Protein–RNA interactions for Protein: Q9JLI2

Col5a3, Collagen type V alpha 3 chain, mousemouse

Predictions only

Length 1,739 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Col5a3Q9JLI2 Malt1-201ENSMUST00000049248 5073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Col5a3Q9JLI2 Snx29-203ENSMUST00000122168 2096 ntTSL 5 BASIC11.45□□□□□ -0.58
Col5a3Q9JLI2 Sh3bgrl3-202ENSMUST00000105879 518 ntTSL 3 BASIC11.45□□□□□ -0.58
Col5a3Q9JLI2 Dtymk-203ENSMUST00000112893 1040 ntTSL 2 BASIC11.45□□□□□ -0.58
Col5a3Q9JLI2 Gm11771-201ENSMUST00000118124 732 ntBASIC11.45□□□□□ -0.58
Col5a3Q9JLI2 Gm11701-201ENSMUST00000121277 1142 ntBASIC11.45□□□□□ -0.58
Col5a3Q9JLI2 Piga-204ENSMUST00000133813 1086 ntTSL 5 BASIC11.45□□□□□ -0.58
Col5a3Q9JLI2 Gm16537-201ENSMUST00000161529 702 ntTSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Col5a3Q9JLI2 Osgep-207ENSMUST00000162177 1219 ntTSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Col5a3Q9JLI2 Gm17225-201ENSMUST00000172051 497 ntTSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Col5a3Q9JLI2 Kif4-ps-202ENSMUST00000185083 652 ntBASIC11.45□□□□□ -0.58
Col5a3Q9JLI2 Ift22-204ENSMUST00000200153 670 ntTSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Col5a3Q9JLI2 Gm32098-201ENSMUST00000211305 479 ntTSL 5 BASIC11.45□□□□□ -0.58
Col5a3Q9JLI2 AC166902.2-202ENSMUST00000213191 1038 ntTSL 5 BASIC11.45□□□□□ -0.58
Col5a3Q9JLI2 AC114585.2-201ENSMUST00000227693 486 ntBASIC11.45□□□□□ -0.58
Col5a3Q9JLI2 Olfr128-201ENSMUST00000080231 1050 ntAPPRIS P1 BASIC11.45□□□□□ -0.58
Col5a3Q9JLI2 Iqcf5-201ENSMUST00000085113 551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Col5a3Q9JLI2 Map6-205ENSMUST00000207883 3431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Col5a3Q9JLI2 Gm37542-201ENSMUST00000192563 2832 ntBASIC11.45□□□□□ -0.58
Col5a3Q9JLI2 Pigg-203ENSMUST00000119014 4573 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.45□□□□□ -0.58
Col5a3Q9JLI2 Pou2f1-202ENSMUST00000069609 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Col5a3Q9JLI2 Olfr1495-202ENSMUST00000215930 2025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.45□□□□□ -0.58
Col5a3Q9JLI2 Fbxo3-201ENSMUST00000028603 4740 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Col5a3Q9JLI2 Gm37697-201ENSMUST00000195680 1844 ntBASIC11.45□□□□□ -0.58
Col5a3Q9JLI2 Hcn3-201ENSMUST00000029686 4002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Col5a3Q9JLI2 9330182L06Rik-201ENSMUST00000069538 4688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Col5a3Q9JLI2 Ccdc162-212ENSMUST00000219054 3182 ntTSL 5 BASIC11.45□□□□□ -0.58
Col5a3Q9JLI2 Lrp8-203ENSMUST00000106732 2648 ntTSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Col5a3Q9JLI2 Cap1-201ENSMUST00000069533 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Col5a3Q9JLI2 Zfp28-201ENSMUST00000081022 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Col5a3Q9JLI2 Hectd2-208ENSMUST00000169036 3842 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Col5a3Q9JLI2 Rab22a-201ENSMUST00000029024 7155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Col5a3Q9JLI2 Nxpe3-201ENSMUST00000099705 6430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Col5a3Q9JLI2 0610037L13Rik-203ENSMUST00000106726 515 ntTSL 5 BASIC11.44□□□□□ -0.58
