Protein–RNA interactions for Protein: Q9ESD7

Dysf, Dysferlin, mousemouse

Predictions only

Length 2,090 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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DysfQ9ESD7 Gm26047-202ENSMUST00000198840 115 ntBASIC9.49□□□□□ -0.89
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DysfQ9ESD7 Eloc-208ENSMUST00000188641 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
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DysfQ9ESD7 Nme6-201ENSMUST00000035053 1074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
DysfQ9ESD7 1600002K03Rik-201ENSMUST00000041882 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
DysfQ9ESD7 Uqcc1-201ENSMUST00000006036 808 ntTSL 5 BASIC9.48□□□□□ -0.89
DysfQ9ESD7 Gm26818-201ENSMUST00000181367 1360 ntTSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
DysfQ9ESD7 Pnmal2-201ENSMUST00000094807 4147 ntAPPRIS P1 BASIC9.48□□□□□ -0.89
DysfQ9ESD7 Cyp2a21-ps-201ENSMUST00000206638 1471 ntBASIC9.48□□□□□ -0.89
DysfQ9ESD7 Mpv17-202ENSMUST00000200744 1653 ntTSL 2 BASIC9.48□□□□□ -0.89
DysfQ9ESD7 Cpa5-202ENSMUST00000115138 1778 ntTSL 5 BASIC9.48□□□□□ -0.89
DysfQ9ESD7 Gigyf2-201ENSMUST00000027475 5724 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
DysfQ9ESD7 Gm43773-201ENSMUST00000198548 2162 ntBASIC9.48□□□□□ -0.89
DysfQ9ESD7 Gdpd2-201ENSMUST00000019503 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
DysfQ9ESD7 Col9a1-202ENSMUST00000088349 3059 ntTSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
DysfQ9ESD7 Shc1-201ENSMUST00000039110 3250 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
DysfQ9ESD7 Megf11-202ENSMUST00000093829 3652 ntTSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
DysfQ9ESD7 Aldoa-201ENSMUST00000032934 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
DysfQ9ESD7 Xkr5-201ENSMUST00000055503 3176 ntTSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
DysfQ9ESD7 Uggt2-212ENSMUST00000156203 6456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.48□□□□□ -0.89
DysfQ9ESD7 Six4-202ENSMUST00000175693 6817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.48□□□□□ -0.89
DysfQ9ESD7 Kansl3-201ENSMUST00000010597 4663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
DysfQ9ESD7 4930488L21Rik-201ENSMUST00000181864 3244 ntTSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
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