Protein–RNA interactions for Protein: Q9DBT3

Ccdc97, Coiled-coil domain-containing protein 97, mousemouse

Predictions only

Length 340 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc97Q9DBT3 Gm12217-201ENSMUST00000118858 696 ntBASIC11.4□□□□□ -0.58
Ccdc97Q9DBT3 Mcfd2-205ENSMUST00000145895 751 ntTSL 2 BASIC11.4□□□□□ -0.58
Ccdc97Q9DBT3 Gm13869-201ENSMUST00000146978 1054 ntTSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Ccdc97Q9DBT3 Hspb9-202ENSMUST00000169833 726 ntAPPRIS P2 BASIC11.4□□□□□ -0.58
Ccdc97Q9DBT3 Pom121l2-201ENSMUST00000017126 2960 ntAPPRIS P4 BASIC11.4□□□□□ -0.58
Ccdc97Q9DBT3 Apoe-208ENSMUST00000174191 472 ntTSL 2 BASIC11.4□□□□□ -0.58
Ccdc97Q9DBT3 Hcfc1r1-203ENSMUST00000180140 693 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC11.4□□□□□ -0.58
Ccdc97Q9DBT3 Mir6927-201ENSMUST00000184494 71 ntBASIC11.4□□□□□ -0.58
Ccdc97Q9DBT3 Gm28345-201ENSMUST00000188769 1139 ntTSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.58
Ccdc97Q9DBT3 Gm28970-201ENSMUST00000191098 1139 ntTSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.58
Ccdc97Q9DBT3 Gm34767-201ENSMUST00000191813 1062 ntBASIC11.4□□□□□ -0.58
Ccdc97Q9DBT3 4930539M17Rik-201ENSMUST00000194792 846 ntTSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Ccdc97Q9DBT3 Rpl36-ps9-201ENSMUST00000196458 277 ntBASIC11.4□□□□□ -0.58
Ccdc97Q9DBT3 Gm5363-201ENSMUST00000211927 938 ntBASIC11.4□□□□□ -0.58
Ccdc97Q9DBT3 Myl6-211ENSMUST00000219236 692 ntTSL 2 BASIC11.4□□□□□ -0.58
Ccdc97Q9DBT3 AC134860.1-201ENSMUST00000224867 660 ntBASIC11.4□□□□□ -0.58
Ccdc97Q9DBT3 AC112945.1-201ENSMUST00000226413 514 ntBASIC11.4□□□□□ -0.58
Ccdc97Q9DBT3 Cox6a2-201ENSMUST00000033049 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Ccdc97Q9DBT3 Crygs-201ENSMUST00000040592 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Ccdc97Q9DBT3 Crabp2-201ENSMUST00000005019 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Ccdc97Q9DBT3 Gm4978-201ENSMUST00000071565 801 ntBASIC11.4□□□□□ -0.58
Ccdc97Q9DBT3 Gm4409-201ENSMUST00000130734 1919 ntTSL 2 BASIC11.4□□□□□ -0.58
Ccdc97Q9DBT3 Ddo-202ENSMUST00000213442 2408 ntTSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Ccdc97Q9DBT3 Fam90a1b-201ENSMUST00000044989 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Ccdc97Q9DBT3 Dglucy-202ENSMUST00000110069 3058 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Ccdc97Q9DBT3 Rcan2-201ENSMUST00000044792 3237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Ccdc97Q9DBT3 Rai2-201ENSMUST00000061514 2204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Ccdc97Q9DBT3 Gcnt7-201ENSMUST00000099060 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Ccdc97Q9DBT3 Fam120b-201ENSMUST00000055352 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Ccdc97Q9DBT3 Rsc1a1-201ENSMUST00000105782 1749 ntAPPRIS P1 BASIC11.4□□□□□ -0.58
Ccdc97Q9DBT3 Platr25-207ENSMUST00000222477 1705 ntTSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.58
Ccdc97Q9DBT3 Ilf3-208ENSMUST00000214758 3177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.59
Ccdc97Q9DBT3 Loxhd1-202ENSMUST00000096547 6595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.59
Ccdc97Q9DBT3 Myo1b-201ENSMUST00000018561 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.59
Ccdc97Q9DBT3 Gm14150-201ENSMUST00000122404 1354 ntBASIC11.4□□□□□ -0.59
Ccdc97Q9DBT3 Lrrc74b-202ENSMUST00000065125 1539 ntTSL 2 BASIC11.4□□□□□ -0.59
Ccdc97Q9DBT3 Gm10787-201ENSMUST00000099552 1548 ntTSL 2 BASIC11.4□□□□□ -0.59
Ccdc97Q9DBT3 CT010498.2-201ENSMUST00000225690 1659 ntAPPRIS P1 BASIC11.4□□□□□ -0.59
Ccdc97Q9DBT3 Sh2d7-201ENSMUST00000060242 2759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Ccdc97Q9DBT3 Pask-201ENSMUST00000027493 5779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Ccdc97Q9DBT3 Gm37759-201ENSMUST00000194155 3246 ntBASIC11.39□□□□□ -0.59
Ccdc97Q9DBT3 Kbtbd12-206ENSMUST00000184878 3351 ntTSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Ccdc97Q9DBT3 Anln-201ENSMUST00000040912 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Ccdc97Q9DBT3 Cenpj-203ENSMUST00000225951 4756 ntAPPRIS P1 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Ccdc97Q9DBT3 Aicda-201ENSMUST00000043301 2405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Ccdc97Q9DBT3 Gprc5d-202ENSMUST00000111922 1317 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Ccdc97Q9DBT3 Dusp16-202ENSMUST00000129433 3993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Ccdc97Q9DBT3 Smchd1-201ENSMUST00000127430 7052 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Ccdc97Q9DBT3 Vps54-202ENSMUST00000109578 4273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Ccdc97Q9DBT3 Dcun1d2-204ENSMUST00000110840 2853 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Ccdc97Q9DBT3 