Protein–RNA interactions for Protein: Q8C2S7

Amigo3, Amphoterin-induced protein 3, mousemouse

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Length 508 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Amigo3Q8C2S7 Sdcbp2-201ENSMUST00000028950 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Amigo3Q8C2S7 Zscan5b-203ENSMUST00000165445 1407 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Amigo3Q8C2S7 Ano4-202ENSMUST00000181976 1410 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Amigo3Q8C2S7 Gm2244-201ENSMUST00000164372 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Amigo3Q8C2S7 Map4k2-201ENSMUST00000025897 4644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Amigo3Q8C2S7 Neu2-206ENSMUST00000166259 1596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Amigo3Q8C2S7 Gm9992-201ENSMUST00000070059 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Amigo3Q8C2S7 E330021D16Rik-203ENSMUST00000204830 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Amigo3Q8C2S7 Alox5-202ENSMUST00000164547 1854 ntTSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Amigo3Q8C2S7 AC130671.3-201ENSMUST00000227393 1897 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
Amigo3Q8C2S7 Nr3c2-204ENSMUST00000109913 5916 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Amigo3Q8C2S7 9530077C05Rik-201ENSMUST00000058868 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Amigo3Q8C2S7 Pla2g15-201ENSMUST00000034377 2706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Amigo3Q8C2S7 Cd163l1-204ENSMUST00000209637 3210 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Amigo3Q8C2S7 Taf1c-201ENSMUST00000093099 3236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Amigo3Q8C2S7 Mon1b-201ENSMUST00000035777 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Amigo3Q8C2S7 Atp2a3-202ENSMUST00000108484 4467 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Amigo3Q8C2S7 Brpf1-209ENSMUST00000204198 4307 ntTSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Amigo3Q8C2S7 Palm2-202ENSMUST00000102905 3271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Amigo3Q8C2S7 Ank2-214ENSMUST00000182547 2428 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Amigo3Q8C2S7 Kcna10-201ENSMUST00000055064 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Amigo3Q8C2S7 Kitl-202ENSMUST00000105283 5648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Amigo3Q8C2S7 Zim1-203ENSMUST00000203908 1740 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Amigo3Q8C2S7 Eif2b3-201ENSMUST00000070610 1369 ntTSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Amigo3Q8C2S7 Mir675-201ENSMUST00000102320 84 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
Amigo3Q8C2S7 Ppih-205ENSMUST00000106321 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Amigo3Q8C2S7 Gm2237-201ENSMUST00000112595 471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Amigo3Q8C2S7 Il24-201ENSMUST00000121040 1159 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Amigo3Q8C2S7 Aif1l-207ENSMUST00000148056 670 ntTSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Amigo3Q8C2S7 Gm15888-201ENSMUST00000154016 538 ntTSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Amigo3Q8C2S7 Speer4f2-201ENSMUST00000166086 1278 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Amigo3Q8C2S7 Prdx5-204ENSMUST00000173091 501 ntTSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Amigo3Q8C2S7 Gm9866-201ENSMUST00000177636 486 ntTSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Amigo3Q8C2S7 Gm26639-201ENSMUST00000181426 491 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Amigo3Q8C2S7 Gm28916-201ENSMUST00000186988 699 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
Amigo3Q8C2S7 Gm29157-201ENSMUST00000188753 612 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
Amigo3Q8C2S7 Gm43667-201ENSMUST00000198616 1095 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
Amigo3Q8C2S7 Ift172-206ENSMUST00000201809 405 ntTSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Amigo3Q8C2S7 Olfr1227-ps1-201ENSMUST00000215627 928 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
Amigo3Q8C2S7 Gm18165-201ENSMUST00000217426 928 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
