Protein–RNA interactions for Protein: Q9DB28

Pop5, Ribonuclease P/MRP protein subunit POP5, mousemouse

Predictions only

Length 169 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pop5Q9DB28 Cycs-202ENSMUST00000161401 3123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Pop5Q9DB28 Rps10-203ENSMUST00000114882 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Pop5Q9DB28 Thegl-203ENSMUST00000118941 746 ntTSL 3 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Pop5Q9DB28 Gm14395-201ENSMUST00000120494 563 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
Pop5Q9DB28 Gm14396-201ENSMUST00000126966 548 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Pop5Q9DB28 Rpl9-ps7-201ENSMUST00000140507 579 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
Pop5Q9DB28 Hnf4aos-203ENSMUST00000141329 839 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Pop5Q9DB28 Cideb-201ENSMUST00000001497 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Pop5Q9DB28 Mrpl23-ps1-201ENSMUST00000173086 580 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
Pop5Q9DB28 Slc2a4rg-ps-202ENSMUST00000176590 1143 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
Pop5Q9DB28 Gm27552-201ENSMUST00000183351 62 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
Pop5Q9DB28 Gm27844-201ENSMUST00000183613 62 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
Pop5Q9DB28 Gm28306-201ENSMUST00000191315 529 ntTSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Pop5Q9DB28 Gm37835-201ENSMUST00000193305 361 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
Pop5Q9DB28 Atraid-205ENSMUST00000201136 894 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Pop5Q9DB28 Ddo-207ENSMUST00000216830 806 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Pop5Q9DB28 9430041J12Rik-201ENSMUST00000050989 534 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
Pop5Q9DB28 Rassf8-202ENSMUST00000058538 1131 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
Pop5Q9DB28 Rpl9-ps4-201ENSMUST00000075549 579 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
Pop5Q9DB28 Gm5451-201ENSMUST00000080545 579 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
Pop5Q9DB28 Zfp286-202ENSMUST00000108705 1979 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Pop5Q9DB28 Gm5766-201ENSMUST00000160520 1977 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
Pop5Q9DB28 AW549877-201ENSMUST00000046633 5076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Pop5Q9DB28 Bloc1s5-201ENSMUST00000035899 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Pop5Q9DB28 Tspan18-202ENSMUST00000111265 3751 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Pop5Q9DB28 Ntrk2-207ENSMUST00000225488 4706 ntAPPRIS P1 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Pop5Q9DB28 Plg-201ENSMUST00000014578 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Pop5Q9DB28 Rbm8a-203ENSMUST00000198027 2757 ntTSL 3 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Pop5Q9DB28 Shc1-210ENSMUST00000191485 3154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Pop5Q9DB28 Tnpo3-201ENSMUST00000012679 4251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Pop5Q9DB28 Pa2g4-202ENSMUST00000131728 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Pop5Q9DB28 Gm5703-201ENSMUST00000186658 3973 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
Pop5Q9DB28 Pde6c-202ENSMUST00000112329 2895 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Pop5Q9DB28 March1-207ENSMUST00000110258 2581 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Pop5Q9DB28 Slit2-216ENSMUST00000174313 7734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Pop5Q9DB28 Mgl2-205ENSMUST00000165951 1635 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Pop5Q9DB28 Gm8271-201ENSMUST00000171053 1469 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Pop5Q9DB28 Il27ra-201ENSMUST00000005601 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Pop5Q9DB28 Zfp217-201ENSMUST00000063710 5685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Pop5Q9DB28 Chdh-202ENSMUST00000118917 3406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Pop5Q9DB28 Rtn4ip1-202ENSMUST00000105492 2059 ntTSL 3 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Pop5Q9DB28 Plet1-201ENSMUST00000114474 1689 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Pop5Q9DB28 9130227L01Rik-202ENSMUST00000189293 1906 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Pop5Q9DB28 Rhoj-203ENSMUST00000118966 4892 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Pop5Q9DB28 Kcnh3-201ENSMUST00000041415 3583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Pop5Q9DB28 Mir877-201ENSMUST00000104738 85 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
Pop5Q9DB28 Dynlrb1-202ENSMUST00000109682 684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Pop5Q9DB28 Gm15264-201ENSMUST00000118050 502 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
Pop5Q9DB28 Gm15352-201ENSMUST00000118696 270 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
