Protein–RNA interactions for Protein: Q8CBY1

Samd4a, Protein Smaug homolog 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 711 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Samd4aQ8CBY1 Armcx6-201ENSMUST00000052431 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Samd4aQ8CBY1 Dubr-204ENSMUST00000186944 2052 ntTSL 2 BASIC10.97□□□□□ -0.65
Samd4aQ8CBY1 Pfkfb3-202ENSMUST00000049849 2076 ntTSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Samd4aQ8CBY1 Alms1-ps2-202ENSMUST00000161983 2290 ntBASIC10.97□□□□□ -0.65
Samd4aQ8CBY1 Gm37333-201ENSMUST00000192904 2251 ntBASIC10.97□□□□□ -0.65
Samd4aQ8CBY1 Thsd4-206ENSMUST00000171654 8522 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.97□□□□□ -0.65
Samd4aQ8CBY1 Themis2-201ENSMUST00000045154 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Samd4aQ8CBY1 Zfp280d-211ENSMUST00000184036 3459 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.97□□□□□ -0.65
Samd4aQ8CBY1 Tsc22d4-202ENSMUST00000100539 3983 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Samd4aQ8CBY1 Nucks1-201ENSMUST00000062264 5998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Samd4aQ8CBY1 Mamld1-201ENSMUST00000082088 4796 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC10.96□□□□□ -0.65
Samd4aQ8CBY1 Psd2-203ENSMUST00000175734 4300 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Samd4aQ8CBY1 Bace2-201ENSMUST00000047275 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Samd4aQ8CBY1 Mapre2-203ENSMUST00000118826 3052 ntTSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Samd4aQ8CBY1 Unc5cl-201ENSMUST00000074574 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Samd4aQ8CBY1 App-206ENSMUST00000227723 8167 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.96□□□□□ -0.65
Samd4aQ8CBY1 Pou2f1-206ENSMUST00000111429 2679 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.96□□□□□ -0.65
Samd4aQ8CBY1 Fdxacb1-201ENSMUST00000042391 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Samd4aQ8CBY1 Odf2l-202ENSMUST00000098538 2564 ntTSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Samd4aQ8CBY1 Ank1-204ENSMUST00000117270 5652 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.96□□□□□ -0.65
Samd4aQ8CBY1 Rufy4-202ENSMUST00000127134 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Samd4aQ8CBY1 Gm10436-202ENSMUST00000220521 1788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Samd4aQ8CBY1 Ptprt-204ENSMUST00000109445 12082 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Samd4aQ8CBY1 Gm29480-201ENSMUST00000188589 1655 ntTSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Samd4aQ8CBY1 Nhlrc3-201ENSMUST00000056749 5047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Samd4aQ8CBY1 Pias2-203ENSMUST00000168882 4984 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Samd4aQ8CBY1 Lamc2-203ENSMUST00000185356 4916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Samd4aQ8CBY1 H2afv-202ENSMUST00000109737 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Samd4aQ8CBY1 Drd3-201ENSMUST00000023390 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Samd4aQ8CBY1 Rab13-202ENSMUST00000107373 1415 ntTSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Samd4aQ8CBY1 Ss18-202ENSMUST00000040964 4153 ntTSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Samd4aQ8CBY1 Slc25a21-205ENSMUST00000217690 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Samd4aQ8CBY1 Ccdc42os-201ENSMUST00000148019 1335 ntTSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Samd4aQ8CBY1 Gm10152-201ENSMUST00000193475 1344 ntBASIC10.96□□□□□ -0.65
Samd4aQ8CBY1 Kcnj9-201ENSMUST00000062387 3857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Samd4aQ8CBY1 Gm11949-201ENSMUST00000117640 372 ntBASIC10.96□□□□□ -0.65
Samd4aQ8CBY1 Gm15352-201ENSMUST00000118696 270 ntBASIC10.96□□□□□ -0.65
Samd4aQ8CBY1 Gm11451-201ENSMUST00000118946 630 ntBASIC10.96□□□□□ -0.65
Samd4aQ8CBY1 Gm1848-201ENSMUST00000120711 789 ntBASIC10.96□□□□□ -0.65
Samd4aQ8CBY1 Gm12516-201ENSMUST00000120819 385 ntBASIC10.96□□□□□ -0.65
Samd4aQ8CBY1 Nop56-204ENSMUST00000136621 868 ntTSL 5 BASIC10.96□□□□□ -0.65
Samd4aQ8CBY1 Tlx1-202ENSMUST00000174617 806 ntTSL 5 BASIC10.96□□□□□ -0.65
Samd4aQ8CBY1 Clec4b1-202ENSMUST00000078559 748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Samd4aQ8CBY1 Esr2-205ENSMUST00000218621 3342 ntTSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
Samd4aQ8CBY1 Gm44913-201ENSMUST00000208060 2990 ntBASIC10.96□□□□□ -0.66
Samd4aQ8CBY1 Siglec1-203ENSMUST00000110227 5790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
Samd4aQ8CBY1 Agrn-202ENSMUST00000105574 7193 ntTSL 5 BASIC10.96□□□□□ -0.66
Samd4aQ8CBY1 Dnmbp-206ENSMUST00000212592 3901 ntTSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
