Protein–RNA interactions for Protein: Q9D8K3

Derl3, Derlin-3, mousemouse

Predictions only

Length 228 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Derl3Q9D8K3 Ndufab1-201ENSMUST00000033157 3479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.45□□□□□ -0.9
Derl3Q9D8K3 Pip5k1a-201ENSMUST00000005768 3480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.45□□□□□ -0.9
Derl3Q9D8K3 Gpm6b-209ENSMUST00000112235 4480 ntTSL 1 (best) BASIC9.45□□□□□ -0.9
Derl3Q9D8K3 Ube2l3-201ENSMUST00000090192 2609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.45□□□□□ -0.9
Derl3Q9D8K3 Myh13-201ENSMUST00000081911 5817 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.45□□□□□ -0.9
Derl3Q9D8K3 Scn10a-204ENSMUST00000214408 5877 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.45□□□□□ -0.9
Derl3Q9D8K3 Specc1l-201ENSMUST00000040105 5928 ntTSL 5 BASIC9.45□□□□□ -0.9
Derl3Q9D8K3 Gm42427-201ENSMUST00000200473 5292 ntBASIC9.45□□□□□ -0.9
Derl3Q9D8K3 Fam49a-201ENSMUST00000069005 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.45□□□□□ -0.9
Derl3Q9D8K3 Rangap1-202ENSMUST00000170134 3002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.45□□□□□ -0.9
Derl3Q9D8K3 Gm15832-201ENSMUST00000146314 1832 ntTSL 1 (best) BASIC9.45□□□□□ -0.9
Derl3Q9D8K3 Gm38192-201ENSMUST00000194364 1847 ntBASIC9.45□□□□□ -0.9
Derl3Q9D8K3 Mybph-201ENSMUST00000038445 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.45□□□□□ -0.9
Derl3Q9D8K3 Ubap2-202ENSMUST00000108068 4380 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.45□□□□□ -0.9
Derl3Q9D8K3 Phf8-202ENSMUST00000046962 3105 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.45□□□□□ -0.9
Derl3Q9D8K3 Gm29895-201ENSMUST00000209933 5652 ntTSL 5 BASIC9.45□□□□□ -0.9
Derl3Q9D8K3 Tcn2-205ENSMUST00000109991 1943 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.44□□□□□ -0.9
Derl3Q9D8K3 5830411N06Rik-203ENSMUST00000164583 3342 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.44□□□□□ -0.9
Derl3Q9D8K3 Gm37264-201ENSMUST00000194916 2192 ntBASIC9.44□□□□□ -0.9
Derl3Q9D8K3 Gm37003-201ENSMUST00000194702 2827 ntBASIC9.44□□□□□ -0.9
Derl3Q9D8K3 Myo9a-205ENSMUST00000135298 12198 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.44□□□□□ -0.9
Derl3Q9D8K3 Clip1-204ENSMUST00000111564 5609 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.44□□□□□ -0.9
Derl3Q9D8K3 Pdp2-201ENSMUST00000059588 5692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.44□□□□□ -0.9
Derl3Q9D8K3 Tenm2-201ENSMUST00000057207 8298 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC9.44□□□□□ -0.9
Derl3Q9D8K3 Col4a3-201ENSMUST00000113457 8554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.44□□□□□ -0.9
Derl3Q9D8K3 Ngf-202ENSMUST00000106925 1187 ntTSL 1 (best) BASIC9.44□□□□□ -0.9
Derl3Q9D8K3 Thoc6-203ENSMUST00000115489 1083 ntTSL 5 BASIC9.44□□□□□ -0.9
Derl3Q9D8K3 Gm14592-201ENSMUST00000117201 560 ntBASIC9.44□□□□□ -0.9
Derl3Q9D8K3 Leng8-202ENSMUST00000117274 874 ntTSL 1 (best) BASIC9.44□□□□□ -0.9
Derl3Q9D8K3 Gm15351-201ENSMUST00000123920 419 ntTSL 1 (best) BASIC9.44□□□□□ -0.9
Derl3Q9D8K3 Tmem74bos-201ENSMUST00000137422 390 ntTSL 3 BASIC9.44□□□□□ -0.9
Derl3Q9D8K3 Fez1-208ENSMUST00000163816 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.44□□□□□ -0.9
