Protein–RNA interactions for Protein: Q9ESN2

Trim39, E3 ubiquitin-protein ligase TRIM39, mousemouse

Predictions only

Length 488 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim39Q9ESN2 Gm11131-201ENSMUST00000113886 3122 ntTSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Trim39Q9ESN2 4732491K20Rik-201ENSMUST00000181774 3142 ntTSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Trim39Q9ESN2 Tfdp1-201ENSMUST00000170909 1700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Trim39Q9ESN2 Npy5r-202ENSMUST00000211920 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.52□□□□□ -0.73
Trim39Q9ESN2 Adh4-201ENSMUST00000013458 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Trim39Q9ESN2 Aadac-201ENSMUST00000029325 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Trim39Q9ESN2 Iqce-201ENSMUST00000041783 6037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Trim39Q9ESN2 Robo4-203ENSMUST00000115048 3392 ntTSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Trim39Q9ESN2 Trpm1-210ENSMUST00000205731 2575 ntTSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Trim39Q9ESN2 Nr1i2-201ENSMUST00000023504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Trim39Q9ESN2 Tmem19-201ENSMUST00000092170 3012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Trim39Q9ESN2 Gm14023-201ENSMUST00000144178 1781 ntTSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Trim39Q9ESN2 Tagln2-202ENSMUST00000111230 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Trim39Q9ESN2 Fnbp1l-201ENSMUST00000162409 5198 ntTSL 5 BASIC10.52□□□□□ -0.73
Trim39Q9ESN2 Hyal3-202ENSMUST00000148440 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.52□□□□□ -0.73
Trim39Q9ESN2 Bpgm-201ENSMUST00000045372 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Trim39Q9ESN2 Lasp1-201ENSMUST00000043843 3540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Trim39Q9ESN2 Il17rd-201ENSMUST00000035336 8280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Trim39Q9ESN2 Swap70-201ENSMUST00000033325 4027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Trim39Q9ESN2 AC125409.1-201ENSMUST00000223213 3370 ntBASIC10.51□□□□□ -0.73
Trim39Q9ESN2 Gid8-202ENSMUST00000078687 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Trim39Q9ESN2 Nnt-203ENSMUST00000109204 3198 ntTSL 5 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Trim39Q9ESN2 Ap1s2-203ENSMUST00000112294 3199 ntTSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Trim39Q9ESN2 CU062626.3-201ENSMUST00000225522 1411 ntBASIC10.51□□□□□ -0.73
Trim39Q9ESN2 Pcgf2-206ENSMUST00000169807 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Trim39Q9ESN2 9030407P20Rik-201ENSMUST00000180933 2310 ntTSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Trim39Q9ESN2 Nufip2-204ENSMUST00000181023 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Trim39Q9ESN2 Mdh1-201ENSMUST00000102874 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Trim39Q9ESN2 Clp1-203ENSMUST00000165219 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Trim39Q9ESN2 C1rl-201ENSMUST00000049124 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Trim39Q9ESN2 Klhl18-205ENSMUST00000198400 4638 ntTSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Trim39Q9ESN2 Zdhhc3-208ENSMUST00000147563 6987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Trim39Q9ESN2 Camk2b-210ENSMUST00000109815 3780 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Trim39Q9ESN2 8030423F21Rik-201ENSMUST00000064097 2851 ntTSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Trim39Q9ESN2 Tiam2-201ENSMUST00000072156 6127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Trim39Q9ESN2 1810043G02Rik-202ENSMUST00000105398 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Trim39Q9ESN2 Timm10b-204ENSMUST00000106784 494 ntTSL 3 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Trim39Q9ESN2 Apoo-204ENSMUST00000113898 784 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Trim39Q9ESN2 Lcn6-203ENSMUST00000114199 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Trim39Q9ESN2 Gm12857-201ENSMUST00000117678 592 ntBASIC10.51□□□□□ -0.73
Trim39Q9ESN2 Gm11663-201ENSMUST00000117888 290 ntBASIC10.51□□□□□ -0.73
Trim39Q9ESN2 Gm12216-202ENSMUST00000120776 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Trim39Q9ESN2 Gm12196-201ENSMUST00000120954 262 ntBASIC10.51□□□□□ -0.73
Trim39Q9ESN2 Gm25109-201ENSMUST00000122474 114 ntBASIC10.51□□□□□ -0.73
Trim39Q9ESN2 Gm25318-201ENSMUST00000122554 314 ntBASIC10.51□□□□□ -0.73
Trim39Q9ESN2 Gm15891-201ENSMUST00000127307 611 ntTSL 5 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Trim39Q9ESN2 Cgrrf1-203ENSMUST00000133989 873 ntTSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Trim39Q9ESN2 Nbdy-201ENSMUST00000140575 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Trim39Q9ESN2 Nbdy-202ENSMUST00000149514 775 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Trim39Q9ESN2 Gm9866-204ENSMUST00000183238 351 ntTSL 5 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Trim39Q9ESN2 Gm27530-201ENSMUST00000184096 98 ntBASIC10.51□□□□□ -0.73
