Protein–RNA interactions for Protein: Q64487

Ptprd, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase delta, mousemouse

Predictions only

Length 1,912 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtprdQ64487 Samd4-202ENSMUST00000100672 4165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
PtprdQ64487 Rgs12-201ENSMUST00000030984 5472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
PtprdQ64487 Gm12474-201ENSMUST00000122898 1410 ntTSL 2 BASIC11□□□□□ -0.65
PtprdQ64487 Ccdc97-201ENSMUST00000002683 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
PtprdQ64487 Paox-201ENSMUST00000026537 4655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
PtprdQ64487 Uhrf1bp1-201ENSMUST00000114849 8584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
PtprdQ64487 Fam234b-202ENSMUST00000111916 2927 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
PtprdQ64487 Sema4c-208ENSMUST00000195620 3640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
PtprdQ64487 Grm2-201ENSMUST00000023959 4711 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
PtprdQ64487 Slc16a12-201ENSMUST00000009522 4051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
PtprdQ64487 Fkbp15-204ENSMUST00000107461 2337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
PtprdQ64487 Gm16587-201ENSMUST00000161943 863 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
PtprdQ64487 Gm5801-201ENSMUST00000182247 780 ntBASIC11□□□□□ -0.65
PtprdQ64487 Gm6794-201ENSMUST00000203829 457 ntBASIC11□□□□□ -0.65
PtprdQ64487 Gm6331-201ENSMUST00000217890 450 ntBASIC11□□□□□ -0.65
PtprdQ64487 CT030195.2-201ENSMUST00000226074 1286 ntBASIC11□□□□□ -0.65
PtprdQ64487 Nsmce2-203ENSMUST00000227173 1122 ntBASIC11□□□□□ -0.65
PtprdQ64487 Olfr115-201ENSMUST00000076936 939 ntAPPRIS P2 BASIC11□□□□□ -0.65
PtprdQ64487 Pcdh1-202ENSMUST00000159405 3880 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
PtprdQ64487 Wars-201ENSMUST00000109848 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
PtprdQ64487 Gm10803-201ENSMUST00000099692 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
PtprdQ64487 Cd247-205ENSMUST00000161559 1816 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
PtprdQ64487 Mirt1-203ENSMUST00000181539 2259 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
PtprdQ64487 Gtf2a1-202ENSMUST00000063314 2265 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
PtprdQ64487 Sh3d21-201ENSMUST00000094760 1859 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
PtprdQ64487 Babam2-204ENSMUST00000114515 1497 ntTSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
PtprdQ64487 Nol3-201ENSMUST00000014920 3176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
PtprdQ64487 Atxn2l-203ENSMUST00000167759 4023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
PtprdQ64487 Vmn1r24-201ENSMUST00000228097 1901 ntAPPRIS P1 BASIC11□□□□□ -0.65
PtprdQ64487 Itga8-201ENSMUST00000028106 5812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
PtprdQ64487 Polr3c-201ENSMUST00000029741 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
PtprdQ64487 Trpv6-201ENSMUST00000031902 2923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
PtprdQ64487 Gm45041-201ENSMUST00000207366 3108 ntBASIC11□□□□□ -0.65
PtprdQ64487 Pou2f1-206ENSMUST00000111429 2679 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
PtprdQ64487 Csde1-207ENSMUST00000197827 2671 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
PtprdQ64487 Nop14-201ENSMUST00000041364 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
PtprdQ64487 Pcnx3-201ENSMUST00000068169 5276 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
PtprdQ64487 Entpd8-201ENSMUST00000044078 2299 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
PtprdQ64487 Trav11-201ENSMUST00000103585 343 ntAPPRIS P1 BASIC10.99□□□□□ -0.65
PtprdQ64487 Trav11d-201ENSMUST00000103648 342 ntAPPRIS P1 BASIC10.99□□□□□ -0.65
PtprdQ64487 Gm45716-201ENSMUST00000124877 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
PtprdQ64487 Gm11465-201ENSMUST00000127942 435 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
PtprdQ64487 Platr12-201ENSMUST00000141027 462 ntTSL 3 BASIC10.99□□□□□ -0.65
PtprdQ64487 Gm43097-201ENSMUST00000196867 151 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
PtprdQ64487 Gm42617-201ENSMUST00000197640 1229 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
PtprdQ64487 Trav11n-201ENSMUST00000200113 343 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
PtprdQ64487 Gm8557-201ENSMUST00000220777 475 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
PtprdQ64487 Eef1akmt1-201ENSMUST00000022518 880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
PtprdQ64487 CT010480.2-201ENSMUST00000225424 737 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
PtprdQ64487 AC154436.1-201ENSMUST00000227272 782 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