Drd3-201ENSMUST00000023390 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Ccdc97Q9DBT3 Themis3-201ENSMUST00000024914 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Ccdc97Q9DBT3 Dlgap2-208ENSMUST00000150247 3138 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Ccdc97Q9DBT3 Zfyve1-201ENSMUST00000048319 4036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Ccdc97Q9DBT3 Itk-202ENSMUST00000101306 1185 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Ccdc97Q9DBT3 Ccdc163-202ENSMUST00000106462 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Ccdc97Q9DBT3 Folr1-201ENSMUST00000106981 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Ccdc97Q9DBT3 H2-T24-201ENSMUST00000113760 2182 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Ccdc97Q9DBT3 Gm7851-201ENSMUST00000117574 323 ntBASIC11.39□□□□□ -0.59
Ccdc97Q9DBT3 Gm3329-201ENSMUST00000159873 556 ntBASIC11.39□□□□□ -0.59
Ccdc97Q9DBT3 Gm8459-201ENSMUST00000162504 760 ntBASIC11.39□□□□□ -0.59
Ccdc97Q9DBT3 Gm20495-201ENSMUST00000173902 235 ntBASIC11.39□□□□□ -0.59
Ccdc97Q9DBT3 1110038B12Rik-208ENSMUST00000174714 520 ntTSL 2 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Ccdc97Q9DBT3 Chtf8-203ENSMUST00000176090 615 ntTSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Ccdc97Q9DBT3 Gm10807-201ENSMUST00000177134 795 ntBASIC11.39□□□□□ -0.59
Ccdc97Q9DBT3 Gm27175-201ENSMUST00000183759 606 ntTSL 3 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Ccdc97Q9DBT3 Gm27223-201ENSMUST00000184653 606 ntTSL 3 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Ccdc97Q9DBT3 Gm37122-201ENSMUST00000195313 1567 ntBASIC11.39□□□□□ -0.59
Ccdc97Q9DBT3 Gm43966-201ENSMUST00000203301 612 ntBASIC11.39□□□□□ -0.59
Ccdc97Q9DBT3 Gm5369-201ENSMUST00000217499 588 ntBASIC11.39□□□□□ -0.59
Ccdc97Q9DBT3 Vmn1r222-201ENSMUST00000077116 1054 ntAPPRIS P1 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Ccdc97Q9DBT3 Dcaf8-201ENSMUST00000074144 4656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Ccdc97Q9DBT3 Bnc2-202ENSMUST00000107198 3948 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Ccdc97Q9DBT3 Zfp280d-211ENSMUST00000184036 3459 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Ccdc97Q9DBT3 Dglucy-204ENSMUST00000110073 3184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Ccdc97Q9DBT3 Gm9271-201ENSMUST00000185988 2580 ntBASIC11.39□□□□□ -0.59
Ccdc97Q9DBT3 Fam114a2-201ENSMUST00000020831 2557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Ccdc97Q9DBT3 Gm15446-201ENSMUST00000112544 2417 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Ccdc97Q9DBT3 Ank2-214ENSMUST00000182547 2428 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Ccdc97Q9DBT3 Rnf20-210ENSMUST00000167496 4312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Ccdc97Q9DBT3 Myo9a-203ENSMUST00000128341 11985 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Ccdc97Q9DBT3 Zfp189-202ENSMUST00000107696 2965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Ccdc97Q9DBT3 Sez6l-205ENSMUST00000212480 5857 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Ccdc97Q9DBT3 Map7d2-202ENSMUST00000112470 1350 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Ccdc97Q9DBT3 Skiv2l-201ENSMUST00000046022 3951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Ccdc97Q9DBT3 Gm18806-201ENSMUST00000207607 1775 ntBASIC11.39□□□□□ -0.59
Ccdc97Q9DBT3 Cyb5b-201ENSMUST00000034400 4316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Ccdc97Q9DBT3 Iqce-201ENSMUST00000041783 6037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Ccdc97Q9DBT3 Gm14565-201ENSMUST00000140021 2494 ntTSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Ccdc97Q9DBT3 Grin2b-205ENSMUST00000152012 2461 ntTSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Ccdc97Q9DBT3 Gmeb1-201ENSMUST00000030733 2485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Ccdc97Q9DBT3 Spo11-203ENSMUST00000109126 1625 ntTSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Ccdc97Q9DBT3 CT010447.1-201ENSMUST00000225657 1608 ntBASIC11.38□□□□□ -0.59
Ccdc97Q9DBT3 Epha7-204ENSMUST00000108194 2323 ntTSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Ccdc97Q9DBT3 Atxn2l-206ENSMUST00000206577 3894 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Ccdc97Q9DBT3 Gpr37-202ENSMUST00000200812 3035 ntTSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Ccdc97Q9DBT3 Car12-201ENSMUST00000071889 3716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Ccdc97Q9DBT3 Bad-201ENSMUST00000025910 1451 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Ccdc97Q9DBT3 Apbb1-217ENSMUST00000191011 2712 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Ccdc97Q9DBT3 Cped1-201ENSMUST00000115382 2002 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.8 ms