Protein–RNA interactions for Protein: Q99J72

Apobec3, DNA dC->dU-editing enzyme APOBEC-3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 440 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Apobec3Q99J72 Wfdc6a-201ENSMUST00000099096 805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Apobec3Q99J72 Slc38a8-201ENSMUST00000036748 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Apobec3Q99J72 Mx2-202ENSMUST00000188251 2421 ntTSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Apobec3Q99J72 BC034090-201ENSMUST00000035914 3797 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Apobec3Q99J72 Gm43061-201ENSMUST00000198850 2241 ntBASIC12.43□□□□□ -0.42
Apobec3Q99J72 Capza1-201ENSMUST00000094028 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Apobec3Q99J72 5530401A14Rik-201ENSMUST00000021044 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Apobec3Q99J72 Clu-201ENSMUST00000022616 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Apobec3Q99J72 Cpne9-201ENSMUST00000041203 2777 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.43□□□□□ -0.42
Apobec3Q99J72 Gm31108-201ENSMUST00000204101 1633 ntTSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Apobec3Q99J72 Nrxn1-202ENSMUST00000072671 8118 ntTSL 5 BASIC12.43□□□□□ -0.42
Apobec3Q99J72 Axin2-202ENSMUST00000106711 2551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.43□□□□□ -0.42
Apobec3Q99J72 AC154314.2-201ENSMUST00000223677 3502 ntBASIC12.43□□□□□ -0.42
Apobec3Q99J72 Bzw1-201ENSMUST00000050552 3876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Apobec3Q99J72 Clcn4-201ENSMUST00000000619 4607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Apobec3Q99J72 Vstm2a-201ENSMUST00000109645 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Apobec3Q99J72 Elfn1-201ENSMUST00000050519 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Apobec3Q99J72 Ncan-201ENSMUST00000002412 7195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Apobec3Q99J72 Rasal1-201ENSMUST00000031606 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Apobec3Q99J72 Rasgrp4-210ENSMUST00000203070 3008 ntTSL 5 BASIC12.43□□□□□ -0.42
Apobec3Q99J72 Ccin-201ENSMUST00000095107 1941 ntAPPRIS P1 BASIC12.43□□□□□ -0.42
Apobec3Q99J72 Nckap5-212ENSMUST00000162877 2630 ntTSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Apobec3Q99J72 Csrnp3-208ENSMUST00000176109 2958 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.42□□□□□ -0.42
Apobec3Q99J72 Bsnd-201ENSMUST00000054472 2756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Apobec3Q99J72 Lgr5-201ENSMUST00000020350 4714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Apobec3Q99J72 Atp1a3-205ENSMUST00000196684 3642 ntTSL 5 BASIC12.42□□□□□ -0.42
Apobec3Q99J72 Gfra2-203ENSMUST00000227697 1323 ntBASIC12.42□□□□□ -0.42
Apobec3Q99J72 Gnl2-201ENSMUST00000030684 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Apobec3Q99J72 Mdm1-201ENSMUST00000020437 3074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Apobec3Q99J72 Rims2-202ENSMUST00000082054 4800 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC12.42□□□□□ -0.42
Apobec3Q99J72 Hnrnpc-210ENSMUST00000228232 2535 ntAPPRIS P5 BASIC12.42□□□□□ -0.42
Apobec3Q99J72 Gnas-203ENSMUST00000087876 3719 ntTSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Apobec3Q99J72 Svop-201ENSMUST00000058472 3379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Apobec3Q99J72 AC154528.2-201ENSMUST00000228432 3023 ntBASIC12.42□□□□□ -0.42
Apobec3Q99J72 Mybph-202ENSMUST00000191577 2320 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.42□□□□□ -0.42
Apobec3Q99J72 Gm10961-201ENSMUST00000106703 144 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.42□□□□□ -0.42
Apobec3Q99J72 Ralyl-202ENSMUST00000108373 267 ntTSL 5 BASIC12.42□□□□□ -0.42
Apobec3Q99J72 Rbm3-205ENSMUST00000115619 969 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC12.42□□□□□ -0.42
Apobec3Q99J72 Gm11952-201ENSMUST00000121172 821 ntBASIC12.42□□□□□ -0.42
Apobec3Q99J72 Tbata-203ENSMUST00000121297 1000 ntTSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Apobec3Q99J72 Gm4879-201ENSMUST00000122190 1272 ntBASIC12.42□□□□□ -0.42
Apobec3Q99J72 Gm16195-201ENSMUST00000130607 442 ntTSL 2 BASIC12.42□□□□□ -0.42
Apobec3Q99J72 Gm24074-201ENSMUST00000158178 260 ntBASIC12.42□□□□□ -0.42
Apobec3Q99J72 Gm15996-201ENSMUST00000161925 762 ntTSL 5 BASIC12.42□□□□□ -0.42
Apobec3Q99J72 Gm28032-201ENSMUST00000184104 96 ntBASIC12.42□□□□□ -0.42
Apobec3Q99J72 Rpain-201ENSMUST00000018593 1100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Apobec3Q99J72 Insig2-214ENSMUST00000186915 674 ntTSL 3 BASIC12.42□□□□□ -0.42
Apobec3Q99J72 Gm18776-201ENSMUST00000188833 654 ntBASIC12.42□□□□□ -0.42
Apobec3Q99J72 Platr10-202ENSMUST00000191479 818 ntBASIC12.42□□□□□ -0.42
Apobec3Q99J72 Gm44814-201ENSMUST00000207018 434 ntBASIC12.42□□□□□ -0.42