Trim39Q9ESN2 Gm28450-201ENSMUST00000187349 638 ntBASIC10.51□□□□□ -0.73
Trim39Q9ESN2 Gm37973-201ENSMUST00000195767 1289 ntBASIC10.51□□□□□ -0.73
Trim39Q9ESN2 Gm8190-201ENSMUST00000199603 586 ntBASIC10.51□□□□□ -0.73
Trim39Q9ESN2 Olfr1415-203ENSMUST00000204766 403 ntTSL 3 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Trim39Q9ESN2 Gm4265-201ENSMUST00000206701 674 ntTSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Trim39Q9ESN2 Gm45781-201ENSMUST00000212860 539 ntTSL 5 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Trim39Q9ESN2 AC113082.1-201ENSMUST00000217324 327 ntBASIC10.51□□□□□ -0.73
Trim39Q9ESN2 Sftpd-201ENSMUST00000077136 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Trim39Q9ESN2 Slc1a2-203ENSMUST00000111212 1957 ntTSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Trim39Q9ESN2 Gdi1-201ENSMUST00000015435 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Trim39Q9ESN2 Samd4-206ENSMUST00000137543 6874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Trim39Q9ESN2 Sept11-201ENSMUST00000074733 5028 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Trim39Q9ESN2 Fetub-204ENSMUST00000170805 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Trim39Q9ESN2 Cnr2-202ENSMUST00000097843 3867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Trim39Q9ESN2 Cnga4-201ENSMUST00000033187 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Trim39Q9ESN2 Slc45a1-202ENSMUST00000117997 2955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Trim39Q9ESN2 Ogfod1-202ENSMUST00000093301 5141 ntTSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Trim39Q9ESN2 Zfp280d-211ENSMUST00000184036 3459 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Trim39Q9ESN2 Hmgcll1-201ENSMUST00000008052 3737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Trim39Q9ESN2 Tifa-205ENSMUST00000171621 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Trim39Q9ESN2 Olfr1349-204ENSMUST00000207820 1325 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Trim39Q9ESN2 Olfr139-204ENSMUST00000214111 1311 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Trim39Q9ESN2 4930528D03Rik-203ENSMUST00000225577 1348 ntBASIC10.51□□□□□ -0.73
Trim39Q9ESN2 Sphk2-202ENSMUST00000107737 3548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Trim39Q9ESN2 Gm12799-201ENSMUST00000118151 2560 ntBASIC10.51□□□□□ -0.73
Trim39Q9ESN2 Atl2-202ENSMUST00000112437 3371 ntTSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Trim39Q9ESN2 Zfp629-203ENSMUST00000122066 5850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Trim39Q9ESN2 4933439N06Rik-201ENSMUST00000203062 1365 ntBASIC10.51□□□□□ -0.73
Trim39Q9ESN2 Poc1a-211ENSMUST00000217213 1398 ntTSL 5 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Trim39Q9ESN2 Fdft1-201ENSMUST00000054963 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Trim39Q9ESN2 Prom2-202ENSMUST00000103214 4190 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Trim39Q9ESN2 Aen-203ENSMUST00000107425 4956 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Trim39Q9ESN2 Mx2-201ENSMUST00000024112 2417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Trim39Q9ESN2 Gm44369-201ENSMUST00000204543 2175 ntBASIC10.5□□□□□ -0.73
Trim39Q9ESN2 Ccar2-201ENSMUST00000035612 3725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Trim39Q9ESN2 Mllt3-201ENSMUST00000078090 6069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Trim39Q9ESN2 Srcap-201ENSMUST00000066582 4545 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Trim39Q9ESN2 Fxyd5-212ENSMUST00000162733 2998 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Trim39Q9ESN2 Serac1-202ENSMUST00000097432 4007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Trim39Q9ESN2 Stard4-201ENSMUST00000025236 5097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Trim39Q9ESN2 Myom2-201ENSMUST00000033842 5075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Trim39Q9ESN2 Zfp280b-201ENSMUST00000061617 5097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Trim39Q9ESN2 Zfp354b-201ENSMUST00000109124 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Trim39Q9ESN2 Olfr315-202ENSMUST00000203256 2458 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Trim39Q9ESN2 U2af1l4-237ENSMUST00000167042 3007 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Trim39Q9ESN2 Armc2-201ENSMUST00000095729 4855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Trim39Q9ESN2 Ppip5k1-205ENSMUST00000110628 5404 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Trim39Q9ESN2 Frmpd3-203ENSMUST00000208130 7314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Trim39Q9ESN2 Acss3-203ENSMUST00000165067 4696 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 58.7 ms