Protein–RNA interactions for Protein: Q9JKX8

Upk3a, Uroplakin-3a, mousemouse

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Length 287 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Upk3aQ9JKX8 AU015836-205ENSMUST00000163458 911 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Upk3aQ9JKX8 Rps28-203ENSMUST00000173019 437 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Upk3aQ9JKX8 2610316D01Rik-201ENSMUST00000181047 924 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Upk3aQ9JKX8 Plac9a-202ENSMUST00000183431 536 ntTSL 3 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Upk3aQ9JKX8 Plac9b-204ENSMUST00000184675 536 ntTSL 3 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Upk3aQ9JKX8 1700065I16Rik-201ENSMUST00000185277 512 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Upk3aQ9JKX8 Gm28746-201ENSMUST00000187453 380 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Upk3aQ9JKX8 Use1-201ENSMUST00000019169 854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Upk3aQ9JKX8 Gm37638-201ENSMUST00000194337 1123 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Upk3aQ9JKX8 Gm9884-201ENSMUST00000194343 1222 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Upk3aQ9JKX8 Gm34023-201ENSMUST00000195539 217 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Upk3aQ9JKX8 Gm42518-201ENSMUST00000196277 938 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Upk3aQ9JKX8 Gm7972-202ENSMUST00000208453 505 ntTSL 3 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Upk3aQ9JKX8 Gm45609-204ENSMUST00000209837 1207 ntTSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Upk3aQ9JKX8 AC167364.1-201ENSMUST00000221495 784 ntTSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Upk3aQ9JKX8 Krtap4-13-201ENSMUST00000050106 815 ntAPPRIS P1 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Upk3aQ9JKX8 E330021D16Rik-201ENSMUST00000058713 1116 ntAPPRIS P1 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Upk3aQ9JKX8 Uba52-201ENSMUST00000081940 541 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Upk3aQ9JKX8 Wfdc6a-201ENSMUST00000099096 805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Upk3aQ9JKX8 Vars2-201ENSMUST00000043674 4425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Upk3aQ9JKX8 L1td1-204ENSMUST00000173659 2547 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Upk3aQ9JKX8 Gm6559-201ENSMUST00000204678 1694 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Upk3aQ9JKX8 Ccdc32-201ENSMUST00000036470 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Upk3aQ9JKX8 Pofut1-201ENSMUST00000049863 5600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Upk3aQ9JKX8 Ptgir-202ENSMUST00000144408 3305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Upk3aQ9JKX8 Strc-201ENSMUST00000038389 5756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Upk3aQ9JKX8 Pou2f1-206ENSMUST00000111429 2679 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Upk3aQ9JKX8 Plcd4-206ENSMUST00000113750 2692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Upk3aQ9JKX8 Wdr36-201ENSMUST00000053663 3281 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Upk3aQ9JKX8 Gm26686-201ENSMUST00000181951 3467 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Upk3aQ9JKX8 Atxn7l1os2-201ENSMUST00000138617 2019 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
Upk3aQ9JKX8 A930006I01Rik-201ENSMUST00000139065 2229 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
Upk3aQ9JKX8 Rgs8-201ENSMUST00000041776 8474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
Upk3aQ9JKX8 Nup205-201ENSMUST00000043815 6412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
Upk3aQ9JKX8 Mbtps1-201ENSMUST00000081381 4195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
Upk3aQ9JKX8 Ckap2-201ENSMUST00000046916 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
Upk3aQ9JKX8 Gm10785-201ENSMUST00000156242 1583 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
Upk3aQ9JKX8 Tmcc2-203ENSMUST00000132435 3514 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Upk3aQ9JKX8 Dennd1c-201ENSMUST00000011623 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Upk3aQ9JKX8 Slc2a4-201ENSMUST00000018710 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Upk3aQ9JKX8 Unc13a-201ENSMUST00000030170 10255 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Upk3aQ9JKX8 Gm44415-201ENSMUST00000204151 2112 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Upk3aQ9JKX8 Fnip2-203ENSMUST00000133154 7299 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Upk3aQ9JKX8 Fhitos-201ENSMUST00000160149 1511 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Upk3aQ9JKX8 Gm34785-201ENSMUST00000222571 4582 ntTSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Upk3aQ9JKX8 Aldoa-202ENSMUST00000087566 1549 ntTSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Upk3aQ9JKX8 Lsamp-206ENSMUST00000187695 3411 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Upk3aQ9JKX8 Tmem8b-201ENSMUST00000107864 4726 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Upk3aQ9JKX8 Rbl2-210ENSMUST00000211136 4504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Upk3aQ9JKX8 Gm6768-201ENSMUST00000022467 1878 