Protein–RNA interactions for Protein: Q68FG2

Sptbn2, Spectrin beta chain, mousemouse

Predictions only

Length 2,388 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sptbn2Q68FG2 Mog-201ENSMUST00000102665 1704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Sptbn2Q68FG2 Pdzk1-202ENSMUST00000107069 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Sptbn2Q68FG2 Trav13-2-201ENSMUST00000103658 390 ntAPPRIS P1 BASIC10.01□□□□□ -0.81
Sptbn2Q68FG2 Scp2-202ENSMUST00000106701 772 ntTSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Sptbn2Q68FG2 Rpl7a-ps11-201ENSMUST00000118791 801 ntBASIC10.01□□□□□ -0.81
Sptbn2Q68FG2 Gm15636-201ENSMUST00000119205 668 ntBASIC10.01□□□□□ -0.81
Sptbn2Q68FG2 E130307A14Rik-204ENSMUST00000139356 701 ntTSL 3 BASIC10.01□□□□□ -0.81
Sptbn2Q68FG2 4933438A12Rik-201ENSMUST00000144579 1013 ntTSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Sptbn2Q68FG2 Plet1os-202ENSMUST00000190941 1119 ntTSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Sptbn2Q68FG2 Gm26901-202ENSMUST00000193106 256 ntTSL 3 BASIC10.01□□□□□ -0.81
Sptbn2Q68FG2 1700113A16Rik-203ENSMUST00000200006 563 ntTSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Sptbn2Q68FG2 Gm6794-201ENSMUST00000203829 457 ntBASIC10.01□□□□□ -0.81
Sptbn2Q68FG2 AC156633.1-201ENSMUST00000215971 614 ntTSL 2 BASIC10.01□□□□□ -0.81
Sptbn2Q68FG2 Gm40689-201ENSMUST00000218006 362 ntTSL 5 BASIC10.01□□□□□ -0.81
Sptbn2Q68FG2 Tcl1b1-202ENSMUST00000222342 664 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.01□□□□□ -0.81
Sptbn2Q68FG2 AC153153.1-201ENSMUST00000225803 793 ntBASIC10.01□□□□□ -0.81
Sptbn2Q68FG2 Clec1b-201ENSMUST00000032262 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Sptbn2Q68FG2 Hpf1-201ENSMUST00000037190 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Sptbn2Q68FG2 Gm16477-201ENSMUST00000085365 801 ntBASIC10.01□□□□□ -0.81
Sptbn2Q68FG2 Gm17415-201ENSMUST00000096427 789 ntBASIC10.01□□□□□ -0.81
Sptbn2Q68FG2 Atp6v0a4-202ENSMUST00000114908 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Sptbn2Q68FG2 Nell2-202ENSMUST00000166170 3366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.01□□□□□ -0.81
Sptbn2Q68FG2 Klhl8-203ENSMUST00000112815 2898 ntTSL 5 BASIC10.01□□□□□ -0.81
Sptbn2Q68FG2 Esr1-204ENSMUST00000105590 6339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Sptbn2Q68FG2 Sult1a1-201ENSMUST00000106371 1370 ntTSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Sptbn2Q68FG2 Sult1a1-202ENSMUST00000106372 1369 ntTSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Sptbn2Q68FG2 Sod3-201ENSMUST00000101208 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Sptbn2Q68FG2 Fbxo25-204ENSMUST00000209913 2035 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Sptbn2Q68FG2 Dgkg-201ENSMUST00000023578 2725 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Sptbn2Q68FG2 Htr1b-202ENSMUST00000183482 4724 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10□□□□□ -0.81
Sptbn2Q68FG2 Vwa1-201ENSMUST00000042196 3623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Sptbn2Q68FG2 Xkr6-202ENSMUST00000120820 1702 ntTSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Sptbn2Q68FG2 4933425D22Rik-201ENSMUST00000201035 1721 ntBASIC10□□□□□ -0.81
Sptbn2Q68FG2 Fn1-213ENSMUST00000188674 7680 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Sptbn2Q68FG2 Fn1-217ENSMUST00000190780 7694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Sptbn2Q68FG2 Rpap1-202ENSMUST00000099529 4813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Sptbn2Q68FG2 Pcdha4-201ENSMUST00000192295 4129 ntTSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Sptbn2Q68FG2 Armcx3-203ENSMUST00000086884 3488 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10□□□□□ -0.81
Sptbn2Q68FG2 Tiprl-201ENSMUST00000043235 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Sptbn2Q68FG2 Gm11540-201ENSMUST00000117457 780 ntBASIC10□□□□□ -0.81
Sptbn2Q68FG2 Gm17171-201ENSMUST00000168048 534 ntTSL 3 BASIC10□□□□□ -0.81
Sptbn2Q68FG2 Gm25591-201ENSMUST00000177317 94 ntBASIC10□□□□□ -0.81
Sptbn2Q68FG2 Gm38349-201ENSMUST00000195732 462 ntBASIC10□□□□□ -0.81
Sptbn2Q68FG2 Gm42908-201ENSMUST00000197508 870 ntBASIC10□□□□□ -0.81
Sptbn2Q68FG2 Olfr1358-201ENSMUST00000204477 1064 ntAPPRIS P1 BASIC10□□□□□ -0.81
Sptbn2Q68FG2 Letm2-206ENSMUST00000210234 837 ntTSL 5 BASIC10□□□□□ -0.81
Sptbn2Q68FG2 AC163638.2-201ENSMUST00000224920 827 ntBASIC10□□□□□ -0.81
Sptbn2Q68FG2 AC118639.1-202ENSMUST00000226957 653 ntBASIC10□□□□□ -0.81
Sptbn2Q68FG2 Limd2-201ENSMUST00000045923 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Sptbn2Q68FG2 Gm23458-201ENSMUST00000083257 169 ntBASIC10□□□□□ -0.81
Sptbn2Q68FG2 1500002C15Rik-201ENSMUST00000178987 2183 ntBASIC10□□□□□ -0.81
