Protein–RNA interactions for Protein: Q9DBU3

Riok3, Serine/threonine-protein kinase RIO3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 519 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Riok3Q9DBU3 Gm29815-201ENSMUST00000202418 178 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Riok3Q9DBU3 Scp2-ps2-202ENSMUST00000213851 609 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Riok3Q9DBU3 Gstt2-203ENSMUST00000218500 794 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Riok3Q9DBU3 AC121844.1-201ENSMUST00000218706 137 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Riok3Q9DBU3 Gm32172-201ENSMUST00000220029 633 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Riok3Q9DBU3 AC165254.1-201ENSMUST00000220736 599 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Riok3Q9DBU3 AC164315.1-202ENSMUST00000226723 657 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Riok3Q9DBU3 Cxcl3-201ENSMUST00000031326 1016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Riok3Q9DBU3 4930513O06Rik-201ENSMUST00000033625 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Riok3Q9DBU3 Scrg1-201ENSMUST00000034023 700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Riok3Q9DBU3 Mcrip1-201ENSMUST00000034913 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Riok3Q9DBU3 Olfr1052-201ENSMUST00000054746 940 ntAPPRIS P1 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Riok3Q9DBU3 Gm6776-201ENSMUST00000057752 900 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Riok3Q9DBU3 Cyp27b1-201ENSMUST00000165764 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Riok3Q9DBU3 Ccdc22-201ENSMUST00000033483 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Riok3Q9DBU3 Igfn1-203ENSMUST00000166193 8989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Riok3Q9DBU3 Dennd4c-202ENSMUST00000082026 7940 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Riok3Q9DBU3 Nap1l1-203ENSMUST00000217908 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Riok3Q9DBU3 Epb41l2-207ENSMUST00000218903 4115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Riok3Q9DBU3 Hnrnpk-202ENSMUST00000116403 2970 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Riok3Q9DBU3 Calcoco1-204ENSMUST00000171838 2968 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Riok3Q9DBU3 Abca7-201ENSMUST00000043866 6590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Riok3Q9DBU3 AC159196.3-201ENSMUST00000224307 1841 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Riok3Q9DBU3 4930539J05Rik-201ENSMUST00000181619 1406 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Riok3Q9DBU3 Urgcp-204ENSMUST00000120306 3972 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Riok3Q9DBU3 Galntl5-202ENSMUST00000114965 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Riok3Q9DBU3 Gm10097-201ENSMUST00000180100 2784 ntAPPRIS P1 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Riok3Q9DBU3 Olfr1189-202ENSMUST00000213679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Riok3Q9DBU3 Stx3-203ENSMUST00000075304 2430 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Riok3Q9DBU3 Ddah1-201ENSMUST00000029845 3764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Riok3Q9DBU3 Acvr1c-201ENSMUST00000028178 9162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Riok3Q9DBU3 Nap1l2-201ENSMUST00000121720 2465 ntAPPRIS P1 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Riok3Q9DBU3 Cln3-203ENSMUST00000098036 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Riok3Q9DBU3 H3f3b-202ENSMUST00000106454 2514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Riok3Q9DBU3 Ddx24-202ENSMUST00000110001 3063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Riok3Q9DBU3 Klhl18-201ENSMUST00000068025 4530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Riok3Q9DBU3 Pdlim7-201ENSMUST00000046246 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Riok3Q9DBU3 Zfp352-201ENSMUST00000080541 1656 ntAPPRIS P1 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Riok3Q9DBU3 Adamts5-201ENSMUST00000023611 8091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Riok3Q9DBU3 CT025624.1-201ENSMUST00000224007 2700 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Riok3Q9DBU3 Hus1b-201ENSMUST00000102943 1187 ntAPPRIS P1 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Riok3Q9DBU3 Cpsf4l-203ENSMUST00000106617 1123 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Riok3Q9DBU3 Lsm2-202ENSMUST00000114011 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Riok3Q9DBU3 Gm14007-201ENSMUST00000118288 210 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Riok3Q9DBU3 Gm15233-201ENSMUST00000118747 400 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Riok3Q9DBU3 Gm13716-201ENSMUST00000126401 808 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Riok3Q9DBU3 1700019G24Rik-201ENSMUST00000130004 503 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Riok3Q9DBU3 Ctcflos-202ENSMUST00000142207 918 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Riok3Q9DBU3 Pisd-ps2-202ENSMUST00000142526 1175 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Riok3Q9DBU3 