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Upk3aQ9JKX8 Rps6ka1-209ENSMUST00000174481 2228 ntTSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Upk3aQ9JKX8 Angel1-201ENSMUST00000021682 3850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Upk3aQ9JKX8 Gm26912-201ENSMUST00000180988 1483 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Upk3aQ9JKX8 Gnrhr-202ENSMUST00000094654 1475 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Upk3aQ9JKX8 C030034L19Rik-203ENSMUST00000181930 3133 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Upk3aQ9JKX8 A230009B12Rik-202ENSMUST00000159602 1810 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Upk3aQ9JKX8 Mir453-201ENSMUST00000104732 82 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Upk3aQ9JKX8 2300003K06Rik-201ENSMUST00000105054 1265 ntAPPRIS P1 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Upk3aQ9JKX8 Gm10961-201ENSMUST00000106703 144 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Upk3aQ9JKX8 Gm14270-201ENSMUST00000118388 846 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Upk3aQ9JKX8 Gm13019-201ENSMUST00000120000 276 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Upk3aQ9JKX8 Gm12208-201ENSMUST00000122004 163 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Upk3aQ9JKX8 Gm27191-201ENSMUST00000145973 448 ntTSL 3 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Upk3aQ9JKX8 Gm14266-202ENSMUST00000146542 1067 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Upk3aQ9JKX8 B230119M05Rik-201ENSMUST00000154072 979 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Upk3aQ9JKX8 Gm16553-201ENSMUST00000160490 716 ntTSL 3 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Upk3aQ9JKX8 Gm15978-201ENSMUST00000161043 738 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Upk3aQ9JKX8 Gm16587-201ENSMUST00000161943 863 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Upk3aQ9JKX8 1110059E24Rik-205ENSMUST00000178523 629 ntTSL 3 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Upk3aQ9JKX8 Gm29410-201ENSMUST00000188383 694 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Upk3aQ9JKX8 Gm6677-201ENSMUST00000195100 441 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Upk3aQ9JKX8 Gm40414-201ENSMUST00000197608 481 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Upk3aQ9JKX8 Gm43298-201ENSMUST00000200887 866 ntTSL 3 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Upk3aQ9JKX8 Polr1d-204ENSMUST00000200993 1167 ntTSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Upk3aQ9JKX8 Gm29797-201ENSMUST00000207856 755 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Upk3aQ9JKX8 Zfp36l1-203ENSMUST00000218835 292 ntTSL 3 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Upk3aQ9JKX8 Gm29787-201ENSMUST00000222129 849 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Upk3aQ9JKX8 Olfr335-ps-201ENSMUST00000223545 939 ntAPPRIS P1 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Upk3aQ9JKX8 Tbca-201ENSMUST00000046644 559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Upk3aQ9JKX8 Lsm8-201ENSMUST00000056398 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Upk3aQ9JKX8 Commd4-201ENSMUST00000065358 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Upk3aQ9JKX8 Prok1-202ENSMUST00000197758 3063 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Upk3aQ9JKX8 Itgb4-204ENSMUST00000106460 5919 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Upk3aQ9JKX8 Gm8020-201ENSMUST00000170174 1406 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Upk3aQ9JKX8 4933406M09Rik-201ENSMUST00000162187 1768 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Upk3aQ9JKX8 Gm10436-202ENSMUST00000220521 1788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Upk3aQ9JKX8 Poldip3-202ENSMUST00000100375 3157 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Upk3aQ9JKX8 Rad51ap2-201ENSMUST00000124065 3175 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Upk3aQ9JKX8 Fam107b-201ENSMUST00000027965 3156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Upk3aQ9JKX8 Cblb-203ENSMUST00000226593 3864 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Upk3aQ9JKX8 Pitpnb-204ENSMUST00000200298 2632 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Upk3aQ9JKX8 Gm44106-201ENSMUST00000203153 1599 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Upk3aQ9JKX8 Hgs-202ENSMUST00000106203 2901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Upk3aQ9JKX8 Rapgef3-205ENSMUST00000129223 3750 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Upk3aQ9JKX8 Dcun1d3-202ENSMUST00000098080 3072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Upk3aQ9JKX8 Vmn2r18-201ENSMUST00000165928 2367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Upk3aQ9JKX8 Anxa3-205ENSMUST00000198631 1523 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Upk3aQ9JKX8 AC160411.1-201ENSMUST00000218544 4560 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Upk3aQ9JKX8 Supt3-201ENSMUST00000050630 1508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Upk3aQ9JKX8 Myo18a-211ENSMUST00000130627 6202 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
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