Protein–RNA interactions for Protein: Q68FE2

Atg9a, Autophagy-related protein 9A, mousemouse

Predictions only

Length 551 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atg9aQ68FE2 Kat7-203ENSMUST00000103159 3248 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Atg9aQ68FE2 Knop1-206ENSMUST00000126792 3253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Atg9aQ68FE2 Hsd3b1-201ENSMUST00000029465 1663 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.27□□□□□ -0.29
Atg9aQ68FE2 Wdr46-ps-201ENSMUST00000200591 1712 ntBASIC13.27□□□□□ -0.29
Atg9aQ68FE2 Gm42858-201ENSMUST00000202512 1704 ntBASIC13.27□□□□□ -0.29
Atg9aQ68FE2 Slc13a5-206ENSMUST00000208912 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.29
Atg9aQ68FE2 Elfn1-201ENSMUST00000050519 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Atg9aQ68FE2 Tsc22d3-201ENSMUST00000055738 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Atg9aQ68FE2 Iba57-201ENSMUST00000054523 4021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Atg9aQ68FE2 Olfr464-204ENSMUST00000216461 2112 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.29
Atg9aQ68FE2 Dync1i2-201ENSMUST00000081710 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Atg9aQ68FE2 Sertad2-203ENSMUST00000109586 5515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Atg9aQ68FE2 Tsku-201ENSMUST00000094161 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Atg9aQ68FE2 Fam234b-202ENSMUST00000111916 2927 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Atg9aQ68FE2 Calcoco1-204ENSMUST00000171838 2968 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Atg9aQ68FE2 Poldip3-202ENSMUST00000100375 3157 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Atg9aQ68FE2 Tmprss6-201ENSMUST00000017086 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Atg9aQ68FE2 Atp6v0a1-201ENSMUST00000044721 4008 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Atg9aQ68FE2 Adamts10-201ENSMUST00000087623 4043 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Atg9aQ68FE2 Zhx2-201ENSMUST00000096430 4376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Atg9aQ68FE2 Sspn-201ENSMUST00000032383 4431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Atg9aQ68FE2 Ddx46-202ENSMUST00000172272 5676 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Atg9aQ68FE2 Madd-212ENSMUST00000111375 5706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Atg9aQ68FE2 Atl3-202ENSMUST00000170373 6474 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Atg9aQ68FE2 Krba1-203ENSMUST00000114571 6695 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Atg9aQ68FE2 4930412O13Rik-202ENSMUST00000114919 558 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Atg9aQ68FE2 Rbfox1-202ENSMUST00000115841 1191 ntTSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Atg9aQ68FE2 Gm13039-201ENSMUST00000118638 794 ntBASIC13.26□□□□□ -0.29
Atg9aQ68FE2 Gm12453-201ENSMUST00000121981 331 ntBASIC13.26□□□□□ -0.29
Atg9aQ68FE2 Tnfrsf14-201ENSMUST00000123514 1018 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Atg9aQ68FE2 9230111E07Rik-201ENSMUST00000124850 811 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Atg9aQ68FE2 Gm12069-201ENSMUST00000145127 806 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Atg9aQ68FE2 Gm16547-201ENSMUST00000159474 293 ntBASIC13.26□□□□□ -0.29
Atg9aQ68FE2 Gm9574-201ENSMUST00000173127 845 ntBASIC13.26□□□□□ -0.29
Atg9aQ68FE2 Otud4-203ENSMUST00000173286 7213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Atg9aQ68FE2 Uba52-ps-201ENSMUST00000183770 379 ntBASIC13.26□□□□□ -0.29
Atg9aQ68FE2 Dpep1-201ENSMUST00000019422 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Atg9aQ68FE2 Ubap2l-215ENSMUST00000198322 3385 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Atg9aQ68FE2 Nras-208ENSMUST00000200069 831 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Atg9aQ68FE2 Gm45500-201ENSMUST00000211676 803 ntBASIC13.26□□□□□ -0.29
Atg9aQ68FE2 Gm19299-202ENSMUST00000215724 1435 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Atg9aQ68FE2 Ormdl2-203ENSMUST00000219215 1051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Atg9aQ68FE2 Drd1-202ENSMUST00000221470 3576 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Atg9aQ68FE2 Gm1000-202ENSMUST00000222329 757 ntTSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Atg9aQ68FE2 Axl-201ENSMUST00000002677 4265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Atg9aQ68FE2 Arl8b-201ENSMUST00000032196 4443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Atg9aQ68FE2 Chmp3-201ENSMUST00000059462 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Atg9aQ68FE2 Rai2-201ENSMUST00000061514 2204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Atg9aQ68FE2 Vmn1r44-201ENSMUST00000089420 1108 ntAPPRIS P1 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Atg9aQ68FE2 Nckap5l-201ENSMUST00000023747 4853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Atg9aQ68FE2 Atp1a3-201ENSMUST00000080882 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Atg9aQ68FE2 Fanca-202ENSMUST00000118395 3274 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Atg9aQ68FE2 Npy1r-201ENSMUST00000039303 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Atg9aQ68FE2 Ldb3-201ENSMUST00000022327 5119 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Atg9aQ68FE2 B3glct-201ENSMUST00000100404 4570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Atg9aQ68FE2 Gm42833-201ENSMUST00000196019 2124 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