Samd4aQ8CBY1 Nox4-201ENSMUST00000032781 3753 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
Samd4aQ8CBY1 AC164092.1-201ENSMUST00000215635 2232 ntTSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
Samd4aQ8CBY1 Nxpe5-203ENSMUST00000159964 3585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.96□□□□□ -0.66
Samd4aQ8CBY1 Uhrf1-202ENSMUST00000113035 3402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
Samd4aQ8CBY1 Csf1r-202ENSMUST00000115268 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
Samd4aQ8CBY1 4931429L15Rik-201ENSMUST00000159565 2037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.96□□□□□ -0.66
Samd4aQ8CBY1 Sypl-201ENSMUST00000020885 2019 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
Samd4aQ8CBY1 Calu-201ENSMUST00000031779 3229 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
Samd4aQ8CBY1 Gm4409-201ENSMUST00000130734 1919 ntTSL 2 BASIC10.96□□□□□ -0.66
Samd4aQ8CBY1 Tyro3-202ENSMUST00000110783 4460 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
Samd4aQ8CBY1 Abcf1-201ENSMUST00000043757 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
Samd4aQ8CBY1 Slc18a1-201ENSMUST00000037478 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Samd4aQ8CBY1 Cad-211ENSMUST00000202795 6559 ntTSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Samd4aQ8CBY1 Ppp1r17-201ENSMUST00000052827 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Samd4aQ8CBY1 Slc6a18-201ENSMUST00000022105 2839 ntTSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Samd4aQ8CBY1 Kcnab2-207ENSMUST00000160884 3922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Samd4aQ8CBY1 Psd-202ENSMUST00000096029 3903 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.95□□□□□ -0.66
Samd4aQ8CBY1 Gm8752-201ENSMUST00000173427 1694 ntBASIC10.95□□□□□ -0.66
Samd4aQ8CBY1 Tgoln1-201ENSMUST00000070524 5013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Samd4aQ8CBY1 Bcl2l2-203ENSMUST00000133397 3813 ntTSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Samd4aQ8CBY1 Fbrs-201ENSMUST00000048896 2650 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.95□□□□□ -0.66
Samd4aQ8CBY1 Ormdl2-201ENSMUST00000026409 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Samd4aQ8CBY1 Pip5kl1-201ENSMUST00000055304 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Samd4aQ8CBY1 Gfra2-201ENSMUST00000022699 3472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Samd4aQ8CBY1 Gm5441-201ENSMUST00000186454 5181 ntTSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Samd4aQ8CBY1 Tie1-203ENSMUST00000184261 4234 ntTSL 2 BASIC10.95□□□□□ -0.66
Samd4aQ8CBY1 Tmprss4-201ENSMUST00000034599 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Samd4aQ8CBY1 Spata2-201ENSMUST00000057627 4012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Samd4aQ8CBY1 Gm13916-201ENSMUST00000117368 628 ntBASIC10.95□□□□□ -0.66
Samd4aQ8CBY1 Prss46-201ENSMUST00000119427 1211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Samd4aQ8CBY1 Gm11660-201ENSMUST00000120955 412 ntBASIC10.95□□□□□ -0.66
Samd4aQ8CBY1 Gm13182-201ENSMUST00000122241 312 ntBASIC10.95□□□□□ -0.66
Samd4aQ8CBY1 Aamdc-203ENSMUST00000124552 618 ntTSL 3 BASIC10.95□□□□□ -0.66
Samd4aQ8CBY1 Itpr3os-201ENSMUST00000143605 794 ntTSL 2 BASIC10.95□□□□□ -0.66
Samd4aQ8CBY1 AA387200-201ENSMUST00000147463 1177 ntTSL 3 BASIC10.95□□□□□ -0.66
Samd4aQ8CBY1 Gm16312-201ENSMUST00000156285 362 ntTSL 3 BASIC10.95□□□□□ -0.66
Samd4aQ8CBY1 Agtpbp1-216ENSMUST00000168821 721 ntTSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Samd4aQ8CBY1 Gm8815-201ENSMUST00000173809 620 ntBASIC10.95□□□□□ -0.66
Samd4aQ8CBY1 Ppy-201ENSMUST00000017460 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Samd4aQ8CBY1 Rn7s6-201ENSMUST00000175005 291 ntBASIC10.95□□□□□ -0.66
Samd4aQ8CBY1 Prss46-202ENSMUST00000176403 1257 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Samd4aQ8CBY1 Gm9034-201ENSMUST00000182071 1005 ntBASIC10.95□□□□□ -0.66
Samd4aQ8CBY1 Mir6998-201ENSMUST00000183343 64 ntBASIC10.95□□□□□ -0.66
Samd4aQ8CBY1 1700088E04Rik-203ENSMUST00000186053 535 ntTSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Samd4aQ8CBY1 Med8-201ENSMUST00000019229 1145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Samd4aQ8CBY1 Gm37299-201ENSMUST00000193951 826 ntBASIC10.95□□□□□ -0.66
Samd4aQ8CBY1 Gm9645-201ENSMUST00000197131 792 ntBASIC10.95□□□□□ -0.66
Samd4aQ8CBY1 Gm43186-201ENSMUST00000198130 824 ntBASIC10.95□□□□□ -0.66
Samd4aQ8CBY1 4931419H13Rik-201ENSMUST00000199770 973 ntTSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Samd4aQ8CBY1 Gm31401-201ENSMUST00000207352 734 ntTSL 3 BASIC10.95□□□□□ -0.66
Samd4aQ8CBY1 Timm10b-210ENSMUST00000209588 373 ntTSL 3 BASIC10.95□□□□□ -0.66
Samd4aQ8CBY1 Gm45285-201ENSMUST00000210418 749 ntTSL 3 BASIC10.95□□□□□ -0.66
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 74.2 ms