Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQK3

Rdm1, RAD52 motif-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 281 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rdm1Q9CQK3 Prg4-201ENSMUST00000006171 1869 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Rdm1Q9CQK3 Tmem109-201ENSMUST00000038128 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Rdm1Q9CQK3 Dsc2-202ENSMUST00000075214 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Rdm1Q9CQK3 Rfx6-204ENSMUST00000219364 2682 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Rdm1Q9CQK3 Fn1-216ENSMUST00000189821 7410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Rdm1Q9CQK3 Zscan10-205ENSMUST00000120967 2609 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Rdm1Q9CQK3 Ltbp1-202ENSMUST00000112514 4870 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Rdm1Q9CQK3 AC125374.1-201ENSMUST00000213573 1400 ntBASIC13.22□□□□□ -0.29
Rdm1Q9CQK3 Gm17745-201ENSMUST00000212186 1692 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Rdm1Q9CQK3 Mphosph10-201ENSMUST00000032735 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Rdm1Q9CQK3 Pars2-202ENSMUST00000106781 3046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Rdm1Q9CQK3 Oprm1-222ENSMUST00000135502 1363 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Rdm1Q9CQK3 Pik3r5-201ENSMUST00000021283 4370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Rdm1Q9CQK3 Cops3-201ENSMUST00000019517 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Rdm1Q9CQK3 Fosb-201ENSMUST00000003640 3782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Rdm1Q9CQK3 Kcnb1-204ENSMUST00000207917 11153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Rdm1Q9CQK3 Nphs1os-201ENSMUST00000152625 1339 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Rdm1Q9CQK3 Gm35363-201ENSMUST00000209330 1317 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Rdm1Q9CQK3 Vps16-201ENSMUST00000028900 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Rdm1Q9CQK3 Gabra1-201ENSMUST00000020707 4688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Rdm1Q9CQK3 Aldh1a7-201ENSMUST00000025656 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Rdm1Q9CQK3 Tfr2-204ENSMUST00000196471 2839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Rdm1Q9CQK3 Gm13445-201ENSMUST00000121664 307 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
Rdm1Q9CQK3 B230307C23Rik-202ENSMUST00000122450 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Rdm1Q9CQK3 Hmgn2-208ENSMUST00000136327 772 ntTSL 2 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Rdm1Q9CQK3 4930571N24Rik-202ENSMUST00000142914 598 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Rdm1Q9CQK3 Gm45716-203ENSMUST00000153734 644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Rdm1Q9CQK3 Gm24248-201ENSMUST00000157321 322 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
Rdm1Q9CQK3 Pax4-202ENSMUST00000164519 1229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Rdm1Q9CQK3 Pax4-203ENSMUST00000171089 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Rdm1Q9CQK3 Gm28166-201ENSMUST00000187637 620 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Rdm1Q9CQK3 1700039I01Rik-201ENSMUST00000194370 479 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
Rdm1Q9CQK3 Gm43001-201ENSMUST00000198925 603 ntTSL 3 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Rdm1Q9CQK3 Gm9508-201ENSMUST00000220084 693 ntAPPRIS P1 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Rdm1Q9CQK3 Gm12216-207ENSMUST00000220191 1073 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Rdm1Q9CQK3 CT025679.1-201ENSMUST00000227106 449 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
Rdm1Q9CQK3 Gm10334-201ENSMUST00000095999 876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Rdm1Q9CQK3 Prss3-201ENSMUST00000096003 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Rdm1Q9CQK3 Swap70-201ENSMUST00000033325 4027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Rdm1Q9CQK3 Tmem8b-201ENSMUST00000107864 4726 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Rdm1Q9CQK3 Mefv-202ENSMUST00000100222 3249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Rdm1Q9CQK3 Polr1e-203ENSMUST00000107814 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Rdm1Q9CQK3 Plekhg5-203ENSMUST00000105662 3933 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.3
Rdm1Q9CQK3 Tubb1-201ENSMUST00000016399 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Rdm1Q9CQK3 Gm32828-202ENSMUST00000219198 2111 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Rdm1Q9CQK3 Gm6793-201ENSMUST00000071732 1604 ntAPPRIS P1 BASIC13.21□□□□□ -0.3
