Protein–RNA interactions for Protein: Q99JW4

Lims1, LIM and senescent cell antigen-like-containing domain protein 1, mousemouse

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Length 325 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lims1Q99JW4 F10-205ENSMUST00000152034 1449 ntTSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Lims1Q99JW4 Trim45-201ENSMUST00000037409 4612 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Lims1Q99JW4 Cyp2a22-201ENSMUST00000170227 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Lims1Q99JW4 Ift140-201ENSMUST00000024983 5489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Lims1Q99JW4 5830417I10Rik-201ENSMUST00000135913 6190 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
Lims1Q99JW4 Serpinb9c-202ENSMUST00000110284 1575 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Lims1Q99JW4 Pax6-206ENSMUST00000111086 2601 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Lims1Q99JW4 Gm44913-201ENSMUST00000208060 2990 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
Lims1Q99JW4 Srrm4-202ENSMUST00000139425 2798 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Lims1Q99JW4 Cep128-210ENSMUST00000141429 4807 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Lims1Q99JW4 Gm5822-201ENSMUST00000161562 1378 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
Lims1Q99JW4 Bmp3-201ENSMUST00000031278 6548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Lims1Q99JW4 Ncam1-201ENSMUST00000114476 2567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Lims1Q99JW4 Ank3-205ENSMUST00000092433 5072 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Lims1Q99JW4 Kif1a-203ENSMUST00000171556 5391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Lims1Q99JW4 Gm5703-201ENSMUST00000186658 3973 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
Lims1Q99JW4 Gm45576-201ENSMUST00000210981 1322 ntTSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Lims1Q99JW4 Cstf1-201ENSMUST00000116375 3451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Lims1Q99JW4 Prpf40b-202ENSMUST00000118287 3129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Lims1Q99JW4 Dscaml1-201ENSMUST00000034592 6886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Lims1Q99JW4 Gm45675-201ENSMUST00000211202 3429 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
Lims1Q99JW4 Kcnh5-201ENSMUST00000042299 4058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Lims1Q99JW4 Pcdhga3-201ENSMUST00000073447 4720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Lims1Q99JW4 Trpc6-202ENSMUST00000214596 2913 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Lims1Q99JW4 Ikbkb-201ENSMUST00000033939 3580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Lims1Q99JW4 1700017B05Rik-201ENSMUST00000034846 4152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Lims1Q99JW4 Slc39a14-210ENSMUST00000152067 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Lims1Q99JW4 Gm14193-201ENSMUST00000105067 153 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
Lims1Q99JW4 Gngt2-207ENSMUST00000107714 558 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Lims1Q99JW4 Cstl1-201ENSMUST00000109952 629 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Lims1Q99JW4 Gm12616-201ENSMUST00000118594 382 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
Lims1Q99JW4 Gm11450-201ENSMUST00000121144 333 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
Lims1Q99JW4 Gm11985-201ENSMUST00000122910 1007 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Lims1Q99JW4 1700084C06Rik-201ENSMUST00000135674 750 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Lims1Q99JW4 1700021J08Rik-201ENSMUST00000138729 575 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Lims1Q99JW4 Gm3948-201ENSMUST00000147795 421 ntTSL 3 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Lims1Q99JW4 Gm14249-201ENSMUST00000156239 1017 ntTSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Lims1Q99JW4 Gm3625-201ENSMUST00000170816 102 ntAPPRIS P1 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Lims1Q99JW4 4930562C15Rik-202ENSMUST00000171105 1299 ntTSL 2 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Lims1Q99JW4 Gm24514-201ENSMUST00000174961 285 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
Lims1Q99JW4 Gm12624-201ENSMUST00000177615 382 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
Lims1Q99JW4 Gm12621-201ENSMUST00000177760 382 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
Lims1Q99JW4 Gm12615-201ENSMUST00000177970 382 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
Lims1Q99JW4 Gm12622-201ENSMUST00000177975 382 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
Lims1Q99JW4 Gm12627-201ENSMUST00000178412 382 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
Lims1Q99JW4 Gm12625-201ENSMUST00000179122 382 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
Lims1Q99JW4 Gm12614-201ENSMUST00000179586 382 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
Lims1Q99JW4 Gm12613-201ENSMUST00000180323 382 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
Lims1Q99JW4 C630004L07Rik-201ENSMUST00000193236 1275 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