Apobec3Q99J72 Il18-203ENSMUST00000213916 885 ntTSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Apobec3Q99J72 Gm9139-201ENSMUST00000218817 700 ntBASIC12.42□□□□□ -0.42
Apobec3Q99J72 Crygb-201ENSMUST00000027090 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Apobec3Q99J72 Tnfsf9-201ENSMUST00000039490 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Apobec3Q99J72 Omt2b-201ENSMUST00000043734 735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.42□□□□□ -0.42
Apobec3Q99J72 Ctxn2-201ENSMUST00000099452 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Apobec3Q99J72 Grhl1-202ENSMUST00000085553 3469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Apobec3Q99J72 Sptbn5-204ENSMUST00000156159 3625 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.42□□□□□ -0.42
Apobec3Q99J72 Rab3gap2-204ENSMUST00000194740 4418 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.42□□□□□ -0.42
Apobec3Q99J72 Cacna1c-201ENSMUST00000075591 7584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Apobec3Q99J72 Brwd1-202ENSMUST00000099502 8547 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Apobec3Q99J72 Robo4-201ENSMUST00000102895 3226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Apobec3Q99J72 Plekhg2-202ENSMUST00000119990 4880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Apobec3Q99J72 Gm20671-201ENSMUST00000144673 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.42□□□□□ -0.42
Apobec3Q99J72 Npy1r-201ENSMUST00000039303 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Apobec3Q99J72 Gm6768-201ENSMUST00000022467 1878 ntBASIC12.42□□□□□ -0.42
Apobec3Q99J72 Tmx3-201ENSMUST00000025515 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Apobec3Q99J72 Gsg1-203ENSMUST00000111910 1384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.42□□□□□ -0.42
Apobec3Q99J72 Clic4-201ENSMUST00000037099 4119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Apobec3Q99J72 Nfya-201ENSMUST00000046719 3645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Apobec3Q99J72 Aldoa-202ENSMUST00000087566 1549 ntTSL 5 BASIC12.42□□□□□ -0.42
Apobec3Q99J72 Ap1b1-203ENSMUST00000109897 3942 ntTSL 5 BASIC12.42□□□□□ -0.42
Apobec3Q99J72 Gm45218-201ENSMUST00000205533 1678 ntTSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Apobec3Q99J72 Arhgap33os-201ENSMUST00000124276 2648 ntTSL 2 BASIC12.41□□□□□ -0.42
Apobec3Q99J72 Myo5b-203ENSMUST00000121875 6065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.41□□□□□ -0.42
Apobec3Q99J72 Gm10699-201ENSMUST00000098916 2130 ntBASIC12.41□□□□□ -0.42
Apobec3Q99J72 Duox2-201ENSMUST00000053734 5744 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.41□□□□□ -0.42
Apobec3Q99J72 Dpf2-202ENSMUST00000118623 2406 ntTSL 5 BASIC12.41□□□□□ -0.42
Apobec3Q99J72 1810008I18Rik-201ENSMUST00000185464 2419 ntBASIC12.41□□□□□ -0.42
Apobec3Q99J72 Gnrhr-202ENSMUST00000094654 1475 ntTSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Apobec3Q99J72 Fnip1-201ENSMUST00000046835 6255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Apobec3Q99J72 Pcdhga4-201ENSMUST00000194418 4727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Apobec3Q99J72 Arhgap24-203ENSMUST00000094559 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Apobec3Q99J72 S100pbp-203ENSMUST00000106059 4084 ntTSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Apobec3Q99J72 Mrgprd-201ENSMUST00000062163 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Apobec3Q99J72 Ccdc96-201ENSMUST00000060100 3585 ntAPPRIS P1 BASIC12.41□□□□□ -0.42
Apobec3Q99J72 Gpld1-201ENSMUST00000021773 5224 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.41□□□□□ -0.42
Apobec3Q99J72 Bri3-202ENSMUST00000110695 669 ntTSL 2 BASIC12.41□□□□□ -0.42
Apobec3Q99J72 Gm12179-201ENSMUST00000118344 1272 ntBASIC12.41□□□□□ -0.42
Apobec3Q99J72 Gm10169-201ENSMUST00000121822 348 ntBASIC12.41□□□□□ -0.42
Apobec3Q99J72 Gm8020-201ENSMUST00000170174 1406 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.41□□□□□ -0.42
Apobec3Q99J72 Gm26134-201ENSMUST00000178484 110 ntBASIC12.41□□□□□ -0.42
Apobec3Q99J72 D130019J16Rik-201ENSMUST00000193261 2158 ntBASIC12.41□□□□□ -0.42
Apobec3Q99J72 Gm6677-201ENSMUST00000195100 441 ntBASIC12.41□□□□□ -0.42
Apobec3Q99J72 Gm43695-201ENSMUST00000196545 196 ntTSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Apobec3Q99J72 Gm44593-201ENSMUST00000208372 1249 ntTSL 5 BASIC12.41□□□□□ -0.42
Apobec3Q99J72 Aldh16a1-206ENSMUST00000209963 3537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Apobec3Q99J72 Gm19299-202ENSMUST00000215724 1435 ntTSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Apobec3Q99J72 Rp9-204ENSMUST00000216973 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC12.41□□□□□ -0.42
Apobec3Q99J72 Slc10a1-203ENSMUST00000218342 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
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