Protein–RNA interactions for Protein: Q3UMU9

Hdgfl2, Hepatoma-derived growth factor-related protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 669 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hdgfl2Q3UMU9 Spats2l-201ENSMUST00000163239 2313 ntTSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Hdgfl2Q3UMU9 Clip1-204ENSMUST00000111564 5609 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Hdgfl2Q3UMU9 Tspan18-202ENSMUST00000111265 3751 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Hdgfl2Q3UMU9 Myo1h-210ENSMUST00000202006 4631 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Hdgfl2Q3UMU9 Htr1b-202ENSMUST00000183482 4724 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Hdgfl2Q3UMU9 Lactb2-201ENSMUST00000027071 4494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Hdgfl2Q3UMU9 Vwa1-201ENSMUST00000042196 3623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Hdgfl2Q3UMU9 Aurkc-203ENSMUST00000207711 1320 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Hdgfl2Q3UMU9 C2cd5-204ENSMUST00000203187 3494 ntTSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Hdgfl2Q3UMU9 CT010498.2-201ENSMUST00000225690 1659 ntAPPRIS P1 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Hdgfl2Q3UMU9 Htr2c-202ENSMUST00000096299 4883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Hdgfl2Q3UMU9 Ppargc1b-201ENSMUST00000063307 3330 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Hdgfl2Q3UMU9 Nop16-201ENSMUST00000026987 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Hdgfl2Q3UMU9 Abi2-207ENSMUST00000188618 4723 ntTSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Hdgfl2Q3UMU9 Xpnpep1-211ENSMUST00000183274 2120 ntTSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Hdgfl2Q3UMU9 Abt1-201ENSMUST00000041782 4456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Hdgfl2Q3UMU9 Gm33831-201ENSMUST00000211696 1542 ntTSL 5 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Hdgfl2Q3UMU9 Gm2464-201ENSMUST00000180838 2551 ntTSL 5 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Hdgfl2Q3UMU9 Glyctk-202ENSMUST00000112543 4081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Hdgfl2Q3UMU9 B4galt4-201ENSMUST00000023482 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Hdgfl2Q3UMU9 Trim61-201ENSMUST00000078409 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Hdgfl2Q3UMU9 Ccndbp1-203ENSMUST00000099489 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Hdgfl2Q3UMU9 Vbp1-202ENSMUST00000114070 632 ntTSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Hdgfl2Q3UMU9 Gm14154-201ENSMUST00000142642 579 ntTSL 3 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Hdgfl2Q3UMU9 Gm11753-201ENSMUST00000151091 396 ntTSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Hdgfl2Q3UMU9 Mir8115-201ENSMUST00000184992 119 ntBASIC11.11□□□□□ -0.63
Hdgfl2Q3UMU9 Gm27241-202ENSMUST00000185013 570 ntTSL 2 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Hdgfl2Q3UMU9 Tmem242-203ENSMUST00000188282 822 ntTSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Hdgfl2Q3UMU9 Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Hdgfl2Q3UMU9 Gm42657-201ENSMUST00000201746 211 ntBASIC11.11□□□□□ -0.63
Hdgfl2Q3UMU9 Gm45285-201ENSMUST00000210418 749 ntTSL 3 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Hdgfl2Q3UMU9 Sdf2-201ENSMUST00000002133 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Hdgfl2Q3UMU9 AC118476.3-201ENSMUST00000216419 1219 ntTSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Hdgfl2Q3UMU9 Gm18065-201ENSMUST00000221395 526 ntBASIC11.11□□□□□ -0.63
Hdgfl2Q3UMU9 AC166344.1-201ENSMUST00000223745 674 ntBASIC11.11□□□□□ -0.63
Hdgfl2Q3UMU9 Gpc6-202ENSMUST00000088483 3488 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Hdgfl2Q3UMU9 Gm43999-201ENSMUST00000204286 2889 ntBASIC11.11□□□□□ -0.63