Atg9aQ68FE2 Hars2-201ENSMUST00000019287 2002 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Atg9aQ68FE2 Tnn-202ENSMUST00000131919 3987 ntTSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Atg9aQ68FE2 Cdc73-201ENSMUST00000018337 11586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Atg9aQ68FE2 Wdr43-201ENSMUST00000047086 3450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Atg9aQ68FE2 Rbbp5-201ENSMUST00000027700 3385 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Atg9aQ68FE2 Krt34-201ENSMUST00000056362 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Atg9aQ68FE2 Gm6793-201ENSMUST00000071732 1604 ntAPPRIS P1 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Atg9aQ68FE2 Celsr1-201ENSMUST00000016172 10879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Atg9aQ68FE2 Gm18210-201ENSMUST00000209001 1524 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
Atg9aQ68FE2 Fastkd5-201ENSMUST00000110262 3015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Atg9aQ68FE2 Zfp809-201ENSMUST00000072465 1425 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Atg9aQ68FE2 Sec22b-201ENSMUST00000029476 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Atg9aQ68FE2 Enpp7-201ENSMUST00000092373 1370 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Atg9aQ68FE2 1700125H20Rik-202ENSMUST00000100681 687 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Atg9aQ68FE2 1700037C06Rik-201ENSMUST00000132824 874 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
Atg9aQ68FE2 Gm13817-201ENSMUST00000142249 604 ntTSL 3 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Atg9aQ68FE2 Gm16755-201ENSMUST00000180595 933 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Atg9aQ68FE2 Prm2-202ENSMUST00000189593 674 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Atg9aQ68FE2 Gm28760-202ENSMUST00000190376 481 ntTSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Atg9aQ68FE2 Gm37860-201ENSMUST00000195380 1034 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
Atg9aQ68FE2 Fgfbp1-203ENSMUST00000199894 1228 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Atg9aQ68FE2 Gm6352-201ENSMUST00000203583 1134 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
Atg9aQ68FE2 4930486N12Rik-201ENSMUST00000206668 632 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
Atg9aQ68FE2 3110009M11Rik-201ENSMUST00000208647 892 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
Atg9aQ68FE2 Gm30978-201ENSMUST00000211581 1066 ntTSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Atg9aQ68FE2 Gm26782-203ENSMUST00000227103 751 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
Atg9aQ68FE2 Cxcl1-201ENSMUST00000031327 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Atg9aQ68FE2 Gm9758-201ENSMUST00000035980 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Atg9aQ68FE2 4930572O03Rik-201ENSMUST00000092696 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Atg9aQ68FE2 Gm29050-201ENSMUST00000190732 2528 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Atg9aQ68FE2 Rab11fip3-203ENSMUST00000122103 5015 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Atg9aQ68FE2 C2cd4c-201ENSMUST00000059699 6729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Atg9aQ68FE2 Tfdp2-204ENSMUST00000179065 2213 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Atg9aQ68FE2 Gm6768-201ENSMUST00000022467 1878 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
Atg9aQ68FE2 Zbtb43-203ENSMUST00000113156 1828 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Atg9aQ68FE2 Chil1-207ENSMUST00000153856 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Atg9aQ68FE2 AC153524.2-202ENSMUST00000220401 1794 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
Atg9aQ68FE2 Frmpd1-202ENSMUST00000107804 5241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Atg9aQ68FE2 Chrnb2-203ENSMUST00000200558 3482 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Atg9aQ68FE2 Gab3-202ENSMUST00000114104 1705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Atg9aQ68FE2 4833411C07Rik-202ENSMUST00000207914 1568 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Atg9aQ68FE2 Cblb-203ENSMUST00000226593 3864 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Atg9aQ68FE2 Grin1-205ENSMUST00000114312 3838 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Atg9aQ68FE2 Grin1-207ENSMUST00000114317 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
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