Gm15831-201ENSMUST00000156195 516 ntTSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Riok3Q9DBU3 Gm26313-201ENSMUST00000157770 308 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Riok3Q9DBU3 Gm15775-201ENSMUST00000159796 538 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Riok3Q9DBU3 Esp1-201ENSMUST00000161110 1049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Riok3Q9DBU3 Proscos-202ENSMUST00000178990 666 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Riok3Q9DBU3 Gm26652-202ENSMUST00000181672 475 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Riok3Q9DBU3 1700109K24Rik-201ENSMUST00000181870 1045 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Riok3Q9DBU3 4930568A12Rik-202ENSMUST00000188292 926 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Riok3Q9DBU3 Neurl3-202ENSMUST00000188666 1206 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Riok3Q9DBU3 Gm42442-201ENSMUST00000197951 1133 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Riok3Q9DBU3 Trmt112-ps1-201ENSMUST00000202320 375 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Riok3Q9DBU3 Gm8556-201ENSMUST00000210437 664 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Riok3Q9DBU3 AC116726.2-201ENSMUST00000217629 986 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Riok3Q9DBU3 CT025579.4-201ENSMUST00000224598 627 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Riok3Q9DBU3 Hsd17b3-201ENSMUST00000039832 1131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Riok3Q9DBU3 Krtap4-2-201ENSMUST00000058987 974 ntAPPRIS P1 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Riok3Q9DBU3 Rps21-201ENSMUST00000059080 394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Riok3Q9DBU3 Olfr933-201ENSMUST00000075680 1003 ntAPPRIS P1 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Riok3Q9DBU3 Haus7-202ENSMUST00000077243 1032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Riok3Q9DBU3 Olfr1436-201ENSMUST00000087812 948 ntAPPRIS P1 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Riok3Q9DBU3 Gm10244-201ENSMUST00000090237 830 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Riok3Q9DBU3 Olfr606-201ENSMUST00000098200 960 ntAPPRIS P1 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Riok3Q9DBU3 Wnt9a-202ENSMUST00000108783 3318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Riok3Q9DBU3 E2f7-209ENSMUST00000174857 2865 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Riok3Q9DBU3 Crtc1-201ENSMUST00000076615 5683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Riok3Q9DBU3 Egr2-201ENSMUST00000048289 2965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Riok3Q9DBU3 Jchain-201ENSMUST00000087033 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Riok3Q9DBU3 Sp3-202ENSMUST00000102689 4181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Riok3Q9DBU3 Lrrc8a-202ENSMUST00000113654 4194 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Riok3Q9DBU3 Hook2-204ENSMUST00000210326 3080 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Riok3Q9DBU3 Prom2-201ENSMUST00000028855 4796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Riok3Q9DBU3 Dysf-212ENSMUST00000203695 6504 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Riok3Q9DBU3 Vill-203ENSMUST00000126251 1411 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Riok3Q9DBU3 Selenot-201ENSMUST00000107924 3157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Riok3Q9DBU3 Paqr8-202ENSMUST00000167119 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Riok3Q9DBU3 C3-201ENSMUST00000024988 5136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Riok3Q9DBU3 Col6a2-201ENSMUST00000001181 3949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Riok3Q9DBU3 Cpt1c-206ENSMUST00000212836 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Riok3Q9DBU3 Clpx-202ENSMUST00000113824 2809 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Riok3Q9DBU3 Ampd2-202ENSMUST00000102637 3586 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Riok3Q9DBU3 Lrp2bp-202ENSMUST00000110380 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Riok3Q9DBU3 Ccnb2-ps-202ENSMUST00000170898 2296 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
Riok3Q9DBU3 Wac-216ENSMUST00000171486 1608 ntTSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Riok3Q9DBU3 Arfgap1-203ENSMUST00000108860 2326 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Riok3Q9DBU3 1300002E11Rik-202ENSMUST00000181780 1650 ntTSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Riok3Q9DBU3 Gm10040-201ENSMUST00000080726 1662 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
Riok3Q9DBU3 Sema4a-215ENSMUST00000169222 3084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Riok3Q9DBU3 AC104200.1-201ENSMUST00000224527 1746 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
Riok3Q9DBU3 Lrriq1-203ENSMUST00000166240 5232 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Riok3Q9DBU3 Celf3-215ENSMUST00000200342 3173 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Riok3Q9DBU3 Prkar1b-202ENSMUST00000110889 2457 ntTSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.5 ms