Hdgfl2Q3UMU9 Cox17-202ENSMUST00000120495 3690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Hdgfl2Q3UMU9 Pstpip2-201ENSMUST00000114741 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Hdgfl2Q3UMU9 Serpinf2-201ENSMUST00000043696 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Hdgfl2Q3UMU9 Zbtb21-203ENSMUST00000113734 6010 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Hdgfl2Q3UMU9 Itgal-204ENSMUST00000120857 4533 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Hdgfl2Q3UMU9 Tardbp-206ENSMUST00000105702 6425 ntTSL 5 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Hdgfl2Q3UMU9 Pin1-201ENSMUST00000034689 3843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Hdgfl2Q3UMU9 Sez6l-206ENSMUST00000212758 2664 ntTSL 5 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Hdgfl2Q3UMU9 Mamld1-201ENSMUST00000082088 4796 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Hdgfl2Q3UMU9 Tmprss5-202ENSMUST00000165088 2895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Hdgfl2Q3UMU9 Aldh3a2-201ENSMUST00000066277 2892 ntTSL 2 BASIC11.1□□□□□ -0.63
Hdgfl2Q3UMU9 CT009489.1-201ENSMUST00000227740 1893 ntBASIC11.1□□□□□ -0.63
Hdgfl2Q3UMU9 Pkp4-201ENSMUST00000037903 4378 ntTSL 5 BASIC11.1□□□□□ -0.63
Hdgfl2Q3UMU9 D6Ertd527e-201ENSMUST00000170124 2161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Hdgfl2Q3UMU9 1600014C10Rik-201ENSMUST00000067854 3143 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.1□□□□□ -0.63
Hdgfl2Q3UMU9 9330111N05Rik-203ENSMUST00000181508 1848 ntTSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Hdgfl2Q3UMU9 Jam3-201ENSMUST00000034472 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Hdgfl2Q3UMU9 Lgsn-201ENSMUST00000062560 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Hdgfl2Q3UMU9 Rpl15-202ENSMUST00000080281 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
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Hdgfl2Q3UMU9 Sirt2-208ENSMUST00000155327 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.1□□□□□ -0.63
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Hdgfl2Q3UMU9 Sirt5-201ENSMUST00000066804 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Hdgfl2Q3UMU9 Suclg2-201ENSMUST00000079847 2518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Hdgfl2Q3UMU9 Cacna1c-224ENSMUST00000219018 7516 ntTSL 5 BASIC11.1□□□□□ -0.63
Hdgfl2Q3UMU9 Loxl3-201ENSMUST00000000707 4098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Hdgfl2Q3UMU9 Zfp617-201ENSMUST00000119003 2920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Hdgfl2Q3UMU9 Idi1-201ENSMUST00000169314 3027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Hdgfl2Q3UMU9 Pip5k1a-204ENSMUST00000107232 3437 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.1□□□□□ -0.63
Hdgfl2Q3UMU9 Tfrc-201ENSMUST00000023486 4890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Hdgfl2Q3UMU9 Trmt2a-207ENSMUST00000140206 3520 ntTSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Hdgfl2Q3UMU9 Dck-201ENSMUST00000031311 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Hdgfl2Q3UMU9 Chd7-206ENSMUST00000170391 3462 ntTSL 5 BASIC11.1□□□□□ -0.63
Hdgfl2Q3UMU9 Fsd2-201ENSMUST00000042318 3985 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.09□□□□□ -0.63
Hdgfl2Q3UMU9 Gm38089-201ENSMUST00000193585 1514 ntBASIC11.09□□□□□ -0.63
Hdgfl2Q3UMU9 Rsl24d1-201ENSMUST00000034738 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Hdgfl2Q3UMU9 Dnajb6-203ENSMUST00000114839 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Hdgfl2Q3UMU9 Tcn2-203ENSMUST00000109989 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Hdgfl2Q3UMU9 Vezt-202ENSMUST00000118077 2223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Hdgfl2Q3UMU9 Gm13398-201ENSMUST00000149378 2837 ntTSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Hdgfl2Q3UMU9 Dclk3-201ENSMUST00000111879 3005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Hdgfl2Q3UMU9 Tyw1-201ENSMUST00000040213 3044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Hdgfl2Q3UMU9 Tesk2-201ENSMUST00000045542 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Hdgfl2Q3UMU9 Cd6-203ENSMUST00000080292 3032 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Hdgfl2Q3UMU9 Pnpla6-201ENSMUST00000004681 4438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Hdgfl2Q3UMU9 Sez6l-201ENSMUST00000075387 6055 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Hdgfl2Q3UMU9 Gtf2i-224ENSMUST00000174772 4078 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.09□□□□□ -0.63
Hdgfl2Q3UMU9 Slc1a4-201ENSMUST00000004634 3872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
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