgef1Q9JM13 Invs-201ENSMUST00000030029 5633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Rabgef1Q9JM13 Nrf1-208ENSMUST00000115208 2492 ntTSL 5 BASIC11.52□□□□□ -0.57
Rabgef1Q9JM13 Pax3-201ENSMUST00000004994 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Rabgef1Q9JM13 Hnrnpc-210ENSMUST00000228232 2535 ntAPPRIS P5 BASIC11.52□□□□□ -0.57
Rabgef1Q9JM13 Stat5a-202ENSMUST00000107356 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Rabgef1Q9JM13 Slc29a3-201ENSMUST00000117513 5240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Rabgef1Q9JM13 Tulp2-210ENSMUST00000210868 1664 ntTSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Rabgef1Q9JM13 5330439B14Rik-201ENSMUST00000194811 1392 ntTSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Rabgef1Q9JM13 Nxpe5-201ENSMUST00000110929 2312 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.52□□□□□ -0.57
Rabgef1Q9JM13 Ddr1-202ENSMUST00000097333 3593 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Rabgef1Q9JM13 Mcfd2-204ENSMUST00000144236 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Rabgef1Q9JM13 Tor4a-201ENSMUST00000081869 3255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Rabgef1Q9JM13 Msh5-202ENSMUST00000097338 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Rabgef1Q9JM13 Gm13556-201ENSMUST00000132692 1412 ntTSL 3 BASIC11.52□□□□□ -0.57
Rabgef1Q9JM13 Trappc9-202ENSMUST00000089770 4047 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Rabgef1Q9JM13 Gfm2-202ENSMUST00000042084 3074 ntTSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Rabgef1Q9JM13 Entpd4-201ENSMUST00000064831 1842 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.51□□□□□ -0.57
Rabgef1Q9JM13 Fam84a-201ENSMUST00000020926 4164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Rabgef1Q9JM13 Adat1-201ENSMUST00000034427 3159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Rabgef1Q9JM13 Gtf3c6-206ENSMUST00000217537 2526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Rabgef1Q9JM13 Arhgef7-203ENSMUST00000098938 4628 ntTSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Rabgef1Q9JM13 Tyw1-202ENSMUST00000044204 4698 ntTSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Rabgef1Q9JM13 Myt1l-201ENSMUST00000021009 5027 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Rabgef1Q9JM13 Bbs2-201ENSMUST00000034206 3064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Rabgef1Q9JM13 Gal3st2b-202ENSMUST00000178757 2722 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
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