Protein–RNA interactions for Protein: Q925F3

Rnf144a, E3 ubiquitin-protein ligase RNF144A, mousemouse

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Length 292 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnf144aQ925F3 Raph1-204ENSMUST00000140485 10024 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.72□□□□□ -0.69
Rnf144aQ925F3 Gm45272-203ENSMUST00000211111 1693 ntTSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Rnf144aQ925F3 Hpgd-201ENSMUST00000034026 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Rnf144aQ925F3 Ptpru-202ENSMUST00000097860 3365 ntTSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Rnf144aQ925F3 Ephx1-201ENSMUST00000036928 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Rnf144aQ925F3 Treml4-201ENSMUST00000059873 1744 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Rnf144aQ925F3 Kalrn-201ENSMUST00000076810 8940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.72□□□□□ -0.69
Rnf144aQ925F3 Gpr101-201ENSMUST00000057645 5410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Rnf144aQ925F3 Gm13264-201ENSMUST00000138416 2011 ntTSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Rnf144aQ925F3 Best1-201ENSMUST00000117346 2080 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.72□□□□□ -0.69
Rnf144aQ925F3 Pik3cd-202ENSMUST00000105688 4335 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Rnf144aQ925F3 Cntd1-201ENSMUST00000103107 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Rnf144aQ925F3 Kpna7-202ENSMUST00000110673 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.72□□□□□ -0.69
Rnf144aQ925F3 A130077B15Rik-201ENSMUST00000219429 2547 ntTSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Rnf144aQ925F3 Zfp941-201ENSMUST00000080651 2791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Rnf144aQ925F3 Ttc27-201ENSMUST00000024882 2820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Rnf144aQ925F3 Astn1-209ENSMUST00000194369 3344 ntTSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Rnf144aQ925F3 Fbn2-201ENSMUST00000025497 10480 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.71□□□□□ -0.69
Rnf144aQ925F3 Baiap3-206ENSMUST00000182825 3862 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.71□□□□□ -0.69
Rnf144aQ925F3 Msh3-201ENSMUST00000022220 3937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Rnf144aQ925F3 Rad1-202ENSMUST00000100775 4085 ntTSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Rnf144aQ925F3 Prom2-202ENSMUST00000103214 4190 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Rnf144aQ925F3 Papln-201ENSMUST00000021646 4260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Rnf144aQ925F3 Csf1r-202ENSMUST00000115268 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Rnf144aQ925F3 Kcns2-202ENSMUST00000228725 4906 ntAPPRIS P1 BASIC10.71□□□□□ -0.69
Rnf144aQ925F3 Spata13-210ENSMUST00000162945 5469 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Rnf144aQ925F3 Rab3gap2-201ENSMUST00000069652 7052 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.71□□□□□ -0.69
Rnf144aQ925F3 Gm23272-201ENSMUST00000104053 129 ntBASIC10.71□□□□□ -0.69
Rnf144aQ925F3 Enpp7-202ENSMUST00000106273 1408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.71□□□□□ -0.69
Rnf144aQ925F3 Rtn2-202ENSMUST00000108468 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Rnf144aQ925F3 Use1-202ENSMUST00000110053 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Rnf144aQ925F3 Tprkb-203ENSMUST00000113751 692 ntTSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Rnf144aQ925F3 Rps10-202ENSMUST00000114881 604 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.71□□□□□ -0.69
Rnf144aQ925F3 Scn5a-202ENSMUST00000117911 8453 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
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Rnf144aQ925F3 Gm12992-201ENSMUST00000124738 4493 ntTSL 5 BASIC10.71□□□□□ -0.69
Rnf144aQ925F3 Tmem190-201ENSMUST00000013235 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Rnf144aQ925F3 Gm15941-205ENSMUST00000140044 1825 ntTSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Rnf144aQ925F3 Rtl1-201ENSMUST00000149046 6358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Rnf144aQ925F3 Lyzl4os-202ENSMUST00000156364 726 ntTSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Rnf144aQ925F3 Tmem176b-202ENSMUST00000164733 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Rnf144aQ925F3 Rsph14-206ENSMUST00000166088 1203 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC10.71□□□□□ -0.69
