Protein–RNA interactions for Protein: Q5RJB0

Bhlha9, Class A basic helix-loop-helix protein 9, mousemouse

Predictions only

Length 231 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Bhlha9Q5RJB0 Mamdc2-201ENSMUST00000036069 3338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Bhlha9Q5RJB0 Fam114a2-201ENSMUST00000020831 2557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Bhlha9Q5RJB0 Cacna1s-202ENSMUST00000112068 6018 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Bhlha9Q5RJB0 Uaca-202ENSMUST00000214354 4417 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Bhlha9Q5RJB0 Qrfpr-203ENSMUST00000197447 1690 ntTSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Bhlha9Q5RJB0 Gm9129-201ENSMUST00000218173 1689 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
Bhlha9Q5RJB0 Nxpe5-201ENSMUST00000110929 2312 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Bhlha9Q5RJB0 Top3a-204ENSMUST00000120417 2318 ntTSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Bhlha9Q5RJB0 Nelfcd-201ENSMUST00000016397 2280 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Bhlha9Q5RJB0 AC108416.1-201ENSMUST00000228755 1558 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
Bhlha9Q5RJB0 Xlr4c-201ENSMUST00000068551 1500 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Bhlha9Q5RJB0 Als2cl-201ENSMUST00000084926 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Bhlha9Q5RJB0 Fam13c-201ENSMUST00000062883 3262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Bhlha9Q5RJB0 Sox13-203ENSMUST00000144386 3179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Bhlha9Q5RJB0 Scaf1-201ENSMUST00000085383 4293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Bhlha9Q5RJB0 Dock6-201ENSMUST00000034728 6467 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Bhlha9Q5RJB0 1700017B05Rik-201ENSMUST00000034846 4152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Bhlha9Q5RJB0 Rad1-202ENSMUST00000100775 4085 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Bhlha9Q5RJB0 Fan1-201ENSMUST00000163289 3460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Bhlha9Q5RJB0 Polr3c-201ENSMUST00000029741 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Bhlha9Q5RJB0 Sipa1l2-202ENSMUST00000212168 6586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Bhlha9Q5RJB0 Tmem130-201ENSMUST00000061446 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Bhlha9Q5RJB0 Zfp710-202ENSMUST00000164056 5871 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Bhlha9Q5RJB0 Ssc4d-202ENSMUST00000111150 459 ntTSL 2 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Bhlha9Q5RJB0 Gm12029-201ENSMUST00000120073 832 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
Bhlha9Q5RJB0 Gm14460-201ENSMUST00000121511 639 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
Bhlha9Q5RJB0 Aamdc-213ENSMUST00000154853 883 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Bhlha9Q5RJB0 Gm9866-204ENSMUST00000183238 351 ntTSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Bhlha9Q5RJB0 1700088E04Rik-206ENSMUST00000187550 1168 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Bhlha9Q5RJB0 Gm37695-201ENSMUST00000191765 530 ntTSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Bhlha9Q5RJB0 Qdpr-209ENSMUST00000198258 1172 ntTSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Bhlha9Q5RJB0 4930430O22Rik-202ENSMUST00000202548 579 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
Bhlha9Q5RJB0 Tepp-207ENSMUST00000212056 613 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Bhlha9Q5RJB0 Gm10752-201ENSMUST00000218348 729 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
Bhlha9Q5RJB0 C330004P14Rik-201ENSMUST00000218833 628 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Bhlha9Q5RJB0 Myl6-211ENSMUST00000219236 692 ntTSL 2 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Bhlha9Q5RJB0 CT009713.8-202ENSMUST00000224732 385 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
Bhlha9Q5RJB0 Tmem258-201ENSMUST00000040372 606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Bhlha9Q5RJB0 Ddr1-202ENSMUST00000097333 3593 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Bhlha9Q5RJB0 Gm12367-202ENSMUST00000146909 2105 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Bhlha9Q5RJB0 Kcne2-202ENSMUST00000113971 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Bhlha9Q5RJB0 Efna1-202ENSMUST00000118587 1632 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Bhlha9Q5RJB0 C530044C16Rik-201ENSMUST00000204275 1624 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Bhlha9Q5RJB0 Zbtb45-205ENSMUST00000210282 3908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Bhlha9Q5RJB0 Cfap100-207ENSMUST00000165673 2072 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Bhlha9Q5RJB0 Papln-202ENSMUST00000121733 4373 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Bhlha9Q5RJB0 Slc35a4-201ENSMUST00000036158 2462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Bhlha9Q5RJB0 Gm10643-201ENSMUST00000098592 1577 ntAPPRIS P1 