Protein–RNA interactions for Protein: Q8CDN9

Lrrc9, Leucine-rich repeat-containing protein 9, mousemouse

Predictions only

Length 1,456 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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Lrrc9Q8CDN9 Kcnt1-204ENSMUST00000114176 4166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
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Lrrc9Q8CDN9 Hacd2-201ENSMUST00000061156 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Lrrc9Q8CDN9 Kdm2b-204ENSMUST00000118027 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
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Lrrc9Q8CDN9 Osbpl11-201ENSMUST00000039733 4520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Lrrc9Q8CDN9 C230024C17Rik-201ENSMUST00000190663 3337 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Lrrc9Q8CDN9 Zeb2os-201ENSMUST00000127150 1305 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Lrrc9Q8CDN9 Polr2a-202ENSMUST00000071213 5799 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Lrrc9Q8CDN9 Gng5-202ENSMUST00000118280 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Lrrc9Q8CDN9 Ccdc85a-201ENSMUST00000042534 5332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Lrrc9Q8CDN9 Iqsec1-202ENSMUST00000101153 8036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Lrrc9Q8CDN9 Otud4-202ENSMUST00000173078 7354 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 115.3 ms