Protein–RNA interactions for Protein: Q68FH0

Pkp4, Plakophilin-4, mousemouse

Predictions only

Length 1,190 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pkp4Q68FH0 Cpeb1-209ENSMUST00000178892 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Pkp4Q68FH0 Mpv17l-204ENSMUST00000141971 2155 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Pkp4Q68FH0 Mknk1-202ENSMUST00000106513 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Pkp4Q68FH0 Ckap2-201ENSMUST00000046916 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Pkp4Q68FH0 5330417C22Rik-202ENSMUST00000106625 5836 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Pkp4Q68FH0 Nudt13-203ENSMUST00000223663 1633 ntAPPRIS P1 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Pkp4Q68FH0 Rpap1-201ENSMUST00000048493 4744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Pkp4Q68FH0 Sept9-202ENSMUST00000093907 3616 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Pkp4Q68FH0 Col19a1-202ENSMUST00000115244 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Pkp4Q68FH0 Gm20646-201ENSMUST00000176807 1316 ntTSL 3 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Pkp4Q68FH0 Gm9415-201ENSMUST00000200462 1321 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
Pkp4Q68FH0 Cpne9-201ENSMUST00000041203 2777 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Pkp4Q68FH0 Irak4-202ENSMUST00000109248 3437 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Pkp4Q68FH0 Srpk3-201ENSMUST00000002081 1981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Pkp4Q68FH0 Serpinb9c-202ENSMUST00000110284 1575 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Pkp4Q68FH0 Pml-202ENSMUST00000114136 4343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Pkp4Q68FH0 Slc17a5-202ENSMUST00000117645 3114 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Pkp4Q68FH0 Gm5124-202ENSMUST00000132683 2083 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
Pkp4Q68FH0 Papln-201ENSMUST00000021646 4260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Pkp4Q68FH0 AC122018.1-201ENSMUST00000217769 1686 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Pkp4Q68FH0 Ptprt-204ENSMUST00000109445 12082 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Pkp4Q68FH0 Eif3d-201ENSMUST00000100484 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Pkp4Q68FH0 Enox1-203ENSMUST00000227662 3064 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Pkp4Q68FH0 Nxpe5-203ENSMUST00000159964 3585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Pkp4Q68FH0 Rpl28-ps1-201ENSMUST00000121497 414 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
Pkp4Q68FH0 2610005L07Rik-201ENSMUST00000139264 948 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
Pkp4Q68FH0 Smim5-202ENSMUST00000142089 685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Pkp4Q68FH0 Gm10051-201ENSMUST00000145209 414 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
Pkp4Q68FH0 AA387200-201ENSMUST00000147463 1177 ntTSL 3 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Pkp4Q68FH0 Gm21092-201ENSMUST00000178995 955 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
Pkp4Q68FH0 Gm20033-203ENSMUST00000180912 796 ntTSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Pkp4Q68FH0 Mir99ahg-209ENSMUST00000182820 835 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Pkp4Q68FH0 1700029J03Rik-201ENSMUST00000185803 789 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Pkp4Q68FH0 Gm28306-201ENSMUST00000191315 529 ntTSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Pkp4Q68FH0 Rbakdn-201ENSMUST00000198334 520 ntTSL 2 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Pkp4Q68FH0 4933408A14Rik-201ENSMUST00000199037 729 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Pkp4Q68FH0 Gm17831-201ENSMUST00000205579 900 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
Pkp4Q68FH0 Gm21057-202ENSMUST00000206111 512 ntTSL 2 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Pkp4Q68FH0 Pdzd9-203ENSMUST00000208635 1238 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Pkp4Q68FH0 AC122024.3-201ENSMUST00000217719 294 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
Pkp4Q68FH0 Fam228a-203ENSMUST00000220978 861 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Pkp4Q68FH0 Apc-201ENSMUST00000066133 1185 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Pkp4Q68FH0 Gm10020-201ENSMUST00000081993 612 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
Pkp4Q68FH0 Gm5879-201ENSMUST00000089501 1209 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
Pkp4Q68FH0 Cenpu-202ENSMUST00000093518 783 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Pkp4Q68FH0 Gm10775-201ENSMUST00000099425 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Pkp4Q68FH0 Cttn-201ENSMUST00000033407 2913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Pkp4Q68FH0 Shc1-210ENSMUST00000191485 3154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Pkp4Q68FH0 Alms1-ps2-202ENSMUST00000161983 2290 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