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Bhlha9Q5RJB0 Slc6a2-202ENSMUST00000165470 6007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Bhlha9Q5RJB0 Ints6-202ENSMUST00000223585 10883 ntAPPRIS P1 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Bhlha9Q5RJB0 Pde6c-202ENSMUST00000112329 2895 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Bhlha9Q5RJB0 Abhd4-201ENSMUST00000041197 2401 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Bhlha9Q5RJB0 Fhdc1-201ENSMUST00000091002 4162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Bhlha9Q5RJB0 Bsdc1-201ENSMUST00000048162 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Bhlha9Q5RJB0 Ncdn-201ENSMUST00000030637 3681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Bhlha9Q5RJB0 Gm26527-201ENSMUST00000180416 1948 ntTSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Bhlha9Q5RJB0 Gm15997-201ENSMUST00000202188 1491 ntTSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Bhlha9Q5RJB0 Sema5b-201ENSMUST00000050625 4350 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Bhlha9Q5RJB0 Ccdc167-203ENSMUST00000129091 2256 ntTSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Bhlha9Q5RJB0 Rasgrp4-211ENSMUST00000203380 3077 ntTSL 5 BASIC10.42□□□□□ -0.74
Bhlha9Q5RJB0 Art3-202ENSMUST00000117108 1408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.42□□□□□ -0.74
Bhlha9Q5RJB0 Art3-203ENSMUST00000118106 1401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Bhlha9Q5RJB0 Gfi1b-204ENSMUST00000164290 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Bhlha9Q5RJB0 Furin-201ENSMUST00000107362 4166 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.42□□□□□ -0.74
Bhlha9Q5RJB0 Ptpn23-201ENSMUST00000040021 5346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.42□□□□□ -0.74
Bhlha9Q5RJB0 Mff-209ENSMUST00000160972 1358 ntTSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Bhlha9Q5RJB0 Dcun1d2-203ENSMUST00000110839 2937 ntTSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Bhlha9Q5RJB0 Mdm1-203ENSMUST00000164077 2922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Bhlha9Q5RJB0 Gm3830-201ENSMUST00000185540 1715 ntTSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Bhlha9Q5RJB0 Tubb4b-ps2-201ENSMUST00000187481 1337 ntBASIC10.42□□□□□ -0.74
Bhlha9Q5RJB0 Slc7a4-201ENSMUST00000063544 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Bhlha9Q5RJB0 Oprm1-230ENSMUST00000154906 2039 ntTSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Bhlha9Q5RJB0 Gm23061-201ENSMUST00000102348 116 ntBASIC10.42□□□□□ -0.74
Bhlha9Q5RJB0 Cdc42se1-204ENSMUST00000107201 907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Bhlha9Q5RJB0 Timm22-202ENSMUST00000120699 746 ntTSL 3 BASIC10.42□□□□□ -0.74
Bhlha9Q5RJB0 Anp32a-205ENSMUST00000135395 924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.42□□□□□ -0.74
Bhlha9Q5RJB0 Rdh9-203ENSMUST00000136223 1276 ntTSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Bhlha9Q5RJB0 Gm16308-201ENSMUST00000162171 940 ntTSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Bhlha9Q5RJB0 Mocs2-203ENSMUST00000164737 745 ntTSL 3 BASIC10.42□□□□□ -0.74
Bhlha9Q5RJB0 Erh-202ENSMUST00000166931 506 ntTSL 2 BASIC10.42□□□□□ -0.74
Bhlha9Q5RJB0 Spaca6-209ENSMUST00000172097 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.42□□□□□ -0.74
Bhlha9Q5RJB0 Gm20495-201ENSMUST00000173902 235 ntBASIC10.42□□□□□ -0.74
Bhlha9Q5RJB0 Rpl31-202ENSMUST00000178079 487 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.42□□□□□ -0.74
Bhlha9Q5RJB0 Stpg4-202ENSMUST00000186211 591 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.42□□□□□ -0.74
Bhlha9Q5RJB0 Gm38321-201ENSMUST00000195053 235 ntBASIC10.42□□□□□ -0.74
Bhlha9Q5RJB0 Calca-205ENSMUST00000205933 458 ntTSL 3 BASIC10.42□□□□□ -0.74
Bhlha9Q5RJB0 Gm45909-201ENSMUST00000212413 1031 ntBASIC10.42□□□□□ -0.74
Bhlha9Q5RJB0 Gm9797-202ENSMUST00000218003 294 ntBASIC10.42□□□□□ -0.74
Bhlha9Q5RJB0 Gm4797-201ENSMUST00000219075 1283 ntBASIC10.42□□□□□ -0.74
Bhlha9Q5RJB0 Ngdn-201ENSMUST00000022815 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Bhlha9Q5RJB0 Npff-201ENSMUST00000023814 540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Bhlha9Q5RJB0 Plp2-201ENSMUST00000033486 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Bhlha9Q5RJB0 Tas2r126-201ENSMUST00000059534 930 ntAPPRIS P1 BASIC10.42□□□□□ -0.74
Bhlha9Q5RJB0 Tepp-201ENSMUST00000098480 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Bhlha9Q5RJB0 Rhoj-203ENSMUST00000118966 4892 ntTSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Bhlha9Q5RJB0 Sept2-201ENSMUST00000027495 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Bhlha9Q5RJB0 Tbrg1-201ENSMUST00000117654 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Bhlha9Q5RJB0 Gtf3c1-204ENSMUST00000205659 6570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.42□□□□□ -0.74
Bhlha9Q5RJB0 Pgf-201ENSMUST00000004913 1582 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Bhlha9Q5RJB0 Pik3cd-202ENSMUST00000105688 4335 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45 ms