Protein–RNA interactions for Protein: Q99JB8

Pacsin3, Protein kinase C and casein kinase II substrate protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 424 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pacsin3Q99JB8 Cutal-203ENSMUST00000113068 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Pacsin3Q99JB8 6430562O15Rik-201ENSMUST00000180491 2488 ntTSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Pacsin3Q99JB8 Tnfsf13b-203ENSMUST00000207792 4771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Pacsin3Q99JB8 Olfr707-205ENSMUST00000214112 1735 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Pacsin3Q99JB8 Srrm4-201ENSMUST00000076124 7472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Pacsin3Q99JB8 Atcayos-203ENSMUST00000150782 3057 ntTSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Pacsin3Q99JB8 9030407P20Rik-201ENSMUST00000180933 2310 ntTSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Pacsin3Q99JB8 Echdc1-201ENSMUST00000020034 3856 ntTSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Pacsin3Q99JB8 Mdm1-203ENSMUST00000164077 2922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Pacsin3Q99JB8 Fam90a1b-201ENSMUST00000044989 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Pacsin3Q99JB8 Rps6ka6-204ENSMUST00000113428 4135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.68
Pacsin3Q99JB8 Gcsam-202ENSMUST00000161347 1796 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.68
Pacsin3Q99JB8 Ankrd1-201ENSMUST00000025718 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.68
Pacsin3Q99JB8 Ank3-220ENSMUST00000182439 2586 ntTSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.68
Pacsin3Q99JB8 Slc9a3-204ENSMUST00000225423 2589 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.77□□□□□ -0.68
Pacsin3Q99JB8 4933439C10Rik-203ENSMUST00000132226 3184 ntTSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.68
Pacsin3Q99JB8 Zfand2a-201ENSMUST00000079996 3169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.68
Pacsin3Q99JB8 Zfp804b-202ENSMUST00000200317 4430 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.68
Pacsin3Q99JB8 4921513H07Rik-201ENSMUST00000201403 2238 ntBASIC10.77□□□□□ -0.68
Pacsin3Q99JB8 Gm40377-201ENSMUST00000204604 2015 ntBASIC10.77□□□□□ -0.68
Pacsin3Q99JB8 Zc3h18-202ENSMUST00000093073 3705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Pacsin3Q99JB8 Slc25a25-202ENSMUST00000052119 3529 ntTSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Pacsin3Q99JB8 Clip3-201ENSMUST00000014065 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Pacsin3Q99JB8 Mypn-201ENSMUST00000095580 5246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Pacsin3Q99JB8 Gm11413-201ENSMUST00000155822 1461 ntTSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Pacsin3Q99JB8 Arhgap24-202ENSMUST00000073302 3151 ntTSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Pacsin3Q99JB8 Prr15l-203ENSMUST00000107633 930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.77□□□□□ -0.69
Pacsin3Q99JB8 Fgf8-204ENSMUST00000111925 702 ntTSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.69
Pacsin3Q99JB8 Gm6890-201ENSMUST00000114117 776 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.69
Pacsin3Q99JB8 1700080O16Rik-202ENSMUST00000114866 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Pacsin3Q99JB8 Gm13996-201ENSMUST00000118456 430 ntBASIC10.77□□□□□ -0.69
Pacsin3Q99JB8 Gm11587-201ENSMUST00000128274 1120 ntTSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Pacsin3Q99JB8 Endov-204ENSMUST00000129327 1184 ntTSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.69
Pacsin3Q99JB8 Gm11651-201ENSMUST00000130673 529 ntTSL 3 BASIC10.77□□□□□ -0.69
Pacsin3Q99JB8 Nbdy-201ENSMUST00000140575 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Pacsin3Q99JB8 Nbdy-202ENSMUST00000149514 775 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.77□□□□□ -0.69
Pacsin3Q99JB8 Naa60-207ENSMUST00000150655 1166 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.77□□□□□ -0.69
Pacsin3Q99JB8 Mir5132-201ENSMUST00000175166 71 ntBASIC10.77□□□□□ -0.69
Pacsin3Q99JB8 4930422M22Rik-201ENSMUST00000191492 948 ntTSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Pacsin3Q99JB8 Gm38228-201ENSMUST00000193169 1293 ntBASIC10.77□□□□□ -0.69
Pacsin3Q99JB8 Gm18753-201ENSMUST00000201000 566 ntBASIC10.77□□□□□ -0.69
Pacsin3Q99JB8 Gm6653-201ENSMUST00000218063 1288 ntBASIC10.77□□□□□ -0.69
Pacsin3Q99JB8 Olfr1347-205ENSMUST00000220413 964 ntBASIC10.77□□□□□ -0.69
Pacsin3Q99JB8 Olfr1347-201ENSMUST00000036357 964 ntAPPRIS P1 BASIC10.77□□□□□ -0.69
Pacsin3Q99JB8 Clec4b2-201ENSMUST00000088455 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Pacsin3Q99JB8 Dab2-203ENSMUST00000110663 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Pacsin3Q99JB8 Pard3-213ENSMUST00000160766 4949 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.69