Pkp4Q68FH0 2610005L07Rik-202ENSMUST00000140111 4009 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Pkp4Q68FH0 Rnft2-201ENSMUST00000117177 4381 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Pkp4Q68FH0 Mgl2-205ENSMUST00000165951 1635 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Pkp4Q68FH0 Ddr1-212ENSMUST00000166980 3627 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Pkp4Q68FH0 Gm31108-201ENSMUST00000204101 1633 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Pkp4Q68FH0 Vcan-202ENSMUST00000109544 5702 ntTSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Pkp4Q68FH0 Lrrn4-201ENSMUST00000049787 3715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Pkp4Q68FH0 Ptprh-201ENSMUST00000049113 3495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Pkp4Q68FH0 Bcl9l-203ENSMUST00000218183 6771 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Pkp4Q68FH0 Atg9a-205ENSMUST00000188347 4041 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Pkp4Q68FH0 Gm12198-201ENSMUST00000154068 1809 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Pkp4Q68FH0 1700036A12Rik-202ENSMUST00000190053 1828 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Pkp4Q68FH0 Poldip3-201ENSMUST00000058793 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Pkp4Q68FH0 D130019J16Rik-201ENSMUST00000193261 2158 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
Pkp4Q68FH0 Chrng-201ENSMUST00000027470 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Pkp4Q68FH0 Cyb5r3-202ENSMUST00000162178 2547 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Pkp4Q68FH0 Dach2-201ENSMUST00000067219 2520 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Pkp4Q68FH0 Ido1-202ENSMUST00000110667 1656 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Pkp4Q68FH0 Syn2-203ENSMUST00000203450 3806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Pkp4Q68FH0 C4b-201ENSMUST00000069507 5379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Pkp4Q68FH0 Sez6l-201ENSMUST00000075387 6055 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Pkp4Q68FH0 Madd-213ENSMUST00000111376 5927 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Pkp4Q68FH0 Madd-206ENSMUST00000099725 5905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Pkp4Q68FH0 Dnajb12-204ENSMUST00000146590 3070 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Pkp4Q68FH0 Myocd-203ENSMUST00000108695 5114 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Pkp4Q68FH0 Abi1-206ENSMUST00000126112 3360 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Pkp4Q68FH0 Dclk2-202ENSMUST00000191752 8042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Pkp4Q68FH0 Fam180a-201ENSMUST00000051176 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Pkp4Q68FH0 Arpc3-202ENSMUST00000102525 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Pkp4Q68FH0 Gm6335-201ENSMUST00000118081 1194 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
Pkp4Q68FH0 Gm15573-201ENSMUST00000119487 540 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
Pkp4Q68FH0 Gm7816-201ENSMUST00000119884 1194 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
Pkp4Q68FH0 Gm15432-201ENSMUST00000121106 195 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
Pkp4Q68FH0 Gm15542-201ENSMUST00000121585 1194 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
Pkp4Q68FH0 Tnni2-206ENSMUST00000149529 768 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Pkp4Q68FH0 Gm11642-201ENSMUST00000150442 440 ntTSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Pkp4Q68FH0 Gm20662-201ENSMUST00000176356 601 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Pkp4Q68FH0 1700021P04Rik-201ENSMUST00000178667 659 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Pkp4Q68FH0 Gm29261-201ENSMUST00000188535 678 ntTSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Pkp4Q68FH0 5730585A16Rik-201ENSMUST00000193457 1027 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
Pkp4Q68FH0 Qdpr-209ENSMUST00000198258 1172 ntTSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Pkp4Q68FH0 Gm43401-201ENSMUST00000198829 394 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Pkp4Q68FH0 Gm13522-202ENSMUST00000209682 997 ntTSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Pkp4Q68FH0 Gm45572-201ENSMUST00000211774 750 ntTSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Pkp4Q68FH0 Gm36176-201ENSMUST00000218749 501 ntAPPRIS P1 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Pkp4Q68FH0 Vmn1r220-201ENSMUST00000072385 897 ntAPPRIS P1 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Pkp4Q68FH0 Orc4-202ENSMUST00000090976 1153 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Pkp4Q68FH0 Olfr1250-201ENSMUST00000099768 1139 ntAPPRIS P1 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Pkp4Q68FH0 Cep112-213ENSMUST00000150863 3453 ntTSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Pkp4Q68FH0 Dhdds-201ENSMUST00000012262 3133 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Pkp4Q68FH0 Synpr-201ENSMUST00000070323 2541 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 87.5 ms