Rdm1Q9CQK3 Slc37a4-202ENSMUST00000213268 1353 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Rdm1Q9CQK3 Rsad1-201ENSMUST00000040487 4143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Rdm1Q9CQK3 Bub3-203ENSMUST00000207442 3414 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Rdm1Q9CQK3 Unkl-204ENSMUST00000160896 4787 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Rdm1Q9CQK3 Ndrg4-203ENSMUST00000080666 2738 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Rdm1Q9CQK3 Vwa1-201ENSMUST00000042196 3623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Rdm1Q9CQK3 Egfr-202ENSMUST00000102884 2943 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Rdm1Q9CQK3 Dlec1-206ENSMUST00000140326 5815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Rdm1Q9CQK3 Jmjd4-202ENSMUST00000108777 4351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Rdm1Q9CQK3 Pbrm1-207ENSMUST00000112095 7907 ntTSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Rdm1Q9CQK3 Tmub2-201ENSMUST00000036376 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Rdm1Q9CQK3 Gm6158-201ENSMUST00000109467 904 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
Rdm1Q9CQK3 Smim6-201ENSMUST00000132961 978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Rdm1Q9CQK3 Gm16587-201ENSMUST00000161943 863 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Rdm1Q9CQK3 Gsdme-205ENSMUST00000170142 2133 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Rdm1Q9CQK3 AC238811.4-201ENSMUST00000178019 1246 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
Rdm1Q9CQK3 AC238940.3-201ENSMUST00000178830 1246 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
Rdm1Q9CQK3 Gm26918-201ENSMUST00000182496 728 ntTSL 2 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Rdm1Q9CQK3 Gm40414-201ENSMUST00000197608 481 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
Rdm1Q9CQK3 4930478P22Rik-202ENSMUST00000201921 723 ntTSL 3 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Rdm1Q9CQK3 4930447C11Rik-201ENSMUST00000204503 928 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
Rdm1Q9CQK3 Gm33080-201ENSMUST00000205429 172 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
Rdm1Q9CQK3 Gm45460-201ENSMUST00000211385 1038 ntTSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Rdm1Q9CQK3 Gm5178-201ENSMUST00000219380 898 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
Rdm1Q9CQK3 AC123694.1-201ENSMUST00000219525 644 ntTSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Rdm1Q9CQK3 Capsl-202ENSMUST00000226688 739 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
Rdm1Q9CQK3 Crygd-201ENSMUST00000045028 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Rdm1Q9CQK3 Lxn-201ENSMUST00000058981 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Rdm1Q9CQK3 Gm9873-201ENSMUST00000063891 1097 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
Rdm1Q9CQK3 Miga2-201ENSMUST00000077977 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Rdm1Q9CQK3 5033403F01Rik-201ENSMUST00000181376 1678 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Rdm1Q9CQK3 Ribc2-201ENSMUST00000023067 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Rdm1Q9CQK3 Ces2d-ps-201ENSMUST00000043209 1656 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
Rdm1Q9CQK3 Fam109b-203ENSMUST00000161178 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Rdm1Q9CQK3 Cfi-201ENSMUST00000077918 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Rdm1Q9CQK3 Kcnk10-201ENSMUST00000110113 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Rdm1Q9CQK3 Sec22b-201ENSMUST00000029476 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Rdm1Q9CQK3 Gucy2e-203ENSMUST00000108665 3645 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Rdm1Q9CQK3 Mbnl2-204ENSMUST00000227012 2390 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
Rdm1Q9CQK3 Dnmt3aos-201ENSMUST00000144896 1385 ntTSL 2 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Rdm1Q9CQK3 Slc37a4-207ENSMUST00000215420 2128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Rdm1Q9CQK3 Gtf2a1-202ENSMUST00000063314 2265 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Rdm1Q9CQK3 Rnf17-201ENSMUST00000095793 5264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Rdm1Q9CQK3 Nrros-202ENSMUST00000115163 3559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Rdm1Q9CQK3 Cyb5b-201ENSMUST00000034400 4316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Rdm1Q9CQK3 Dcaf8-202ENSMUST00000191689 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Rdm1Q9CQK3 P2ry1-201ENSMUST00000029331 3886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Rdm1Q9CQK3 Add2-207ENSMUST00000203724 3143 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Rdm1Q9CQK3 Spock2-203ENSMUST00000165024 3699 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Rdm1Q9CQK3 Srd5a3-202ENSMUST00000113506 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Rdm1Q9CQK3 Crygc-202ENSMUST00000114064 612 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Rdm1Q9CQK3 Gm11380-201ENSMUST00000118067 560 ntBASIC13.19□□□□□ -0.3
Rdm1Q9CQK3 4930507D10Rik-201ENSMUST00000137411 1152 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Rdm1Q9CQK3 Gm12714-201ENSMUST00000143391 669 ntTSL 3 BASIC13.19□□□□□ -0.3
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