Derl3Q9D8K3 Ccdc188-201ENSMUST00000167061 747 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.44□□□□□ -0.9
Derl3Q9D8K3 Gm27046-201ENSMUST00000182160 463 ntBASIC9.44□□□□□ -0.9
Derl3Q9D8K3 1700094J05Rik-202ENSMUST00000190491 997 ntTSL 1 (best) BASIC9.44□□□□□ -0.9
Derl3Q9D8K3 Gm43184-201ENSMUST00000197247 542 ntBASIC9.44□□□□□ -0.9
Derl3Q9D8K3 Gm43667-201ENSMUST00000198616 1095 ntBASIC9.44□□□□□ -0.9
Derl3Q9D8K3 Gm2420-203ENSMUST00000202748 447 ntTSL 5 BASIC9.44□□□□□ -0.9
Derl3Q9D8K3 Gm19309-201ENSMUST00000218295 205 ntBASIC9.44□□□□□ -0.9
Derl3Q9D8K3 Olfr54-201ENSMUST00000072152 942 ntAPPRIS P1 BASIC9.44□□□□□ -0.9
Derl3Q9D8K3 Olfr1375-201ENSMUST00000073543 942 ntAPPRIS P1 BASIC9.44□□□□□ -0.9
Derl3Q9D8K3 Zdhhc12-201ENSMUST00000081838 1187 ntTSL 1 (best) BASIC9.44□□□□□ -0.9
Derl3Q9D8K3 C2cd5-201ENSMUST00000087485 4265 ntTSL 5 BASIC9.44□□□□□ -0.9
Derl3Q9D8K3 Gtf3c2-201ENSMUST00000088010 4552 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.44□□□□□ -0.9
Derl3Q9D8K3 Ccndbp1-203ENSMUST00000099489 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.44□□□□□ -0.9
Derl3Q9D8K3 Henmt1-203ENSMUST00000106586 1838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.44□□□□□ -0.9
Derl3Q9D8K3 Madd-204ENSMUST00000077941 5990 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.44□□□□□ -0.9
Derl3Q9D8K3 Madd-205ENSMUST00000099723 5977 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.44□□□□□ -0.9
Derl3Q9D8K3 Adcy6-201ENSMUST00000096224 6038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.44□□□□□ -0.9
Derl3Q9D8K3 AC164099.2-201ENSMUST00000227795 2005 ntAPPRIS P1 BASIC9.44□□□□□ -0.9
Derl3Q9D8K3 Slc6a2-201ENSMUST00000072939 6187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.44□□□□□ -0.9
Derl3Q9D8K3 Cdh18-207ENSMUST00000226693 2165 ntBASIC9.44□□□□□ -0.9
Derl3Q9D8K3 Ino80c-203ENSMUST00000141489 2207 ntTSL 1 (best) BASIC9.44□□□□□ -0.9
Derl3Q9D8K3 Gm9220-201ENSMUST00000190721 2544 ntBASIC9.44□□□□□ -0.9
Derl3Q9D8K3 Wwp2-204ENSMUST00000212205 2758 ntTSL 1 (best) BASIC9.44□□□□□ -0.9
Derl3Q9D8K3 Eef2k-204ENSMUST00000106489 3047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.44□□□□□ -0.9
Derl3Q9D8K3 Slc45a3-202ENSMUST00000177943 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.44□□□□□ -0.9
Derl3Q9D8K3 Slc25a44-204ENSMUST00000195657 3504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.44□□□□□ -0.9
Derl3Q9D8K3 Vwce-201ENSMUST00000055115 3540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.44□□□□□ -0.9
Derl3Q9D8K3 D630003M21Rik-202ENSMUST00000103121 4521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.44□□□□□ -0.9
Derl3Q9D8K3 Gm5878-201ENSMUST00000113802 4643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.44□□□□□ -0.9
Derl3Q9D8K3 Atp5g1-201ENSMUST00000090541 4715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.43□□□□□ -0.9
Derl3Q9D8K3 Bicd2-202ENSMUST00000110084 4488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.43□□□□□ -0.9
Derl3Q9D8K3 Ints3-201ENSMUST00000029542 4337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.43□□□□□ -0.9
Derl3Q9D8K3 Pear1-201ENSMUST00000029714 4260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.43□□□□□ -0.9
Derl3Q9D8K3 Tnk2-204ENSMUST00000115123 4225 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.43□□□□□ -0.9