Sptbn2Q68FG2 Slc9b1-201ENSMUST00000078568 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Sptbn2Q68FG2 Bean1-206ENSMUST00000213077 1373 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC10□□□□□ -0.81
Sptbn2Q68FG2 Stab1-201ENSMUST00000036618 7999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Sptbn2Q68FG2 Kcnma1-212ENSMUST00000188285 4440 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Sptbn2Q68FG2 Ppp1r16b-201ENSMUST00000045503 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Sptbn2Q68FG2 Araf-202ENSMUST00000120356 1520 ntTSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Sptbn2Q68FG2 Gm20052-201ENSMUST00000200831 1525 ntTSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Sptbn2Q68FG2 Ylpm1-202ENSMUST00000101202 4605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10□□□□□ -0.81
Sptbn2Q68FG2 Grb2-203ENSMUST00000106497 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Sptbn2Q68FG2 Exosc9-201ENSMUST00000029269 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Sptbn2Q68FG2 Cblb-203ENSMUST00000226593 3864 ntAPPRIS ALT2 BASIC10□□□□□ -0.81
Sptbn2Q68FG2 Atp1a2-201ENSMUST00000085913 6227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Sptbn2Q68FG2 Ercc4-201ENSMUST00000023206 3480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Sptbn2Q68FG2 Ikzf4-203ENSMUST00000221150 2213 ntTSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Sptbn2Q68FG2 Ss18l2-206ENSMUST00000215966 2316 ntTSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Sptbn2Q68FG2 Usp2-208ENSMUST00000177054 2370 ntTSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Sptbn2Q68FG2 Stat1-203ENSMUST00000186057 3998 ntTSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Sptbn2Q68FG2 Lgi4-201ENSMUST00000039775 4037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Sptbn2Q68FG2 5830432E09Rik-203ENSMUST00000210953 2428 ntTSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Sptbn2Q68FG2 Ccng2-202ENSMUST00000121127 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Sptbn2Q68FG2 Rnf185-201ENSMUST00000064364 2906 ntTSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Sptbn2Q68FG2 Scn5a-203ENSMUST00000120420 7536 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10□□□□□ -0.81
Sptbn2Q68FG2 Lyn-201ENSMUST00000041377 3463 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Sptbn2Q68FG2 Trpm4-209ENSMUST00000211743 3673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Sptbn2Q68FG2 Fam220-ps-201ENSMUST00000116535 783 ntBASIC10□□□□□ -0.81
Sptbn2Q68FG2 Gm14715-201ENSMUST00000156823 643 ntTSL 3 BASIC10□□□□□ -0.81
Sptbn2Q68FG2 Gm23555-201ENSMUST00000157815 135 ntBASIC10□□□□□ -0.81
Sptbn2Q68FG2 Ubl5-211ENSMUST00000162303 505 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10□□□□□ -0.81
Sptbn2Q68FG2 Bnip2-208ENSMUST00000165389 945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Sptbn2Q68FG2 Gm8707-201ENSMUST00000183325 980 ntBASIC10□□□□□ -0.81
Sptbn2Q68FG2 Gm42732-201ENSMUST00000202887 1197 ntBASIC10□□□□□ -0.81
Sptbn2Q68FG2 Gm39147-202ENSMUST00000211730 882 ntTSL 5 BASIC10□□□□□ -0.81
Sptbn2Q68FG2 Gm36172-201ENSMUST00000219852 723 ntTSL 3 BASIC10□□□□□ -0.81
Sptbn2Q68FG2 CT009550.1-201ENSMUST00000225750 864 ntBASIC10□□□□□ -0.81
Sptbn2Q68FG2 Spen-202ENSMUST00000105786 12299 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10□□□□□ -0.81
Sptbn2Q68FG2 Ceacam9-201ENSMUST00000001984 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Sptbn2Q68FG2 Immt-203ENSMUST00000114151 2518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Sptbn2Q68FG2 Sdccag8-201ENSMUST00000027785 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Sptbn2Q68FG2 Adrb3-201ENSMUST00000081438 2795 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Sptbn2Q68FG2 Kcnk5-201ENSMUST00000024011 3392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Sptbn2Q68FG2 Matn2-202ENSMUST00000163455 3577 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.99□□□□□ -0.81
Sptbn2Q68FG2 Ret-201ENSMUST00000032201 5456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Sptbn2Q68FG2 Hnrnpm-206ENSMUST00000148178 3934 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Sptbn2Q68FG2 Lta4h-201ENSMUST00000016033 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Sptbn2Q68FG2 AC132833.1-202ENSMUST00000228875 1690 ntBASIC9.99□□□□□ -0.81
Sptbn2Q68FG2 Gm31718-201ENSMUST00000212406 1646 ntTSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Sptbn2Q68FG2 Tnnt3-211ENSMUST00000105949 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.99□□□□□ -0.81
Sptbn2Q68FG2 Cst10-202ENSMUST00000109938 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.99□□□□□ -0.81
Sptbn2Q68FG2 Gm11191-201ENSMUST00000117231 610 ntBASIC9.99□□□□□ -0.81
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 68.8 ms