Protein–RNA interactions for Protein: Q3UJD6

Usp19, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 19, mousemouse

Predictions only

Length 1,360 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp19Q3UJD6 Ncstn-201ENSMUST00000003550 2901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Usp19Q3UJD6 Tasp1-202ENSMUST00000099304 2127 ntTSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Usp19Q3UJD6 Mcf2l-202ENSMUST00000098927 3215 ntTSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
Usp19Q3UJD6 Mylk3-202ENSMUST00000121972 2407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Usp19Q3UJD6 March1-207ENSMUST00000110258 2581 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
Usp19Q3UJD6 Eno3-201ENSMUST00000072841 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Usp19Q3UJD6 Npy1r-201ENSMUST00000039303 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Usp19Q3UJD6 Fam180a-201ENSMUST00000051176 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Usp19Q3UJD6 Oxsm-201ENSMUST00000022311 3759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Usp19Q3UJD6 Kansl3-201ENSMUST00000010597 4663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Usp19Q3UJD6 Mcph1-201ENSMUST00000039412 4662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Usp19Q3UJD6 Cd6-202ENSMUST00000039043 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Usp19Q3UJD6 Wdr36-201ENSMUST00000053663 3281 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Usp19Q3UJD6 Herc4-201ENSMUST00000020258 3898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Usp19Q3UJD6 Pemt-202ENSMUST00000102692 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Usp19Q3UJD6 Spop-201ENSMUST00000107722 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
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Usp19Q3UJD6 D3Ertd751e-204ENSMUST00000119572 1011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Usp19Q3UJD6 Mrpl24-204ENSMUST00000121920 1115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
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Usp19Q3UJD6 Gm13530-201ENSMUST00000134014 390 ntTSL 2 BASIC14.34□□□□□ -0.11
Usp19Q3UJD6 2810404F17Rik-201ENSMUST00000156615 1704 ntTSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Usp19Q3UJD6 1810026B05Rik-208ENSMUST00000190028 590 ntTSL 3 BASIC14.34□□□□□ -0.11
Usp19Q3UJD6 Gm29763-201ENSMUST00000205306 616 ntBASIC14.34□□□□□ -0.11
Usp19Q3UJD6 Gm33080-201ENSMUST00000205429 172 ntBASIC14.34□□□□□ -0.11
Usp19Q3UJD6 Gm2594-201ENSMUST00000214774 742 ntBASIC14.34□□□□□ -0.11
Usp19Q3UJD6 AC123694.1-201ENSMUST00000219525 644 ntTSL 5 BASIC14.34□□□□□ -0.11
Usp19Q3UJD6 CT025679.1-201ENSMUST00000227106 449 ntBASIC14.34□□□□□ -0.11
Usp19Q3UJD6 Sapcd1-201ENSMUST00000040151 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Usp19Q3UJD6 Eya2-201ENSMUST00000063433 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Usp19Q3UJD6 Brsk2-216ENSMUST00000174499 4223 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.34□□□□□ -0.11
Usp19Q3UJD6 Mlxip-201ENSMUST00000068237 7303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Usp19Q3UJD6 Fubp1-209ENSMUST00000198227 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Usp19Q3UJD6 Atp6v1a-201ENSMUST00000063661 3896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Usp19Q3UJD6 Hddc3-201ENSMUST00000032747 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
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Usp19Q3UJD6 Gm26672-201ENSMUST00000180922 2685 ntTSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Usp19Q3UJD6 Syne3-203ENSMUST00000109927 5263 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.34□□□□□ -0.11
Usp19Q3UJD6 Tmem2-202ENSMUST00000096194 6667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.34□□□□□ -0.11
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Usp19Q3UJD6 Ino80c-204ENSMUST00000153360 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
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Usp19Q3UJD6 Cfap53-201ENSMUST00000114895 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Usp19Q3UJD6 Mdm1-201ENSMUST00000020437 3074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
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Usp19Q3UJD6 Cd55b-202ENSMUST00000119432 986 ntTSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