Rnf144aQ925F3 Gm18159-201ENSMUST00000174516 1070 ntBASIC10.71□□□□□ -0.69
Rnf144aQ925F3 7530416G11Rik-201ENSMUST00000178942 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Rnf144aQ925F3 Rsph14-207ENSMUST00000179546 1190 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Rnf144aQ925F3 9530082P21Rik-203ENSMUST00000181605 3162 ntTSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Rnf144aQ925F3 Gm16740-201ENSMUST00000181819 956 ntTSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Rnf144aQ925F3 Eef1b2-209ENSMUST00000188524 681 ntTSL 3 BASIC10.71□□□□□ -0.69
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Rnf144aQ925F3 Gm6145-204ENSMUST00000210902 1266 ntTSL 5 BASIC10.71□□□□□ -0.69
Rnf144aQ925F3 Gm45696-201ENSMUST00000212088 985 ntBASIC10.71□□□□□ -0.69
Rnf144aQ925F3 5830428M24Rik-201ENSMUST00000221805 825 ntTSL 2 BASIC10.71□□□□□ -0.69
Rnf144aQ925F3 Prkcd-201ENSMUST00000022521 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Rnf144aQ925F3 Bora-201ENSMUST00000022656 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
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Rnf144aQ925F3 Pgpep1l-201ENSMUST00000032770 953 ntTSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Rnf144aQ925F3 Ccdc32-201ENSMUST00000036470 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
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Rnf144aQ925F3 Fcrla-201ENSMUST00000046322 1679 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
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Rnf144aQ925F3 Tpp2-201ENSMUST00000087933 4649 ntTSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Rnf144aQ925F3 Rsph14-201ENSMUST00000009214 1179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Rnf144aQ925F3 App-206ENSMUST00000227723 8167 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.71□□□□□ -0.7
Rnf144aQ925F3 Pck2-207ENSMUST00000226519 4625 ntAPPRIS P1 BASIC10.71□□□□□ -0.7
Rnf144aQ925F3 Rin1-208ENSMUST00000225427 4503 ntAPPRIS P2 BASIC10.71□□□□□ -0.7
Rnf144aQ925F3 Pde2a-201ENSMUST00000163751 4218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.7
Rnf144aQ925F3 Fubp1-209ENSMUST00000198227 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.7
Rnf144aQ925F3 Dcun1d3-202ENSMUST00000098080 3072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.7
Rnf144aQ925F3 Zfp629-201ENSMUST00000058038 6120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.7
Rnf144aQ925F3 Nmnat1-203ENSMUST00000119921 2657 ntTSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.7
Rnf144aQ925F3 Dock6-207ENSMUST00000217336 6880 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Rnf144aQ925F3 CT010462.1-202ENSMUST00000222225 2225 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Rnf144aQ925F3 Olfr1495-202ENSMUST00000215930 2025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Rnf144aQ925F3 Vgll4-201ENSMUST00000032459 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Rnf144aQ925F3 Lgsn-201ENSMUST00000062560 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Rnf144aQ925F3 AC167565.1-201ENSMUST00000226980 1833 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
Rnf144aQ925F3 Ddr1-202ENSMUST00000097333 3593 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Rnf144aQ925F3 Mmp25-201ENSMUST00000024696 3373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Rnf144aQ925F3 Snhg18-201ENSMUST00000181536 1486 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Rnf144aQ925F3 Rabl2-202ENSMUST00000094056 1322 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Rnf144aQ925F3 4833420G17Rik-204ENSMUST00000225186 2627 ntAPPRIS P1 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Rnf144aQ925F3 Gm11628-201ENSMUST00000117568 171 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
Rnf144aQ925F3 Gm16166-201ENSMUST00000118291 787 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
Rnf144aQ925F3 Gm15549-201ENSMUST00000121595 622 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
Rnf144aQ925F3 1700007P06Rik-201ENSMUST00000160380 823 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Rnf144aQ925F3 Gm15978-201ENSMUST00000161043 738 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Rnf144aQ925F3 Fhit-204ENSMUST00000161302 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Rnf144aQ925F3 Rps28-203ENSMUST00000173019 437 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Rnf144aQ925F3 Higd1c-202ENSMUST00000177211 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
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