Amigo3Q8C2S7 Iqcf5-201ENSMUST00000085113 551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Amigo3Q8C2S7 Bptf-201ENSMUST00000057892 11488 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Amigo3Q8C2S7 Dnajc12-201ENSMUST00000043317 3025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Amigo3Q8C2S7 Slc27a2-201ENSMUST00000061491 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Amigo3Q8C2S7 Steap3-202ENSMUST00000112640 2752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Amigo3Q8C2S7 Zscan10-205ENSMUST00000120967 2609 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Amigo3Q8C2S7 Vps45-201ENSMUST00000015891 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Amigo3Q8C2S7 Xaf1-204ENSMUST00000146233 2597 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Amigo3Q8C2S7 Nanog-201ENSMUST00000012540 2211 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Amigo3Q8C2S7 Wdr20rt-201ENSMUST00000046331 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Amigo3Q8C2S7 AC156031.2-201ENSMUST00000213107 3310 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
Amigo3Q8C2S7 AC134898.1-201ENSMUST00000223738 1836 ntBASIC14.52□□□□□ -0.08
Amigo3Q8C2S7 Dph3-202ENSMUST00000067955 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Amigo3Q8C2S7 Rbm39-203ENSMUST00000109587 2810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Amigo3Q8C2S7 Prl8a1-202ENSMUST00000095926 1682 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Amigo3Q8C2S7 Dnaic2-202ENSMUST00000092469 2799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.08
Amigo3Q8C2S7 Gpr151-201ENSMUST00000054738 1633 ntAPPRIS P1 BASIC14.52□□□□□ -0.08
Amigo3Q8C2S7 Nisch-213ENSMUST00000168206 4990 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Amigo3Q8C2S7 Vsir-203ENSMUST00000105460 4843 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Amigo3Q8C2S7 Vsir-201ENSMUST00000020301 4846 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Amigo3Q8C2S7 Clec4n-202ENSMUST00000112554 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Amigo3Q8C2S7 Gm8482-201ENSMUST00000117972 471 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
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Amigo3Q8C2S7 Dcdc5-203ENSMUST00000126340 396 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Amigo3Q8C2S7 4930538E20Rik-201ENSMUST00000131383 546 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
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Amigo3Q8C2S7 Gm25972-201ENSMUST00000175374 101 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
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Amigo3Q8C2S7 Gm24973-201ENSMUST00000175588 101 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
Amigo3Q8C2S7 Gm23292-201ENSMUST00000175618 101 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
Amigo3Q8C2S7 Gm23646-201ENSMUST00000178119 101 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
Amigo3Q8C2S7 Gm24643-201ENSMUST00000178305 101 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
Amigo3Q8C2S7 Gm24302-201ENSMUST00000178350 101 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
Amigo3Q8C2S7 Gm26386-201ENSMUST00000178407 101 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
Amigo3Q8C2S7 Gm8210-201ENSMUST00000178557 483 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
Amigo3Q8C2S7 Gm19668-201ENSMUST00000178581 747 ntAPPRIS P1 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Amigo3Q8C2S7 Gm25458-201ENSMUST00000178981 101 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
Amigo3Q8C2S7 Gm22825-201ENSMUST00000179444 101 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
Amigo3Q8C2S7 Gm15454-201ENSMUST00000179718 483 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
Amigo3Q8C2S7 Mir6909-201ENSMUST00000184212 62 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
Amigo3Q8C2S7 Gm38004-201ENSMUST00000192972 357 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
Amigo3Q8C2S7 Ackr1-202ENSMUST00000194046 1122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Amigo3Q8C2S7 Clec4n-206ENSMUST00000205129 363 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Amigo3Q8C2S7 Hcst-203ENSMUST00000208740 366 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Amigo3Q8C2S7 Gm42067-202ENSMUST00000210917 410 ntTSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Amigo3Q8C2S7 A930033M14Rik-201ENSMUST00000217206 400 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
Amigo3Q8C2S7 Gm1000-202ENSMUST00000222329 757 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Amigo3Q8C2S7 Gm6344-201ENSMUST00000075962 483 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
Amigo3Q8C2S7 Tmem129-201ENSMUST00000019439 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Amigo3Q8C2S7 Hk2-204ENSMUST00000170833 2792 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Amigo3Q8C2S7 1110051M20Rik-203ENSMUST00000102594 1977 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
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