Col5a3Q9JLI2 Fhl1-206ENSMUST00000116596 1203 ntTSL 5 BASIC11.44□□□□□ -0.58
Col5a3Q9JLI2 Mir1190-201ENSMUST00000116925 96 ntBASIC11.44□□□□□ -0.58
Col5a3Q9JLI2 Gm11800-201ENSMUST00000120050 579 ntBASIC11.44□□□□□ -0.58
Col5a3Q9JLI2 Gm14699-201ENSMUST00000122340 228 ntBASIC11.44□□□□□ -0.58
Col5a3Q9JLI2 1700112J05Rik-201ENSMUST00000129353 793 ntTSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Col5a3Q9JLI2 1700017J07Rik-201ENSMUST00000140241 473 ntTSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Col5a3Q9JLI2 Gm11608-202ENSMUST00000153049 877 ntTSL 3 BASIC11.44□□□□□ -0.58
Col5a3Q9JLI2 Gm37872-201ENSMUST00000192362 886 ntTSL 5 BASIC11.44□□□□□ -0.58
Col5a3Q9JLI2 Gm26901-202ENSMUST00000193106 256 ntTSL 3 BASIC11.44□□□□□ -0.58
Col5a3Q9JLI2 AC154347.2-201ENSMUST00000221223 715 ntTSL 3 BASIC11.44□□□□□ -0.58
Col5a3Q9JLI2 AC122824.1-201ENSMUST00000221705 828 ntTSL 3 BASIC11.44□□□□□ -0.58
Col5a3Q9JLI2 3830406C13Rik-213ENSMUST00000225294 1191 ntAPPRIS P1 BASIC11.44□□□□□ -0.58
Col5a3Q9JLI2 AC161877.1-201ENSMUST00000227736 699 ntBASIC11.44□□□□□ -0.58
Col5a3Q9JLI2 Gm9869-201ENSMUST00000063858 375 ntTSL 5 BASIC11.44□□□□□ -0.58
Col5a3Q9JLI2 Ralgds-202ENSMUST00000100241 3102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Col5a3Q9JLI2 Ndufa11-201ENSMUST00000002452 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Col5a3Q9JLI2 Syvn1-204ENSMUST00000138532 3464 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Col5a3Q9JLI2 Fut8-203ENSMUST00000177595 2980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Col5a3Q9JLI2 Top3a-204ENSMUST00000120417 2318 ntTSL 5 BASIC11.44□□□□□ -0.58
Col5a3Q9JLI2 Gm10646-201ENSMUST00000213227 3293 ntTSL 2 BASIC11.44□□□□□ -0.58
Col5a3Q9JLI2 Mgat1-203ENSMUST00000109194 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Col5a3Q9JLI2 Gm4880-201ENSMUST00000207645 1696 ntBASIC11.44□□□□□ -0.58
Col5a3Q9JLI2 Med1-202ENSMUST00000092735 2627 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Col5a3Q9JLI2 Naa50-201ENSMUST00000063520 3557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Col5a3Q9JLI2 Grip1-202ENSMUST00000077871 3720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Col5a3Q9JLI2 Abcf3-201ENSMUST00000003319 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Col5a3Q9JLI2 Met-203ENSMUST00000115443 6809 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.44□□□□□ -0.58
Col5a3Q9JLI2 Csrnp3-207ENSMUST00000145598 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Col5a3Q9JLI2 Nek1-202ENSMUST00000120689 5478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Col5a3Q9JLI2 Olfr272-202ENSMUST00000107667 1936 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.44□□□□□ -0.58
Col5a3Q9JLI2 9130227L01Rik-202ENSMUST00000189293 1906 ntTSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Col5a3Q9JLI2 Cog1-201ENSMUST00000018805 3935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Col5a3Q9JLI2 Zfp641-201ENSMUST00000023722 4212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Col5a3Q9JLI2 Iffo2-201ENSMUST00000040023 5227 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.43□□□□□ -0.58
