Protein–RNA interactions for Protein: Q6PCS8

Zbtb40, Zinc finger and BTB domain-containing 40, mousemouse

Predictions only

Length 1,258 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zbtb40Q6PCS8 n-R5s118-201ENSMUST00000179887 119 ntBASIC13.68□□□□□ -0.22
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Zbtb40Q6PCS8 AC122860.1-201ENSMUST00000217669 773 ntTSL 3 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Zbtb40Q6PCS8 AC153962.2-201ENSMUST00000219417 550 ntBASIC13.68□□□□□ -0.22
Zbtb40Q6PCS8 CT025679.1-201ENSMUST00000227106 449 ntBASIC13.68□□□□□ -0.22
Zbtb40Q6PCS8 BC049762-202ENSMUST00000065950 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
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Zbtb40Q6PCS8 Nek3-204ENSMUST00000178324 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Zbtb40Q6PCS8 Ces2a-201ENSMUST00000034346 1960 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Zbtb40Q6PCS8 Gusb-201ENSMUST00000026613 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Zbtb40Q6PCS8 4930517G19Rik-201ENSMUST00000206152 1676 ntBASIC13.68□□□□□ -0.22
Zbtb40Q6PCS8 Pcdhgc4-201ENSMUST00000066140 5024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
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Zbtb40Q6PCS8 Dstyk-201ENSMUST00000045110 6282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
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Zbtb40Q6PCS8 C130083M11Rik-201ENSMUST00000197171 2072 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Zbtb40Q6PCS8 Foxn4-201ENSMUST00000044790 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Zbtb40Q6PCS8 Ppp1r16b-201ENSMUST00000045503 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Zbtb40Q6PCS8 Tmeff2-202ENSMUST00000114565 2718 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
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Zbtb40Q6PCS8 Tubb2b-201ENSMUST00000075774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Zbtb40Q6PCS8 Nckap5l-201ENSMUST00000023747 4853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Zbtb40Q6PCS8 Brd3-202ENSMUST00000077737 5272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Zbtb40Q6PCS8 Kifap3-202ENSMUST00000077642 4012 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
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Zbtb40Q6PCS8 Kcnk18-201ENSMUST00000065204 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Zbtb40Q6PCS8 4930579F01Rik-202ENSMUST00000199293 1598 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
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Zbtb40Q6PCS8 Sez6l2-201ENSMUST00000106332 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Zbtb40Q6PCS8 Myo10-201ENSMUST00000022882 5880 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Zbtb40Q6PCS8 Slc37a4-201ENSMUST00000165839 2086 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
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Zbtb40Q6PCS8 Ccdc88c-201ENSMUST00000068411 7542 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
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Zbtb40Q6PCS8 1700081H04Rik-201ENSMUST00000190550 1128 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
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Zbtb40Q6PCS8 Ormdl2-203ENSMUST00000219215 1051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
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Zbtb40Q6PCS8 Pitpnm3-201ENSMUST00000075258 6555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
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Zbtb40Q6PCS8 Drc7-201ENSMUST00000058479 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Zbtb40Q6PCS8 Ctnnal1-201ENSMUST00000045142 3664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Zbtb40Q6PCS8 Srebf1-201ENSMUST00000020846 4299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Zbtb40Q6PCS8 Elf2-206ENSMUST00000163748 2656 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Zbtb40Q6PCS8 Nup205-204ENSMUST00000201374 6411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Zbtb40Q6PCS8 Snx27-208ENSMUST00000200642 1308 ntTSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Zbtb40Q6PCS8 Duox2-201ENSMUST00000053734 5744 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Zbtb40Q6PCS8 4930465M20Rik-201ENSMUST00000130564 1446 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Zbtb40Q6PCS8 Nrd1-203ENSMUST00000106644 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Zbtb40Q6PCS8 Nol3-201ENSMUST00000014920 3176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Zbtb40Q6PCS8 Trpc6-203ENSMUST00000217462 3168 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Zbtb40Q6PCS8 Nanog-201ENSMUST00000012540 2211 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Zbtb40Q6PCS8 Plod3-201ENSMUST00000004968 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Zbtb40Q6PCS8 Pcdhgb2-202ENSMUST00000195112 4661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Zbtb40Q6PCS8 Akap10-203ENSMUST00000108710 3394 ntTSL 2 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Zbtb40Q6PCS8 Mir671-201ENSMUST00000102432 98 ntBASIC13.66□□□□□ -0.22
Zbtb40Q6PCS8 Olfr29-ps1-201ENSMUST00000117959 963 ntAPPRIS P1 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Zbtb40Q6PCS8 Gm7541-201ENSMUST00000118361 535 ntBASIC13.66□□□□□ -0.22
Zbtb40Q6PCS8 Fthl17-ps2-201ENSMUST00000122268 528 ntBASIC13.66□□□□□ -0.22
Zbtb40Q6PCS8 Gm22344-201ENSMUST00000122642 278 ntBASIC13.66□□□□□ -0.22
Zbtb40Q6PCS8 Aamdc-207ENSMUST00000138060 467 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Zbtb40Q6PCS8 4930571N24Rik-202ENSMUST00000142914 598 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Zbtb40Q6PCS8 Has2os-202ENSMUST00000163314 633 ntTSL 3 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Zbtb40Q6PCS8 Pax5-209ENSMUST00000165417 1056 ntTSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Zbtb40Q6PCS8 Gm7902-201ENSMUST00000198842 947 ntBASIC13.66□□□□□ -0.22
Zbtb40Q6PCS8 Gm44498-201ENSMUST00000199509 111 ntBASIC13.66□□□□□ -0.22
Zbtb40Q6PCS8 Apoa5-205ENSMUST00000215187 495 ntTSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Zbtb40Q6PCS8 Gm40879-201ENSMUST00000220759 612 ntBASIC13.66□□□□□ -0.22
Zbtb40Q6PCS8 D730050B12Rik-201ENSMUST00000223149 585 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
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