Pop5Q9DB28 Gm14208-201ENSMUST00000119645 678 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
Pop5Q9DB28 Gm12570-201ENSMUST00000122047 1030 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
Pop5Q9DB28 Nbdy-201ENSMUST00000140575 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Pop5Q9DB28 Nudt6-207ENSMUST00000141438 899 ntTSL 2 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Pop5Q9DB28 Gm16275-201ENSMUST00000147774 712 ntTSL 3 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Pop5Q9DB28 Nbdy-202ENSMUST00000149514 775 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Pop5Q9DB28 Arid3b-204ENSMUST00000164010 1259 ntTSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Pop5Q9DB28 Mir7051-201ENSMUST00000184167 73 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
Pop5Q9DB28 Gm2260-201ENSMUST00000184965 657 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
Pop5Q9DB28 Gm4753-201ENSMUST00000188327 1255 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
Pop5Q9DB28 Ighv5-11-201ENSMUST00000193354 371 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
Pop5Q9DB28 Crcp-204ENSMUST00000202163 931 ntTSL 2 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Pop5Q9DB28 Gm42800-201ENSMUST00000202494 733 ntTSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Pop5Q9DB28 Gm35549-202ENSMUST00000203656 1009 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Pop5Q9DB28 AC164612.1-201ENSMUST00000216699 517 ntTSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Pop5Q9DB28 Abracl-204ENSMUST00000220110 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Pop5Q9DB28 Olfr1350-201ENSMUST00000070985 927 ntAPPRIS P1 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Pop5Q9DB28 Fpr-rs3-201ENSMUST00000071189 1032 ntAPPRIS P1 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Pop5Q9DB28 Hcst-201ENSMUST00000075062 442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Pop5Q9DB28 Gm7551-201ENSMUST00000089593 1074 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
Pop5Q9DB28 4933425M03Rik-201ENSMUST00000195991 1544 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
Pop5Q9DB28 Amz1-202ENSMUST00000120630 4037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Pop5Q9DB28 Gm11571-201ENSMUST00000136820 2396 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Pop5Q9DB28 Rcbtb2-219ENSMUST00000169513 3622 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Pop5Q9DB28 Polr3c-201ENSMUST00000029741 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Pop5Q9DB28 D630029K05Rik-201ENSMUST00000033651 2133 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Pop5Q9DB28 Pigb-206ENSMUST00000184035 3221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Pop5Q9DB28 Zmynd11-203ENSMUST00000110634 3824 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Pop5Q9DB28 Zfp217-202ENSMUST00000109155 5670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Pop5Q9DB28 Hmg20a-205ENSMUST00000215269 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Pop5Q9DB28 4933424N20Rik-201ENSMUST00000200749 1463 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
Pop5Q9DB28 Otof-201ENSMUST00000074171 7129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Pop5Q9DB28 Gm11735-201ENSMUST00000106377 1581 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
Pop5Q9DB28 Cblb-203ENSMUST00000226593 3864 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Pop5Q9DB28 Gm9415-201ENSMUST00000200462 1321 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
Pop5Q9DB28 Kir3dl2-202ENSMUST00000113108 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Pop5Q9DB28 Myo5a-206ENSMUST00000136731 6480 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Pop5Q9DB28 Myt1l-201ENSMUST00000021009 5027 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Pop5Q9DB28 Ncapd3-205ENSMUST00000216677 5149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Pop5Q9DB28 Oprm1-203ENSMUST00000056385 1440 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Pop5Q9DB28 Atg9a-205ENSMUST00000188347 4041 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Pop5Q9DB28 Sh3gl2-201ENSMUST00000030212 2822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Pop5Q9DB28 Nos1ap-203ENSMUST00000160466 1533 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Pop5Q9DB28 Ankub1-202ENSMUST00000197088 1854 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Pop5Q9DB28 Lig3-210ENSMUST00000173347 3631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Pop5Q9DB28 Mier1-204ENSMUST00000106857 4752 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Pop5Q9DB28 Lztr1-202ENSMUST00000115681 3394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Pop5Q9DB28 1700017B05Rik-201ENSMUST00000034846 4152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Pop5Q9DB28 Rhox2g-201ENSMUST00000115169 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Pop5Q9DB28 Bcas3os2-201ENSMUST00000134305 661 ntTSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Pop5Q9DB28 2010001A14Rik-203ENSMUST00000152790 714 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.7 ms