Protein–RNA interactions for Protein: Q61361

Bcan, Brevican core protein, mousemouse

Predictions only

Length 883 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BcanQ61361 Gstz1-203ENSMUST00000220574 971 ntTSL 2 BASIC13.7□□□□□ -0.22
BcanQ61361 AC126799.1-201ENSMUST00000221976 246 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
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BcanQ61361 Sept4-202ENSMUST00000063156 1245 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
BcanQ61361 Pcdhga4-201ENSMUST00000194418 4727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
BcanQ61361 Atp5g1-201ENSMUST00000090541 4715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
BcanQ61361 Carns1-201ENSMUST00000167055 3968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
BcanQ61361 Il2rb-201ENSMUST00000089398 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
BcanQ61361 Wdr82-201ENSMUST00000020490 3747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
BcanQ61361 Rxrg-201ENSMUST00000015987 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
BcanQ61361 Nnt-203ENSMUST00000109204 3198 ntTSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
BcanQ61361 Slc25a25-202ENSMUST00000052119 3529 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
BcanQ61361 Gucy1a3-204ENSMUST00000193924 4710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
BcanQ61361 Trim25-201ENSMUST00000000284 5566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
BcanQ61361 2410002F23Rik-203ENSMUST00000084937 2092 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.7□□□□□ -0.22
BcanQ61361 AC122811.1-201ENSMUST00000222257 2921 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
BcanQ61361 Igsf3-201ENSMUST00000043983 7371 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
BcanQ61361 Tcirg1-204ENSMUST00000126070 3041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
BcanQ61361 Pbx1-208ENSMUST00000188912 3970 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
BcanQ61361 AC154537.1-201ENSMUST00000226101 1304 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
BcanQ61361 4931428F04Rik-201ENSMUST00000014981 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
BcanQ61361 Cc2d1a-201ENSMUST00000040383 3471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
BcanQ61361 Eno3-201ENSMUST00000072841 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
BcanQ61361 Recql4-201ENSMUST00000036852 3922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
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BcanQ61361 Slc1a4-201ENSMUST00000004634 3872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
BcanQ61361 Cyp2a22-201ENSMUST00000170227 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
BcanQ61361 Slc13a5-206ENSMUST00000208912 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
BcanQ61361 Wipf1-203ENSMUST00000102680 4032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
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BcanQ61361 Gnas-201ENSMUST00000080493 3519 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
BcanQ61361 Acsl4-201ENSMUST00000033634 5280 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
BcanQ61361 Akap3-202ENSMUST00000202574 2879 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
BcanQ61361 Ackr2-201ENSMUST00000050327 2853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
BcanQ61361 Gm11380-201ENSMUST00000118067 560 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
BcanQ61361 Gm13019-201ENSMUST00000120000 276 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
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BcanQ61361 Gm11728-201ENSMUST00000150628 660 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
BcanQ61361 Scgb2b7-201ENSMUST00000178258 520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
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BcanQ61361 Mir99ahg-209ENSMUST00000182820 835 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
BcanQ61361 Gm18801-201ENSMUST00000186616 536 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
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BcanQ61361 Fabp6-201ENSMUST00000020672 479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
BcanQ61361 3110009M11Rik-201ENSMUST00000208647 892 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
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BcanQ61361 Eif4ebp3-201ENSMUST00000036765 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
BcanQ61361 Accsl-201ENSMUST00000099690 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
BcanQ61361 Epb41l1-201ENSMUST00000029155 6220 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
BcanQ61361 Pcnt-202ENSMUST00000217838 9341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
BcanQ61361 2410002F23Rik-204ENSMUST00000107948 2908 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.69□□□□□ -0.22
BcanQ61361 Pip4k2b-201ENSMUST00000018691 5053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
BcanQ61361 Rab14-201ENSMUST00000028238 3081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
BcanQ61361 Zfp263-201ENSMUST00000023176 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
BcanQ61361 Atad2-201ENSMUST00000038194 5684 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
BcanQ61361 Lta-201ENSMUST00000025266 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
BcanQ61361 Larp7-201ENSMUST00000029588 2121 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
BcanQ61361 Gabrr1-201ENSMUST00000029947 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
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BcanQ61361 DXBay18-201ENSMUST00000080324 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
BcanQ61361 Gm14685-201ENSMUST00000088459 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
BcanQ61361 Kcnk18-201ENSMUST00000065204 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
BcanQ61361 Lef1-201ENSMUST00000029611 3482 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
BcanQ61361 Vwa7-201ENSMUST00000007245 4313 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
BcanQ61361 Mest-210ENSMUST00000157040 2383 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
BcanQ61361 Brcc3-203ENSMUST00000118428 2093 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
BcanQ61361 Cops3-201ENSMUST00000019517 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
BcanQ61361 Nlrp6-201ENSMUST00000106045 3823 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
BcanQ61361 Fam222b-203ENSMUST00000155571 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
BcanQ61361 Scamp5-201ENSMUST00000046587 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
BcanQ61361 AC126257.2-201ENSMUST00000215507 2300 ntBASIC13.68□□□□□ -0.22
BcanQ61361 Glis3-209ENSMUST00000162022 7514 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
BcanQ61361 Ntng2-202ENSMUST00000071201 1881 ntTSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
BcanQ61361 Nom1-201ENSMUST00000001611 9219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
BcanQ61361 Idi1-201ENSMUST00000169314 3027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
BcanQ61361 Src-204ENSMUST00000109531 3586 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
BcanQ61361 Colec11-201ENSMUST00000036136 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
BcanQ61361 Slc22a4-201ENSMUST00000020586 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
BcanQ61361 Fam107b-202ENSMUST00000115052 861 ntTSL 3 BASIC13.68□□□□□ -0.22
BcanQ61361 Gm13026-201ENSMUST00000140113 608 ntTSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
BcanQ61361 Ccndbp1-208ENSMUST00000171260 1187 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
BcanQ61361 Gm23400-201ENSMUST00000174994 102 ntBASIC13.68□□□□□ -0.22
BcanQ61361 Gm26463-201ENSMUST00000175065 101 ntBASIC13.68□□□□□ -0.22
BcanQ61361 Gm24332-201ENSMUST00000175102 102 ntBASIC13.68□□□□□ -0.22
BcanQ61361 Gm25959-201ENSMUST00000175112 102 ntBASIC13.68□□□□□ -0.22
BcanQ61361 Gm22475-201ENSMUST00000175169 102 ntBASIC13.68□□□□□ -0.22
BcanQ61361 Gm22903-201ENSMUST00000175193 102 ntBASIC13.68□□□□□ -0.22
BcanQ61361 Gm25070-201ENSMUST00000175237 102 ntBASIC13.68□□□□□ -0.22
BcanQ61361 Gm24159-201ENSMUST00000175264 102 ntBASIC13.68□□□□□ -0.22
BcanQ61361 Gm25299-201ENSMUST00000175283 102 ntBASIC13.68□□□□□ -0.22
BcanQ61361 Gm23798-201ENSMUST00000175560 102 ntBASIC13.68□□□□□ -0.22
BcanQ61361 Gm23802-201ENSMUST00000175565 102 ntBASIC13.68□□□□□ -0.22
BcanQ61361 Gm25708-201ENSMUST00000177687 102 ntBASIC13.68□□□□□ -0.22
BcanQ61361 Gm24370-201ENSMUST00000178007 102 ntBASIC13.68□□□□□ -0.22
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