Pacsin3Q99JB8 Top1-201ENSMUST00000109468 3856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Pacsin3Q99JB8 Tpp2-201ENSMUST00000087933 4649 ntTSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Pacsin3Q99JB8 Etfrf1-203ENSMUST00000111721 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Pacsin3Q99JB8 Ccr6-203ENSMUST00000166348 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Pacsin3Q99JB8 Fam170a-201ENSMUST00000039121 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Pacsin3Q99JB8 Ewsr1-201ENSMUST00000063232 1320 ntTSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Pacsin3Q99JB8 Cdkl2-201ENSMUST00000069937 3976 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Pacsin3Q99JB8 Gm43375-201ENSMUST00000196705 2480 ntBASIC10.77□□□□□ -0.69
Pacsin3Q99JB8 Zfp217-201ENSMUST00000063710 5685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Pacsin3Q99JB8 Madd-213ENSMUST00000111376 5927 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.69
Pacsin3Q99JB8 Madd-206ENSMUST00000099725 5905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.69
Pacsin3Q99JB8 Ankrd52-201ENSMUST00000014642 6620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Pacsin3Q99JB8 Zfp956-201ENSMUST00000101445 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Pacsin3Q99JB8 Tsix-202ENSMUST00000211291 3263 ntTSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Pacsin3Q99JB8 Kyat1-201ENSMUST00000044038 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Pacsin3Q99JB8 Hrh1-201ENSMUST00000088987 3782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Pacsin3Q99JB8 Pax3-201ENSMUST00000004994 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Pacsin3Q99JB8 Pcgf2-202ENSMUST00000103148 1438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Pacsin3Q99JB8 Gm16702-201ENSMUST00000181180 2384 ntTSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Pacsin3Q99JB8 Gm44190-201ENSMUST00000205083 1401 ntBASIC10.76□□□□□ -0.69
Pacsin3Q99JB8 Ccdc33-201ENSMUST00000042205 2632 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Pacsin3Q99JB8 4930517G19Rik-201ENSMUST00000206152 1676 ntBASIC10.76□□□□□ -0.69
Pacsin3Q99JB8 Pdcd10-205ENSMUST00000161137 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Pacsin3Q99JB8 Lamb1-201ENSMUST00000002979 5784 ntTSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Pacsin3Q99JB8 Tsc2-201ENSMUST00000097373 6018 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Pacsin3Q99JB8 Prph2-201ENSMUST00000024773 2665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Pacsin3Q99JB8 AC164161.2-201ENSMUST00000217446 1730 ntTSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Pacsin3Q99JB8 Arhgap6-204ENSMUST00000112129 2487 ntTSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Pacsin3Q99JB8 Nap1l2-201ENSMUST00000121720 2465 ntAPPRIS P1 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Pacsin3Q99JB8 Dnm2-202ENSMUST00000091087 3450 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Pacsin3Q99JB8 Lrtm2-201ENSMUST00000068351 4001 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Pacsin3Q99JB8 Gm5532-201ENSMUST00000097531 1751 ntTSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Pacsin3Q99JB8 Sf3b5-201ENSMUST00000105139 3841 ntAPPRIS P1 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Pacsin3Q99JB8 Tax1bp3-202ENSMUST00000108477 1153 ntTSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Pacsin3Q99JB8 Gm11509-201ENSMUST00000117358 325 ntBASIC10.76□□□□□ -0.69
Pacsin3Q99JB8 Hmgn1-202ENSMUST00000133885 261 ntTSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Pacsin3Q99JB8 Arf4os-201ENSMUST00000166902 566 ntTSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Pacsin3Q99JB8 Ino80dos-202ENSMUST00000186436 652 ntTSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Pacsin3Q99JB8 Ip6k2-202ENSMUST00000192028 1199 ntTSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Pacsin3Q99JB8 Gm42800-201ENSMUST00000202494 733 ntTSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Pacsin3Q99JB8 1700112L15Rik-201ENSMUST00000212067 510 ntBASIC10.76□□□□□ -0.69
Pacsin3Q99JB8 Fxyd2-211ENSMUST00000216289 668 ntTSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Pacsin3Q99JB8 Myl6-211ENSMUST00000219236 692 ntTSL 2 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Pacsin3Q99JB8 Ss18-202ENSMUST00000040964 4153 ntTSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Pacsin3Q99JB8 Slc19a1-208ENSMUST00000136925 2863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Pacsin3Q99JB8 Trim17-201ENSMUST00000047697 3664 ntTSL 2 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Pacsin3Q99JB8 Gm45675-201ENSMUST00000211202 3429 ntBASIC10.76□□□□□ -0.69
Pacsin3Q99JB8 Nek4-207ENSMUST00000228328 4245 ntAPPRIS P2 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Pacsin3Q99JB8 Gm26686-201ENSMUST00000181951 3467 ntTSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Pacsin3Q99JB8 Gm43713-201ENSMUST00000198251 1896 ntTSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Pacsin3Q99JB8 Plekha7-201ENSMUST00000084664 4312 ntTSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Pacsin3Q99JB8 Efna1-202ENSMUST00000118587 1632 ntTSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Pacsin3Q99JB8 Optc-205ENSMUST00000153617 1615 ntTSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51.8 ms