Protein–RNA interactions for Protein: Q8C006

Trim35, Tripartite motif-containing protein 35, mousemouse

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Length 501 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim35Q8C006 E330011O21Rik-208ENSMUST00000211650 1225 ntTSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Trim35Q8C006 AC101984.1-201ENSMUST00000219639 402 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
Trim35Q8C006 Timm9-203ENSMUST00000220482 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Trim35Q8C006 AC166349.1-201ENSMUST00000220866 695 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
Trim35Q8C006 Nsd1-205ENSMUST00000224693 852 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
Trim35Q8C006 Atp6v0c-201ENSMUST00000024932 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Trim35Q8C006 Cks1b-201ENSMUST00000029679 849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Trim35Q8C006 Spata19-201ENSMUST00000034473 697 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Trim35Q8C006 Vmn1r177-201ENSMUST00000073967 930 ntAPPRIS P1 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Trim35Q8C006 Olfr1487-201ENSMUST00000076856 948 ntAPPRIS P1 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Trim35Q8C006 Olfr716-201ENSMUST00000098137 1104 ntAPPRIS P1 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Trim35Q8C006 Spg11-201ENSMUST00000036450 7671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Trim35Q8C006 Ldb3-201ENSMUST00000022327 5119 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Trim35Q8C006 Lrrc29-201ENSMUST00000070508 1922 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Trim35Q8C006 Trim27-205ENSMUST00000221464 1400 ntTSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Trim35Q8C006 Asl-202ENSMUST00000159619 2088 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Trim35Q8C006 Gm5422-201ENSMUST00000050717 2721 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
Trim35Q8C006 Gm15684-201ENSMUST00000160605 1814 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Trim35Q8C006 Wscd1-201ENSMUST00000021168 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Trim35Q8C006 Mlh1-201ENSMUST00000035079 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Trim35Q8C006 Fam217b-201ENSMUST00000094251 4541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Trim35Q8C006 Mpv17l-201ENSMUST00000023360 3087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Trim35Q8C006 Gm11725-201ENSMUST00000125607 1850 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Trim35Q8C006 Rpn1-201ENSMUST00000032143 3633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Trim35Q8C006 Jade2-203ENSMUST00000109091 6099 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Trim35Q8C006 A630014C17Rik-201ENSMUST00000150973 2984 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Trim35Q8C006 Olfr541-203ENSMUST00000210357 1642 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Trim35Q8C006 Nlrc3-203ENSMUST00000177551 5403 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.84□□□□□ -0.35
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Trim35Q8C006 Fbxw23-202ENSMUST00000198480 1388 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
Trim35Q8C006 Spz1-201ENSMUST00000050658 1537 ntAPPRIS P1 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Trim35Q8C006 Prkcd-204ENSMUST00000112206 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Trim35Q8C006 Zfp207-201ENSMUST00000017567 2245 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Trim35Q8C006 Erg-201ENSMUST00000077773 2232 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Trim35Q8C006 Kcnc2-204ENSMUST00000219301 2944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Trim35Q8C006 Gm4450-201ENSMUST00000167753 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Trim35Q8C006 Gm38385-201ENSMUST00000194454 2351 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
Trim35Q8C006 Celsr3-207ENSMUST00000213524 9930 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Trim35Q8C006 Map3k4-201ENSMUST00000089058 5305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Trim35Q8C006 Ddx17-201ENSMUST00000054014 4761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Trim35Q8C006 Gm8108-202ENSMUST00000170207 1961 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Trim35Q8C006 Oprl1-204ENSMUST00000108767 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Trim35Q8C006 Birc7-201ENSMUST00000108875 1178 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Trim35Q8C006 Tprkb-204ENSMUST00000113752 749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
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Trim35Q8C006 Gm23867-201ENSMUST00000122649 274 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
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Trim35Q8C006 Gm12945-201ENSMUST00000140080 674 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Trim35Q8C006 Gm29049-201ENSMUST00000185705 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Trim35Q8C006 1700054K19Rik-201ENSMUST00000186102 452 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Trim35Q8C006 Gm20809-202ENSMUST00000187943 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
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Trim35Q8C006 Gm28171-201ENSMUST00000190100 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Trim35Q8C006 1700019A02Rik-202ENSMUST00000190748 726 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC12.84□□□□□ -0.35
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Trim35Q8C006 4930559C10Rik-201ENSMUST00000223202 649 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
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Trim35Q8C006 Sstr5-201ENSMUST00000051864 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
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Trim35Q8C006 Selenbp1-201ENSMUST00000090839 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Trim35Q8C006 Selenbp2-201ENSMUST00000090848 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Trim35Q8C006 Rnf14-201ENSMUST00000072376 3038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Trim35Q8C006 Psd2-201ENSMUST00000115716 4607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Trim35Q8C006 Abca7-202ENSMUST00000132517 6696 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Trim35Q8C006 Snx10-201ENSMUST00000049152 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Trim35Q8C006 Hnrnpr-201ENSMUST00000084219 2647 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Trim35Q8C006 Unc45bos-201ENSMUST00000156395 1306 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Trim35Q8C006 Gm46430-206ENSMUST00000222064 1647 ntTSL 3 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Trim35Q8C006 Prkcd-203ENSMUST00000112203 1927 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Trim35Q8C006 Gm5989-201ENSMUST00000096092 2077 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
Trim35Q8C006 Apol7e-201ENSMUST00000096358 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Trim35Q8C006 Scn5a-202ENSMUST00000117911 8453 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Trim35Q8C006 Rab11fip5-201ENSMUST00000060837 4035 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Trim35Q8C006 Baiap3-202ENSMUST00000182056 4645 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Trim35Q8C006 Ddx27-201ENSMUST00000018143 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.35
Trim35Q8C006 Tjap1-201ENSMUST00000012440 2426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.35
Trim35Q8C006 Nacc2-202ENSMUST00000114159 6675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.35
Trim35Q8C006 Tspan5-202ENSMUST00000119993 2107 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.35
Trim35Q8C006 Herpud1-205ENSMUST00000161576 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.35
Trim35Q8C006 Unc5c-202ENSMUST00000106236 9646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Trim35Q8C006 Nfkb2-202ENSMUST00000111881 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Trim35Q8C006 Dnaja2-201ENSMUST00000034138 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Trim35Q8C006 Sv2a-201ENSMUST00000035371 4334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Trim35Q8C006 Grm7-202ENSMUST00000172951 4197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Trim35Q8C006 Afmid-201ENSMUST00000073388 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Trim35Q8C006 5330426L24Rik-201ENSMUST00000200008 2175 ntBASIC12.83□□□□□ -0.36
Trim35Q8C006 Parp3-202ENSMUST00000112479 2030 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Trim35Q8C006 Usf1-207ENSMUST00000160486 1878 ntTSL 2 BASIC12.83□□□□□ -0.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 94.3 ms