PtprdQ64487 Tprg-201ENSMUST00000056087 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
PtprdQ64487 E330021D16Rik-201ENSMUST00000058713 1116 ntAPPRIS P1 BASIC10.99□□□□□ -0.65
PtprdQ64487 Nfasc-203ENSMUST00000163770 3903 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
PtprdQ64487 Gm2115-201ENSMUST00000180387 7055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
PtprdQ64487 Araf-201ENSMUST00000001155 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
PtprdQ64487 Moxd2-201ENSMUST00000031937 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
PtprdQ64487 Ces2h-201ENSMUST00000172032 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
PtprdQ64487 Cacna2d1-202ENSMUST00000078272 7311 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
PtprdQ64487 Csrnp2-201ENSMUST00000061457 4126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
PtprdQ64487 Cdh22-201ENSMUST00000065438 3702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
PtprdQ64487 Tiam1-214ENSMUST00000164263 3569 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
PtprdQ64487 Fbxo46-201ENSMUST00000053109 4873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
PtprdQ64487 4930579F01Rik-201ENSMUST00000012186 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
PtprdQ64487 Atl2-202ENSMUST00000112437 3371 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
PtprdQ64487 Bcl2l1-206ENSMUST00000140436 1865 ntTSL 2 BASIC10.99□□□□□ -0.65
PtprdQ64487 Mllt6-201ENSMUST00000044730 7274 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
PtprdQ64487 Zbtb42-201ENSMUST00000169593 3478 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.99□□□□□ -0.65
PtprdQ64487 Nyap1-202ENSMUST00000118326 4565 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
PtprdQ64487 Gm23769-201ENSMUST00000104441 121 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
PtprdQ64487 Pdzk1ip1-202ENSMUST00000106548 887 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
PtprdQ64487 Rpl17-ps1-201ENSMUST00000119156 552 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
PtprdQ64487 Stk33-205ENSMUST00000141210 949 ntTSL 3 BASIC10.99□□□□□ -0.65
PtprdQ64487 Platr20-202ENSMUST00000143209 937 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
PtprdQ64487 Bnip2-208ENSMUST00000165389 945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
PtprdQ64487 Tex29-204ENSMUST00000166638 561 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
PtprdQ64487 Gm25677-201ENSMUST00000174983 72 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
PtprdQ64487 Gm5865-201ENSMUST00000198713 637 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
PtprdQ64487 Gm39091-201ENSMUST00000206189 553 ntTSL 2 BASIC10.99□□□□□ -0.65
PtprdQ64487 Fcer2a-205ENSMUST00000208145 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
PtprdQ64487 Ftl1-204ENSMUST00000210864 503 ntTSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
PtprdQ64487 Gm18001-201ENSMUST00000212023 688 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
PtprdQ64487 Apoa5-205ENSMUST00000215187 495 ntTSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
PtprdQ64487 Gm13871-202ENSMUST00000107319 1324 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
PtprdQ64487 Gm11757-202ENSMUST00000107321 1324 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
PtprdQ64487 Mgll-207ENSMUST00000163271 3991 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
PtprdQ64487 Bpnt1-201ENSMUST00000027916 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
PtprdQ64487 Tmigd1-202ENSMUST00000102495 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
PtprdQ64487 Lonp2-207ENSMUST00000163987 1556 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
PtprdQ64487 Zfp830-201ENSMUST00000056677 1591 ntAPPRIS P1 BASIC10.99□□□□□ -0.65
PtprdQ64487 Snx29-201ENSMUST00000096273 1622 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
PtprdQ64487 Tbp-203ENSMUST00000118001 1652 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
PtprdQ64487 Zfp384-204ENSMUST00000088308 2875 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
PtprdQ64487 Palld-203ENSMUST00000121493 5445 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
PtprdQ64487 Gm38192-201ENSMUST00000194364 1847 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
PtprdQ64487 Phldb1-201ENSMUST00000034611 5461 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
PtprdQ64487 Nek3-204ENSMUST00000178324 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
PtprdQ64487 Tsc22d3-201ENSMUST00000055738 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
PtprdQ64487 Chrnb2-203ENSMUST00000200558 3482 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
PtprdQ64487 Specc1-202ENSMUST00000092415 6797 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
PtprdQ64487 Cdc37l1-207ENSMUST00000225210 4163 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 81.1 ms