Lims1Q99JW4 Pmvk-204ENSMUST00000198440 978 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Lims1Q99JW4 Atraid-205ENSMUST00000201136 894 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Lims1Q99JW4 Gm45909-201ENSMUST00000212413 1031 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
Lims1Q99JW4 CT009713.8-201ENSMUST00000225448 560 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
Lims1Q99JW4 Wfdc21-201ENSMUST00000070832 434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Lims1Q99JW4 Taar7d-201ENSMUST00000092657 1077 ntAPPRIS P1 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Lims1Q99JW4 Ptpre-205ENSMUST00000210833 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Lims1Q99JW4 Zfp114-203ENSMUST00000206547 3154 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Lims1Q99JW4 CU062626.3-201ENSMUST00000225522 1411 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
Lims1Q99JW4 Prph2-201ENSMUST00000024773 2665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Lims1Q99JW4 Csnk1a1-204ENSMUST00000165123 4083 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Lims1Q99JW4 Nup205-201ENSMUST00000043815 6412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Lims1Q99JW4 Prx-202ENSMUST00000098644 4841 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Lims1Q99JW4 Pbrm1-207ENSMUST00000112095 7907 ntTSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Lims1Q99JW4 Zfp518b-203ENSMUST00000179555 6816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Lims1Q99JW4 Crybg2-201ENSMUST00000121391 4761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Lims1Q99JW4 Pcsk9-201ENSMUST00000049507 3521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Lims1Q99JW4 Gm6580-201ENSMUST00000117504 1357 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
Lims1Q99JW4 Lgals4-201ENSMUST00000066723 1384 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Lims1Q99JW4 Zfp330-201ENSMUST00000034147 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Lims1Q99JW4 Cutal-203ENSMUST00000113068 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Lims1Q99JW4 Fam114a2-201ENSMUST00000020831 2557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Lims1Q99JW4 Sgk3-203ENSMUST00000168907 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Lims1Q99JW4 Loxl3-201ENSMUST00000000707 4098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Lims1Q99JW4 Pck2-207ENSMUST00000226519 4625 ntAPPRIS P1 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Lims1Q99JW4 Fbrs-201ENSMUST00000048896 2650 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Lims1Q99JW4 4921513H07Rik-201ENSMUST00000201403 2238 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
Lims1Q99JW4 Ttll9-201ENSMUST00000099197 1797 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Lims1Q99JW4 Nudt13-203ENSMUST00000223663 1633 ntAPPRIS P1 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Lims1Q99JW4 Eid3-201ENSMUST00000211623 1305 ntAPPRIS P1 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Lims1Q99JW4 Olfr520-202ENSMUST00000220185 1330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Lims1Q99JW4 Slc7a3-203ENSMUST00000113710 2750 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Lims1Q99JW4 Olfr370-203ENSMUST00000214156 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Lims1Q99JW4 Cacna1c-227ENSMUST00000220022 7765 ntTSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Lims1Q99JW4 Oas1h-201ENSMUST00000072476 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Lims1Q99JW4 Gm45699-201ENSMUST00000212838 1576 ntTSL 2 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Lims1Q99JW4 Enpp4-201ENSMUST00000024757 4560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Lims1Q99JW4 Pak6-201ENSMUST00000099557 4411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Lims1Q99JW4 Camk2a-205ENSMUST00000115297 499 ntTSL 2 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Lims1Q99JW4 Gm14398-201ENSMUST00000117287 1073 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
Lims1Q99JW4 Gm11331-201ENSMUST00000119764 288 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
Lims1Q99JW4 Sgcg-202ENSMUST00000121148 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Lims1Q99JW4 Spx-202ENSMUST00000126521 357 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Lims1Q99JW4 Il4-203ENSMUST00000140684 530 ntTSL 2 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Lims1Q99JW4 Il4-204ENSMUST00000150568 605 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Lims1Q99JW4 Gm22334-201ENSMUST00000158070 133 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
Lims1Q99JW4 Gm18367-201ENSMUST00000176139 600 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
Lims1Q99JW4 Pid1-205ENSMUST00000176720 450 ntTSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Lims1Q99JW4 Sbsn-205ENSMUST00000182721 677 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Lims1Q99JW4 Gm37707-201ENSMUST00000195309 325 ntTSL 3 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Lims1Q99JW4 Gm43916-201ENSMUST00000205062 967 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 162.3 ms