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Usp19Q3UJD6 Gm16876-201ENSMUST00000151945 760 ntTSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
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Usp19Q3UJD6 B230110C06Rik-201ENSMUST00000181388 1274 ntTSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
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Usp19Q3UJD6 Gm45609-204ENSMUST00000209837 1207 ntTSL 5 BASIC14.34□□□□□ -0.11
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Usp19Q3UJD6 Gm18499-201ENSMUST00000220808 1021 ntBASIC14.34□□□□□ -0.11
Usp19Q3UJD6 AC154435.1-201ENSMUST00000223938 959 ntBASIC14.34□□□□□ -0.11
Usp19Q3UJD6 CT030135.2-201ENSMUST00000225255 893 ntBASIC14.34□□□□□ -0.11
Usp19Q3UJD6 Cxcl1-201ENSMUST00000031327 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Usp19Q3UJD6 E330021D16Rik-201ENSMUST00000058713 1116 ntAPPRIS P1 BASIC14.34□□□□□ -0.11
Usp19Q3UJD6 Zw10-201ENSMUST00000034803 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Usp19Q3UJD6 Cycs-202ENSMUST00000161401 3123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.11
Usp19Q3UJD6 Gm5475-202ENSMUST00000148928 2320 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.11
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Usp19Q3UJD6 Axl-201ENSMUST00000002677 4265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.11
Usp19Q3UJD6 Ccdc85a-202ENSMUST00000093253 5431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.11
Usp19Q3UJD6 Becn1-205ENSMUST00000130916 4365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.11
Usp19Q3UJD6 Tiprl-201ENSMUST00000043235 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.11
Usp19Q3UJD6 Camk2d-216ENSMUST00000163226 4204 ntTSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.11
Usp19Q3UJD6 Med12l-201ENSMUST00000029393 2295 ntTSL 5 BASIC14.33□□□□□ -0.11
Usp19Q3UJD6 Vmn2r18-201ENSMUST00000165928 2367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.33□□□□□ -0.12
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Usp19Q3UJD6 Slc22a14-201ENSMUST00000093775 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Usp19Q3UJD6 Eif2s3y-201ENSMUST00000091197 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Usp19Q3UJD6 Mx2-202ENSMUST00000188251 2421 ntTSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Usp19Q3UJD6 Fhitos-201ENSMUST00000160149 1511 ntTSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Usp19Q3UJD6 Arpc3-202ENSMUST00000102525 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Usp19Q3UJD6 Apoc3-202ENSMUST00000118649 453 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.33□□□□□ -0.12
Usp19Q3UJD6 Mir1896-201ENSMUST00000122641 81 ntBASIC14.33□□□□□ -0.12
Usp19Q3UJD6 Gm13709-201ENSMUST00000138573 614 ntTSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Usp19Q3UJD6 Gm27191-201ENSMUST00000145973 448 ntTSL 3 BASIC14.33□□□□□ -0.12
Usp19Q3UJD6 Ndufc2-202ENSMUST00000149122 470 ntTSL 2 BASIC14.33□□□□□ -0.12
Usp19Q3UJD6 Gm20414-201ENSMUST00000172918 646 ntBASIC14.33□□□□□ -0.12
Usp19Q3UJD6 Tmem108-203ENSMUST00000189066 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Usp19Q3UJD6 Gm9916-201ENSMUST00000192943 1228 ntBASIC14.33□□□□□ -0.12
Usp19Q3UJD6 Gm44753-202ENSMUST00000208297 562 ntTSL 5 BASIC14.33□□□□□ -0.12
Usp19Q3UJD6 Isoc2b-205ENSMUST00000208816 820 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.33□□□□□ -0.12
Usp19Q3UJD6 Gm8255-201ENSMUST00000218693 305 ntBASIC14.33□□□□□ -0.12
Usp19Q3UJD6 Gm1000-202ENSMUST00000222329 757 ntTSL 5 BASIC14.33□□□□□ -0.12
Usp19Q3UJD6 AC164429.1-201ENSMUST00000224210 518 ntBASIC14.33□□□□□ -0.12
Usp19Q3UJD6 AC158388.3-202ENSMUST00000225517 775 ntBASIC14.33□□□□□ -0.12
Usp19Q3UJD6 4930449E01Rik-201ENSMUST00000022711 595 ntTSL 2 BASIC14.33□□□□□ -0.12
Usp19Q3UJD6 AC154436.1-201ENSMUST00000227272 782 ntBASIC14.33□□□□□ -0.12
Usp19Q3UJD6 Myf6-201ENSMUST00000044210 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Usp19Q3UJD6 2310057N15Rik-201ENSMUST00000054223 1028 ntAPPRIS P1 BASIC14.33□□□□□ -0.12
Usp19Q3UJD6 Ccdc130-202ENSMUST00000098578 2119 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Usp19Q3UJD6 Ttc7b-206ENSMUST00000223020 3307 ntTSL 5 BASIC14.33□□□□□ -0.12
Usp19Q3UJD6 Kcne2-202ENSMUST00000113971 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
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