Derl3Q9D8K3 Gripap1-201ENSMUST00000065932 3156 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.43□□□□□ -0.9
Derl3Q9D8K3 Zfp672-201ENSMUST00000057836 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.43□□□□□ -0.9
Derl3Q9D8K3 Sun1-204ENSMUST00000110882 2454 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.43□□□□□ -0.9
Derl3Q9D8K3 Casq2-205ENSMUST00000165540 2434 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.43□□□□□ -0.9
Derl3Q9D8K3 Gm44798-201ENSMUST00000208123 2410 ntBASIC9.43□□□□□ -0.9
Derl3Q9D8K3 AC129336.1-201ENSMUST00000220224 2277 ntBASIC9.43□□□□□ -0.9
Derl3Q9D8K3 Kif3a-202ENSMUST00000118353 2178 ntTSL 5 BASIC9.43□□□□□ -0.9
Derl3Q9D8K3 Mcf2l-222ENSMUST00000173099 6081 ntTSL 5 BASIC9.43□□□□□ -0.9
Derl3Q9D8K3 Lrit3-201ENSMUST00000179187 1683 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.43□□□□□ -0.9
Derl3Q9D8K3 Krt33b-201ENSMUST00000073890 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.43□□□□□ -0.9
Derl3Q9D8K3 Gm26912-201ENSMUST00000180988 1483 ntTSL 1 (best) BASIC9.43□□□□□ -0.9
Derl3Q9D8K3 Rnft2-201ENSMUST00000117177 4381 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.43□□□□□ -0.9
Derl3Q9D8K3 Stpg3-201ENSMUST00000043774 1430 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.43□□□□□ -0.9
Derl3Q9D8K3 Myh10-204ENSMUST00000108673 1315 ntTSL 1 (best) BASIC9.43□□□□□ -0.9
Derl3Q9D8K3 Igf1-204ENSMUST00000121161 1344 ntTSL 1 (best) BASIC9.43□□□□□ -0.9
Derl3Q9D8K3 Top1-201ENSMUST00000109468 3856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.43□□□□□ -0.9
Derl3Q9D8K3 Glrx2-202ENSMUST00000111957 580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.43□□□□□ -0.9
Derl3Q9D8K3 4930483J18Rik-202ENSMUST00000138715 1093 ntTSL 1 (best) BASIC9.43□□□□□ -0.9
Derl3Q9D8K3 Lyzl4os-202ENSMUST00000156364 726 ntTSL 1 (best) BASIC9.43□□□□□ -0.9
Derl3Q9D8K3 Hsbp1l1-201ENSMUST00000166219 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.43□□□□□ -0.9
Derl3Q9D8K3 Rpl41-206ENSMUST00000177163 544 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.43□□□□□ -0.9
Derl3Q9D8K3 Gm29396-201ENSMUST00000185659 716 ntBASIC9.43□□□□□ -0.9
Derl3Q9D8K3 Sox2ot-208ENSMUST00000197103 802 ntTSL 2 BASIC9.43□□□□□ -0.9
Derl3Q9D8K3 Gm5714-201ENSMUST00000197343 566 ntBASIC9.43□□□□□ -0.9
Derl3Q9D8K3 Gm43058-201ENSMUST00000197645 625 ntBASIC9.43□□□□□ -0.9
Derl3Q9D8K3 Hax1-206ENSMUST00000197786 857 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.43□□□□□ -0.9
Derl3Q9D8K3 Sox2ot-217ENSMUST00000200414 710 ntTSL 3 BASIC9.43□□□□□ -0.9
Derl3Q9D8K3 Gm43050-201ENSMUST00000201062 338 ntTSL 2 BASIC9.43□□□□□ -0.9
Derl3Q9D8K3 Btg4-203ENSMUST00000213680 1282 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.43□□□□□ -0.9
Derl3Q9D8K3 Gm40639-201ENSMUST00000214642 625 ntTSL 5 BASIC9.43□□□□□ -0.9
Derl3Q9D8K3 Prss52-201ENSMUST00000022537 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.43□□□□□ -0.9
Derl3Q9D8K3 Crygs-201ENSMUST00000040592 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.43□□□□□ -0.9
Derl3Q9D8K3 Zfp366-201ENSMUST00000056558 6382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.43□□□□□ -0.9
Derl3Q9D8K3 Pvalb-201ENSMUST00000005860 977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.43□□□□□ -0.9
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 67.7 ms