Col5a3Q9JLI2 Gm5046-201ENSMUST00000100608 611 ntBASIC11.43□□□□□ -0.58
Col5a3Q9JLI2 Guca2b-202ENSMUST00000106309 697 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.43□□□□□ -0.58
Col5a3Q9JLI2 Nsa2-ps2-201ENSMUST00000120785 773 ntBASIC11.43□□□□□ -0.58
Col5a3Q9JLI2 Gm12254-201ENSMUST00000134617 471 ntBASIC11.43□□□□□ -0.58
Col5a3Q9JLI2 Gm13554-201ENSMUST00000137349 477 ntTSL 5 BASIC11.43□□□□□ -0.58
Col5a3Q9JLI2 A630023P12Rik-203ENSMUST00000141532 638 ntTSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Col5a3Q9JLI2 2810403D21Rik-204ENSMUST00000144421 747 ntTSL 3 BASIC11.43□□□□□ -0.58
Col5a3Q9JLI2 Grin2b-205ENSMUST00000152012 2461 ntTSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Col5a3Q9JLI2 Gm23081-201ENSMUST00000157845 297 ntBASIC11.43□□□□□ -0.58
Col5a3Q9JLI2 Rian-208ENSMUST00000182370 352 ntTSL 3 BASIC11.43□□□□□ -0.58
Col5a3Q9JLI2 1700052H01Rik-201ENSMUST00000196142 717 ntTSL 3 BASIC11.43□□□□□ -0.58
Col5a3Q9JLI2 Gm31678-201ENSMUST00000198262 454 ntTSL 3 BASIC11.43□□□□□ -0.58
Col5a3Q9JLI2 Gm17815-201ENSMUST00000198305 895 ntBASIC11.43□□□□□ -0.58
Col5a3Q9JLI2 Gm30652-201ENSMUST00000199103 430 ntBASIC11.43□□□□□ -0.58
Col5a3Q9JLI2 Gm43821-201ENSMUST00000199198 729 ntTSL 3 BASIC11.43□□□□□ -0.58
Col5a3Q9JLI2 Gm43625-201ENSMUST00000199177 1539 ntBASIC11.43□□□□□ -0.58
Col5a3Q9JLI2 A730020E08Rik-201ENSMUST00000180421 3387 ntTSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Col5a3Q9JLI2 Lrrc55-201ENSMUST00000099930 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Col5a3Q9JLI2 Fgfr3-210ENSMUST00000169212 4245 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Col5a3Q9JLI2 Fgfr3-201ENSMUST00000067150 4218 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Col5a3Q9JLI2 Abcb8-201ENSMUST00000073076 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Col5a3Q9JLI2 Pum2-202ENSMUST00000111122 6311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Col5a3Q9JLI2 Gm38227-201ENSMUST00000193036 1602 ntBASIC11.43□□□□□ -0.58
Col5a3Q9JLI2 Zfp341-202ENSMUST00000109702 3162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.43□□□□□ -0.58
Col5a3Q9JLI2 Gm26912-201ENSMUST00000180988 1483 ntTSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Col5a3Q9JLI2 Ppp6c-205ENSMUST00000204701 1495 ntTSL 5 BASIC11.43□□□□□ -0.58
Col5a3Q9JLI2 Acvr1-203ENSMUST00000112599 2891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Col5a3Q9JLI2 Ap1m2-202ENSMUST00000115433 2586 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Col5a3Q9JLI2 Dnajc6-205ENSMUST00000106933 5191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Col5a3Q9JLI2 Efr3b-201ENSMUST00000111178 6547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Col5a3Q9JLI2 Trib1-201ENSMUST00000067543 4330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Col5a3Q9JLI2 9230110C19Rik-201ENSMUST00000065291 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
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